EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-03801 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:230238020-230244020 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3811489chr1230239259hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:230242907-230242918AGAGATAAGGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:230239421-230239442AAACAGAAAATGAAAGAACCC-6.65
PLAG1MA0163.1chr1:230241093-230241107GGGGCCCACTGGGG+6.86
RREB1MA0073.1chr1:230243379-230243399TGTGTGTGTGTGGTTGGTTG-6.06
RREB1MA0073.1chr1:230239920-230239940GGTTCTGGGGTGGTGGGGGG-6.25
RREB1MA0073.1chr1:230243383-230243403TGTGTGTGGTTGGTTGGTTG-6.86
TFAP2AMA0003.3chr1:230242926-230242937AGCCTCAGGCA+6.32
ZBTB18MA0698.1chr1:230243681-230243694GCACATCTGGATC-6.41
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01245chr1:230239641-230243336Adrenal_Gland
SE_01785chr1:230239049-230240587Aorta
SE_01785chr1:230240637-230243187Aorta
SE_02496chr1:230239508-230241945Astrocytes
SE_25348chr1:230236453-230250730DND41
SE_31112chr1:230238334-230250198Fetal_Thymus
SE_34791chr1:230238329-230243364HeLa
SE_36634chr1:230239950-230242005HMEC
SE_37247chr1:230239177-230242475HSMMtube
SE_39241chr1:230238979-230242188IMR90
SE_39366chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_39366chr1:230239361-230243263Jurkat
SE_39366chr1:230243332-230245406Jurkat
SE_43672chr1:230238380-230242897MM1S
SE_45047chr1:230239152-230242696NHLF
SE_45719chr1:230236856-230242994Osteoblasts
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SE_49908chr1:230243259-230245387RPMI-8402
SE_50426chr1:230239072-230243127Sigmoid_Colon
SE_51846chr1:230239549-230242044Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_58501chr1:230239434-230311477Ly1
SE_61418chr1:230219055-230306985Toledo
SE_63637chr1:230239456-230242241HSMM
SE_65792chr1:230239400-230241648Pancreatic_islets
SE_65792chr1:230242407-230243231Pancreatic_islets
SE_66256chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_66256chr1:230239361-230243263Jurkat
SE_66256chr1:230243332-230245406Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr1230238379230241057
chr1230239370230239686
chr1230240136230242131
chr1230242543230242593
chr1230242784230243065
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I230101chr1230237569230243904
Enhancer Sequence
GGCCCGGCAT GCTGAGCGCT CAGTAACCCT TGGCCTAATG TACAGTTTTT CATTCTGTGA 60
ATCAGGAATA GAGCAACATA AGGGGAGCTT CTGCTTGAGA CAGCAATGGC AGCATCAAAA 120
TAAACGTGGC AATTTTGGTC TTCAAGAGTG AAGTTGTGTC TCTGAAATTG TAAGCCCAAA 180
TGGATCATTT CCTTTTTTAG GTTTTAGAAT TCCAGGTTTA TTTTCTGGAA GAGCTTGCAG 240
CAGATGGGCT TCTGTAGGGG AACGTTTATA CCTTGGGGGT TCCGTTTCGA GAGTCCTTGA 300
TTTATTATTG TTTACAAATG GTGGTTGGAA ATTGTTCATT GATTTGACAT AAAGCTGCCC 360
AGGCTTATTG TAAAAACACC TCTGCATCCA ATTAGAATGA CAGACACTTA GTGTGATGAC 420
TCAGGACAGT TGATGGCCTT AAAAAAAAAG CGAACAGATT AAATCACTCT CTGTTTTTTC 480
ATAGCCATTG ATGGAAACAG ATTCTGTGGG GTAAATAACA GAGTCTTGGG TGGTGGAAAG 540
GTTGAAGATG TCCAGTAGTT GTGGCAGGGC AAGGATGGAG GACTTTTTCT TTGCAGGGGC 600
AGTGGAGAGG CGGGGCCATG GGTGAAGACT GGAGAATACT CAGAAGGTAG CATGGACGAG 660
AGTGTTGTTT GATGACTCTG CATGTGACCA GTAGTGACAT TTTACTCACT GAGGCTCATA 720
TTGAGGTTAA GCCCGAGGTC CATTGGCCTT GCTGAGATCG TGTTTAGAAC ACAGCACTGT 780
GCAGTAAGAG ACTCCTATAA CTCTATCAAA TTTGCATTTG GAGGAATTGT AAAGAGCCTC 840
TGTTACCTCC TAGGTGAGGC AGTCCAGGAA AACAGTTGCT AGAAGGAGCT ATCTGCAGAA 900
ATAGACAGTT GTGGTCCTTT CATGTTTTAA TAATTGTTCC CTGGATTTCA AGGAGTCAGT 960
CCAAAATCCC CGTAATAGAT TTTAGTAACG TTCATGGAAT CTCAGTTTGC ACATCATGAG 1020
ACCTTTAGTG TGGTGTTTAC TGTCTTCACC TTAATATACT TTGTATCCAT GAGCAACCTT 1080
GCTACAGTCA TGCAAAGATG ATTATTTTTT ATTCAGCAAT AATTAGCCAC AGTGTTGAGC 1140
ACCCAGATGC CTTCCTGCAG CAGCCCCCCT TTTCTCCCCA GCCAACATCT GCAACTGTGA 1200
ACAGATTTCC ATCTTCAGCC TTGGTGGTTG GAAAGAAATG TAAGTCACCT TTTTTTCTGG 1260
TTGGTTCTGG GGCAGATGCC ACCAGGCTGC AGAGGCAGTC TGTGTCTGTG GGGCTCACCA 1320
GGGCATGAGT TCTGCTCCCA GGAAAGAGAT TCTTGCAGGA TTTTGTCTGT GGTTCTAAGG 1380
AGACAAGTAG GTGGCACACA AAAACAGAAA ATGAAAGAAC CCATCCCTCC AAAACCACAC 1440
ACACAAAGCC AAAAGGAAAA AAAAAAAGCA CATAATTATC ATGTAGGCAC TGTTGCAGCT 1500
AACCCTGATT TTGGCCTCAA TTCTGAAACA AGTTAGCTGG TTTAGACAAA CCCCTTATTA 1560
GGTAATGGAT TGTTATTCAT TCCTCCCCTT CTCCTAGTCA TTTACTCCGT GAGAGCTGCT 1620
CCTACCTGAC CTTCCACTGA TTTTGGTAGC AGCATCTCCC AGAGCGACTG TTTCCTTCTT 1680
CAGCAGTGTT CCTTACTCAG GGTGTAAGAT CTTAACCCCA CAGAGCCCCG TATCAGGTTT 1740
AATTAACTAA TTGATTCAGC TTGTGCTTAC TGAGTGCGAG GCAGTCATGT GCTTCTGTTT 1800
GGTAAATGGC TTCATTTTCC CTCTAACTCC TGAGCGTCCT GAAGCTTCTC TTATGGTTCT 1860
CTCCAAAGGA GTCAGCAGGC TGGCTCTGCA AGGGTCAGTA GGTTCTGGGG TGGTGGGGGG 1920
CCGAGGGAGG CAGGGAGGTT GGCTCTGTCT TTATTTGGCA TAGAGCTCCC CGAACAGGGT 1980
CTCTCCTCCT TTCTCCAAAG GTTAATGGAA CCACTATCTT AAAAAGCTGA AATCTTATCT 2040
TCTGGGGTAT TTGGGTAGAG AAGGCTAGGG AATCCCTTTT CCATGGTGGT GCAGTAGGTT 2100
CTCAGAACCA GCTGGTGGGC CTCAAAGAGA GGCGGCTGTA TTTTAGCCTG ATAATCTTGA 2160
TTCCTGGTTT CCTGGCTCTG TAGCATCAGA AATGGGAAGC TTTAAAAGCC GTGCCTTGTT 2220
GGATGCACCG AGTCATAAAA TAAATGTGAT GTGCTGGGTG GGGGAAATGC GGGAGGAGGG 2280
AAACAGGTGG TTGGAGCTGC TTCGTGATGG CCGCCCACCC TGGCTCTCCT TTCTTAATAG 2340
GCTTCAGAAA TCCTGGAATG CGTAATTCAC CAGCTCACAG AGTTCCACCC ATGTCCCCAG 2400
TGGCTTCAAA ATGTAAATGA CATTTGCAGT GCTGGGAGGT AGGAGGGCGA TCCCGTTCCT 2460
TCCCTGGATC TCAGTCGCAG AGGTGCTGGC TCATGTGCCT GAGTGCAGCG GCTGGCCCGT 2520
CATTACTGGT CTTTGCAGGA AGCCACTCTG AAGGCACCTG GGCCCTTGCC AGGCTGAGTC 2580
ACAGCTGACT TAGGGAAATG CCACACAGGA CGCTTGCAGT CCCCCCGTTC TAAGCGTAGG 2640
TTTTGCAACT GCATACTCGG AAAATGAATC AGAGTGGGGG AAAGTGTCAG AGAAACAGCA 2700
GAAATGGAAT GTAGGCAGGA GGGCCACAGT GGCGCTGTGG ATTCAGACCA CACCTTCGGC 2760
TCTGTTTGGG GCCCTTCCTG TAAGGAGCGT ACTGATGCCA GAGGCTGGGG GTGTGGAAGG 2820
GAAGCTGCTG TGCTGTTAGA TCCATTCTGC TATTTAGCCA GCCTTCCTTT TCCCAGCTGG 2880
CACAGACAGG ATGTGTTAGA GAGGTGCTCA GACCTCCTTT CAGAGCAACT GAATCATTCT 2940
CCAGGAGGGA CAGGGAGTCT GAAATGCAAA CAGGTTCCCA GGGTTATTGA AGAGCAGCCA 3000
AACTGAACAC CCACTGCTCT GTGGACTCAA GCTGGTTTTA GACATTGTTT GGTCAGGACC 3060
AGAGCCGAGC TCTGGGGCCC ACTGGGGGCT CTTGTCGCAC CATATCATTG ATTCTACAAT 3120
GCACATTTCC CCCGCCTCTC ATGTTTTAAC ATGTCTGAAA TCAGGATGCA TCTTCCATGG 3180
ATGGTGTTTC AGGGTTTCAT TGATCGTGTT TTTCTTCCTG AGTGGCACAC AAAATTAATG 3240
GTGCTCCCTA GAGTTGATGG TCCCTGCGGT TCAGTGAACC GTGTTGCTCT TGTGTAAGCT 3300
CCTGTGGGAA CATAGAGTCT CTGTGTCCCA CCTTCTTCCT CGCAGTGGTC AGCACGGATG 3360
AGGTGGGAGT TGCATAAATG TCAGCATTCG AAAGTGAGGG CGTCTGTCGG TGCTGTCTCA 3420
CTGTGGGGCT TCAGAGAACG TGAGCACCTG TGTTTGCATT CTCCATCAAG GTTCATGTCC 3480
TGTTGGCTCA TAAGCATGAT TATATCCATT ATACAAACTG GGGCACAGGC ACCCAGAGAG 3540
AAGTCAAAAG ACTTGTTCAA GATGGACAAC TAGGAAGTGG TGGGGACAGA CCAGTCCTGT 3600
CTGATGCCAG ATCCAGCGCT GTATCTGCCA GTCAGCATGC ACACTTTCAT CTCTCCAGCC 3660
TCTTCCCACT CACCTTTACT CAACATTTCT GGGCCTCCAT AGTGATTGTA GTAATTCGGT 3720
AAAGATGATT CATTTCTTTA GTCCGGTCTT CGGACTTGAC TTCTTAGAAG CAGGTCTTGT 3780
GCAATAGTTG CATATTAACC ACTTGGTGAC ACAGTGCATG AGGGTATGCC AACTCTTTTT 3840
GCTCATGGCC GTGCAGTGCA GAATTTCCAG GCATTGTCCG CTCTGTTTCC TGGACTTCGG 3900
AGTGATAGCA AAGTTTTGTA TTCCCTGATC AGCTGTGTAT CTCTGAGCAG CAAGTTGATC 3960
TCTCTGTATA AGGGTGACTG TGCCCATGGA GGATGGCATG CAATTGCCTA AAGATTTCAG 4020
TCTGAGAATC TGAGAAACGA TACTGAATGG AGATGACAGG CTTAGTGCCT GCTTCCAGGA 4080
GCCATGCCTC CTCCTGGCCT GGAATGAATA CCTAAACACC TGAGGCTCTG AGTTCCGGCA 4140
GTGTGCTGAA ACTGCTGTTG GTCTGGCCCA CTGACCCGGA AACCCAGCCA CCTGAGGTTG 4200
TGACTTTAGG GCTTCTAGTT TTGTATTTAG CTTTAATTCC ATCTGTGAGG CAGTGGAGAC 4260
TGTTCATTTT ATTTTACATC AAAGGCTTTT GGAGGTTGAG ATGGGAACAG GATGATAGAA 4320
CAGTAATGCA TAATTATGGA GCATTTGCTG TATGGCAGGC ATTCGTAAGA GTGCATTTGT 4380
TGATATTATT GTTTGGCCTC TCCTGTCATT AGCCCTAAGC AGCTACACTT GCTAAGCTCT 4440
GTGCTAAGGC TGCAGTAAGC AGGCAGGCAG TGCGTGCTGG TGAGCTTGGG CAGTGCTGGA 4500
GTGTGTCTTG CCCAGTGTGG GGATGAACAT ACACCCTTTC ATGCTCACAG GTGCCTTAGC 4560
CTGGATGATA ATGTTTAAGT TCATTCTGTT TATATGCACC GTGTCATTAA ACAATGCTGT 4620
GAAAAGGGCA CTATTATTTC CCCCATATTT TCAGTGATAA GGCAGAGGCC CATGGGCTCC 4680
TTGTAGCAAT GGAGGCATTC CTTGAGGATC CAGGCAATCT GACTCCCGAG TCCCGGGGCT 4740
GGACAGAAGG AAGCTGGCTC CGAGAGCTAG ACTGCAGTGC AGAGGAATTC CACGCTCCGC 4800
AGGTGCTGTC TTCAGAAGTT GCATCTCGTC AGCAGGATGA GTGCTTTTGG AATAGACAAT 4860
CTTAAATGTC ATAGTGAGGT GACTTGCAGA GATAAGGAAG GACGCCAGCC TCAGGCACTG 4920
ACTGATGAAT CCAGATGGTG ACTTCCTCCT TGCAGGAGAA TCAGCCACTT ACACAGACTG 4980
GGAGGGATTC TACTGAGGGA AAAAATGAAT TCGCAGCCAG GGACAGTGGC TCATGCCTGT 5040
AATTCCAGCA CTTTAGGAGG CTGAGGAGGC AGGAGGATCA CTTGAGCCCA GGAGTTCGAG 5100
ACCAGCCTGG GCAACAGAGC AAGATCCTGT CTCTACAAAA ACAGAACAAA CCAACAATTA 5160
GCCAAGTGTG GTGGCACACA CCTGTAGTCC CACCTACTCG GGAGGCTGAG ACGGGAGCAT 5220
TGCTTAAGCC TAGGAGTTTG AGGCTGCAGT GAGCTATGAT TGTGCCACTG TACTCCAACC 5280
TGGGTGACAG AGCAAGAATG TTAAAAAAAA AAAATTCTCA TTTCTTCTCA TGGACTTTGT 5340
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GGTTGGTTGG TTGGTTTAAG CCATGGATTA 5400
AAGAAAGGAG AACTATTTCC TGTGACTAAA AGTGGTTTAC ATATTGGTGC TTTAGCAGGA 5460
ATTTTGGAGG GTGGCTTAAG TGAATAATTA AAACAGAAAT CTTCCTAGAC GATGTTTATC 5520
ACACTCAAGA CATTAAAAAT TAGAGTCAAG GGACTGCTAA GACTTGGGGT GCTGGTGGGT 5580
GAGGCTGCCT TTCAGGGAGG CCATGCTGTG AGTTGAGAAT CCTAGGCCAC CTTGCCTGCA 5640
CTGCCAGCTT TGCAGCTGTG GGCACATCTG GATCCCCATT TCTGTGCGGG TGCAGACAGG 5700
TGAATGTTAC CTGCGTGCAT CATAAAATGC TGTGAAAGGG GTCACAGGTA TTGCCCAGGC 5760
TTGGGCAGAC TCATTCATAG GGCTCACTGG CTTGCATGAG AAGGGATGCT GGGCACGGTA 5820
AACACAGAAG GAGAAGGCAG GCTCTGCTGC CAGGAGCTTG CACCCTGAGC CACGTGGAAC 5880
TGGTTTGCCT GTGAAGCAAT AGGCACAGTC CTGAAAGAGC ACAGTCCTGA AAGAGCACTT 5940
CTAATTGGGC ATACAAGCAA GCTCATAATA AAGTTCTCCT AGGAAGTTTT CCTCATGTTT 6000