EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-00193 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:12506460-12510640 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MYCNMA0104.4chr1:12507043-12507055GGCCACGTGGCC+7.22
MYCNMA0104.4chr1:12507043-12507055GGCCACGTGGCC-7.22
ZNF263MA0528.1chr1:12508024-12508045GGGGGAGAAAGAGGAGGGAAC+6.23
Number of super-enhancer constituents: 29             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00009chr1:12506389-12526105Adipose_Nuclei
SE_01743chr1:12506662-12507146Aorta
SE_01743chr1:12507910-12508720Aorta
SE_01743chr1:12508791-12509347Aorta
SE_01743chr1:12509733-12511495Aorta
SE_03005chr1:12508205-12508805Bladder
SE_03005chr1:12508948-12509464Bladder
SE_15065chr1:12506299-12515319CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20910chr1:12506384-12515111CD8_Memory_7pool
SE_26086chr1:12506439-12510424Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26716chr1:12506659-12513255Esophagus
SE_28215chr1:12507888-12510030Fetal_Intestine
SE_29231chr1:12507637-12510111Fetal_Intestine_Large
SE_29871chr1:12507739-12511538Fetal_Muscle
SE_33776chr1:12506505-12516452HCC1954
SE_37319chr1:12506164-12510707HSMMtube
SE_39244chr1:12506590-12507653IMR90
SE_39244chr1:12508337-12510202IMR90
SE_39882chr1:12506572-12512625K562
SE_41209chr1:12508082-12512128Left_Ventricle
SE_42647chr1:12507839-12509412Lung
SE_42647chr1:12509663-12511484Lung
SE_45864chr1:12506318-12510756Osteoblasts
SE_49026chr1:12508155-12509308Right_Atrium
SE_49026chr1:12510064-12511360Right_Atrium
SE_50544chr1:12507931-12511360Sigmoid_Colon
SE_51539chr1:12506369-12511986Skeletal_Muscle
SE_52815chr1:12507938-12510555Small_Intestine
SE_54847chr1:12507468-12511742Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr11250737012507567
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I012446chr11250657212511845
Enhancer Sequence
AGACTCCCTC TCAAAAAAGA AAAAAAAAAA AAAGAACAAT GGCAAAGATC AAGAGGAATG 60
AAGATTGAAC CAAATGAACT TTCAAAATCT TCTTTTTTTA CCCTAGGAGC ATGGTTGGTT 120
TTGCCTGCTT TCTCTCTATA GTCCTCTTTC TCTCCATAGT CCTCTTTCTT TCCATATCCC 180
CCTATATTTG TATCTCCATA TATGTCCATT ACTGGTACAT GAAACAGGCC TTTCCAGAGC 240
AGTAGCTTCT TTTGGAGTTA GTTTGCTTGA CCAGACCAGC TCTAACTTAG CAAATGTTTT 300
AGCTTTGGTG TTCTACGTCC TTCAGGAAAT CATTCTCCTA TAAGAAGCTG GGGTGGAAGA 360
GGAGACCTCT CCTCCATAGG CAGCACCTCT TGAAATCACT GGTCCCAATC TCCACCCCAG 420
TCTGGCCTCC ATCTTTCTTC CTAGTATAAA TGGTACATAC TAGTAATGTA AGCTGGTGTG 480
GTGTGATGTG ATCCACATAA CGGACATGTA CCAAGCCTCC TATTTCTTTG GGACCTGTTT 540
CAGATTGTCA GAGTAGTAGC TTTGGGAAAA GAAGTAGATT CTAGGCCACG TGGCCTCCGG 600
AAAGGTCTGG GTGATGGAAG TGGGCCAGGT GTCTGAGTTA CGGATATGGA TCAAGAAAGA 660
ACACTGGAGC CTGACTCCTC TTCCTTGTCC AGATATTTGC ATGTAATTTT TCAGAAATTT 720
TTTAATATAC TTTTGTCAGC TGCCTTCCTT TGTCAGTTCT GCTACTTGGG AGAGAAAAGA 780
GATATGCCTG ATATCTCTGT ATAATTTTCA CTGGCATTTA GGAAGGAATT TTTCTACGAA 840
GACAATAGCA AAAGTCATGG TTGGGTTACC TCTCTAGGTT ACCCAGTATC ACACATAGAT 900
ACTTAGCAGA CTTTTGCTGG AAATGCTCAT GGTCTTTCCA GCTTTATCTG TAAAATGAGC 960
ATAATAATAC TACCTCACAG GATTGTTGTG AGGATTAAGC TAGTTAAATA TTTCATTGAT 1020
GAGAGGCCCC AAAGACAGTG GCTGGCACAT GACGAACGTT GTTGGCTGAT GCTTATGATT 1080
CCAGAAGTTC CACTGTGGTC TTCAGTACTT GGAAGTTTGC CCTTACCTAC TCTGCCACAC 1140
ACTCATCTAA AACTTAATTT ATTTAAAGAA ATAGTTGGGA ACGGATTTCT TTCTAAAAAC 1200
CTCAAAAAAC TTATTCCAAA CCCTTGAAAC CTATTTTACT TTTGCCACAA GAAGCTCAGC 1260
TTATACTGGT GCCCAGCATC TATGATTATT CTCTCTGATG TCATCAGCCT CCTTTCTTCT 1320
AAGCCTTTGG CATTAAAGTG AATATATTTA TTCATTTGAA ATAAATACAA AGTACTTTGT 1380
AAGAATGGAG GTCTTGTGAC TAGGAAGGAG ATCATCTTGA GCTTCTTTTC TGTTGAGGAA 1440
TGTTCGGTTT CATTTCTAAA GTTCTGTATT TTGCGATTTT AATTGACATA TTTATGCTTT 1500
CCTTTGTTCC AGAATGGGCA TGAGGTGATT TCCATAGTTT AGGATGAGAC ATGCAAGATT 1560
CAGTGGGGGA GAAAGAGGAG GGAACCGGAG AGCACTCATT GGAAGAAAGG ATAGGATTTC 1620
CAGTAATAAC CCTTTGATTT GTGTTTTTTT CCAAGTGCTT TCGTAACCAA GGTCGCCGTG 1680
GGTAACTCCA TGGGTGGTGT TCTCCCTGTT TTGTAGATGA AGACACTGAT TCTAAAGAGA 1740
GTGTGTCTTT TGCTCATGTT CACCCAGCTG ATACTAATGA CAAGAGTTGG CATCAGGACT 1800
CTGCTTTTGA GAGCCTGTGT GTTTTCTTGG AGTTGAAATA AGTTATCTGC CAAATCAGGC 1860
TTTATGGTGT GACCGCCATA GAGGGAATTT TTTTTCCTGC ATTATAATCT ATCTCCTGGT 1920
TCAGTACTGA GGCACAAGCT ATTTATGCAA AAACCTTGTT AGAATGGCAA AACAGGAGCT 1980
CTCATGGGGT GGGAAGGCAT ATTCCCCATG GCCAGTGCTA ACTGTATGGA AACCTGTCTT 2040
CAGGCTTCCC TCTGCATGCT TCATGGGGTT TCAGCAACAG ACAAGTAGGG GTCTGGCATT 2100
TTCAACATAA GCATACCCCC CTTCTGCCAA AAAGTCCTAC ACTGGGTCCT AGCTGATGAA 2160
GAGCTGAAAG GCAGGACACA ATTCCATCCA CAGCTGGGCT TCAGGATTCA TCCTTCCTTC 2220
ATAATTCTTT ATAATCAATG TAGAAAAACT ATAGGGAAAA TAGGATTTGA CTAAGCCCCG 2280
ACTTCTCTAT GTTGAAGATC AGTTGTCTTG ATTCTACCTG TGTACATCCT GCTTATTTCT 2340
GCGGTTTTTA CTTTATAGCA TACTCCACCA ATCCTTTTTA AGGAAAAAGC AAAATCCTAT 2400
TATGGGAATG CTTCAAACCA CTCTGAGCTT CCAGATTAAT CTGAAACAGC ATCTGAGTTC 2460
ACAACTGGGT CAGAGTTGCA GAATAGCAAG AGAAACTTGC CAGTTCAGCA GGCGTGTGTC 2520
TTGGGTTAGT TAAGACAGCA GGACAGTCCT GAGGCCTGAC TTCCTTGCAT GTGTTTCAAC 2580
CTTGGGTGCT GAGATAATTC TGGGTGGCTT TAGATAACTT TGTTTCTTAA CTGAAAAAGG 2640
AGTGTCTGTT GCCTGATAAG TGTTTATCCG TGAAATAGCA ACATGGTGTG CATCTTAGGG 2700
TAGGAGGGCT TTTAGATCTC CAGAGACCAG GAAAAAAAAA AAAGCAAGGT CATTGGCTTA 2760
GGCATATTAC TGGAATTAGG ATGTCAGTCC CAACTTTAAA ATGCCTGTAT TGTTTTTATT 2820
CAGGGTCCCC TTTCTGGATT CCTCCCCTTT TTTTCTCTTT GCCTTAAGGG CTATACATAA 2880
TCCATAACCA AGTAGAACTG AAAACAGACA AAAGCACTCC TCTTCTAGTG GATAGAAATC 2940
TGGAATCCAG AAATGCTTCC TTCTTGCCAA ACCTCAACTT GTTCCGTGCC TTTTTTTTTT 3000
TTTTAAATGC CTCTTCCCAG CCTCCCCACC CTTTCGTGAT TTGGCTGAGT GAGGACTAGC 3060
TGTTTGGTTT GCCTTTTATC AACAATAGAT ATTCACTGCT TTTCAGGTCA CATTTTCCTT 3120
TAACTCTTCT CTGTTTATGA GTATCACAAA AGGGTTCTTC AACATCAAGG CAAAACTCAC 3180
ACTCAGAATA CTTTTTAACT GTGGATATTT TGACAGTATG AAACGGAAGT CAGTGGTGAA 3240
GACTTTCGTT TTGAAGTGAC TTAGGTCTTA CATGACTCAA AGATGGTTTT CCTAGTAGTA 3300
TACCAGCAGA GTTGAAAATG ACTCTGAAAT TGAAAGTCCC ATACTACTTC TAAGAAACTT 3360
GTAAAAAGTG TTGGCCAAAT GCTACACCAA ACATTTTGCA TTAATTATTC TCTTAACTCT 3420
TCAAAACAGT CCTTTGCAGG CCAGGCTCGG TGGCTTATGC CTGTAATCCT AGCACCTCGT 3480
GGGGCCGAGG TAGGCAGATC ACATGAAGCC AGGAGTTCAA GACCAACCTG GCCAACACGG 3540
TGAGACCCTG TCTCTACTAA AAATACAAAA ATTAGCCAGG CGTGGTGGCA CACAACTGTA 3600
ATCCCTGCTA CGGGAGGCTG AGGCATGAGA ACCGCTTGAA CCCAGGAGGT GGAGGTTGCA 3660
GTGAGCTGTG ATCGCACCAC TGCACTCCAG CCTGGGTAAC AGACTGAGAC TCAGCCAGCA 3720
AAAAAAAAGA GCAATCCCTT ACAGTAGAAA GTATGTGATT TTAGCAGATG GATAAACTGA 3780
GGTTCAGAGA AATTAAGCCT CTTCCACCAG CATGCGTGTT TGGTAACTGT CAGGGTAAGA 3840
TTTGATTCCT TTGCTCCTGC TTGTTTGACT ACATCGTGGC AACTCCCACA AAGTTCATGG 3900
CAGCCTTACT TAGAGGCACA ATAGATAGTT GGGTTTTCCA AATTTATGAG TTCAGACATA 3960
GCTTATTGCA GGCAATGCTG ATTAGAATTA GAGCTGTGCT GGTAGCTGAG GTTTGCAGCT 4020
GTACAACCTT GTATAGTCTC TGACTTGTGG TGGTTTAACT TACAATTTTT TGACTTGACG 4080
ATGACGTAAA AGCTATATGC ATTCAGTAGA AACTGTACTT CAGATTTTGA GTTTTGATCT 4140
TCCTGGGCTG GTGACATGTG ATCCGATTCT GTCGCAGTGC 4180