EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-44468 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chrX:12973650-12975680 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chrX:12974393-12974413CCCCCAACCACTACCCACGT+6.06
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09612chrX:12972105-12976925CD14
SE_10462chrX:12972222-12976871CD19_Primary
SE_11231chrX:12964480-12979243CD20
SE_11864chrX:12967020-12976869CD3
SE_14440chrX:12972408-12976633CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15419chrX:12972058-12976225CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15857chrX:12970491-12974846CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15857chrX:12975338-12976613CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16331chrX:12972355-12976701CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16908chrX:12970426-12975732CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17382chrX:12964629-12977016CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17855chrX:12964647-12977052CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18339chrX:12964526-12976996CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19260chrX:12964787-12976630CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20114chrX:12964869-12976883CD56
SE_20864chrX:12972546-12976255CD8_Memory_7pool
SE_21563chrX:12973837-12976634CD8_Naive_7pool
SE_21967chrX:12967159-12977050CD8_Naive_8pool
SE_22410chrX:12965021-12976933CD8_primiary
SE_25447chrX:12972538-12976881DND41
SE_27537chrX:12973777-12975378Esophagus
SE_30940chrX:12972019-12976866Fetal_Thymus
SE_32462chrX:12972299-12977020GM12878
SE_38726chrX:12973561-12975965HUVEC
SE_39711chrX:12973722-12975601Jurkat
SE_40111chrX:12973747-12976020K562
SE_49904chrX:12973747-12975687RPMI-8402
SE_50189chrX:12973698-12975396Sigmoid_Colon
SE_52563chrX:12973689-12975337Small_Intestine
SE_52563chrX:12975401-12975694Small_Intestine
SE_53489chrX:12972019-12976836Spleen
SE_55209chrX:12973857-12975810Thymus
SE_58417chrX:12964783-13034394Ly1
SE_58905chrX:12964721-13049077Ly3
SE_60593chrX:12964761-12998409DHL6
SE_61870chrX:12964787-12998403Toledo
SE_62231chrX:12964510-13049336Tonsil
SE_66386chrX:12973722-12975601Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chrX1297379412974181
chrX1297418412974672
chrX1297485412975280
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH0XI012945chrX1296392512977022
Enhancer Sequence
AGAATCACTT GAACCCGGGA GGCAGTAGCT GCAGCGAGCC GAGATCATGC CACTGTACTC 60
CAGCCTGGGC AACAGAGCGA GACTCCGTCT CAAAAATAAA AAATAAAAAA TAAAAAAAAA 120
ACAGAGACAG CCAAAGTAGC AATGTGCCTG TGAGAGGGCC TAAGTTTTCC CCCTCAGGGT 180
AGTCTTGTCA GATGAAATAC AGGATGCCCA GTTAAATTGG AATTTCACAG AAATAAAATA 240
ATTTCTATGG TCTCAAATAT TGCATGGGAC ATATTCATAC TAAAAAGCTA TTTGTTATTT 300
ACCTGAAATT CCCATTTAAA TTTGAGGGCG TCTTCCATTT TTATTGGCTA AATCTGGCCA 360
CCCTCCCTCA GGGTGTGACG GCAGGAAGCG GGAGAGAACA CAGATGTCCC CTGTTATCTC 420
CCTGGGCCCT GCGTGGCCCT CTCAGGGAAC CACAAGCCAG GGCCAAGCCC ATCCAATCCT 480
CCTGCACCAG GAGCAGCAGA AGCCATGCCG CTAATGGCAG TCACCTCGGT GGAAGTAGAG 540
CGGGCCTGTG GCGGCGTGAG GCTTTTCTGC TCTGCTTCTG TGGAAGTGAT TATCCAATAA 600
CTAGTAGGAA TCGGGCAGTT GGCAGACGCC TCCCATGCTA TAAAGCCACA CAAGGCAGGC 660
AAGTGTGGGC ACAGATGAGA GGCTGAGAGC GGAGGTAGGA TGTCACCCCT GCCCTCGCCA 720
GCCTCATCTG TTTTCCCAGG CGTCCCCCAA CCACTACCCA CGTGGATTCT CCCTCGAAGA 780
GCCCCCTTTC AGGGCCCCAT TGGCACTTCA CTCTTGAGGG AGGCCTAGGA GAAGCTAGTG 840
GAAAGTTACT TCCACATAAA CGGTCAGACA GACGGATGAT GAAACCACAG GAAACCACAG 900
CTCCTCCCCT GCCGGGGCAC CAGGCCAGAA GCCGACCTGC TAGGCTTGGG GACCCCTTCT 960
GGTCTTGCTA GGGGCTCAGA GACCCTGGGG AAGTCCCTTA CTGTGTGTCT CATGTCTTCA 1020
CTTATGGATG GGATGCCAGC TGCCCTCTCA TGCCCTCACA GGGCTGTTGG GAGGCAAGGG 1080
TGAGCTAGCA GATGCAAAAT AATGGCAAAA TTAAGAAACC AAGTACCTGT ACAAATGTAC 1140
ACCTTTATAG TGGTTCAATT TGGCCACACG TGCTTCTACT TAGAGAAACA CCATACATGA 1200
ATATTCAGGC ACATATACAT ATCACTATAT GATCCTACGA GCAACTTCCC TACCTCACTG 1260
AAAATATGAT TCACTTCACC AAAATGTAAT GCTATGGTCA CATTCTACAA GGAAAACATC 1320
CAAAGCACAG CCACTGTAAG TGAGGATAGT TCTCAACTGG GCCTATGGTG GGCTGGCTGA 1380
CTACACTTGC AGTCTAGAAC GGGGCCTACT GCAGACTGGT CTGCAGTTAG TTTGATCTAG 1440
GGTTATGACA GCAGTTGACT TGAAAATAAC TTTCCTCCTG CCCCTTTAAG AACACGGGTT 1500
CCTTCCCTTG CAGATAAGCA GGAAGTCCCC CTCCCTCTGT CTTGGTGCTT GGTGGTGTGT 1560
TTCACTTCCT TTCAAAGGTG TTTTCTTACT AAAGAAACCC TAAGCCCAGG GTCACATTCT 1620
GTTTCTTTCA CAGGCATACT CAACTGCGTG TTGTTGATTC TGTGACAAGT TTCTTGAGCA 1680
AGAAAATACA CAGAAAAAAT GTTAAATGTA TAAAATATGA AAGTAAAACA TCAATAATGT 1740
TTTAAATATT TAAAATATAA AAGTAATGCA TGCTTCTGGT AAAAATGTAA ATGGTAGAGG 1800
TTTCTCTATT TCCTTTCCCC AGAGGTAAGC TCTTAAAATT CCCTTCCGGA AATGGTCTCT 1860
CTACACCTCA CTTTTTTATT GCACAGAAGG GATCAGACAC TATTTATGAG GCTCTTTATT 1920
TTCCACTTAA GAGTATTCTG GCTGGGCGCG GTGGCTCACA CCTGTAATCC TAGCACTTTG 1980
GGAGGCCGAG GTGGGTGGAT CACGAAGTCA GGAGTTGGAG ACCAGCCTGG 2030