EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS138-00113 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MSC_BM 
Coordinate
chr1:8962210-8966840 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
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Lhx3MA0135.1chr1:8965058-8965071TATTAATTAATTA-6.25
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Lhx3MA0135.1chr1:8965069-8965082TAATTAATTAATT+6.78
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Lhx3MA0135.1chr1:8965066-8965079AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965070-8965083AATTAATTAATTA-6.78
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POU6F1MA0628.1chr1:8965059-8965069ATTAATTAAT-6.02
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POU6F1MA0628.1chr1:8965071-8965081ATTAATTAAT-6.02
TFAP2AMA0003.3chr1:8964140-8964151TGCCTGAGGCA-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:8964466-8964487TCCTCTCCTTTCCTCTCCTCA-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:8964456-8964477CCCTCCCCTCTCCTCTCCTTT-6.33
ZNF263MA0528.1chr1:8964444-8964465TCCCCTCTCCTCCCCTCCCCT-6.49
ZNF263MA0528.1chr1:8964451-8964472TCCTCCCCTCCCCTCTCCTCT-7.48
ZfxMA0146.2chr1:8962319-8962333CCCGCCTCGGCCTG+6.62
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_27088chr1:8962399-8963262Esophagus
SE_27088chr1:8963489-8964684Esophagus
SE_27088chr1:8965237-8966346Esophagus
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SE_34103chr1:8965610-8966423HCC1954
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SE_34916chr1:8962041-8965067HeLa
SE_34916chr1:8965216-8966534HeLa
SE_36553chr1:8962470-8964537HMEC
SE_36553chr1:8965481-8966338HMEC
SE_42834chr1:8963483-8964807Lung
SE_46612chr1:8962243-8964865Osteoblasts
SE_46612chr1:8965500-8966434Osteoblasts
SE_47312chr1:8961358-8966536Panc1
SE_56056chr1:8962341-8965238u87
SE_67633chr1:8962341-8965238u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr189623718964927
chr189640538964236
chr189653378966372
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008902chr189624608964905
GH01I008905chr189655548966260
Enhancer Sequence
GATTACAGGG GTGCGCCACC ACGCCCAGCT AATTTTTGCA TTTTTAGTAT AGATGGGGTT 60
TCACCATGTT GACCAGGCTG GTATCGAACT CCTGACCTCA GGTAATCCAC CCGCCTCGGC 120
CTGCCAAAGT GCTGGGATTA CAGGCATGAG CCACTGCACC CGGCCTTAAT ACATTTTTGT 180
TGAATGGATG AAGTGCTTCT CCATAAGGGA TGTTTGGGTT CAATTTTCTG GCTCCCACAA 240
ACCCACCTTC TGAGTCTCAG ACCCTCTCCT TGTCCATACC TGTCCATGCG GAGATAGGCG 300
GTGTGGTGTT ACGATAGATA CATACTGGTT TGCATCTGCA GATCCCCGTT CCTAACTCCC 360
ACAGTCCTGT GATAATGTTG GGGCACTTGA GGCCTCAGGA AACAGAACCT CTCCTCTGAA 420
CTTCTCCTGT TCCTCTTTCA CCTGTCCAAC CAGGATTCTA ATCTGATGTG GGTCCAAAGA 480
CCTTCATTCC AGAGAGGGTC CTGCCCCATA CCCTAGAGCA AGACTGTTCA GCCCACCGTC 540
CAGGATGGCT TTGAATGCAG CCCAACACAA ATTCATAAAC TTTCTTAAAA CATTATGAGA 600
TTGTTTCACA ATTTTTTTTT AAAGATCATC AGCTATCATT AGTGCTAGAG TATTTTATAT 660
GTAGCCCAAG ACAATTCTTC TTGTTCCAAT GTGGCCCAGG AAGTCAAAAG ATTGGTCAGC 720
CCTGCCCTAG AGGAAGGAAT GCTGAGAGAG AGGCCAAGAA AAGTCTGAAC AGACAGGCCT 780
TGCCGGGGGT TTAGATCATG AGATTTTTGT CCAATCACAT TTCTACACGG TTATCAGTCG 840
TGCCCATGTA ATGAAGCCTC CATAAAAAAG CCACGAGGAC TGGGTTTGGA GAGGTTCTGG 900
ATGGCTGAAT ACGTGGAGGT TCCTGGAGGG TGGTGAGACC CAGGAGAGCA TGGAAGCTCT 960
GCTTCCCCTA AACTCCACCC TATGCATGGC TTCATCTGTA TCCCTTGTGA ATCCTTTATA 1020
ATAAACCACT AAACATAAGT AAGTGTTTTC TTGAGTTCTG TGAGCCATTC CAACATATTA 1080
ATCAAACCCA GGCTGGGCAT CGTGCCTCAT ACCTGTAATT CTAGCACTTT GGCAGGCCAA 1140
GGCGGGTGGA TTACTTGAGG TCAGGTGTTC GAGACCAGCC TGGCCAACAT GGTGAAACCC 1200
CGTCTCTACT AAAAATACAA AAATTAGCCG GACATGGTGA CTCACACCTG TAATCCCAGC 1260
TACTCAGGAG GCTGAGGCAG GAGAATCGCT TGAACCCGGG AGGCGGAGGT TGCAGTGAGC 1320
CGAGATCCCG CAACTGCACT CCAGCCTGGG AGACAGAGTG AGACTCCGTC AAAAACAAAA 1380
AAACAAAAAG CAAACAAACA AAAAAACAAA CCCAAAGAGG GGGTCATGGG AACCCCAAAT 1440
TGAAGCCAGT GACTCAGAAG TTCCAGAGGC TCAGACTTGT GACTAGCATT GGGGGAGATA 1500
GTCTTGCAGA CTGAGTTCTC AAGCCCTGGG ATGTGATGCC ATCTCCAGGT AGATAGTGTT 1560
GAAATTGAAT TGCAGGACAC CCAGCTGGTG TCCACCCCCA CACATTTGGT CACAGAAGTC 1620
TTCTTCTGTG TTGACTGTTG TGGTGTGAGA GTAGAGGAAA AATGCAGTTT GGATAGAGTT 1680
TTTTTCTGAC ACAGGTGGTG ATCTTCAGGA ACCCACCTGC ACCTGTGAGA TTCTGAAGAC 1740
GTGGACCCAG CCTTCACAGG CATCCAAGTT ACCTTCCCCA TGAGGACTTG TTTTACAGAT 1800
CACAAAAGAC ATCTGCACTT TGTATGGCTC CAGCAGGATC TCTCTGATCT GTGAGGATTA 1860
ATGAGCCAGC CACATCTCTC CCCAGCTTCC TGGACCAATG GCGCAAACCT AGTTCAGAAA 1920
CCCAGCAAGT TGCCTGAGGC ATTAGCCAGG CATCCGTGGT ATGCAAGTTT TGGCACTGGT 1980
TTGCTGTTTG GATGTTTTTC TCCTTCAGGC GGAAATTTAC AAAGCACTCA TGCTCCAACT 2040
ACCATGGCAG AGAGAGGAGG TGAAGCAAAT TGTAAAAACT TCAACCTCAG TATTGAGTTT 2100
CTCCTTGACT TGTGTTGAAG CCAATGATGG CAAGGGATGT GGATAACCTG GATGTTTTCT 2160
CTTGGGATCC ACCCTCTCAC AGGTGTTCCT CTGAGCACTT TGCAGGATGA GAAGTTGAAT 2220
AGGGAGGGGA GAGGTCCCCT CTCCTCCCCT CCCCTCTCCT CTCCTTTCCT CTCCTCACAG 2280
GGTCTCGCTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AGTGGTGTGA TCTTGGCTCA CTGCAACCTC 2340
CACCTCCTGG GCTCAAGCAA TCCTCTCACC TTAGCCTTCT GAGGAGCTGG GACTACAGGC 2400
ACGTGCCACT ATACATGGCT AATTTTTATA TTTTTTTTTG GTAGAGACGG AGTTTTGCCA 2460
TGTTGTCCAG GCTGGTCTTC AACTCCTGGG CTCAAGCAAT CTGTCTACTT CGGCCTTACA 2520
AAGTGGGTGC TGATTTCTCT GCAGCTTATG GACACACCAT AAGCTGGGGG CACCCATGGA 2580
AGTGCTTTAG CTTGTAATCT CCATCAACAT CTCCCACAAG ACACCTCCCC AAACTTGATC 2640
TGGTTTGGGG AGTCACTGCT GTCTGGAGGA AAACATCTCT AATTTAGCCC TCGAGATTAC 2700
ACATATTAAG TTCAACTAAG TACGAACTCA AGGTATATTA AATACAATTT CCAAACACAC 2760
CAGCCATCAT GAGTGAGAAT CAGCAGAAAC TATGAATGAC AGACTTAGGC CATCTCAGGT 2820
TTTTGGAGTG ATCAGATACA GATTATTTTA TTAATTAATT AATTAATTAA TTATTTTTGA 2880
GATGGAGTCT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCATG ATCTTGGCTC ACTGAAACCT 2940
CTGCGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCAAGT AGCTGGGATT ACAGGCGTGC AACACCATGC 3000
CCGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTTGAGAT GGGGTTTTGC CATGTTAGCC AGGCTGGTCT 3060
CGAACCCCTG ACCTCAGATG ATCCACCTGC CTTGGCCTTC CAAAGTGCTG GGGTTGCAGG 3120
CATGAGCCAT CCCGCCTGGC CAGATACAGA TTATTAAGCA TAGAGTTGTA AGGCAAGCGT 3180
TCTGGGTCTT TCTCTTTCTC TGTCTCTCTC TCTTTCTTTT TTTCTCTCTT TTTCTTTCTT 3240
TCTTCTTTTG AGACGGAGTC TTGTTCTGTT GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG CCACGATTCA 3300
GGCTCACTGC AACCTTCACC TCCTGGGTTC AAGTGATTCT CCCACCTCAG CCTCTCGAGT 3360
AGCTGGGATT ACAGGCACCC ACCACCACCC CCAGCTAATT TTTGTATTTT TAGTAGAAAC 3420
AGTGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CAAACTCCTG ACCTCAAGTG ATCCACCCAC 3480
CTCAGCCTCC TAAAGTGCTT GGGATTACAG GCGTGAGCCA CTGCGCCCCG CCCTGGGTGT 3540
CTGTTTCGAT CTTGCTGCTC CTCTGAGCCT CCTATACAAA GATTCTGGCG CTACTGCACG 3600
CCCTGTGTTT GTGTCCTCTA TGTTAAAGTT CTTTTTCCTG GCTAATGTGG TCCAGACATG 3660
TTGGAAGGGA TTCTAAAGTA ACAATCCTGT GACCACGTGA CTGTGAGAAG AATTCTTTTC 3720
TAAAGAAAAG GATCTTCATC ACATACCGAC CCATCTCTTT CACTACCTTT AATACCACCT 3780
CAGATATCTC TCTTTTCATT TCCTGCAGCC CTTATTGCTT CCGTGGTGTT AGGCCCCTTG 3840
GCATTTTGTC ATATTTGTTT TTTTCCATTT TGTAGCTGAC TGTCTCACCA GTCACTCCTG 3900
TCTGGAGGAA AACATTCCCA GTTTAGCCCT TGAGATTACA CTTATTAAGT TCAACAAAGC 3960
ACAGCCTCAT GATACATAAT TTCCAAACAC ACAAGGAAGC CAGCCATGAT GAATGAGAAA 4020
CTATGAACAA CAGACTTAGG CCTCTTTAGG ATTTTGGAGA AATCAGATAC AGATTATTAA 4080
ATAACTACTC ATGGATTTTT TTTTGGGTGG GGCGGTGCTG CTTTTTGATT TCTTTCTTTT 4140
TTTTTTTTTT TGAGATGGAG TCTTGCTCTG TTGCCCAGGC TGGAGTGCAA TGGTGTGATC 4200
TCAGCTCACT GCAACTTCCA CCTCCTGGAT TCAAGCGATT CTCCTGTCTC AGCCTTCTGA 4260
GTAGCTGGGA TTACAGATGC CCACCACCAT GCCTGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG 4320
ACAGGGTTTT AACATGTTGG CCAGGCTGGT CTCAAACTCC TGACCTCAAG TGATCCATGA 4380
GCCTCAGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACT GGCATGAGCC ACTGTGCCCG GCCTTGATTT 4440
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGACAGAGT CTTGCTCTGT CACCCAGGCT GGAGTGCAGT 4500
GGCAAAATCT CGGCTCACTG CAAGCTCCGC CTCCCGGGGT TCACGCCTTT CTCCTGCCTC 4560
AGCCTCCCAA GTAGCTGGGA CTACAGGCGC CCGCCACTAC GCCCGGCTAA TTTTTTGTAT 4620
TTTTAGTAGA 4630