EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS134-38589 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Mesendoderm 
Coordinate
chr3:58033280-58036610 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11707429chr358033834hg19
rs12494328chr358035497hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr3:58033864-58033874ACCAATTAAC+6.02
NKX2-3MA0672.1chr3:58034318-58034328TTCAAGTGGT-6.02
NR2C2MA0504.1chr3:58033638-58033653TGACCCTTCACCCCC-6.01
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58035975-58035990TGAGCTCTTGACCTC-7.23
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58033509-58033524TGAACTATTGACCTC-7.41
RARAMA0729.1chr3:58033506-58033524TCGTGAACTATTGACCTC-6.16
ZfxMA0146.2chr3:58035998-58036012CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00762chr3:58032174-58039716Adipose_Nuclei
SE_01957chr3:58033868-58034414Aorta
SE_01957chr3:58034706-58035838Aorta
SE_01957chr3:58036187-58037788Aorta
SE_23194chr3:58034815-58035733Colon_Crypt_1
SE_26498chr3:58033363-58039459Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27681chr3:58033703-58037597Fetal_Intestine
SE_29426chr3:58033550-58039244Fetal_Intestine_Large
SE_30574chr3:58034058-58035832Fetal_Muscle
SE_36024chr3:58033449-58039332HMEC
SE_37989chr3:58025669-58040227HUVEC
SE_41579chr3:58033874-58034394LNCaP
SE_41579chr3:58034780-58035730LNCaP
SE_41579chr3:58036203-58037368LNCaP
SE_45969chr3:58032377-58039419Osteoblasts
SE_47269chr3:58019885-58040171Panc1
SE_56289chr3:58032310-58039346u87
SE_64106chr3:58033450-58035902HSMM
SE_64106chr3:58036259-58039158HSMM
SE_65730chr3:58034390-58037100Pancreatic_islets
SE_67942chr3:58032310-58039346u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr35803351558034395
chr35803500658035314
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058046chr35803243758041425
Enhancer Sequence
TGCATATCAC ACACTTTTTT TTTTTTTAAT TTATTTTTGA GACAGAGTCT GGCTCTGTCG 60
CCCAGGCTGT AGTGCAGTGG CATGATCTTG GCTTACTGCA TCCTCTGCCT CCTGGGTTCA 120
AGCGATTCTC CTGCCTTAGT CTCCTGAGTA GCTGGGATTA CAGGCACGGG CCACCATGCC 180
CAGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGATG GGGTTGGCCA AGCTGGTCGT GAACTATTGA 240
CCTCAAGTGA TCCTCCTGCC TCAGCCTCCC AAAGTGCTAG GATTACAGGA GTGAGCCACC 300
ATGCCTGGCC ACATGCGTGT TTTTTATTGA ATCATTTGAA AGTACTCAGC TCGTATCATG 360
ACCCTTCACC CCCACATACT CCAACAAGCA TCTCTAAGAA AAAGGACATT CTCCTAACCA 420
CAGTGTCTCT GCATTCCCAG GACATTCTTC TAACCACAGC GTCACTGCAT ACCCAAGAGG 480
TTAGCACCGA TACAGTAATA ACATCTTGTG TAAAACTTCC CAAAATGCTC CCAAGTGTCC 540
TTTATGACAG TTTAAAAAAA AATGGCATTT TTTGGGATCC AGGAACCAAT TAACGATTAC 600
TCAATTGAAT TTGGTTTCAA AGTCACATAC CTCAACTTTT CCTTTAATCA AGAACAGCCC 660
CCCTGCCTTT TACACATTTT TTTGTCTTTC GTGACCGTGT CATTTTTGAA GAAATCAGGC 720
CCGTTGTCTT GTAGAACTGG TGTTTCTCAA GTGTGCTTGG GAGGGTCTTG GTAAAATGCA 780
CATTCTGATT CTGGAGAACA GGGTGGAGCC TGGGAATCTG CATTTCCAGC CAGCATCCCG 840
GTGATGCCAG TGCAGCTGGT CTTCGGCTGT AGAATGTTCC ACATTCTAGG TCTGTCTGTT 900
TCCTTGTGAT TAAATTCAAG TTGAATATTT TTGGCTAGGG CACTTCCTGA GGTCATAGGT 960
ACTTCCCACT GCCTCACAGC ACAGGCTCAC AATCTCAGTT TGTCCTGTTA CTTCGTGGTG 1020
CTAAGTGTGG TCACCTGCTT CAAGTGGTGT CCGCCTGCTC TCTGTTGAAA CAATACCTTT 1080
CTCCTAGTAT AATGATTAGG TAACCTGTGA TTGTAATTGG TAAGTAATCT TTGAGACTAC 1140
ATGAATATCC TGTTCCCCAG CAGTTTTCAC TCATTGGTGA ACTGTTTTGG GAAAAATAAT 1200
AGCATCTTAC AGTTATAATA CCCTGCTGGT AACACATGGC TCTTACATAA TCAGCAGTTA 1260
ATTGTTTGTA TGTGTGTTAA TTTTTATTTT TAAAATGTAA CTAGTGACTG GTAACTCTCA 1320
TTTGTATTTT AAACATTGGC TTTTACAGCT TCTCAGTACA TTTCACTCTG TGTATGTTTT 1380
TGGTAGAGCA TTTGTTGTCC TGTATAATGG TTTAGGAAAT CCTATAGGCC AAATGAAGGG 1440
CTGGAGACTC ACCTGTGTTC CCACCACTGT GTTTCACTGT GTATTGCCAG AGAAAATACA 1500
GTTAAATTTG AATTTCAGAT AGACAATGAA TAACTTTTTA GTATAAGTAT GTTCCAAGTG 1560
TGGCAGACAG CTCTCACAAG TTACAAGTCG TTGCGTAGGA CATACCTATG CTAAACGATT 1620
TGATGTTTAT CTAAATTAAT ATGTAACTGA TATCTTGTAT TTTTATTTGT ACGATCTTCC 1680
AAGCCCACGT CCCACCGCCT TCTCGGGGAT GGCCACCATT TGTGTTTGCT GCCTGGTGGT 1740
GTTTGCAGCT GCGAGAAGGG CCTTGGAGGA GGAGCAAAGT GTAGTGGTAT CTCCGTGCTG 1800
TGGCCTTGGG CACTGGGGTG GGGGTTAGAT GAGTAATTAG CTGAATATGA CCTCACCCAT 1860
GAAGAATGTG CCCTTGCTAG GTATTAGCAG AGGTTTAGGC TCCAGGGAGC CATTGTCAGA 1920
AGCTTGTCAG TGATGTCATC AGCTGGAAGG GCCAGCTTTC AGGCCTCAGG AAAAAGCTTG 1980
AAAGTCAGGG CTCCAGTTTT GGTAATAAAT GGGAATGGAG TTTCACAGGT AGGGTGTGGA 2040
GGAATTTATT GTGACAGGAA GCCTGATGGA GCCTCTTGCC TGTGTGCAGC CCCCAGCCAG 2100
GTTTCTGAGT TCTGATGAAC TACCAGAAAC TTCCACCACG GCCTGTGATT ACACTGTTGG 2160
CCCAATGCCC TGGAAAAATT GGCTTGCTCT CGGGGAACAC TCCAGGAGCT GCAAAGGGGG 2220
TGTCAGGACT GTTGTGCAGC TCCCCTTAAA TTGGGGAGGA GGGGTGGCTG ATGTGGAAAC 2280
TGTTCATTAG ACTGCTCAGG GTAGTGTGAG AAAACGTGTA ATCTGTGGGC ATCTACCCCT 2340
AGCTGCCCCT CTGATCTCAC CCACTACTGT GGGAGGACCC CGTGGATGGG GGCAGAGGAG 2400
GGTCTTCTGG ATTTAGACAC TCACAAAACT TCCTTTTACC TTGTTCATTG GAAGAAATAG 2460
AAAATGCCTT TTTTTTTTTT TTTTTCTTTT TTTTTGAGAC AGAGTCTCGC TCTGTTGACA 2520
GGCTGGAGTG CAGTGGCATG ATCTTGGCTC ACCGCAACCT CTGCCTCCCG GGTTCTAACA 2580
ATTCTCCTGC CTCAGCCTCT GGAGTAGCTG GGACTACAGC CACGTGCCAC CACACCCAGC 2640
TAATTTTTGT ATTTTTAGTA CAGACGGGGT TTCACCATGT TGGCCAGGAC GGTCTTGAGC 2700
TCTTGACCTC GTTATCCACC CGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCGTGAGC 2760
CACCATGCCT GGTCTCTTTT TCATTTTTAA AGGGTAATTT GCTGTGCAGG AGTGGGCTCT 2820
CAGACCAGAA GTGGGGACCT GAATGAAATC AAGGACTGAG TATGGTAACT ACAGCCATTT 2880
AATTTTATTT GAAGTCTCCC GTAAAATGTT CTGGAAAAAA CAGGGGTTCC AGGGCTGGGT 2940
GGGCAGTTTC AATCATGGAC TGGATTTTGT GGTTCAGATT TCTCTGGGCC TGTTGGAGGT 3000
TCCCCTTAAG CAATTACCCA AGGCAGTTCT GCCCAGCTGA AGTACTGATT ACCTGCACAC 3060
TATACCAGTG AGGACTCATG GGTGAGCAGA TGGGAGGCAC TGAGCTTGAT TCTGAAACCC 3120
TGGCCTCCAT CCCACCTGAC ATTCAATGTC AGATTAGAAT TTGGAAGACC CTAAGTCTCC 3180
AGATTGGTGC ACTGGGTAGC TCCTGAAATG GGGTGGCTGA GACAGGTCCT CTGTGCCCCC 3240
TTCCACAGCT TCCTCTGGGG CCCTTCTGCT CACTGGCATG TGCTTCTGGG CAAATAGGCC 3300
TCTCCCAGCA TTTGTTTTGG CTCTGTGAAA 3330