EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-00194 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:12513430-12516050 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr1:12515004-12515015CTCTGTGGTTT+6.14
Sox3MA0514.1chr1:12513684-12513694AAAACAAAGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00009chr1:12506389-12526105Adipose_Nuclei
SE_01743chr1:12511532-12515011Aorta
SE_03005chr1:12513943-12515024Bladder
SE_15065chr1:12506299-12515319CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20910chr1:12506384-12515111CD8_Memory_7pool
SE_26086chr1:12513098-12515726Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26716chr1:12513330-12515524Esophagus
SE_28215chr1:12513081-12514952Fetal_Intestine
SE_29231chr1:12512885-12515007Fetal_Intestine_Large
SE_29871chr1:12514499-12515348Fetal_Muscle
SE_33776chr1:12506505-12516452HCC1954
SE_37319chr1:12513768-12518184HSMMtube
SE_39882chr1:12512832-12515652K562
SE_41209chr1:12512181-12515171Left_Ventricle
SE_42647chr1:12511538-12515195Lung
SE_45864chr1:12513386-12516437Osteoblasts
SE_49026chr1:12513381-12515085Right_Atrium
SE_50544chr1:12513372-12515427Sigmoid_Colon
SE_51539chr1:12512592-12515650Skeletal_Muscle
SE_52815chr1:12513220-12515041Small_Intestine
SE_54847chr1:12512158-12515661Stomach_Smooth_Muscle
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I012452chr11251265812518656
Enhancer Sequence
CTCTTAGAAA GAATATAAGA GCTTGAGAGA AACAGGAAAG ACCTGAATAA GACCCTGAAT 60
TGGCTGCGGT GCTCCTGGGT CTCTTCAGGT GGAGATGTGT CCCCTGGAGA CACACAGGAC 120
ATGGGCACGC GTCACTTAAC TGTGGTTCTC ACAGCGTCTG GGGCACCAGA GAGACACGTT 180
TTTGTCTGGA ACCTGAAGAA CGCTGGCAGC CTACATAATT CTAAACATAG CAGGCACTCT 240
TATTGATTCT TTCCAAAACA AAGGTCACAT TTCCTTTCTG TGTAGTTTGT GTCCTGGGTT 300
CCTGCTGACT GTTTTGTGTA TACGATTGTT ACCTTCTCAA AGAGACTGTC AGTTCTTGAG 360
GGCAGGGTTC AAGGCTGCTG TTTGTTTGTG TTCTTCAGCA GTACCTAAAT CTGTCCTGGG 420
CTCAGAGGAA GTATTTAGTA AAGACATTCT ACCTTGGGTT GTAGGTCACA CAGTGCCAGA 480
GCTGGAAAGG ATTTTGGAAA TCGTAGAGTC CAACACTCTA ATTTTGTAAG TGGTACCACT 540
CCAAAAACTT ACTTGGGAGG CTGGTGTTTA TCTGCTGGAA AGAGAGGATT TTATTATGTT 600
AAACTATAGT GCAAATGACC ATAATTCTAA ACCTTTGACA GGCTTCCCTC AAACGCTGCA 660
GGCATGTTCC TCCTTGGACT AGTAGCAGAG TAATAAGAAC AGTAAGAATG CTAACTAGAT 720
ACCAGGCCCC CGAGCCATTG TCATGAATGC TTCCAGCCAC ATGACAAAGT AGGTACTCTG 780
GCTATTCTCC AGATGCAGAG GAGGCTCAGA GGTAGGTGAC CTCGCTCAGG GTCATGTAGT 840
TACCAGAATG GTCGAGGGAG GACTGAAGTT TGGTCAGATG CCCCAGCTTG TGGCCCTTCT 900
CCTATACTGT GGTAACTCTC AGATGGGGTC TCTGACTGAA GCCACTCCTT AGTGATTCAC 960
GGTGCTAGCT TTGCAGCGTC GTGTGGTGTT TCCAGTTGTC CTAAAGGAAG TTATTAATTT 1020
TCATTAACTT TAATTCTCTC ATTAGACAGG CAGTGATATG GAAGGCAAGG CAGAAAGCAA 1080
ACAAATAATG ATAGGGGTTA CATCTCCAGA AAGGTCAGGA ATCACTGCCC TAGGTTGTAA 1140
AATATTTGGA CTGAGTAAAA GGCATGAGTC TTCCCATAGC TTCTTCCAGG AACTGTTGCT 1200
TTACATGGAA TTGCTGCTGT GTTCACTAGT CCCTCTTCTG TGCCCAGAAC TCACTGTCAC 1260
ATGTGTCAAG AATCCTCATG ACTGAGGTTT CCAGGGCAGA TCTGATCTGT GTAACACGCA 1320
CCCTAACCCC CTTGCCAAAG GAGAATGAAA TAGGCCCCTA GATGGCCACC CAGTTCCTGG 1380
GCCTTCCAGG CAGGCAGCTT GCCTTGAGGC TTTCCCCTGA GCCTTGTATC TAAGGAACAT 1440
TCCTGTGAGT TTTCTAAGAG GTTAGTCCTG GGTCATTGGC ACTTAAACCA CTTGTTTTGG 1500
TAGATCCTTC CTGAGAAGGT TAATTATATA TTTGATATCC TTCTCTTTTT ATGCCTGAAT 1560
GATGAGGATA AGTACTCTGT GGTTTATTAA CTGTCACTTT AAACCTTTTC AGATTGTCTT 1620
GTGACAAAAC AGAGTTTTAT GTCCTTTTTA TCCCAGCTTT GATGGATGAG ACAGCTTTTC 1680
TGGTTAAAGT ATGCCAGGAT AAATAAAATC TCTGAATTGT GGAAAGGGTG GGTTTGCATT 1740
TGAAATCATG AGTTCAAGTC TGCCACCTCC TATGAACGGT GACCTAACCT GTTAATCTTT 1800
CCATCGATTT CGTTTTTGGC TTTTGACAAA TGGAGCTTGG CACCTCATAG GTACTCAGTA 1860
ATTATTGAAT AAATGAAAGA CAGCATTACT GGAGGGAGTT TGATGTCTCC AAATATTTGA 1920
TACCAAACCC TAAAGCAACA ATCTGACACA TTTCCTGTTT TGAATTCCAC TAATTCTTAG 1980
AGCAAAGAGC CTATGTTCTT ACCATGATAC AGTCCTGAAG CTCACTTCTC CCTCAAGACT 2040
ATTTTGTTAT ACCTCTGATT TTTTCAGTAA ATTTGGAGTA GTATTCTGGA AAGTGAATGT 2100
CATTAAAGAT TTTTAGTAGT TGCTTTGCAA AGCCTAGTGT CCTCCATTGT ATGCATCCCC 2160
CAATTGGTAT GTGTCCAGTC CTTTTGAGAA CCACTCAACC TGGGGCAGAC AGTATAGGTA 2220
ACTGCATTTA AAATATTTAA ATTTATTTAT ATTTAAATTA TTGGCCAGGC ACAGTGGCTC 2280
ACGCCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC TAGGTGGGCA GATCACTTGA GGTCAGGAGT 2340
TCGAGACTAG CCTGACCAAC ATGGTGAAAC CCCATCTCTG CTAAAAATAC AAAAATTAGC 2400
CAGGTGTGGT GGTACACACC TGTAGTCTCA GCTACTCGGG AGCCTGAGGC AGGAGAATCA 2460
CTTGAGCCTG GGAGGCGGAG GTTGTGATGA GATGAGATCA CACCACTACA GACCAGCATG 2520
GGCTTATCTA ATTGTATTTA ATTTAAATTT ATTTAAAGTA ATTCAAATAG TAAAAATAGT 2580
GCCAAGACTT TAAAACTCTT CTCCTGCTTT TAACTCCTTC 2620