Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS133-31953 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | melanoma |
Coordinate | chr9:98919530-98920420 |
Target genes | |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920167-98920187 | TGTGGTGTGTTGGTGTGTGT | - | 6.02 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920267-98920287 | TGTGGTGTGTTGGTGTGTGT | - | 6.02 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98919966-98919986 | GGTGGGTGTGTGTGGTGTGG | - | 6.07 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98919935-98919955 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98919995-98920015 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920128-98920148 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920178-98920198 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920278-98920298 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920328-98920348 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920343-98920363 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920354-98920374 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98919890-98919910 | TGTGTGTGTGTGTGGGGGGG | - | 6.17 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98919968-98919988 | TGGGTGTGTGTGGTGTGGTG | - | 6.32 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98920162-98920182 | TGGTGTGTGGTGTGTTGGTG | - | 6.37 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98919892-98919912 | TGTGTGTGTGTGGGGGGGGG | - | 6.38 | RREB1 | MA0073.1 | chr9:98919888-98919908 | TGTGTGTGTGTGTGTGGGGG | - | 6.95 | ZNF740 | MA0753.2 | chr9:98919901-98919914 | GTGGGGGGGGGTG | - | 6.09 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 1 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_50729 | chr9:98918189-98920661 | Sigmoid_Colon |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH09I096155 | chr9 | 98918190 | 98920661 |
|
Enhancer Sequence | CTTTGATTCA TGGGTCCAGG TGTGCCCACC TCTGAGAGAC GGCCCGGGGT GTCATCAGTA 60 ATTGCCAGAT GGGGAGCTCA GCCCTATGGT CTCAAACCCC TATCTGTTCA TAAATGCAGC 120 TCTTGTCTAA GGAGTAGCTT GGACAGCGTG AGTGGGGAGG TGGCCCCGTG TACTGAAACC 180 GCAAGGCGAG GAGAGTAGCG CTCGCTTGCA GACTGCAGCA GCGCCTGCAC ACAGCGCTGA 240 TCCCTGCCAT TCCTATCAGA AAACAGGAAA CATCGTGGCC TTTAACATAG TCTCCTTCAA 300 AATCAAAATG CTGCTGCTTC TCCAAATAAA ATAGAGCCAA AAGTCATGGG GGAAAGTGTG 360 TGTGTGTGTG TGTGGGGGGG GGTGTGTGCG CAGTGTGTGT GGTGTGGTGT GTGTGTGGTG 420 TGTGTGTGTG GTGTGCGGTG GGTGTGTGTG GTGTGGTGTG TATGTGGTGT GTGTGTGGTG 480 TGTGTAGTGT TATGTGTGGT GTGTGGTGTG TGTGGTGTGT GTGTTGTGTG TGTGGTGTGT 540 GCTGTATGTG GTGTGTGTGT GGTATGTGTG GTGTGTGTGT GGTATGTGTG GTGTGTGGTG 600 TGTGTGTGTG GTGTGTGTGT GCTGTGTGTA TGTGGTGTGT GGTGTGTTGG TGTGTGTGTG 660 GTGTGTGTAT GTGTGTGGTG TATGTGTGTG GTGTGTGTGG TGTATGTGTG TGGTGTGTGT 720 GTGGTATGTG GTGTGTGTGT GGTGTGTTGG TGTGTGTGTG GTGTGTGTAT GTGTGTGGTG 780 TGTGTGGTGT ATGTGTGTGG TGTGTGTGTG GTGTGTGTGT GTGTGGTGTG TGTGTGGTGT 840 GTGTGTGTGT ACACGTATGC ACAGTGTGTG TTCCCAATAT AGCTTTTGAG 890
|