EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-02439 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:156087070-156090910 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs584025chr1156088526hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:156088560-156088570TTTAATTAGA-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156087970-156087988GGAAGCAAGGAAGGGGAG+6.11
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156087966-156087984GATAGGAAGCAAGGAAGG+6.98
FOSL2MA0478.1chr1:156089502-156089513GGATGACTCAG+6.32
JUNBMA0490.1chr1:156089502-156089513GGATGACTCAG+6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:156089127-156089142TGATCTCTTGACCTC-7.23
Number of super-enhancer constituents: 100             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00096chr1:156080796-156101121Adipose_Nuclei
SE_00946chr1:156087364-156088922Adrenal_Gland
SE_00946chr1:156089108-156092197Adrenal_Gland
SE_01581chr1:156087202-156088946Aorta
SE_01581chr1:156089090-156091849Aorta
SE_02264chr1:156087780-156088882Astrocytes
SE_02264chr1:156089267-156091707Astrocytes
SE_02910chr1:156087573-156088902Bladder
SE_03587chr1:156089521-156090398Brain_Angular_Gyrus
SE_04119chr1:156087686-156088930Brain_Anterior_Caudate
SE_04119chr1:156089527-156095333Brain_Anterior_Caudate
SE_05125chr1:156087463-156088988Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05125chr1:156089122-156091896Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05929chr1:156087400-156088917Brain_Hippocampus_Middle
SE_05929chr1:156089027-156101075Brain_Hippocampus_Middle
SE_07183chr1:156087506-156088972Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07183chr1:156089141-156095517Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08091chr1:156087677-156089092Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08091chr1:156089208-156090739Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13990chr1:156087584-156088811CD34_Primary_RO01536
SE_13990chr1:156089518-156090370CD34_Primary_RO01536
SE_14505chr1:156087375-156088926CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14505chr1:156089108-156097622CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20836chr1:156087590-156089077CD8_Memory_7pool
SE_20836chr1:156089251-156095484CD8_Memory_7pool
SE_23093chr1:156087237-156088901Colon_Crypt_1
SE_23093chr1:156089133-156090838Colon_Crypt_1
SE_23759chr1:156087347-156088559Colon_Crypt_2
SE_23759chr1:156089224-156090308Colon_Crypt_2
SE_24837chr1:156087221-156088754Colon_Crypt_3
SE_24837chr1:156089121-156090294Colon_Crypt_3
SE_25840chr1:156087235-156089064Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25840chr1:156089473-156100844Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26548chr1:156086912-156088920Esophagus
SE_26548chr1:156089107-156094187Esophagus
SE_27785chr1:156087243-156088988Fetal_Intestine
SE_27785chr1:156089233-156090406Fetal_Intestine
SE_28870chr1:156087154-156088996Fetal_Intestine_Large
SE_28870chr1:156089141-156090386Fetal_Intestine_Large
SE_29555chr1:156087142-156088982Fetal_Muscle
SE_29555chr1:156089051-156100923Fetal_Muscle
SE_31480chr1:156087218-156088948Gastric
SE_31480chr1:156089118-156094178Gastric
SE_33818chr1:156084540-156088964HCC1954
SE_33818chr1:156089071-156100785HCC1954
SE_34290chr1:156086996-156089033HCT-116
SE_34290chr1:156089168-156100920HCT-116
SE_34622chr1:156081872-156089092HeLa
SE_34622chr1:156089137-156100971HeLa
SE_35870chr1:156087300-156088916HMEC
SE_35870chr1:156089270-156095364HMEC
SE_36976chr1:156083066-156100811HSMMtube
SE_37998chr1:156087521-156089040HUVEC
SE_37998chr1:156089128-156101096HUVEC
SE_39944chr1:156087823-156088840K562
SE_39944chr1:156089248-156090861K562
SE_40679chr1:156087255-156088975Left_Ventricle
SE_40679chr1:156089063-156100913Left_Ventricle
SE_42123chr1:156087161-156088959Lung
SE_42123chr1:156089099-156097425Lung
SE_44150chr1:156087174-156088973NHDF-Ad
SE_44150chr1:156089067-156095526NHDF-Ad
SE_44752chr1:156087307-156088997NHLF
SE_44752chr1:156089051-156100846NHLF
SE_45674chr1:156087294-156088990Osteoblasts
SE_45674chr1:156089030-156100954Osteoblasts
SE_46650chr1:156089532-156090295Ovary
SE_46650chr1:156090383-156090846Ovary
SE_47353chr1:156087084-156089069Panc1
SE_47353chr1:156089172-156097544Panc1
SE_47548chr1:156087677-156088789Pancreas
SE_48087chr1:156082990-156088968Psoas_Muscle
SE_48087chr1:156089090-156100885Psoas_Muscle
SE_48596chr1:156087282-156088945Right_Atrium
SE_48596chr1:156089186-156094188Right_Atrium
SE_50099chr1:156087198-156088944Sigmoid_Colon
SE_50099chr1:156089082-156094200Sigmoid_Colon
SE_51113chr1:156081970-156100942Skeletal_Muscle
SE_51811chr1:156087503-156088947Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51811chr1:156089074-156090894Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52395chr1:156087081-156088951Small_Intestine
SE_52395chr1:156089097-156094182Small_Intestine
SE_53563chr1:156088045-156088723Spleen
SE_53563chr1:156089358-156090845Spleen
SE_54528chr1:156087228-156089071Stomach_Smooth_Muscle
SE_54528chr1:156089255-156100947Stomach_Smooth_Muscle
SE_55941chr1:156089174-156094234u87
SE_56996chr1:156087237-156088901VACO_400
SE_56996chr1:156089140-156091803VACO_400
SE_57950chr1:156087470-156088862VACO_9m
SE_57950chr1:156089200-156089850VACO_9m
SE_63596chr1:156087543-156088896HSMM
SE_63596chr1:156089060-156091882HSMM
SE_64308chr1:156087443-156089002NHEK
SE_64308chr1:156089298-156090560NHEK
SE_65290chr1:156087700-156088771Pancreatic_islets
SE_65290chr1:156089091-156092133Pancreatic_islets
SE_67798chr1:156089174-156094234u87
SE_68037chr1:156071509-156101126TC32
SE_68038chr1:156071509-156101126TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1156089405156089622
chr1156089252156090247
chr1156089186156090200
Enhancer Sequence
GCTGGAGTAC AGTAGTGTGA CCTCAGGTCA CTGCAACCTC TGCCTCCCAG GTTCAAGCCA 60
TGCTCCTGCC TCAGCCTCCC AAGTAGCTGG GACTATAGGT GCCTGCCACC ACGCCCGGCT 120
ACTTTTTATA TTTTTAGTAG AGACGGGGTT TCACCATGTT GGCCAGGGTG ATCTCGAACT 180
CCTGACCTCA AGTGATCTGC CTGCCTCAGC CTCCCAAAGT GTTGGGATTA GAGACGGGAG 240
CCACTGCGCC TGGCTTCTTT TTTTCTTGAG ATAGGGTTTC ACTCTGTTAC CCAGGCTGGA 300
GTGCAGTGGC AAGGTCATGG CTCACTGCAG CCTCTACCTC TCTGGCTCAA GCCATCCTCC 360
CGCCTCAGCC TCCTGAGTAG CTGGGACCAC AGGCAGGCAC CACCACCCAC AGCTAATGTT 420
TTTGTATTAT TTTGTAGAGA TGGGGTTTTG CCATGTTGCC CACAGTCTTG AACTCCTGGG 480
TTCATTCTGC TGAAAGAGAC CACACCTGTC CTTTTCTTTA TTTTTATTAT ATTTTTCAGA 540
GACAGGGCCT TGCCCTGTTG CTCAGGCTAG AGTGCAATGG TACAATCATA ACTTGCTGCA 600
GCCTGGAACT CCTCCTGGGC TCAAGCGATC CTACCGTCTC ACCTTCCGGA ATAGCTGAGA 660
CTAAGGGCAG GCACCACCAC GCTTGGCTAA TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTGCTTT 720
TTGTTTGTAA AGATGGAAAC TTGCTATGTT GCTCAGCTGG TTCCGAAGTT TTGGCCTCAA 780
GCAATCCTCC TGCCTCGGCC TCCGGAAGCA CTGGGATTAC AGGCATAAGC CACCAGGCCT 840
GACGCCAGGC CTGTCTTTTT TCTACTAGTG ATATGAACAA TTTAGTTAGC AAGACAGATA 900
GGAAGCAAGG AAGGGGAGAC CCAGAGAATT CGTTGCATTC TAAACTAGTC CACTCATCTA 960
CCAAAGCCCT GTGAAGGACA TTTTTAGCAG TTTTAGCAGT TTTCTGGTCA AAACTTTGAT 1020
CGAGAAACAG ATTGAGTGGA TTCGATATTC TCTTGCTCAC CCAGCCACGC CAGTTTGTCT 1080
CCTCTGCCTC CTAGTGCAGC TGTCCAGGCC TGGGACACCA GGCGGGTATG TGCGCATGTG 1140
GGGCAGGGCG GAGGTGGTGT GTGTACTTGT TATATTTAGC CACCTCCCTC TGTTCTCCCC 1200
CACTGATCCT GGCTGGAAAG GCTGGGCTTC CGGAAAAGAG AGGTGGATTT GCACACCTGG 1260
ATCCCAAGCT GATAGAAAGT GGGGTGAAGA CAAAGGGGAC TCAGACTGGG GTGTCTGTCC 1320
TCTTCTATGC CCACAGTAGG AGGAGCCAGG ATTGGTTACT CCCTGCTGGG TCTGCTGTGC 1380
TCAGAGTGAG GTAGAGAAGT GGGTAGAGTA AAGAATTTGG GAGAGGAAAA AAGGCATTTT 1440
CCCAACCCCT CCCACCAAAG CCTAGAGAGA AGGTGTTGTC TGGTTTAATG TTTAATTAGA 1500
GCTCAGAGTT CAGGGCCAGA TTTGGAGTTG GGATGGAAAG TTGTTTTTAA GACCCTGTAG 1560
CAATTTTTGA CCCAGCCTGG GTACCTCAAC CACACTCAGG AGTTTGGGGG ACCTTCTGTT 1620
GGGCTGGATT ATAGGCTCCA AGAAGAAACC CCTTTCGCCA ATACTCTCTC TCTCTTCTTT 1680
TTTTGAGACA GGGTCTTGTT CTGTTGCCCA GGCTGGGGTG CAGTGGCATG ATCACAGCTC 1740
ACTGCAACGT CAGCCTCACA GGCTCTGGTG ATTCTCCCAC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG 1800
GGATTACAAG TGTGTGCCAC CATGCCCAGC TAATTTTTTT TTTCTTTTTT TTTTTTTGAG 1860
ACGGAGTCTT GTTCTGTTGC CAGGCTGGAG TGCAGTGGTG CGATCTCGGC TCATTGCAAC 1920
CTCCACCTCC CAGGTTCAAG CGATTCTCCT GCCTCAGCCT CCCGAGTAGC TGGGACTACA 1980
GGCACATGCC ATCACGCCCA GTTAATTTTT GTATTTTTAG TAGAGTTGGG GTTTCACCAT 2040
GTTGGCCAGG ATGGTCTTGA TCTCTTGACC TCGTGATCCG TCCACCTTGG CCTCCCAAAG 2100
TGCTGGGATT ACAGGTGTGA GCCACCGTAC CCGGCCACTA ATTTTTATAT ATTTTGTAGA 2160
GATGGGGTTT CACCGTGTTG CCCAAGCTGG TCTCGAACTC CTAGGCTCAA GTAATCCACC 2220
TGCCTTGGCC TTGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATGTATAGG CATGAGCTAC CGCACCTGGT 2280
ACCCCCTGCC CCTTCTCTGT CTCTTTCTAG TCTGTAGCCC AAGGGATTTG GATACCCAAG 2340
TGCAGGCAGA ATGGGAAGGT TGTAAGCACC AGGGAAGCCT GTCTGGAGTC CAGGCTTGCA 2400
GCTGGGCCCC ACCCCAGGCA AGGCAGCTGG GTGGATGACT CAGATGCTGC CCCCCTCCCT 2460
CCCACCCTGG TGGCTTTACA GAAGACAGCA GGAGACAGGG TGGAGACAGC AGTTGTCTTA 2520
AAGGGAGGAG TGGTGGTCTG AATGTCTACC TCTTCTGCCC CCCTCCCCAT TGCATCCTGG 2580
AGTCCCTTGC CTGGCTCCTT CCTGAGACCC TCTGGTGGTG TCTGGACACA TAGCTCTCTC 2640
TGGACAGGTA ACATGCACAA GTAATTAGAA TCCAGAGTTG AGTTCAGAGT TATGGATTGG 2700
GCTGCAGGAT AGTGCCAGGG TCTGTGCCTT CCCATGTGAA ACTGATGGAG GAAGGCTGAG 2760
TCAGAAGTGG GGAGATCCGA GGCCCACAAA GCAGAAGCGC TACTTCCACT CCAAAAAGGC 2820
CCTGGTGCTT GACAACTTCC TGGATTGCCC ACTGTTGCAG CCCCAGTGTG GACAGGCAGG 2880
GAGATGCAGG CTCCAGTTCA TGTAGGCTCT GATCAAGACA AGAACAGCAA AGGCCACAGA 2940
GGCACAGATG CTTGTCCCAT GTCACACAAT AAAGGGGTCA GCACTTGATC ACAGGCCTTA 3000
TGACTTCCAG CTGGGTGTGC TCTTACCATT AAGCCTCACT TCTCTAGCTT GGGGGACAGG 3060
TTGGAGGGAG GATCTAGAGG GTGAGGTAAG GTGAAGTCAG GTAGCTGAGG CTCACTTCTG 3120
CAGCCTGGAA ACTCTGCTCT GGGGCCAGTG ACACCTTAGT GCTCTATGGC CATACTTCGT 3180
GGCTCATGCC TGTAATCCCA GTGCTTTGGG AGGCTAAGGC AGGAGGATCA CTTGAGGCCA 3240
GGAGTTTGAG ACCAGTCTGG GCAACATAGC AAGACCCCCT TCTGTACAAA AAAATTAGCC 3300
GGTCAACACC TGTAGTCCAG CTGCTTGGGA AGCTGAGGCG GGAGGATCAC CTGAAGCCAG 3360
GAGTTTGAGG CTATTGTGAG CTATGACTGC ACTACTGCAC TCTAGCCTGG GAGAGAGAAA 3420
GACCCTGTCT CTGAAAAAGA AAAAAACAAA ACAAAACTCT GCTGTCCTGC AGGGCCTGTT 3480
AGCATATGAT CGATAGCCTT TGCTCCAGCC TATACCTGGA CCCAGGACCC CTGCCAGCCC 3540
CTCAATCGTG AGACGGTCAG AGCTCTGGGA GGCTGGTGAT TCTTGTCTTG AGACTATCTT 3600
GAGACTTGTC ATGGGAATTG TCCACCCGGA TTGAAAGGAA GCTGTGCCTT TTGGCAGACC 3660
CATTAGGTTA ATGGGGTTGG AGACCTTTGA GGATGCATGG GCCCTGGGCT TTATCTGAGG 3720
GTATCTCCTG GTGTTACCTC TCCAACCCTC CACCACCAAA TCCATTCTTT TTTTTTTTTT 3780
TTTTTTTTTT TTGACAGTCT CGCTCCCTGG CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG CATGATCTTG 3840