EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS134-40452 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Mesendoderm 
Coordinate
chr3:138597060-138599270 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:138598158-138598170GTTTGTTTGTTT+6.32
HNF4GMA0484.1chr3:138598838-138598853AGGGATCAAAGTTCA+6.74
Hnf4aMA0114.3chr3:138598839-138598855GGGATCAAAGTTCAGT+6.6
Lhx3MA0135.1chr3:138597239-138597252TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr3:138597243-138597256AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr3:138597242-138597255TAATTAATTAATT+6.78
POU6F1MA0628.1chr3:138597240-138597250ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:138597244-138597254ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:138597240-138597250ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:138597244-138597254ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_28317chr3:138597974-138599548Fetal_Intestine
SE_28944chr3:138598104-138599576Fetal_Intestine_Large
SE_40235chr3:138597003-138597545K562
SE_40235chr3:138598431-138598979K562
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH03I138878chr3138597004138597545
GH03I138879chr3138598052138599263
Enhancer Sequence
TCATCATGTT GTCCAGGCTT GTCTCAAACT CCTGACCTCA AGTGATCCTC CCACCTCAGC 60
CTCCCAAAGT GCTGGGATTA GAGTCGTGAG CCACTGTGCC CGGCCAGGGA GAGTGTGTTT 120
CTGTTGGAAG GATCCTCCAA GGACATCTGC AGTTTTTTCA ATGTGAGGAC AGATACCTGT 180
ATTAATTAAT TAATTCGTTC TCAGGAACTA TTTTTTTCAC TAAAAGGTGA ATATAAAGGT 240
AATTTACCAT AAAATTATCA CACAATACAC TTCAAAATCA AATATATTAA TGGAGTCATT 300
ATTTAGATTA TTTTTGCCTT TTCTCCACTT CCTTGGTGGG AATGATCAGA TTTGACTACA 360
GAAACTCAAT ACCTTTGCCA CCAACCACAA ACATTGGTGG CACTCCTTAG TATAGTAGGA 420
GAACTGAGGG TGTAAAGAGG TGGCAGGTTT CTGGCCTCAT AGAGACCTTG GCCATTCCAA 480
AGATGAATCT TTTTTTATTT TTTGAGACTA TGTCTTGCTC TGCCACCAGG CTGGAGTGCA 540
GTGGCATAAT CTTGGCTCAC TGCAATCTCC GTCTCCTGGG TTCAAGTGAT TCTCCTGCCT 600
CAGCCTCCCA AATATCTGGG ATTACAGGCA CAAGCCACCA CACCTGGCTA ATTTTTGTAT 660
TTTTAGTAGA AACGGGGTTT CACCATGTTG GCTAGGCTGG TCTCGAACTC CTGACCTCAA 720
GTGATCCACC CGCCTTGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCATGAGC CACCATGCCT 780
GGCCTCAAAG ATGAATCTTA TTGCCATAGT TTTTTATTTA TAAGTCAGCA TCTGTTTGCT 840
AAAGGAGCTT TCTGGGGCTC AAGCAATCCT CCCGCCTCAG CCCCTTGAGT AGCTGGGACT 900
ACAGGTACAG GCCACCATGC TTTACTATTA TTTTTTAAAA ATGTTTTTGT AGAGACAGGG 960
TTTCCTTATA TTGCCCAGGC TGGTCTCAAA TTCCTGGGGT CAAGCAGTAC ATTCACCTTG 1020
ATCTTCCAAA GTGCTAGGAT TACAGGTGTG AGCCACCACA CCCAGCCTCC TTCTTGACTC 1080
TTATACTCCA AATATTTTGT TTGTTTGTTT TATTTTGAGA TGTGGTCTTG TTATGCTGCC 1140
CAGGCTAATC TCAAACTCCT GGTCTCAAGC AATCCTCCTC CCTTGGCCTC CCAAGTAGCT 1200
GGGATTATAG GCATAGGCCA TTGTGCCTAG TTTACCCTCA ATATTTATAA TTTATCAATG 1260
GATTCTTTTT TATTTTTATT TTTTGTAGGA AGAGATGGAA TCACACTAAT TTGTGCAGGC 1320
TGGTCTCAAA CTCCTGGCCC TAAACTATCC TCCTGCCTTG TCTTCTCAAA GTGCTGAGAT 1380
TACAGGTGTG AGCCACTGCA CCTGGCCTAT CAGTGGATTC TTATCCCATT CTATGCAGGA 1440
TCCCGATTGG ATTAAATTCA GATACTAATC CAACTGGTGG CTCTTGAGCC CTGTCGCCTA 1500
TGCATAGGGC TCTGCTCATC AGTTGTGCTG GTGCTGTTCT GTGCAGGTGT GGCCGGGACC 1560
TGGGAGGATG CTGCAAGTAG ATTTCAGGTT GAGACCCATG CCCAAGTTTG ACCTGCTCCT 1620
ATTGCTCATT GTTTAAGTTT AAAGGAGCAT TGTTTAAACT CCCTTCTAAA CCAGCAGTGT 1680
GGATTTTGCC TTGGTGTAGA CTCAAGATAT TCCTGACTGG GTTTCAGTGA CAGGAGAACT 1740
CCCTCTTTCC AGCTCACACT GCCTTGCCAC CCAGACAGAG GGATCAAAGT TCAGTCTATG 1800
TGACTGAACT AATTTGTGAT TGTGTTTTGA GTAGTTGTTT CGACAATCAA AGTCAGCCTT 1860
AGCCCCGCAT TGAACTTCTC ACATGCTAAA AAGCGTCTGA CACTCACAGC ACCAGGTGGT 1920
AGTGGCTCCT GCTGGGCCAT TCCCCTGCCT TACAGGTTAG GATCTGGAGT TTCAAGCTAG 1980
CGCTCAGCAA AGGAGAGTCC CAGAGCAATG AGGCATTGAC TTTTACCCAG AGGCATAGCC 2040
TGAAGGAAGA CAGTGACTTC AGGCTGGGCG CGGTGGCTCT CGCCTGTAAT CCCAGCAATC 2100
TGGGAGGCTG AGGCGGGTGG ATCACAACGT CAGGAGATCG AGACCATCCT GGCTAACACG 2160
GTGAAACCCC GTCTCTACTA AAAAATACAA AAAATTAGCC GGGCGTGGTG 2210