EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-26492 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr3:42101230-42106690 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:42102437-42102449GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:42106569-42106581AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:42106573-42106585AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:42106577-42106589AAACAAACAAAC-6.32
Klf12MA0742.1chr3:42103424-42103439AACCACGCCCTTCTA+6.14
Klf1MA0493.1chr3:42104645-42104656AGCCACACCCA+6.14
RREB1MA0073.1chr3:42101832-42101852TGGGGGGTGGTGGTGGGTGA-6.06
RREB1MA0073.1chr3:42102835-42102855CCCCCACGCACACCCACACA+6.07
RREB1MA0073.1chr3:42101825-42101845TGGGGGGTGGGGGGTGGTGG-6.11
RREB1MA0073.1chr3:42102802-42102822CCCCCACGCACACCCCCCCA+6.39
RREB1MA0073.1chr3:42101835-42101855GGGGTGGTGGTGGGTGAGGG-6.51
RREB1MA0073.1chr3:42101829-42101849GGGTGGGGGGTGGTGGTGGG-6.8
RREB1MA0073.1chr3:42101822-42101842CGGTGGGGGGTGGGGGGTGG-7.1
ZfxMA0146.2chr3:42106304-42106318GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 30             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00063chr3:42100849-42110891Adipose_Nuclei
SE_01171chr3:42103304-42103870Adrenal_Gland
SE_01796chr3:42102629-42105918Aorta
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SE_10226chr3:42100720-42101830CD19_Primary
SE_10226chr3:42102802-42104135CD19_Primary
SE_10922chr3:42092287-42111479CD20
SE_25861chr3:42102470-42106148Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26989chr3:42102629-42105906Esophagus
SE_29565chr3:42100077-42111501Fetal_Muscle
SE_36966chr3:42100886-42106777HSMMtube
SE_38230chr3:42102410-42105900HUVEC
SE_40683chr3:42101584-42106077Left_Ventricle
SE_42248chr3:42101660-42105904Lung
SE_44342chr3:42100992-42106487NHDF-Ad
SE_44918chr3:42102813-42106315NHLF
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SE_48670chr3:42101702-42105961Right_Atrium
SE_49555chr3:42105146-42105862Right_Ventricle
SE_50309chr3:42102641-42103829Sigmoid_Colon
SE_50309chr3:42103956-42105894Sigmoid_Colon
SE_51166chr3:42100863-42106373Skeletal_Muscle
SE_51885chr3:42102255-42106027Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52625chr3:42102688-42105862Small_Intestine
SE_53513chr3:42101516-42105919Spleen
SE_54717chr3:42102690-42105960Stomach_Smooth_Muscle
SE_62800chr3:42053253-42125059Tonsil
SE_63663chr3:42102277-42106171HSMM
SE_65044chr3:42102493-42106259NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr34210147842101669
chr34210264842102781
chr34210280842103873
chr34210520042105820
chr34210216542102741
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I042057chr34209869342111283
Enhancer Sequence
CTGTGATGGA GGCTCTTCTA GGCAGGATAT AGGGTAACTT AGATTCTTGT TCTGGCTTCA 60
CCGTTTGCTT GTGGTACTTC AGTTTCTTCC TCTGTGCAGT GGGCATAATA ACGCCTGCTC 120
CTTTGACTTC ACAGATCATT GAGGAATGAG TGAGATTATA TAAAGTAATA TACTTAGTGT 180
GGACAATGAT ACAATAAAGC ATGGAGGACA GTGTTACAGG TACATAGCAA TTCTGAAAGT 240
GCTTGTTTGA TATTAATCAC TTCTTTCTTT CCCCCTGCAT AAGAAATGTC TTTTCTTTTT 300
AAAAAACATT CTGTTTTTTT CCCAATGATT CCAGAGAACC ATGTCAATAA GACTCACAGG 360
GGAAAGCCCA TAGAAGGTTT TCAAGAAATC CTGTTAGCAG TGAACAAAAC ACACAAAAGC 420
TCCATCCACA TGGAGCTTAC ATTCTATTTG GGAGAGAGGG GAAATAAACA AATGAGTATA 480
TTGTAGTGTA TCAGAAGGAA TAGCTTCTAA GAAGAAAAAT AAAGGAAGGG GATGCCGAGG 540
GGTTGAGATG TCAGTTAAGA TATGAAAAAA GACAGAGATG GCTACAGCAC CACGGTGGGG 600
GGTGGGGGGT GGTGGTGGGT GAGGGCGGGT GGTAAAGGGA GATTCCAGGT AGAGGGAATA 660
GCAGATACCA AGACCTCTGG GTTCTGAGGA GCAGGGAGGA GAGACGGGGC AGCTTTGAAA 720
CTGTGGGACA GGAGAGTAAT GTAACGGTAG AGGAGTGCCT CTTTTTCCAG GCGTGGTCCC 780
TTAGCAGTCT CACTGGTTTA TAGTCTCAGT CTGTCATTGG GAACAAGCCT TAATGTGAAT 840
GTTGTCATAT TAATATCACA CCTGTTTGTC AGGTCATTTT TGGCTGCTTT TTTTTTTTTT 900
TTTTTTGAGA CGGAGTTTTG CTCTTGTTGT CCAGGCTGGA GTGCAGTGGT GCGATCTCTA 960
CGCACTGCAA CCTCCGCCTT CCTGGTTCAA GTCATTCTCC TGCCTCAGCC TCCTGAGTAA 1020
CTGGGATTGC ATGTGCCCGC CACCACTCCT GGCTGATTTT TTTTATATTT TTAGTAGAAA 1080
CGGAGTTTCG CCATGTTGGC CAGGCTGGTC TCGAACTCCT GACCTCAGTT GATCTGCTCA 1140
CCTTGGCCGC CTAAAATGCT GGGATTACAG GCATGAGCCA CCGCGCCCGG CCTTTTTTGT 1200
TGTTGTTGTT TGTTTGTTTT GCAGTTTTTT GGGGATCTCA TCAGGTTCAT TTAGGGCTAA 1260
ATAAACTGAC CCTCCAAGGG ACTTAATGAC TTATGCTGAA GGACCCTGTG AAAACCTAAA 1320
TGGTATGCTT CAGGCCTGGA AGCTGACTTA AAAGTGCATT TTAAAAAGTT CTTTGTTATG 1380
GTATAATTTT AGATTTATAG AAAAGTTACA AAAAGTGTGC AGAGTTCCCA TACACCCTTG 1440
ACCCAGCTTC CTCTAATGTT AACATCTTAC GTAACCATTG ACCTTAAGTT TTCAAGTGAT 1500
GGGTGTGTGT CTACATCTGT GCATGCGTGC ATGCACACAC CCACCCACAC ACGCACCCCC 1560
CCATGCACAC CTCCCCCACG CACACCCCCC CATGCACACC CCACCCCCCC ACGCACACCC 1620
ACACACACAC ACACAGTGCC AGGGAGGCAG CCCTGTTGTC TGTCAGCCTT TTCATAGCTC 1680
ATCATATTTA CACCTCCTGG ATACAGAGTG GACCCTGGCC ATGGCAAAAG CAGGCAAGGA 1740
GCTACTTTGA AGCTGAAGTT CCAAAGCAGG AGATACGGGG AAAACAATCA GCTGCTACAG 1800
AGCTCTGAAT ATCATGTGAA CCCAGTGCCA CTTGAACTTT ATTTAGTAGA AGATTGGCCT 1860
GAGACACTTA ATATAGAAAT CCCAGCCATC ATGTGAGAAT TCCATTCCGT GCAAGTACAA 1920
ATACAAGAGA ATTTGGGAAT GTTCACTTTG GCTTGTGTTA TGCTAAGTCA TCTCACTTCT 1980
TTCCCATCTA ATTTATGAAT CAGAACACCA ACAATATATA CCAGTTTATT AACTAATGAA 2040
TCAGGAGCAA CAAGCCCATC CATCTACCCA TCTGCATGGA TTTGAGCTTT ATTCAGTAGT 2100
ACTTTGCCTT GGAAATGGTC CAGGTTATTT TGGAAACGGA TATTCAATTC AAATGATGAC 2160
AGCCATTGGC ACTCACTCTG GGGCTCAGGA GGGAAACCAC GCCCTTCTAG GCTATTGCTG 2220
ACGCCATCCC TCCAGAATGC AGCTGTCTCG GGTGGAGGCT CTGGGACAGC TGCTTCTGGC 2280
TAAGGCTGCC CATTTGGGAG AAGGGGACAT TGAAATTGCA AGAGGAGTCA TGGCTGAGAG 2340
AGATCCTGCT CATATGTGTG GCAGGAATCC TACAGCAGAC AAGATTTTGA CAATGGACAA 2400
GTCACTCACC TTCTAACATG TCCACTTTCC TGTGGATGAA GTGGAATTTT CCAAAAGCAG 2460
GAGTACAGTG CTGCCTGTTA CTCTTGTGAA ACTCTCAATC TCTTGGTGAA CTACTGGTAT 2520
TATAAAGGAG TGCCGTATTA GCGGAGGTGC AAACAAAATG CTTCAGTGCT TTTGATTCCT 2580
TTGGCTAAGG ATAGGTCTTA ATTTTGAATA TTTTTTTTCC TACTAGGGCC AATTTCAAAA 2640
AAAATCAAGT TTGCATTCAC ATGTTTAATA ATTCCAGTTA TACTTTTAGC ATTAAAAAAT 2700
ATGCTTGTCT TGGAGACTAT TTTTTAACAT TTCAGAATCT ACAAAACCAG CTTAAATACA 2760
GCATGACTAT ACTGCTACCC CTCTGAAAAA CTTTGTATTT GAGTCCTGGC ACCTCTGAGG 2820
CTTCTTCATG TTGGTGGTTT TTATTTTCCT TTTCACTGAC CATGCATGCT ACTCTGTGTG 2880
AAATAGGGTT TGTGAAATAG GTTGTGTCAG CGCTATCTGT ATGCCTTAAA ACAAAGTATT 2940
ATGCTGTTGA GAAAAAGCAA AACAAGGATA GGTCTTTAAC AAAGACTATT TAGGCTGCTG 3000
CTGCCTAATA TAATTCTCAT CAGTGAAGTC TTCACTTTGT TGGAAAACAG TGCCTGACAC 3060
TCCCTTGTGT CCTGCCTGGT GGGACTTCCC TACAGCCCCT TGAGCTGTTT TCCAGGCTCT 3120
GCACTGCAGT GAAGGCGTGT TTGTCTTATG AGGGGATGTG CACTGCACTT TCACCTGTAT 3180
TACCTCACTC CCCAGAGCCA CCTTAGGAGA TGGATGACAT TATCCCTGTT TTTGAGATAT 3240
GGAGGACGTG CTTCAGAAAT TTTAAGAAAC TCAAACAAGG TCACACTGGT AGTGAGTAGT 3300
AAAGTCAGAA TTCCAGGCCT GGTTTTCCAG TACCAAATCC AGTGCTTATT CTCACAGACC 3360
ATGGGTCAAA TCCATCCCAC CGCCTGCTGT TATAAATAAA GTTTTATTGG AATACAGCCA 3420
CACCCATTCA TTTCCATATT TTCTGACTGC CTTCCAGCTA CAACTGCGGA ATTGCAACGG 3480
AGACTGTATT GCCCTCAAGG CCTGAAATAG TTATTATTTT CCGCTTCGCG GGAAAAGTTT 3540
GCCAAGCCCT GCCCTAAGCC ATTGCTGAAG GAGCATCCGG GTTTTGTCTG TCAGTACATT 3600
CCCCACTGCC CCTGCCCAAC CAGGAATGCC TTTGTGATGC AGTTCTTGCT CTTTTGTAAA 3660
GGTGGGGCTG GGTGTGGTGG CTTGTGCCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG GCTGAGGCGG 3720
GCAAATCAGT TGAGATCAGG AGTTTGAGAC CAGCCTAGAC AACATGGCAA AACCCTGTCT 3780
CTACAAAAAT TACAAAAACT AGCCAGGCCT GGTGGGACAC GCCTGTAGCC CCGTCTCCTT 3840
GGGAGGCTGA GGTGGGATGA TTGCTTGAGC CTGGGAGACA GAGGTTGCAG TGAGCTGAGA 3900
TTGTGCCACT GCATTCCAGC CTTGGTGACA GAGTGAGACT CTGTCTCCAA AAAAAAAAAA 3960
AAAAGTGGTG GGAGCCACAC AGTGAAAAAA GCATATGTGC CGGGGCAGCC CAGCTGTGCC 4020
TTATTGTCTG CTCTCTGGCC CTGTGGTGGG CTGAAAGTTC TTACCATACT CCCATCCAGA 4080
TGTAGAGTCT GTAACCTTTC CCCTTGAATC TGCGTTGGCC CGGTGATGTA TTTTGACCAA 4140
TAGTTTGCGG TAGAAGTGAC ACTGTGTAAC TTTTAAAATT GAGTCTAAAG AGATCTGTAA 4200
TTTCTGTCTC ATACTTTGAA CACCCCTTCT TGGGATCCAG CCAGCATGTG AGAAGCCCTG 4260
GTGGCCATGT GGAAATTATA TCCACGTGAG AGAGAGGCCC AGTCATCCCT TTCAGAGCAC 4320
TAGAGATGGG AGGGAACCCA TTTTACATGC CCAGCCCTTA TTACTATCTG ACCTGAGGGA 4380
GATCACAAAT GCCTTCTGTA TTGGGTGGTA ATGATACATC ACAAAAATGC GAATGCTCGC 4440
AGCCAGGCGG GCGCTGTGGC TCAAGCCTGT AATCCCAGCA CATTTCAAGC CTAGGTGGGT 4500
GGATCCCTTG AGCCCAGGGG TTTGAGACCA GCCTGGGCAA CGTAGCAAGA CCCTGTCTCT 4560
ACCAAAAATA CAAAAATTAG CCAGTCTTAT AACCCGGTCT CAAATGAATA AATAAATAGA 4620
GGGATACAAA TTAAAAAAAA AAACCTTTAA AAAGAATTCT CTTACAGTCT GATGTCAATG 4680
TTGGAAGATT AAGAAATAAA ATAAATTTTT GAACTTGCTG TCTGAGTTAC CCAAATGTAA 4740
TTTCTAAGAA CTCTAAAATA TTATCACCTA GAATCTAGGA AGCTACCATG TGATCCTAGA 4800
CTAATAGCAT AGAATGAATG TTGCTTCATT ATGAACTTAT TATGGAAATA CAAATACATA 4860
ATAAATACTT TAAGCAGACT ATAGACTGTT TCCTAAAATA CTGAAGTTAA AATATTTGTG 4920
CTAGACTTCC TGATATGAAA AGCTTTTCTC ATAATGATTT GTGAATTAAT TTTACCATAG 4980
AATAGTAAGG GTATATTTTT AATGGGTTAA GTAGCTATAC TTAAAAAATA CATGCCAGGC 5040
ATGGTGGCTC ACACCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC GAGGCGGGCA GATCACGAGG 5100
TCAGGAGATC AAGACCATCC TGGCTGACAC GGTGAAACCC TGTCTCTACT AAAAATAACA 5160
AAAAATTAGC CAGGCATGGT AGCAGGTGCC TATAGTCCTA GCTACGCAGG AGGTTCAGGC 5220
AGGAGAATGG CGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATGGTGTGAA TCCGGGAGGT GGAGCTTACA 5280
GTGAGCTGAG GTCGCGCCAC TGCACTCCAG CCTGGGTGAC AGAGCAAGAC TCTGTCTCAA 5340
AACAAACAAA CAAACAAACA AAAATTAGCT GGGCATGGAT GCACACACCT GTAACCCCAG 5400
CTACTCTGGA GTCTGAGGCA CGAGAACTGT TTGAACCTGG AAGGTGGAGG TTGCAGTGAG 5460