EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS139-37034 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Myotube 
Coordinate
chr3:46011260-46014570 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:46013928-46013949AAACAGAAAGCAAAACAAAAC-6.22
Nkx3-2MA0122.3chr3:46013089-46013102AAAAACACTTAAC+6.06
SOX10MA0442.2chr3:46013944-46013955AAAACAAAGAA+6.62
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01742chr3:46011006-46012330Aorta
SE_01742chr3:46013658-46014875Aorta
SE_19761chr3:46013585-46015068CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_22687chr3:46002951-46011717CD8_primiary
SE_22687chr3:46013349-46015115CD8_primiary
SE_25625chr3:46013637-46015346DND41
SE_26485chr3:46013162-46015171Duodenum_Smooth_Muscle
SE_31991chr3:46013812-46014313Gastric
SE_41214chr3:46013701-46014913Left_Ventricle
SE_42816chr3:46013692-46014954Lung
SE_48232chr3:46013709-46014424Psoas_Muscle
SE_51129chr3:46010786-46012006Skeletal_Muscle
SE_51129chr3:46013413-46014960Skeletal_Muscle
SE_52959chr3:46013739-46014900Small_Intestine
SE_59148chr3:46001905-46039214Ly3
SE_62841chr3:45980257-46038045Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr34601358746013667
chr34601396946014548
chr34601421246014510
chr34601390046014025
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH03I045969chr34601078746012330
GH03I045971chr34601347346021979
Enhancer Sequence
TGGGGCCACA AAACAGACAT ACCTGTATTC AGAGCAGGAA ACCTAACACA TGGAGGCCTT 60
GCTGGTCACT AGGCAACCAG GTGGTGGTAG GGGGCTGCCT TCCCAGGTAG AATGTAAGAA 120
AGTCAAAGCC AACAGATTCC ACCAAAGAGC ACAGCTACAC TGGTCTGTAA CAGATAAATT 180
CCATGGCTAG AGTTTTACCA TCATGGCTTT CCTCCCACTG CCAAAAAAGA ATTAAGTGAA 240
CATGTATTTC CCACTATTTG GTTTAAATTT TCCTTGAGCT TTTGGTGCCT GCCTCAGTTT 300
GTCTGCCAGT GAGGAACAAG CAGCAGTCAG TTTGGTAAAT AAGAGTCACA CTGTGCTTGG 360
GGGCTCAGCT GCCCGCTCTG TATGACACAG CAACAGTGTG GCTGGGAGGC CTGCTTCTAG 420
GTCACATAAC CAGGCCAGTC AGTGCAGATA CAGAACATTT CCCTCATGCA GAAAGTTCCA 480
TTGGATGGCA CTGCTTTAGA AATACAAAGG CTTGTGTGAT AACTCTCGTT TAGCAGGAAC 540
ACTGGAAACG AAACACATTT TTACTTCATC AGAATCATCT CCTAAATCTA AAATTATTGT 600
GTGTTCAAAC CTAGTCTCCA AAACCCAGCA ACTGCCCTTC ACAGTATCTT CCCTGAAGAC 660
AGTCACATAT GTACATAAGG AGACAGTGGG GATGCTCTTG GCAGCACTGT AACTGGAAAA 720
AGGGAAACCA AACAAACTCT ACACTGCTAT GGAAAGAGAT ACACTGTGGC TTATTCACCC 780
AACAGAATTC TCTACACCAT GGGTTGGCAT TCTTTTTTTT TGAAAAGGGC CAGATAGTAA 840
ATATTTTGGT CTTGTGGGCT ATATGGTCTC TGTCACTCAA CTGGCACTGT TAGCATAAAA 900
GCAGCCATGG ACAACAGGTG AGTAAATGGG CAAAGCTGTG TTCCACACAG CCCTCTGGGC 960
TGTGCTTTGC CAACCCAACT CTACACTTAC AGAACTCCAT GTATAAACAG ATACAAAATC 1020
TCAAAAACAA GGCAAAATGA AAAAAGCAGG TTGCAAAGGA TAGCTATTAC ATGATTCAAC 1080
ATGTGTAAAA TTTTAAAACA TTTACAAAAT AAAACTATAT ATATATACAT ATATAAAATA 1140
TTTACAAATA CACAATTAAT AATGAAAGCA TAAGATCTGA GAATGAAATG CATTGATTAC 1200
ATGATTACTT CTGAAAGGGG AACAAAGGAG AAAGGATGGC ATTGGGGTGG GGCTTTAGCT 1260
GATCTATAAT ATTTTATTTC TTAAAAAAGT ATCAGATGTA ACCAAACCTC CCCACAAGAG 1320
CCAGCTTGAA GGGGGCTCCC CACTGGGGTA ATTGGATAAA TGGGATAATG TAAGCTTCAA 1380
AATAAATAAT GACAGTGACA GAATGCAACC TATTGAATAA AATAAGAATC CATGAGTCAA 1440
TACTGCTATG AATGAATAAA TGGGGAAAAA GAAAAAGATC TTCCTTACAG TAGAATGCCA 1500
ACTAATAATG TAAAAGAAAT AATGGAGTTA GAAAATCACT CTGGTAATTA TTATGGTAAT 1560
AACTGCTTCA GGCAAGAATG ATCAAATGGT ATTAAAACTA ATACAGGACA GATTTAAGAG 1620
AAAAAAGGAT AATAATGTAA TTTCAGCATG TCTTCCCATA AGATATATAC TCATTACAAA 1680
GGAAGAAATA GTAACTTTTG GAGAAACTTG GCAAGCACCG CCTTACCCAA ATGACCAGGG 1740
TTAACCTCAT TAGTAATGAA ACAAATCAAC ACTGTGTGCC TCCAGATACA GTGTGCTGAC 1800
AAGGACACAA CAGGTAAGGT ATTCCTGCCA AAAACACTTA ACCTAAATCC AATAATGAGG 1860
AAACATCAGA CAAACTCAAA TTAAGGAACA TTTTACAAAA TAACTGGCCT GTATTTTTCA 1920
AAAATGTCAA TGTTATGAAA GACAAAGACT GAAAAACTGT TCAAAATTAA AGGGGACTAG 1980
AGAGGCATAG CAATTAATGA ATTAACAATT AATATGTGAT CTGGGATTGG ACCTTAGATT 2040
ATGAGAGACA TTACTGAGAT AATTTGTAAA ATTTAAATGA GATCTGTAAA TTAGATAGCA 2100
GTATTGTATC AATGCTAATT TTCTGATTTT AATAACTGTA CTGAGTTATA TAACAGGATG 2160
TCCTTGATTT TAGAAAATAC ACAATTAAGT ACTTAAGAGA AAAGAGGATC AAGTCTGTAA 2220
TTTACTCTCA AAAGGCTTAG GAAATAAATC AACATGTAAA TAGAAAAAAT GATGAACAAT 2280
TATAGTAAAA TATCGATAAC TAGGGAATCA GGGTGAAGGA TAGATGAGTA CTTTGTACTA 2340
TTTTTGCAAC TTTTCTGTAA TTCTGAAATT ATTTCAAAAT GTAAAAGTTT TAAAAAGAGT 2400
ATCTGGGCCA GGCGTGGTGG CTCACACCTG TAATCCCAGC AGTTTGGAAG GCCAAGATAG 2460
GAGGATAGCT TGAGCCCAGG AGTTCAAACC AGCTTGGGAG AGATGGCAAG ACTCCGTCCC 2520
TACAAAAAAT AAAAATAAAA AAAGGACATC TGAATATGGC AAAATTAAAT CCTAGTGGTT 2580
TGCATGTGAC TATCATAGTC ACCACTTTTC TCTATACATG AAGTATTTCC TAATAAAAAA 2640
TATGAATGTT AAATTTTAAA AGCCTTATAA ACAGAAAGCA AAACAAAACA AAGAACACTG 2700
GACTTGATTT TAACCCAAGT CAGGTGTCCC AGGCCTGCTG CCCACCAGCT AGGTGACTTT 2760
GTCAAGTCCC CTGATCCTCT GAGCCTGTTC CTCACACCTC CTTCTTGGAG CTCATGTAAG 2820
GACTCTGGTG GTATGTGAGT GCCACACTGG TGTAAGATAT GGCTGGCTTG ATGGCCTCAG 2880
AAAAGAAAAA AAGAAGAAAC AAAAATGCAG CAACCTTTCC TGCAACCCTT ATGTGGACAA 2940
GCTGTGGCTT TCACTTCCTC TCCTACTGCT TAGGAGCCTT CTGTAATAAC TCCATAAGAA 3000
CAGGCACGGG AAAAAGCCCA CTCCTCCCCC AATGCCCGTA ACAACAAGTG CCTTAAAAAA 3060
ATTTTAAAGC CTTGGCTTTT GCAATACACA TCTCCACTGA CTCATGCCCT GGCCAGTTAA 3120
GTTGGTTTAA GGTTGGAGCC TTCAGATGTT ATTGTTAGTC ATGATTCAAC AAAGTCTGTA 3180
AAAGGAGCTG GAATAAGAGT TGAACAGGTT TGTGTAATTT ACTGAGCAAG CAAAATTGTT 3240
TTGAGTAGAC TGGTGGCAAT CTTCAAAACT TCAAATGTCT CTTTTCCTGT CTTTTAAACC 3300
AAGCAATCCT 3310