EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-17440 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr18:2958180-2960640 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr18:2960385-2960406AATAATTTTCAGTTTCCCTTT+6.19
IRF1MA0050.2chr18:2960391-2960412TTTCAGTTTCCCTTTCCCTTG+6.65
IRF1MA0050.2chr18:2960336-2960357ATCTAGTTTCTGTTTTGCTTT+6.77
IRF2MA0051.1chr18:2960390-2960408TTTTCAGTTTCCCTTTCC-6.41
Lhx3MA0135.1chr18:2959845-2959858CATTAATTAATTT-6.54
POU6F1MA0628.1chr18:2959846-2959856ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:2959846-2959856ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 35             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00574chr18:2955664-2962654Adipose_Nuclei
SE_09781chr18:2957955-2964204CD14
SE_10621chr18:2956157-2963999CD19_Primary
SE_11211chr18:2955421-2965599CD20
SE_11888chr18:2954270-2965406CD3
SE_13797chr18:2959029-2959837CD34_Primary_RO01536
SE_13797chr18:2960020-2960860CD34_Primary_RO01536
SE_14570chr18:2955417-2965583CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15580chr18:2958273-2965388CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16149chr18:2959566-2962287CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16392chr18:2958193-2965256CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16996chr18:2958261-2964094CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17424chr18:2953224-2965618CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17870chr18:2953882-2974054CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18346chr18:2955510-2974150CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19436chr18:2954812-2965462CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20084chr18:2955732-2964153CD56
SE_21011chr18:2958230-2964978CD8_Memory_7pool
SE_21798chr18:2959152-2964179CD8_Naive_7pool
SE_22207chr18:2958088-2965485CD8_Naive_8pool
SE_22362chr18:2953866-2965617CD8_primiary
SE_26140chr18:2958139-2962798Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28431chr18:2959830-2962157Fetal_Intestine
SE_29294chr18:2959203-2961178Fetal_Intestine_Large
SE_31871chr18:2959820-2960346Gastric
SE_32704chr18:2956087-2964115GM12878
SE_46307chr18:2958145-2960053Osteoblasts
SE_46307chr18:2960219-2962620Osteoblasts
SE_51026chr18:2959588-2960299Sigmoid_Colon
SE_52825chr18:2958971-2960373Small_Intestine
SE_52825chr18:2960375-2962329Small_Intestine
SE_55616chr18:2958976-2960334Thymus
SE_58874chr18:2954099-2995404Ly3
SE_59888chr18:2955879-2985795Ly4
SE_62302chr18:2955378-2999752Tonsil
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH18I002955chr1829552532963963
Enhancer Sequence
GAAAAAAAAA CTTTTATAAA TAATCAAGTA ATCAGCTTTT TCTGATATCA ATAAATTTTA 60
AAATATCAAG TACACATTTA CCTTCTAAAA GTAAACTCCT AAGTTACTAA ATTTACTGGG 120
AGTACTGCTG TTCTACCAAA CAATTACGTA TCAATGGCAG TGGGAAAATT ATTATACTAC 180
ATCTCTCTAA ACAGTGGTTT TAAGGTGGTC ATGATTTCAA ATTCACTTCA TAGGTACACC 240
CGTATTTGAA AATTTGGGGT CTTACTTTCA CATCAATGGC CAGCTTTCCC TAACCCAAAC 300
TGACTTAAAA TAAGACAAAT AGTTAATGCA AATTGCCAGT GTATCTCAAA GTAGGCATGA 360
TTTCAGTTTT ACTCTCACAG TTTTTCAGTT TTCTCACAGG AAAGCTGTTT TGGTAAATCA 420
AATGGCCAAA TTTCCTCCCA AACATATTCT TTGGGTTTCT GAGATACTAA GGGAGTAGGA 480
GGAAAAAAAT TCTCTTTTCC TGTGTCTCAT GAGTACATTC CTATTAAAAA TGCAACGTTT 540
TGACAAGATA GTAACACAAC GATTGTGTAG CTTTTGCACA GGAATTGTAT TATTTCCTAA 600
ATTAGAGGCA CACAGCAAGC AGGAAAAGGT GTTTTATCTA CTTGGTCACC ATTTACAGAT 660
GCATACATGC TTATAAATAC ATCTGCCTTC AGGTTCCATT TTGAAAGGCC AGACACTGAT 720
CCAATGTGAT AAAAAACAAT CTCAGCAAAA AAAAAAAATA ATGATGATGA TACCTTATCA 780
GCAGTTTTAC AATAGATCCA TACACAACTA ATGGGAAATT TCAGTTTGTT GCCAATTCCC 840
CCAGAACAGG TCCAGTCTGA AAGTACTATT GGTGTTACCA CAAAGAAAGA AAAAATTTCA 900
GAGAACCTAA ACTATGGCTA AATAACACTG TTTTGCAATG GAAAGTTTCT AAGTCCCTAA 960
GTAAACTGCA ACTGCTTTTG CTTTCTAAAG GGTGACTCTG AACAGAGGCC AGACCACACA 1020
AGCCCTGCTA CCCTGAAATG TGGTTCTCCA GTGGAAACTG ATTTTGTAAT ACCTAGAAAT 1080
GAGATGTTTT TCCTGGAGGA AAAAAAGAAA AAGAATATCT AGTTTTGTGA AATCCATTTT 1140
CTTTCACTCT CAAAATAACA TTTAAGTTTA ATTAAATAGA GGGAAATTTC TATTTAAAGC 1200
TCAGCTATAT AAAATAGCAA AAAGCTGAAA ATAAATGTTT TCGACTTACA CCAGTGGTCC 1260
TCTACCACAT ACTTTTAGGT CTGTGCCAGA AAATGGTGAG GCTCTTTTGT TGTGCTTTAA 1320
AATGTTGACA AAGCCTTTCT ATGTTATTTA AGTAGATACT GCGAGGCAAG AATAGAAAGA 1380
GAAATCTGTG TACCTGCCAA GTGTTATTAC TAGCTCTGTT TTCTAATTTG ATTGACATCA 1440
GATATACTAG CAAAACTTCC AGCTGCTCCA TAACCTGAAG AGGATAAGAA AAACCTACAC 1500
AAATATCTTC TTCCTGAATG AATCTTCCCT AAAACAAACA AAAGTCAACC AGCCTATGGT 1560
CTGTTGGTTA GCATTTCAGT CAAATATGGG GACAAGTCCT GGTATCAACA ACAGAATTTA 1620
GATTACAAAA GTTTTTACAG CTTTGTCAAA ACAAACAAAA TGTGGCATTA ATTAATTTCC 1680
TTTAAAAAAA AAAATATGGC CAGGTGCGGT GGCTCTACAC CTGTAATCCC AGAACTTTGG 1740
GAGGCCGAGG CCGAAGCCGG TGGATCACTT GAGGTCAGGA GTTCGAGACC AGCCTAGCCA 1800
ACAAGGTGAA ACCCCGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAAATT AGGGGGGCAT GGTTGCACGT 1860
GCCTGTAATC CCAGGCACTT GGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TCGCTTGAAC CTGGGAGGCG 1920
GAGGTTGCAG TGAGCCAAGA TCACACCGCT GTACTCCAGC CTGGACAGCA AAGCGAGACT 1980
CCGACTCAAA AATGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTCT 2040
TGATTATACC CACCTATTCC ATTTACAATT AGTATGAAGG TATTAGCCTA AGTATTTAAA 2100
AATACTATAT AAGGTAAAGG AAATTTTTCT TTTTCTAAAT ATGTCTAAGT TCCCCCATCT 2160
AGTTTCTGTT TTGCTTTTCT GAGTTGCAAC ATGTAAGATT ATTATAATAA TTTTCAGTTT 2220
CCCTTTCCCT TGAAGAGACT TCTGCAGTCG AGCTTTGTGG TTTTCAAAGT AACTTCAAAA 2280
GCAATACATA AAGGTTGACT TCTCGTAACA TTGTCTCAAC ATCATTCAGG TTAAAAAAAA 2340
AAAAAGGCCT AGAAAACTCA CAATAGCGAT TTATTCATAG AGGATGACTT TTCTACTCCT 2400
TGAGGACACT CACTCACTTT CTCTTTGAAT CTCAGGATGA CTTTTCCTCT CCTTGAGGAC 2460