EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS134-07644 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Mesendoderm 
Coordinate
chr10:82226880-82228470 
Target genes
Number: 9             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr10:82227751-82227772AAAGTAAAAATGAAAACAATA-6.27
MEF2CMA0497.1chr10:82227073-82227088TTTTATTTTTAGTTT-6.1
STAT1MA0137.3chr10:82227146-82227157TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr10:82227146-82227157TTTCTGGGAAA+6.32
Spz1MA0111.1chr10:82227286-82227297GCTGTAACCCT-6.14
Number of super-enhancer constituents: 42             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00012chr10:82211895-82238814Adipose_Nuclei
SE_03133chr10:82226384-82228868Bladder
SE_03722chr10:82226758-82227764Brain_Angular_Gyrus
SE_03722chr10:82227821-82228415Brain_Angular_Gyrus
SE_04012chr10:82217181-82228773Brain_Anterior_Caudate
SE_05643chr10:82217090-82229822Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06016chr10:82217051-82229868Brain_Hippocampus_Middle
SE_08270chr10:82217071-82229796Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09209chr10:82213893-82229394CD14
SE_12039chr10:82222314-82228744CD3
SE_14580chr10:82213988-82229858CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15608chr10:82224731-82228690CD4_Memory_Primary_8pool
SE_17018chr10:82223165-82229622CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17363chr10:82212715-82235520CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17861chr10:82212598-82235299CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18324chr10:82213958-82235661CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19180chr10:82214007-82229473CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20438chr10:82221932-82229927CD56
SE_20998chr10:82221958-82228918CD8_Memory_7pool
SE_21854chr10:82226920-82229921CD8_Naive_7pool
SE_22113chr10:82222070-82229858CD8_Naive_8pool
SE_22394chr10:82214028-82235411CD8_primiary
SE_23676chr10:82227343-82227741Colon_Crypt_1
SE_23676chr10:82227765-82229491Colon_Crypt_1
SE_23916chr10:82227366-82227708Colon_Crypt_2
SE_23916chr10:82227754-82228126Colon_Crypt_2
SE_23916chr10:82228291-82229063Colon_Crypt_2
SE_26561chr10:82217136-82235180Esophagus
SE_31654chr10:82226824-82227751Gastric
SE_31654chr10:82227757-82229754Gastric
SE_38806chr10:82217205-82230050HUVEC
SE_39636chr10:82223453-82228920Jurkat
SE_40835chr10:82217112-82229768Left_Ventricle
SE_41793chr10:82227383-82229496LNCaP
SE_42164chr10:82217114-82229807Lung
SE_48782chr10:82222384-82229760Right_Atrium
SE_50150chr10:82217126-82229850Sigmoid_Colon
SE_52532chr10:82217154-82229636Small_Intestine
SE_53353chr10:82217368-82229838Spleen
SE_55160chr10:82223570-82229774Thymus
SE_58559chr10:82213055-82265607Ly1
SE_62319chr10:82212748-82296810Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr108222709582227457
Enhancer Sequence
CTTGTTTCTT AGTCTTATAA TCTCTATTTT AATATTAATG ATGGTCAGTT TTTGTGTCTA 60
AATCCCAAAA GGGAGGAGGT ATGTAATGAG GCCTTTCCAA CCTCCTCCTT GTTGTGGCCA 120
AGAGCTGTTT TTCAGGTTTC TCTGGGGTCC TCGTGGCCAA GAGGGTCTGT TTAGTTGGTT 180
ATGGGGCTTA GAATTTTATT TTTAGTTTAC AGGTTGTTGG ACCCAAACAA GACTGGGAAA 240
GTCACCATCG AGGCAGCTCA GTATTCTTTC TGGGAAAAAC ACAATGGATG TAGAGGCTGG 300
GATTTGAATT CGGGCTTACT GGGTGACCTT GGTGGGTCAC TTCCTGGGGT GTAGATTCTT 360
ACTAGAAAAT GGAAGTGTTG CTCAGAGGAA CTTTGGGAAC ATTTTAGCTG TAACCCTTGG 420
AGTTCTATTA ATCTAACTCC AAAATGGTTC TATTAATCTA ACTCCACTAC CTGGAATCTC 480
TCTTGCCAAC TCAGGATCCT TTGGAAGAAA ATGTCATCAG ATGGAATTAA CAAAGAGCCC 540
CTCTTTTCCT GGGCATTTCT TCCTCAGGTT CTTGAGGGGT GGTGATGATC ACCTCAAAAG 600
ATGCCTGTAG TTTTCAAGTG GAAACCGAGC CACCCTGAGC CCAAACACAC ACTCCCAGTG 660
TTCAGGCGCT GAGTGTGGCC CCTGGAGTTC ACTGATGAGT AGTCTTACCT TGGACCTCGC 720
CTTGGCTTTT CTTGGAAATG GCACATTACT TTTGTTTATT AGTGTAGCCC CTCTGTTGTG 780
AAGTGGAATC CAGGGAGAGG GAAGTAAAGC TTTTAATTTT ACCTCTTGCC AAAGTGAGGC 840
CAAGCTCTTA AATGTAAAAA CAAACTTGTT AAAAGTAAAA ATGAAAACAA TATCCCCATT 900
CCTCTTCTTT GGGGGTGGAG ACTGTGTTTA AATTTTGCCT CTATTTTGTC AACAGGTTCT 960
AGGAGACAAA ATGTTCTTTT CCTGGTGACC TTTCAGGCTG GGTTTCTGCC CTTTATGTGC 1020
CTTTCCTGGC CCAGCCTCCA TCCTCTGGGC CCGCCCACCC AAACCAGCAC TGCCTACCAG 1080
GCCCCCCTGT GCCTGTTGCC CGTCTGACTT CCTCCCATTG TCTTCGGGGC CAGCCTGTGT 1140
CACTGCTCTA GGCTGTGTTT CTGCCGGCAC GAACACAGGA GGGCGGTGGT CTTGGAAGAG 1200
GCAGGTCTCT ATCATTTGGT TAGAGTAGCT TTTACAGCTG AGAAATGGGA ATAAAAATAA 1260
TCTGTGAGGA TCCATTGGGA TGCAACAAAA TCCCAAACAA ATCCCAAAAT TAAAGCATTC 1320
CTCCAGGGAA GCTGATTGCA TCCTTGTAAA TCAGGAACAA TAAAGATGGG TGGCTTTCTT 1380
CCCATGACTT GCTTTAATGG TTGTTTTCCT TCTGTGTGTC AGCGTTACAT CCTTACTATT 1440
CAAAGTGCCA TCCACAGACC TGCTGATGGG CAGCATGAGC ATCACCTGGG AGCTTGCTGC 1500
GCTGTAGAAT CTTGAGGGGT CTCCATCCAG ATCAGCTGAA TCAGAGTTTG CATTGTTAAC 1560
AAGGTAACCC AAGTGATTTG AATGCTTTTT 1590