EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-03520 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:218632360-218637550 
SNPs
Number: 4             
IDChromosomePositionGenome Version
rs4846483chr1218632368hg19
rs6604615chr1218634362hg19
rs1108548chr1218634787hg19
rs7512679chr1218635079hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr1:218632650-218632661TTCTTATCTCT+6.32
GATA2MA0036.3chr1:218632678-218632689TTCTTATCTCT+6.32
Gata1MA0035.3chr1:218632650-218632661TTCTTATCTCT+6.32
Gata1MA0035.3chr1:218632678-218632689TTCTTATCTCT+6.32
Gata4MA0482.1chr1:218632679-218632690TCTTATCTCTT+6.02
RORA(var.2)MA0072.1chr1:218634261-218634275TATATGTAGGTCAA+7.04
YY1MA0095.2chr1:218633014-218633026CAAAATGGCGGC+6.92
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02323chr1:218632576-218634378Astrocytes
SE_02323chr1:218635599-218637662Astrocytes
SE_37059chr1:218632371-218634846HSMMtube
SE_37059chr1:218635214-218638958HSMMtube
SE_38564chr1:218632171-218634771HUVEC
SE_38564chr1:218635938-218637602HUVEC
SE_45788chr1:218632187-218634995Osteoblasts
SE_45788chr1:218635176-218639378Osteoblasts
SE_51738chr1:218632695-218633426Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51738chr1:218633528-218634324Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51738chr1:218635656-218637466Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_56115chr1:218632549-218634603u87
SE_56115chr1:218635322-218638954u87
SE_63527chr1:218632695-218634384HSMM
SE_63527chr1:218635502-218637466HSMM
SE_68133chr1:218622758-218673720TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr1218632912218633039
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I218458chr1218632323218634631
GH01I218461chr1218635328218638710
Enhancer Sequence
GCAAACACTT CCATACTGCT TACTTTATCA GGCACTGATT ATCAGCACTA TTAAGTGCTT 60
CGCATTTATT AATACACGTA GTCTTTACAA CAACCCTATG AGACAGAGTC TATTACAGTC 120
TCCATTTCTC AGGTGAGTAA TGTGAGATAA CCAGAGAAGT AGATGGGCCA AAGTCATACA 180
GGTCTTAAAA GGAGGAGCTA AGAATACAAA AGCAGGCAAT GAGCTCCAGA GCCTACGCGC 240
TGACCTGCTG CTATGCAATG CAGCAGAGAA ACGGACCAAA AGGCTCACCG TTCTTATCTC 300
TGTGTGATGC GAGACTAGTT CTTATCTCTT TGGGTTAGTA TTATTTTTTG CTTTACTATC 360
TTCACATAGT AAACACACAT TATTATACTG ACAGATATAT TTTATTCAAA AGATAGAATC 420
ATTAAACCAC ATCAATAACC CAAAGCTAAT AAGCACTGCC TATGTCAAGG GGTTTGGTAA 480
GGATTCCATA TAAACGGAAA GGCCCTCTCT GTGTAAGGTA ATGTGACAAT TTTGCTAGCA 540
TTGTGTCAGC ACAGTGCGGG CCCTTGATTG TTCTTGCTGA CTTTCTGAAG AGCCACGGGG 600
TGGAGGGGAT GAGGCCTGAA AGGGAAGTGC GTGGAGCTTA CTTAGGCAGG TGGCCAAAAT 660
GGCGGCTTGG CCTCTGCAGC AGAAAGACAC CGGGCAAAAG TGCATCTAGG ATATTTGGGA 720
ATAAGATTCA ATTGTCTCGA GTCCATTGCC TTGAACCCTG GGTCTATTTC TCTTTTGTCT 780
GTAGCCTGTC ATCTGAAAAG TGTCGTGTTC CAAAAACATT TTATTCATTA AATTTAGCCC 840
CTGCCTTCCT CTCCTAAAAG TGGATCTGTG TTGTCCAGGT TTCTGACGCT CCCCCTCCTC 900
TCCTGGAAGT CCCCTGGGCA AGACAGGAGT AAGTGCAGTG GTCGAGATCA TGGCAGCAAA 960
GGTGACCTTG TCTGCAAATT GCACATGTCC TTCCTTGCCA CAGAGATGGG ATTCCAAAAC 1020
AGACCCGGTA AAAGCCAGTT GAGGAGTTTC ACAGAGTCAC AGCAGGGTGT TCAGCTTTAT 1080
ACATAGTTGT GGGATGACTC ACTACCAAAT GCTTCCTAAA AGAGACTCCT TAAGTTACGG 1140
TAACATTTTA GAATGGTATT TATAGTGCCA ATAGAAAATA GGAGGGGCAA GTTATTTGGA 1200
GCATTGCCTT TTTCTGCACA CTCTCCTCCC TGCCAGCTAT TTCTCTTTTT CAGTTTTCAC 1260
ATCTTCTTTG TCCCCTGCCT GAAGGCAAAG CCTGCAAGAG ACAGCCTTCT GATGGCCAAG 1320
GGGCTCTGCA GCTGACCCCA TGTACTGGCA ATAAACAACC TTTCAAATGT TCCCATTATA 1380
TCCCCCTCTG TCCCAAATCC CCACCCTAGC CCCTCCAGCT AGACCCTCCA ATCTGCTATG 1440
CTCCTTCCAA CAGTTCTGTT CTCTGTTTAT TAACAATTCA GATGTACTGT CTTGAAATGA 1500
GTGGAAATGC CAGAGGTTAT TTGTTCTGGT TTCCTTCCAC TGTGTATGCT CCGTTTCCGT 1560
GGCTGTCTGT TGGTTACCTA GGATATGGCC AGGGGAGGCA AAGGATTGGC CAGGAGCTTG 1620
GATGGATTCC CTGGGAGGCT GTGGAGCAGG GCTTAGTGGT CAGTAGGATG CCCTAATTGA 1680
GTGCCTGATT AACGACTCAA TGACCCCTTC TGGGCTGGGC TCACAGTGTC CTCTCTAGGA 1740
CTCCAGGAGT TCCACATCCA TACCCCTGTT TTGGCTCTTC TTCACTGGTA TATAAATTTG 1800
TCTATCTGTC CACCACAAGG CTATAGGATT CTCTAAAACA ATGATTATAT ATTATTCTGT 1860
GTTGTGCCTG GCACAGTTCA AAGCACACAA ATGGTGCTTG ATATATGTAG GTCAAATTCA 1920
TACCTAAATA AGCACTTACT CTGGTTTTTC TCTTTTTTTA GTTTGAAATA ATTTTGGCTT 1980
TTAACATTCC AATAATGATT TTGATGGAAA ATACACCGCA TATTTATTAA TCACCAATTG 2040
CATCGAGACC TTTTTAGCTC TATTAACTTC TTTACCCTTC AAAATGACTT TATGATAAAG 2100
TAGATATTAT TATCATCCTC ATCAAATTAC ATATAAAATC ACCATGTTCA GGGAGTGTAA 2160
GTAATTTTGC CTGAGATCTC TGTTAGGAAG TGGCGAAGCC AGGATTTGGG TCTCTGGGTG 2220
TCTTATTGCT TACACTGCTC CGTAAAGCCC CCAAACTAGA CTGCTACCTA TATGTATGCT 2280
TTAATCATGT GAATTCAACT GGAAAAATGT GCTGTTTTGA AAGTCACTCA AAGAGTTAAT 2340
ACTGGAAATA AATGAATGGC TATGTGGAAA TTTTAAAAGT TTATTATCAT GGAAAATTTC 2400
AAACATATAC AAAAGTAGCA AGAAGAATAC AGAAGCCTCA TGTATCCTTT ATTCATCTAC 2460
AACTGCTTTA TTTACATTAT TCTTCACTTT CCCTTTTCCT CCACTGGATT ATTTGGAAAG 2520
AAATCCCAGA TAGTGACTCA ATTGACTAAG ATCTTTAAAA TTGTTAACAC AATGATATTT 2580
CTGCTCCTGG AACATAAACA TGCTTAGACA ATTTTGGTAA AACCATCCAA AGAAACTGAT 2640
TCCCTCTGGT TGTTAGAACT ATTCAGCTGC TGTGTGTGTG TGTATATATA TATATATGAG 2700
TGTGTGTGTG TGTGTATACG TATATATATG TATATACACA CACACATATA TGTGTATATG 2760
TATATATGTA TATACACATA TACACATATA TGTGTGTGTG TATATACGTA TATATATGTA 2820
TATACACATA CATATGTGTA TATATAAACA GCAGCCAAAT GGTTGCTGTA TATATATATG 2880
GCTATATATA TATATATAGC CATATATATA TGTGGCTAAC CGTTCACTAT ATATGGCTGA 2940
CAGTTCACAT TATCCTCAGA CCCTATTAGT TCTTCTATTA GTTCTTTAGA GTATGAAATA 3000
TACCCTACAT AAGTGGAAAG CAAGAGATCC TCTAAAGTGT ACTCCTCCGT ATTTTAGATA 3060
GACTTACATT TGGGAAATAA ACATGTAATT TTGCATGTCC CAAGTGAACC TCAACAGAGT 3120
GCTCTAGATC AGCATAAATG TATTAAACTT TCAGGTGCTA TTACTTTCTT TTCCGTTGCA 3180
GATTTTATAT GCAGTATCAC ATAAGTGAGC TTTTTCCATT CTCTTCAACG GAGTCTCTGT 3240
CCATTTTTTC AGAGGCTGGT TGTTGGTAGT AACAGCAGGA ACATCGCCAG CATTTTACCA 3300
TGACGCCCTC AAGAGTTCAA GACTGGTTTG GAGAAACATC CAACATTTAA ATGTGTATAG 3360
AAAAACTTTC AACCACCCCA GCAATTTTTA CAAAAGTTTT AGGAGAAAGC CTTATCAAGA 3420
ATGATCTTTT ATCTGGGGGA AACTGTTACA ATTTTACTCT TCAGCATGAT TTGGGTTTTG 3480
ATCAAAACTA GAGATTGTGA CAGTGGGATT TTATGCAGAG GTCTGAGGTG TATATGCACA 3540
TGTGTGTGCA TGTTTGTGCA CATGCACGAA CATACCAGAC CAAGCAGGTG GGTGGAGAGT 3600
GATTTGTAAA AGTGACAGGA GGGGCACATG AGTGAGAACC ATTTTGGTGT CTGTAGCTTT 3660
ATGTACTTGG GGATGTCAGG TCTAAAAATA ACTCTCCTTT GGAACCATTG TTGTTTATCT 3720
GTATCCTGGG TTTTCCCATT CTTAAAAATA CCCTGACATA CATAAAAAGA CTGTATTCCA 3780
AAGGTTAATG CCCATTAATC CGAAGGGAGT GGTGAGTAAA TTCCTTATAT ATCAGTCTAA 3840
GAATAGGTCT TGGAGCTATT CAAGTGTGTG CCATCATGTG AGCAGTTTCT TCTTTTTTTA 3900
AAGGAAGCAA ATGGTAATGG TTGGGGAAGA AAAGGAATAA ACGGTAAAAA AAAATGGATA 3960
AAAGGGTTTG GATAAAATAA AATTTACCCT AAACATGTCT CTGTGGCTTG AAAGAATCAC 4020
TGCATAGAAA AGGTTTTATC TGGGGAGGGG TTGTGGGGGG AGAAGTTGTC TGAGAATATT 4080
TTCCCCGCTG TGGCATTTCC CATTGGAGCC TAACCCAAAA CTCTGAAAAT CCAAGGAAAG 4140
TGAGCACTTT TATTTTATTT CTTTCTTTTT TAAGGCTGCT TTGCACTGTG ATTTTTTTGA 4200
CTCAAGGGAT TCTGATTCTT TCCTCTGCAT GCAAGGATAA CAGGCCCTAG CCATGTCCAG 4260
CTTGCCCCCT CAACACAGGT CAGAATCCCT TTCGGATTTC TGTTTCCAAC AGAATGTCTG 4320
GCAACCAGAC TTTCTGAATC AGCGTTGTTT CTGCACCGCT GCTCCCGACA CGCTGGAGGC 4380
CAGGCAAAGA GCAAAATACA AAGAATTGAA ACTAATTCCG CAAGGCTGCT AAAGGTTTCA 4440
GATACAGCCC AGTTTCCTCT CTGAATCCGT TGTTCTCCTC TGTGCCCCTT TATGCTTCTG 4500
GGCACCACAC TCTAGGCGAA AGAGTCTCCT GGGACCAACA CCTAACCAGG TTTCCTCACA 4560
GTACCTGTTT GTATGGTGAG TTAAAAACAA GCAAAATTTA AAAACGGTGT ACATCTGGAC 4620
AAGTTGGAAA GGTCAAATGG ATTTTTTTTT TTTAAGGATG TATTTCTGCA TGACTCACTG 4680
GGCCTTCTCA CTTCCTGCTA GAATTATTAC AAAATATATC TGGAAGACAG TGAGCCCGCT 4740
GATGACTTCC CTTCACGGAC TACACACAGG CCTGCTGTGG TATCAGGCGC CCCTTGGCCA 4800
GCTGCCCTCT TTCTTGGTCC CCTCTCCAGG GTCACTAGCA AAGACACAGA CTGGCCACAG 4860
ATAACAATTA CTTCTCCCAA GCTGGCTTGT TCCATTAAGC ATTTTGGGAA AACCAAATGG 4920
CTATTGATGA TGATTGAGAT TTTGCTCATG TGCAGCCCTA AAGGGCGGGA AAAACACCAC 4980
TCTGGAAAGG TATTGGATGA TAGCTGTGAA TGACATTTCT TATGACGACT GCTATTTTGA 5040
AATGTGCTTT GTAATAATAT TTCAGGCACT CAGTTTAAAT TTCAAGTTCT CAAGCAAAAT 5100
TATATACAGT AAGGAGGAAA CTTTCTGCTC CCCTTGCAAA TTTTTGTTGG TGGTATTCTC 5160
ATAATTCTAT TTTTTTTCTT ATAGGACAAA 5190