EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS140-00052 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Namalwa 
Coordinate
chr1:23937930-23943310 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:23940818-23940829ACAGATAAGGA-6.14
KLF13MA0657.1chr1:23940802-23940820TTACCACGCCCATTTTAC+6.62
KLF14MA0740.1chr1:23940803-23940817TACCACGCCCATTT+6.31
Klf12MA0742.1chr1:23940803-23940818TACCACGCCCATTTT+6.39
NFYAMA0060.3chr1:23943128-23943139AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr1:23943123-23943138AGCTGAGCCAATCAG+6.38
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10300chr1:23938099-23943334CD19_Primary
SE_11050chr1:23936367-23956768CD20
SE_18996chr1:23938003-23948106CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_39565chr1:23938163-23943200Jurkat
SE_50077chr1:23938069-23941212Sigmoid_Colon
SE_55151chr1:23938143-23941191Thymus
SE_55151chr1:23941234-23942451Thymus
SE_58372chr1:23873313-23964782Ly1
SE_66424chr1:23938163-23943200Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr12394298723943225
chr12393827723941172
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I023611chr12393819823943278
Enhancer Sequence
CTTGAACCTG GGAGGTGGAG GTTGCAGTGA GCCAAGATCG CACCACTGCA AATCCAGCCT 60
GGGCAACAGA GTGAGACTCC ATTTCCAAAA AAAAAAAAAA TTAGCTGGCT GTGGTGACAC 120
ACACCTGTAA TCCCAGCTAC TCAGGAGGCT GAGGCAGGAG AATTGCTTGA ACCCAGGAGG 180
CAGAGGTTGC AGTGAGCTGA GATGGCATCA TTGCACTCCA GCCTGGGAGA CAGAGTGAGA 240
CTCCATTTCA AAAACCAAAA AAAAAAATAC AATAAATGGC CATACACAAC AATAATCATT 300
AGCACTTAAG CACCTACTGT GTGTCAGGTG CTGTGCTAAT CCATTTTCCA GTTGTGGAAA 360
CTGAGTCTCA GAGAGGCTAA GCAACCTGCC CAAGGTCACA CAACAGGAAG TAGCATAGCC 420
AGGACTGGAA CACAAGTGGG CCTCAAAGTG CAGGTTCTCA TCACCTGGTA GCAACTACCT 480
ATTGCTAGGC ACTATTTCCA ATCCAACAAA GCTCTACAAG GTCAGTGTTT TTTTCCAGAA 540
ACTTAGAGAG GTCAGATGAT TTCTCCAGGG CCACACAGCT CATAGGGGGT GGGGGTAGGG 600
GCAGGGAAGC AGGGTTGGAG AGTTTGCCAT TAGTTGGAGC AGGTGACTGG CAGATTGCAC 660
GGTGGCAGCC TCAGGGATTT TTTTAGCCCC AACGGGTGGA GCCACCTCTC ACCAGGTGCC 720
TCCCGGAGTC ACTCCCCAGC TGCAACCACA GGATTTAGAC TTTCAAAGCT GGGCAGGGCC 780
CTCAGCATCC TCTAGGCTGC CTCTTGCCTG TGACTTTAAA ACTAATAATA ATGATCGCAG 840
TCAGCCATGG CTTCCTGAAC CCCTGGTGTA CTCATTCATT GTCTTTCTCT ACATTGTCGC 900
TAATCTGACC ACAACTCTCC TTTAGGATTG TACAACATCT ACAGGCAGGT ATCATGGGCT 960
GCTCATTTTG TAGAAGAAGT CTGAGGCTTA GAAGGCAAAT GACTTGTCCA CGATCGCGAG 1020
GCAAGTCAGA CCCTTCAGAG CCAGACCCTG ACCCCAGGGC AGTGTATGCA GCTTAGAGCA 1080
CCGATCCTGG ACCTGGAAAG GCTGCATCCA CATCCCCAAT TGCACCTACC AGCTGTGCTG 1140
ACCTTGGACA AGTCATTTCT CTGCATCTTA GTTTCCTCAT CTATGAAATA GGAACAGCAA 1200
TAGCATCTGC TTCATCTGGT TGTGGTAAGG ATGAAATGAA TGATAATACA TAAAGCACTC 1260
AGAGCAGTTA TTAGAAACAC ACCAAGGGCT TTATAAGCAT TGTATCCTGG AGTCCACTGA 1320
GCTTTCCAAC CTTGTCTGAG GAGGCTCTTA AAATTGCTTC TGTGTGACCC TGGCTTTCAT 1380
AGTAATCAAC TGAATGGTTC CCACCAGGGC CATGCACTAT GCTTCACAGG CCATGCTTGC 1440
CCCATTCAGC CCTCACCATC ACCCTGTCCC CATTTTGCAG ACAAGGAAAC TGAGGCCCAG 1500
AGAGGAGTTA TGACCTGCTC AGGCCTCCAC ATCTCAGAAA CTGCAGAGCC AGGGGGACTT 1560
CTCCCAAGTC GAAGCTGGTA GTCCCCCCCT CCCAACCGCA GGAAACCCAG ATTGTTATGA 1620
TTACTGGTAT TGTTGTCCAA AACAATACTG GAGACGATGA CAATACAACA ATCATGGAGG 1680
GTGCTTATTT CCACTGGCTC AACAATTATC CCAACGCCCA TATGGAGGGG GCCTGGGGCT 1740
TCAAGAAGAG GCTTCTCGAG GCAGGATGAA CAAACAAGCA GTGAAAAGCC TGCAGCTGGG 1800
CCCCAGGTGC TGGAAGAGAG AGTGGGGCAG GAAGCGGGCA GGCCATTTCT TTCCTCTTCT 1860
TTCTTATTTG TTTGAGAAGC AACTTTACTT TCTAAATCGG TCATTGTCAC CCGTTAGCCC 1920
CCGCCCCACC TGGGCCAGGG CCTCTGGTGA CGGGAGCTCA GGAGGAAGCT CTAGGGGGCA 1980
GGAGGGATGA GGGTGCGAGG TGGGGCAGGG CCTGGGCCCA GCTGGACATG GGGGCTTCTT 2040
TCCTGCAGGG GCCTCATAGG CCACCTTCAG GTGACCTGGG CCTGGCAGAC AGTACCTGCT 2100
GGAGGTGTGA CCTGAGTCCT CCAGGTTCAG CTGCCAGTGG GGAGGGGAGG GAACCCTCAT 2160
CAACAGGGAA GTAGCTGGCA CGGTGGTCAG GGGCCTGGCT CTGGAGTCAG ACCCATTTGG 2220
CTTCCACAGT CTGTCACCTC GGGCAAGTTA CTTCACCTCT CTGAAAATGG GATGGTTTGT 2280
TGTGAAGATT AAAAATAATG AAACCACATG ACACATGGAA AGCATTTAAC ACGTTTACTA 2340
GCACTTAAGC ACATTTACCA CTGGAGATTT ACTTAAGAAG CCAATAGGTA TTGGGCATTT 2400
ACTATGCACC AGGCACTTTT AAAGCATTCT ACACGTATTA ATTCATTTAT TTGGCACAAT 2460
TAACATTCTT CCCACTTAAC AGATGAGAAA ACTGAGGCAC ACAGAGAGGT AGAGTTCCTC 2520
ACACAGGGGC AGATCCAGGC TTGGCAGGAT GTCAGTAAAG GTTATACAAT ACTGAGGGCG 2580
GGGGGGTCTC TTTAAATAAT GAAGTACAAG GCCATGCCAA TGAGGGACCC AGGACTTAAA 2640
CCTCACCATC CTCACCTTAA ATCTCCCTCT AAGCTCTGCC GCCCTGCTAG GAAGTGGTAG 2700
CAGAGGCCAG GTGGCTAGCT CCAGAACCCG TAAGAGTTAT AAGCACTATT GAGAGTACAC 2760
GAGACAGTCA CTGCAGAATG CCACACAAAT AAGAGGCAGC ACTTCCATTG CATGTACCAT 2820
GGGCTACACA CTCATTTAAC CCTTCCAGGA ACCTAATGAG GGTGGCATAT TATTACCACG 2880
CCCATTTTAC AGATAAGGAA GTCAAGGCTC AGAGCGGACC AATGGTTTGC CTGAACGCAC 2940
AGTGCTAAGG AGTGGTAGAC CAGGATTCCA GCCCAGGCAG CCTGATCTCA GGGGCCACCT 3000
GTTTAGCCAC TACAATAACT GTCACCTCGC TCATGACTGG GGCTCAGCAC CTTCCTCTCA 3060
CCTCCCCTTG CAGGCTCTCC CATCTGTTCC CTGACAGCAG CTTGGGGTGT GGACAAGACA 3120
CCCCTGCTTT GGAGTCAGAG ATGCCTGGAT ACTAATCCTC ACCCTGTTGC TTGCTCGCTG 3180
TGTGTCCCTG AGACAGTCTT TTCCCATCTC TGAGCCTTAA TTTTCTCATC TGTAAAATAG 3240
GAATTGTGCA ATTTATAGGG TGGTCATGAA ATGCAGATAC ATCAATTATT ATTTTATGTG 3300
TTTTGTAACA TACTATCAAT AAGCCATGTA TTTAAGTAAG TAAGTTGCCT TTGGATACCA 3360
CTTCATAGGG TGGCTTGGAG AGTCAGAGTA AGGCGAAGAG TCTGGCCCAT ATTAAATGCT 3420
CAGGACCGGT AGAGATCACC ATGCTGGGGA CAAGGGGACA AGTCATTTGT GAGGAGTCAG 3480
GGGAATGGAG AAATGGACAA AACCAGATGT TGGGATGCCT GCATTCTGGA GGGATTTCTA 3540
CCACCAGCTT GTGGTGTGAC CTTGGACAAG TCACTCCCTC CTTTCTGAAC TCAGTTTCTC 3600
CATTTGCAAG TTGTAGGCAT CGCTCCTCAC TAATGCATGA ATGAAACTGT CTCTAAGGTC 3660
CTTAAGAGAC TGAATTTCTG GGTAGGAGCA CAGGAGCATC TTCTGGGTCT CTCTGAGGGC 3720
TGCTCCCATG AAGTCTCCCC CCTACTCTTG GGGTGCTTTT CATGGCTCCC ACTCTTGAGA 3780
CAAACAGGAG GGTTTGCAGG GAACTCATAC ATCTCATCTG CTCCAGCAGA ACCACAGTGC 3840
ATGGCTCAGC TCGTGGGCTC TGCAACTGGA TAGCCTTGAT CTAATCTGTT TCTCACCTGT 3900
AAAATGGAGA TGAAGATAAT ATAATAGATG TCCTTATCCT GAGTTCATAG AGGAGGAGAC 3960
GGAGGTTCCA GGAGGCACAG GACTTGCTGG AGGTCATGGC TCTCACCTTG CCCTTGTCCT 4020
ACTGCCTCTG GCCCACCCTT CTACAGATAT GGGCTTTCCC TATGGGAATC CCAGCTTCCT 4080
CTCCCCATCC TAGAGGATTG GGTCACATTG TCTTTTGCCC TCTGCCTGAC ATCCTGTCTC 4140
TCCTCTCTCC CCATCTGGCA AACTCATCCA GTGGAGGTGG GCCAGCCCTG GTGTCCCCAC 4200
TTACGAGCAC GGTGACCCTG AGTAAGCCTC CCACCCTCTC TGGGCCCCAT CCCCTCCCCG 4260
ACGTCACAGG AACAACGTGG AAACGCTTGG CACACCCAGT GCCTGACCCA TGGTGAGTGC 4320
TCATGAAATG TCATCTCAAA TGTTGTCTCC TCAGGGGGCT GCCCTGGGGC CTCCATGTGG 4380
ACCAAATTTC TCTGGGCTTG CAAAACCCAG TCCCTTCAGC ACTTATCACC CTGTATCATA 4440
ACCATCCACC ATCAGGTCTG TATCCCACGC ATCCTCAGAT CCCTGTGTCT TCTTTACATC 4500
CACTGTGTTT GGCATAGGGA CTGATACAAA GGAGGCACTC AGTTAAAGAT TGTTCAATGA 4560
GTGAGTGAAT GAATGAATGA ATAAATGAAT AAATGAATGA ATGGTGCCTG AGTGGTGCTA 4620
CATTGCACCG GGGTAAGCAT TTCTCAGTGT CTCTCACTCA GCCTTCTCTG TCACCCTATG 4680
GGGTGGGTGT TCTGTCATTG CCCCCATTTC ACAGATAAGC AAACAGACTC TGCTGGGGGA 4740
GGTGGCATAA TCAGTGTTGG TGAAACCGGG TCCCAGAGCC TTTCCATGTC AGGTGAGGGT 4800
GGGTGGTTGG AGCCCAGAAC AGTGAGTGTG AGTGACCCCT TCCAGAATTT GCCTTTGACC 4860
ATTACCTCCT TGTAGAACTT CTCTCCTCCC TCGAAGACGC TGCTTCTCCC AGAACCTCTC 4920
TCATACCCCT CAGTCTCCTT CCCAAGTTCC AGCCAACCCT TGAATATTAG TGTTCCCCAG 4980
GGTTCTGCCC TCAAGCCTCA TTGTAAACTG AGGCAGGGCT GGAACCTCTT TTGTCTGCCC 5040
GGCATATTTT TCCAATCTTC TCATTTCCTG TCCATGTGCT CTGGTCAGGT ATCCCTCACA 5100
GGGCCCCACC CACTGGGAAG GCAAGTAGGC CAATTACAGT GTCCCATTTT CCTTGATATA 5160
CAGTGATTGG TTTGGGCCTG GGCATGTGAT ACAAGCTGAG CCAATCAGAG CCCTCCCTGG 5220
AACTTTCGAT GGAGCCAGTG GCGAAGCTTG GCTCTCTCCT GAAATGAGAG CTGGTAGGAT 5280
GTAAACATTT GAGCATCTTT CCTGGGACTG GAGAATGCCT ATCTGCCATG GGAGAGAAGG 5340
CCCATTCTTT TTTTTTTTTT TTTTTTGTTT GAGACAGAGT 5380