EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-03239 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:204262510-204267200 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6594001chr1204266980hg19
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RESTMA0138.2chr1:204266068-204266089TGCAGTACCATGGAAAGCTTA+6.1
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_06666chr1:204264675-204266436Brain_Hippocampus_Middle
SE_08425chr1:204265074-204266568Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_28816chr1:204262665-204264136Fetal_Intestine_Large
SE_28816chr1:204264392-204266746Fetal_Intestine_Large
SE_31690chr1:204263134-204263799Gastric
SE_31690chr1:204264508-204266226Gastric
SE_37243chr1:204260462-204271182HSMMtube
SE_39222chr1:204262606-204267246IMR90
SE_50227chr1:204262676-204263764Sigmoid_Colon
SE_50227chr1:204264504-204267158Sigmoid_Colon
SE_52903chr1:204262622-204263864Small_Intestine
SE_52903chr1:204264563-204266197Small_Intestine
SE_65374chr1:204264438-204265442Pancreatic_islets
SE_65374chr1:204265532-204266322Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr1204262810204263933
chr1204263200204264406
chr1204264279204264369
chr1204264529204264782
chr1204264870204266225
chr1204265400204266196
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I204292chr1204261217204267182
Enhancer Sequence
CCTTGGCCTC CCAAAGTGCT GGGATTACAA GCATGAGCCA CTGCACCCGG CCAATCAAGA 60
CTTATTTTAA CGCGATATTT TTGAAATAAA AATTAACATT AAAAACCCAT GATGAATGAA 120
ATACCAACAT TTCAAATAAA GACAGGACCA GTATCACTGG AATTTCCCTT TTGCCTCAGC 180
CTCCAATTTG GCTTAAAGTG GCACTGTTTT AGATCCTGTC TTTATTTCGA ATGTTACTAT 240
TTTGTTCTTC ATGAAATGTT TGCATTGATT TTGATTTTAA AATTATTGCA TTGAAATGTT 300
ATTTATCTTG ACTACCGAGT TTTTTGGCAC CCATTTGGCA AAATGTAAGA CATTTTGTAC 360
CTAAGGGGAG TGTATTAATC GCCTTACTCT AGTCAGCCCT GCTCAGGGAT GAGGAAAGAC 420
GGGACAAGGC TCAGGAAGTC CCAGAGAGGA TCCTGTGCTC TTTAAGAAAA CTTCAATGCA 480
TGAACATGGA GAAAGGCTGA GGGACTTTCC AGACTGAGAG GAAAGAGACA TGATCCTGAA 540
TTGGATTCTA ATGACATTAT TAGGACAACT GGTGAAATTT CAATATGGAC TGTATATTAG 600
ATAATAGAAT TGTATCGATG TTATTAAGTT TCCTGAGTCT GTTAATTGTA CTGTGGTTAT 660
GCAAGAGAAT GTCCTTGTTT TTAAAAGGAA AAAGAGAAGA TGAAGAAAGA GTGGCCAGAG 720
CGTGACAGCT GCTTGACAGC TGCATTAAGC CAAACACCCT TCTCTCTCTC CAGCCTGTCT 780
CTCCTCCAAT TCCAGGCCAT CCCAGGAGGA TACGGAGGAA GTGGTGATGG CAGAAAATCT 840
TGTCCAGAAG ATAGGGTACT GGAGGGCTGG TTGGACATTT CTTCTTGAAA TAAGAATTAA 900
CCTTGAATTC CCAAATTACC CTTCACCCTC CCAGGAAAAC TTGACAACTA GCACAGAAAG 960
AAAAAGGAAA TTAACACCTA TCCAAGTCAT GATGCTAGCG AATTCTCTGC TTAACCCCCA 1020
GAGATAGGTA TTGCTGTCCT GCTGTTGCGG AGGAAGAACC TGAGAGGTCA GGTTATTAGC 1080
CCAAGGCTAC ACAGTTAGGA AGTGAGAGAA CTGGGATTAG AGCCCAGGAC ACAGCCCAAA 1140
GCCAGCTTTC TTCCCACTTT ATGTTAGTTG TGCAACTTGA AATTCCCTTC TCATGCATCA 1200
TCCTACCAGC TAATCCTTTC GTTTATTTTT ATTGAGTTGA ATCCGCATTA GCCTTGAGAT 1260
TTTTGGCTCT GGAGTCAGAC TGCCCCAGTT CCAATCCCGG CTCCACCAGT TACTACCTAA 1320
GGGACTCTGG GTGAGAAACT TAACCTCTCT GTGCTTTCAT TCCCCCATCT GTGAAAACGG 1380
GATAATATAC GGACCTTCTT CATGGGTTCG TCACAGGAGT AAATAAGATT ATACCCACAA 1440
AAAATTTATG AAAGGTTCTG GCACTTAGTA AATGTTCAAT AAATGCTAAT AATCATTATT 1500
ATCTGTCTGC ATCTGCCTTG GGCTATTTAT CCTTAGGAGA CAGTGGCTCA ATTTTGATTA 1560
TAAAACCCCT CACCACTTTG ACACCTACAG ATGGATGCTT AATAATTTGT TCCTAAAGAA 1620
GTTATCCATC AAGATAGTAC CCTCTCCCCT GTACTTAGGA GCCAGAACAA TTAACACCTG 1680
AGAATCTCAA ATGTGAGGGA GGTCTGTTCC TAGTGTAATT TGAACTGGGA GGTGGGCTTT 1740
TGTGTGTGTG TCATGGTTGA AAGCAGTCCA TTCTAAGGGT CAACATTACT GGACAGAAAT 1800
AATTGACTAA GAAGACCCAG TTCTAGGCCA GGCGCATTGG CTCATGCCCA TAATCCCAGC 1860
ACTTTGGGAG GCCAAGGTGG GTGGATTTCC TGAGGTCTGG AGTTCAAGTA CAGCCTGGCC 1920
AACATAATGA AACCCTGTTT CTACTAAAAA TACAAAAAGT AACCAGGTGT GGTGGCACAC 1980
GCCTGTAGTC CCAGCTACTC GGGAGGCTGA GGCAAGAGGA TCGCTTGAAT CCGGGAGGCG 2040
GAGGTTGCAG TGAGCTGAGG TCATGCTATT GCACTCTAGC CTGGGTGACA GAGGGAGATG 2100
CCATCTCAAA AAAAAAAAAA CAAACAACAA AAAAAAAATT CTAGTGCTTA TGCTGCTATC 2160
CAGCTGCATA AGGTGTGTAG CAAGTCCTTG TTCTCTTGGG GCCCACTAGA CCTGAGAAAG 2220
GGAATCTCAT TGCCCCTAGA GCAAATTATA GGACAAAAGA GCTGCTCATC CTGAGCACCT 2280
TCGGTTCTTC AGGGAAGCGC TCCTTCCAAA GGCTGCCTGC TCATCTGAAA CCCTCACCCC 2340
ATTTTAGAGG CTTAGATTCA GCTGGGGAGG ACCCACAGCC CGAGAAGGAA AACAAACCAA 2400
CAGATTATGC TTCTAGGTGG CCACAGCAGG CCAAGCCAAG GGCAGGGTGG CCAAAGGTCA 2460
AGCAGCAGTC AGACTGAGCC AACACGAGCC TCCTGTGACA AAGCCAGAGC CAGAGCAGGG 2520
CAATTTTCTA ACTATAAACG GAAACTCAAG AAGCTCCAAA CCGCACAAAC ACACGTGGGA 2580
AGATGAGGGT AAGGCACAGA AGCTACGGGG TGCACGCACA CAGAGGAAGG GGCTTCATGA 2640
CGTGCAGGCA GGGGACCAAG GAAGGGCATA TGTGTCAGTG TCGTGGATGC AGCAACAGAT 2700
CTGGGTTTCT GGGGTCCTGG AGCTTATACA ATTTGTGGTG GGAGGGGCGT GGTCCTCATT 2760
AAGGAAAAGA CTATAGGTAC AAATTTGTGT GTTAGATATG GCCTTGGAAG GGGCCAGTGC 2820
AAGTGCATCC TCCTCCCCAT GTGGATTTCT GAACACTGGT GCACACTCAC ATGCGTGTGT 2880
TTCGTGGCCT CCTGGTTCCC GTCTCAGCAC TATTTCTCTT TCCTCTCACA CAGTGCTTTG 2940
CCTGATTTTT TTTTTTAATG GTAGAGAGCA TGAATTAAAG CCCCCACATC TTGGAATTCA 3000
ATTCCTCTCC AACACATGTG ATGGGCATTT AGATTTTGCA TGCCTTCCCC TACCCTCCTC 3060
CAATGCCCTG CACCATCATC ACTATCTACC AGAGCAGAGT CCCTCCCCAC TCCCCTACTC 3120
GCTTTGCTGT GGGTAGCCCC ACCTTCCCCA AAGGGCATTG CAGCGGCCCT CTAAGCTGCC 3180
AGAAGGGTGA AACCACAGCT CCCCCCAGCT GCCTGGCCCC TTGCATTCCA GCCCTGCACC 3240
CAGAGTTTGA CCTTCTCTGT GGCTGGCTGC AGACGTGCTC TGTGTTACAG AAATAGTCCA 3300
GCTCCTGAGC CCCTCCAGGC CTCCCTCTGC TTCACTCAGA GACACCCCCA CCTCACTGGC 3360
TCCAAAAGAG TCAGGCAGGA TCAGAGAGAA GTGCTCCGTT CTCCAGCCTC CTCCCACACA 3420
CTACTCAGAG CAGAGAGTGG GGCCTGCCTG TTCCCCTCCT TCTCCTTCCA GCCTCAGTAC 3480
TCTGTGTCTG CAGAGAGCGT GGACGGAAAT GAGAGGTTTG AGGCATCGCA GAGTGAAGGG 3540
GAGCAGAAAG AAAAAGCCTG CAGTACCATG GAAAGCTTAT GCAATTTGAC CTGAAGAAAG 3600
GAGTTCAGAT TTAGGAACAT GGCTATTACC ACCATAACCA GAGAGCCACC GTACCCATCC 3660
CTGCAGATTT CTTTTTTTAA ACTACCAGCT CCATGGAGAG AGAAAGGAAA AGAATTTAGT 3720
GACAACAGTA GAGATAAAAT CCGAATCAGA TGGAGAAAGT CACTAACTAA CATATCCTTC 3780
TTCCTAGAAA GAAAAATCTC CTGGCTCTAA CATTTGTCTT TGATGTGACA TTTAACTCCT 3840
AAACACTACC TTCTGGTAGG AAAATACATG GATACATGGA GTGTCTAAAT GTAAATTTCT 3900
CTTGTTGGAA AGTCTCAAGA CAAAGACTAA TCCTCGTCCC CCTTTAAGTT TTCTCTTTCC 3960
AACAAGAAAT TCTACTGGGT GTAAGGCACT GGGCCTTAGC ACATGGCTAC AAAGGACAAG 4020
GTCGCTGTCC TGGGGGAGTT GATATCAGGC AGTCTTTTCT CCTGTTCACC TGGGGTAGAA 4080
CTGTTTGGTT CCCCAGTTGG TCAGAGAGAA AAGGAAGGAT GGCTGGGAAG TCACAATGCC 4140
TGGATTAGAA TCCTGACTCT ACTCCATACT AGCAATGGGA CTTTGGACAA GTTATTCAAT 4200
CTCTCTATGC CTCAGTTTCC TCATCGGCAA CAGGGGGGGT GGGTAACAGT TTCTACTTCA 4260
TAGGATTTAT TGTGAGGATT AAGTGACTTA ATTCACATAA AATGCCTAAA ACGATGCCTG 4320
TTACACGTTC GTGGTTATCA TTGTCTCAAC CCCCCAGCTT GTGGAACCAC CAGAAACATC 4380
GGAACTGAAA TTCAGTCCCC TCTACATTGC TAACTATGAG CTGTTTCTTA TCAGAGATCC 4440
AAAAGGATTT AGGGTTCTTT GCAGGTTTTG GTTGCCCAAC CTCCACAAGG TCCATCAATG 4500
TGAGTGATAG AGGGAAGACG GCATCTTGAT CTAGGACCCC TTTGCTGTCC TCCCCCTACT 4560
CCTCATATCT CTCCCCATTG ACTTGCCTGA ACCTCCACAC CTTTCTCATG GTTCACAATT 4620
GGCTCTGGTC CCATGGAGCC AGTAGTTGGA AAAGAAGAAT CTAGAGGAGT GCTCTTGGGC 4680
ATTTCCACAA 4690