EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-29881 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr4:54942090-54945160 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs192046469chr454944743hg19
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr4:54943128-54943139AATAAACAATT-6.02
LMX1BMA0703.2chr4:54942470-54942481TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr4:54942463-54942476TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:54942460-54942473AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:54942464-54942477AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:54942459-54942472AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr4:54942467-54942480TAATTAATTAAAT+6
PHOX2AMA0713.1chr4:54942471-54942482TAATTAAATTA-6.62
POU6F1MA0628.1chr4:54942461-54942471ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:54942465-54942475ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:54942461-54942471ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:54942465-54942475ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr4:54942471-54942482TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr4:54942471-54942482TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr4:54942471-54942482TAATTAAATTA-6.62
Stat6MA0520.1chr4:54943044-54943059GAGTTCCTCAGAAGT+6.13
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
SE_36740chr4:54942919-54944743HMEC
SE_38575chr4:54942256-54944913HUVEC
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr45494315354944463
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I054076chr45494270554944964
Enhancer Sequence
CATACCCCAG TGCTGTAAAC AGAGAGATAT TCATCCCATT CTATAAACTT CAGAGAAAAC 60
TTAAGTTAAA TGACTTACTC AGGCTGGGCA TGGTGGCTCA CACCTGTAAT CCTAGCACTT 120
TGGGCAGCTG AGGCAGGAGG TTTGCTTGAG CTCAGGAGTT CAAGAACAGC CTATGCAACA 180
TAGCGAGATC TTGTCTCTAC TAAAAATTCA AATAAATTAG GTAGGCGTGG TAAGGCACAG 240
CTGTAGTCCC AGTTATTTGG GGGGCTCAGG CAGAATTGCT TGAGCCAGGA AAGCCAAGAC 300
TACAGTGAGC CATGATCATG CCACTGTAGT CCAGCCTGGG CAATAGAGTG AAAATCTGTC 360
TCAAAAAAAA AATTAATTAA TTAATTAAAT TAATTTTTAA AAATGACTTA CTCAGCTCAG 420
ATGGCCCCTA AAAGCTGAAA TACAACTAAG GTCTAAGACT TCTGCTGTAG GTAAATGTTT 480
CTACTGCAAG GGAGAAAAGA TAAATAAGAA GGAAAAAATA TAAGCAATGA GAAAATAAAG 540
CTAACTGGTT TTACTCAGTA TAATTAGCAA TTGTTGAGTG GTTATTTTAA AAGTCTATAT 600
GCTTCCCCAA AGATTTTACA ATCCCATGAT GATATTTAAG AAACTGGGCA TTTCTCCATC 660
AGCCAGGAAG GACATTGGTG TTGAGGACAA TAACTACCAC GGCTTCCAGT GTTTTGAAGA 720
AATTTCAGAT GCATAGCCTT TTGGCCAGGT GTCTGTGATT TCATATTGTC AGAGCATTTC 780
TTGTAATGCT GGGGGTTGCA GCTCTCTTAA AGTTTACATT GCTGAACCAA GAAAGCAGAT 840
ATATGTAGAT TTCTACAGAA ACTATGATTC CATGAAAGAT TTTGAGGAGG TGAAGAGGGC 900
TGGTACCTTT CAGAGTGCAA AGTGATTTTG GAATGTTAAG AATGTTTTGG GATTGAGTTC 960
CTCAGAAGTT TGTCACTGAC CTATGTTCCT GAACTATGAA ACATGAATAT GTGGGCTAAG 1020
GAATCATTTG TACTGATAAA TAAACAATTA AAAATTTAAA AAAAGAAACT GAGGAAACTG 1080
GGTTAACTCA ACAATTGTCA TCCTTGTTAT CATCTGTGTA ATGCAGCTAA TTATAGTACT 1140
CATTCATAAA GTTGTTGGGA GGATTAAAAT GATACAATAT ATGACAAGTA CTCAACGTTA 1200
GTTGTTATTG AGGGTGTTGT TATTTTAATC AGGATGGACA AAATTCTAGA TAAAGAGTAG 1260
AAGATATGCG TTTTCATGCT GTTATAATCA GCCAACTATA AATTCTCTTC CTTCAGTTCT 1320
TTTTTTCTAG AGAATGAAGA CAATATTCCT TTCTAGTTGC CTCCTTCACA GAAAAAATTC 1380
ACCAGAATGG ATTATGTTCT CAGCACCGTC AAAGCCTTGT AGAAACACAA GAAGATCCTG 1440
CAACCATTTT TCTCTTCCAG TCTTTCTCCT TGCCATTCTG AGCAGAGCCA TATTGCAGTG 1500
CAGTGGAAAG GGTATATGAA TGGTCATTCA TTCAGACTTA CATGGCTGTC TGGCAATTTA 1560
AGAGTTCAAT GGCTGAACTG GAAAGAACAG CCAGCATGAT TTTATTGTTT TCTGAGAATC 1620
AAATGAATAG TTCACACTAT CTATGCACCT ATCATCTAAG GAACAGACAG GTTATTTTGC 1680
TGAGGATGAG CATAGTCACT AGCCTGTAAG AGGTTTCTCC ACAAGAATAT GCTTCCTCAA 1740
AATGTACTTG CAAGGCTGTT GAGGCTACTA CTCACCTTAG ACATGATCCC ACTTTGGCTC 1800
AAAGATCCCA CTCTGCCAGT GGTTCTGTTA GGTCTCTATA ACTTCATTTC TATAGCAGCC 1860
CTCCTGCCAC CCGGCTGCCA ACTGTGAGGA CCTGTTGTTC AAGGGCGTAT CACTTGAGCA 1920
GGTGAGCATT CTTATTAGTA TCACAGAGCA GCTATCATTC ACAATTACAG CATGAATGTT 1980
GACTAAATCA GAGACCATTC AAACCCACCT ACACCCTGTG ACATCAGCAT GTGGTTCTAT 2040
TCTGCCCTGC CTGATTTTAG ATGCTTTAGG AATGATGTAA CTTGGCAAAG AAATCCTAAG 2100
TCAAAATTTT TTTGATGATA ATCTCAGATC AACTGAGAAT GATGCCAATC AACCCATGAA 2160
TGTAATGTGT CTCACATGTG GGATTCTATA ATTAGTGCTT ACTAATAGAG GTTTCTTCAA 2220
GTTACTGAAA TGAGTTTACA AACTTTAGGT AGCTCAGGAC CCTACCCTCA TGTATATGTG 2280
AGATTTCATT TTTATAAATG CCACTGTCAA AGGGTCAGAT GTTGCTTTTT ATTCTCGTTG 2340
CTAGGATGGT CAAAATCAAC ATTTTGATGG TTGTGTTGAA CAGAGCAGTC CAGTCAGATT 2400
TAATCCAGTC ATATTAGGAT CATGCCATTA GAGAACAGTT CCACAATCTT TTCTAATTCC 2460
TCTTTTGTTT CTGGATCATA ATTAAAATAA TATAGGAACA ACCTTATTAA TAAAGCTTGA 2520
ATTAGTTTGT CTGTATTGAG CTGGCCTTTC ATTTTTCTGT CATACAACCT TAAAAGATCT 2580
CTCATGATTT ATTTATTTAT TTATTGTTTT GAGACAGAGT CTGTCTCTGT CCCCAGGGCT 2640
GGAGTGCAGT GACACGATCT TGGCTTACTG CAACCTCCGC CTCCTGGGTT CAAGCGATTA 2700
TCTGGCCTCA GCCTCCCAAG TAGCTGGGAT TACAGGCATG CACTACCACA CCCCGTTAAT 2760
TTTGTATTTT TAGTAGAGAT GGGGTTTCGC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CAAACTCCTG 2820
ACCTCAAGTG ATCTGCCCAC CTTGGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACATA AGTGAGCCAC 2880
CGTTCCCGGC CTCTCTTATG ATTTGTTAAC TATTATCTTT ATGTTTTCCT ACATGACATT 2940
AAATTATACA ATCTTTGAAA TTTTACTATA TACTTTCTTT TCCATGTTAG TGTTAAAACT 3000
TCCCCTTACA GAGCCGGGTG CGGTGGCTCA TGGCTGTAAT CCTAGCAATT TGGGAGGCTG 3060
AGGCAGGCAG 3070