EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-28248 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr3:149118400-149120720 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:149119042-149119056CTTGTTTACCTTTG-7.03
IRF1MA0050.2chr3:149120522-149120543AAGAAAAAAGTGAAAGCCTAT-6.12
Lhx3MA0135.1chr3:149119706-149119719AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr3:149119705-149119718AAATTAATTAATT+6.92
MEF2CMA0497.1chr3:149119336-149119351TGTTATTTTTAGAAA-6.17
POU6F1MA0628.1chr3:149119707-149119717ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:149119707-149119717ATTAATTAAT-6.02
TFAP4MA0691.1chr3:149119330-149119340ATCAGCTGTT-6.02
ZNF410MA0752.1chr3:149118494-149118511TGTATCCCATAATATAT+6.24
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_27098chr3:149118857-149119346Esophagus
SE_27098chr3:149119605-149120202Esophagus
SE_28499chr3:149118460-149120176Fetal_Intestine
SE_32147chr3:149118866-149119456Gastric
SE_32147chr3:149119595-149120590Gastric
SE_33885chr3:149118040-149120708HCC1954
SE_34635chr3:149118220-149120867HeLa
SE_38218chr3:149118769-149120838HUVEC
SE_45806chr3:149118827-149120740Osteoblasts
SE_47116chr3:149118550-149120863Panc1
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr3149118612149120600
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I149400chr3149118137149120952
Enhancer Sequence
AATACAAAGA AATGATACAT ATTTGAGATG ATGGATGTGC TGATTACTCT CATATGATCA 60
TTATCCATTG TATACATGGG TATTGAAATA TGACTGTATC CCATAATATA TACAATTATT 120
ACATGTCAAC TAAAAATAAA AAGAAAAGTA AAAAATAAAA ATTCAATCAT GTATACATAG 180
CACTCAAGGG CATATTTGCT TAATCCTTAG AATGACATTT TGTTCAGTGC AAAAGAGTGA 240
TGCAAGAAGT TAAAAGCAAT GTGCTGGGTA TACTCCTTAC TAATAATACT AACAATACTT 300
CTATTTATAT AAACTTCTGT GGTCTTCAAA GCCCTTCTAA ATGTATAACC AAAATGTTGA 360
GAAAAGGCTA TATGGTTGTT ACATTTACTG ACCAGAATTG AGCTATTTTG TTTGATGCTC 420
AAAACAATGT TTGATATAGG TAGAGAAGGT GTTTTATTAC TTCATCGTTA TTATTATTAT 480
TTTACAACTG GAAAAACTAA GAGAGTTCAG ATGACTTGCC CAGAATCCAG AAAAAGTAGC 540
AAGACTGGAA GTAAACCTAT GTTTCCAATC CTAGTACCTT TTCTCTCCTA ATATATCATA 600
CAGTTTCTAA GATAATTATG AAAGGTGATT GACTTGAAAT CACTTGTTTA CCTTTGAAGA 660
GAGATTTTCT TTCCAGATCT CCAGTTGCCT GTCACTACCC TCTGTCAAGA CCCTTGGAGT 720
CATGACTAAC AGGAAGGGAG CAGGTGGCAG CGTGGCCACC TGCCATGCAG AAAGACTGGG 780
TCACTTCCTG TTGGTAAAGG GTTTCCTGGT TCAGGTTTGT TAGGCATTCT AAAATGGAGA 840
GAAAAACAAA TGCACCTCTA AAGTACATGG AAAAATAAAC ACCAAAGTCA ATGTTTTTGT 900
GTTCCAAATG AAAATGTCAC TCTAAAGAGA ATCAGCTGTT ATTTTTAGAA AGAAAGAATA 960
AAATTTCAGC TCTGTATACC AAAACTATAG CCTCATCCAT TAGGGACACT GATGTAGAAG 1020
CAAGTAGAAA CTATCCAAAG TCTGCAGTTC CTACCTGACT AGGTAATGCT TAAATAAATA 1080
ATCAGTTCTC ATCATGCAAC TCAATGTTTA GCTGAGTCCA AACATACTGC TGCCAACATT 1140
TTAAAGTCAA CAACGATATC TAAAATAAAC ATAGGCTGAC TAACACACAC TGGTACTTTA 1200
ATGAAAATAT ATTGTGAAAT AGCTCCTTGC CAATAGAAGT TCTTGCGCTC CTTCTTTGGA 1260
TAACTGTGGA CTATTCAACA GAATGTTAAG CCACCTATAT TTTTTAAATT AATTAATTCA 1320
ACAACCTCCC CCCTTTTTCG AGCACTTACT CTTAAGAATT TGAAGGATCT GAGATTTTAG 1380
CTTATTTTAT CCTATTTTGA AGCTATTTGT TAGCTTGCCA GTTTCAAAGG AACTGGTAGA 1440
AGTCATGAGA TTCTTGGGTC AGAGACAAGT GACTTTGTTA CAGCAGTAGC AGTAGCCAGT 1500
TTCAGCATTT GAGAGGAACT CTGAGCTTAG GGAAATCAGG CCTTTTACAC CGAACAGGAA 1560
GCATGCCTAC TCATTACTCT TGAGACACTT TTTCACTCTT CCAAGGTGGT TTGCTACACA 1620
AACACCCTTG AAAAATAGTC CAGAACAAAG TCAGTCAATC CCTTTACTCA TGAGACATGT 1680
AGAAATGTGA GAAATCCAAG GAGAATTGTC TCCAGACACT TACTCTCTAC CAGACATTGT 1740
AATAGATGCT AAACATACGA AGATAGAAAG AAAGAACATG CTACCTAATT CTTGATAAAT 1800
ATAATAGTGC TAATAAATTC AACTGACATT AAACTCTCAA GTTCTGTCCA TAGAAAATGT 1860
AGGAAGTTCA GTTTGTTTAG TAACCCTCTT TAAATTCTTC TAATCAAGAA AATTGGTGAA 1920
GTATTCACAA GGCAGAAAGC CTGCCTTTTC ATCACCAGCT TGTTTGCCAG TGAAGTGTTG 1980
AAGTACTATG TGTTGGCAAA ATGGAACTAA CGCATTACAA TTACATTAGA GTGCAATATC 2040
TCCGCACTTT CCAAAGTTTT CAGTCTGTGG CATAATGATC AAGATGACAT AAAGGCAAAG 2100
GTCACTGGCA GGGGAAGTAG ATAAGAAAAA AGTGAAAGCC TATAGAAAAA TATTATCAAG 2160
GAAACCTTTC TTAATTGTAC TGATAGGACT TTGCTATAAA AGAAATTAGA ATTAAGCCAC 2220
ACCAAAATTC AGAGCAAAAC ACCCGACTCT AGCAAATGCA TGAGTTACAA ATGCCTTTAG 2280
AATACAATTT AGAGGTGCGT TTTTCTTTTT TTCCTAAAAC 2320