EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-24947 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr5:39168530-39172150 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROD2MA0668.1chr5:39169315-39169325GCCATATGGT+6.02
POU4F2MA0683.1chr5:39168866-39168882ACACATAATTAATGAA+6.06
ZNF263MA0528.1chr5:39170639-39170660TCATCCATTTCTTTCTCCTCC-6.09
ZfxMA0146.2chr5:39169706-39169720GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_14412chr5:39166546-39168966CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17328chr5:39168877-39171931CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18256chr5:39148300-39171271CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18256chr5:39171341-39172658CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19181chr5:39169806-39170440CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_22332chr5:39169223-39171161CD8_primiary
SE_22332chr5:39171426-39172446CD8_primiary
SE_60230chr5:39146019-39191957Ly4
SE_62247chr5:39149212-39220084Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr53916919739169576
chr53917066039171203
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH05I039168chr53916887839172658
Enhancer Sequence
TTCACTGAAT GAAAACATAA TGTAAAAAAT TGTGTAAGAA ATTTGTGGAT TTCTGAGAAT 60
GTCCAAAGAC CTTGGGTTGA TCTATACTGC CCTAATTGCC ACAGTTAGGT TATCAATTGC 120
ATGTAAAGAT ACCTCCACCT TATTTATCTA ATCTGTATAC TTTGCTTAAT AATTCTAACT 180
ATAATATCAA ACAATGCCAG GTTTTACAGC TTCTAAGTCT AATTCTTAAA TCTTGTCACT 240
ATATTATAAA AATTAAGTTA AAAACCGTAG TCACATTTAC TGTTGTGCAT ATAATCGTGT 300
ATAAAGTCCA AACATAATAG TCAATTGGTG AAATGAACAC ATAATTAATG AATATGTAAT 360
AATCATTCAT ATTAATTCCT TTTTTCTTTT TTTAATCAAA ATAGGAAACT TTTTATTTTT 420
GTCACTAAAT ACAATTAGTT TCCCTGATTG TAACCCATTA TCAATGTCAC CTAACATATA 480
GATGGTCTGT ACAGAGGTGA ACACCACCAG CATCTTTCTC TACATGTATA TTAGGACCAC 540
TGAACTCAGA AAAAGCAGAG TTGAGCTTGT TAAATTATTG TCTCTTTTAG AAACTCTTAC 600
CATTTAAAGG AAATAGGAAG ATTTAGGTAG CAGAATACTT GCATAATAAC TTAAAAAGTT 660
AAAAGCTTGT AGTGATAAAA TAATCTTGTG CACATTCTCA GAAATTTTAG GCAATTGGCC 720
TTCTTGCAGA TCCCAAGTTT AGAAAAAGAC AACTAATCAT TGCAACATCT GGGCTCAGTT 780
CATTTGCCAT ATGGTTGGTC GTGGTGCATT TCTGGTGTAT AAGTCAACAG AACAATCATG 840
ACCCAGAGGT GAAGCCAAGC CATATATATA ATCACAAAAA CTCATGCTAT GGGGTATCTT 900
TGGAGAAAAA TTCCCAGACG AATACTAAAC CGGTCAATTG AACTAGCTTT GTGAATTTTT 960
CCGTACATTC CTGCCAGATT AGTTTCTGTG CCATTAAAAA GAACAGGAAC ATTTCACAGA 1020
AGAGTGCCTT CACCATTGAC AATTTCAGAC ATATTAATCG AAGACCCGTT ACTACTACTT 1080
CCAGAGGCAG AGTCCATCTG CTGTTTGAGG TGCTCCAGTT GAAAGACCAA GGAGGGCCAG 1140
ATGCAGTGGC TCACGCCTGT AATCCCAGCA CTTTGGGAGG CCGAGGCGGG TGGATTACCT 1200
GAGGTCAGGA GTTCGAGACC AGTCTGGCCA ACATGGTGAA ACTCTGTCTC TATTGAAAGT 1260
ACAAAAATTA GCCGGGCCAG TCGAAGGTTA GATAGTTCAT GTGATTTGCC ATCTTCATTA 1320
GGTGTTGGGA TGTGCTCAGT GCAGGCAGCA TTTGATGATG CATTTTCCAA AAGAATTTTC 1380
TTCAGTGGTT TTGATGGTGG TTATACTGGG GTTCACAGAA CTAACACTTG ACGTCCAAGA 1440
ACTCTGAAAG ACAGGTGTCT TTCCTTTTTC CTTTTTGATT TCCACCCTCC CAGTAGGCTC 1500
CTTCTGTGAA CTATTAAGGA AATTAAAGGG CAGCTCATCA TCAGGTTCTG ACTTTCTTGT 1560
TCACACAAAT TGGGATGAAG GCCTAGGAAC AGATGAATTT TCAATAGGAT GAGAGGCCTC 1620
CACTGGTGTC CTAGATCTTA CTTTCACATT TGCAGTGCCA GCTAAGATGG TGGCTTTTTG 1680
ATTTCAAATG TTATCAGTTG CTGATGAAGT ATAAGTAGCT ACAGGTCAAG TCTGATATGT 1740
CAAATCTGTA TTTGAACTTC TGTGAAGTTC AGTATAGTCA GTATTTTTGC TATATATGAT 1800
GTTGCTGGTG GTGGTGTCTT TCCTACTGAG AGCTGTTGCA GCCCCTTGAT CAACTCAGTT 1860
TAAAAGATCT TCTGTCTTTC CAGCAAGATC AACAAACCAA GACATGATGG CAGCAGAATA 1920
ATCCTATTGG CAAACCTGAG GACTCTGGGC CAGCTGCACC GTGGTCTTGT CGCCGTCCTG 1980
GGCCGGACCC CCTCAGCAGC AGACCTGGAG GGGGCCCAGG CTGAGTAAAC TTCCCTCCTT 2040
TTTTCTGATT CCCTACATCC AATACATGAG AATTCCCCAT TAATGCTACA GCTGAAACTC 2100
ATTCTAGATT CATCCATTTC TTTCTCCTCC ATTTGACCTC CCTTGTGCAA ACTTCATCAT 2160
CTCTTATCTG GACTCTTAAC AGTAGCCTCC TCACCAGTTT TTTGGTGTCA TTATTATTTG 2220
CCTACAGCTG ATGCTCTACA CAGGAAAAAG AGGTCCTAAA ATGCAAACCA GACTATAACA 2280
TTCCTCTTCA TTATGGCTCC AATTTCAATG TCTTCCTATC ATAAATTCCA AACTGTGACC 2340
TTCTGGATCT ATGGAATTTG GTCAGTGCCT ACTGCTCCAG CCTCATCTGG AACCATTATT 2400
CCTCCTTCAT CTGTGATATT CCAGCCCATC CAAGTCTTTC TGTTTCTTTA ACCCCATAAA 2460
GCTTGTTCTT ACCTAAGGAA TTTGTACTCC CTGCTCTCTG ATCAGAACGC TCCTTTCCCC 2520
TATTATTGTA TTACCATTCA TGTTTCTGCT TAAGTAAATT GCTTAAAAGA ATTTTTAGAC 2580
TGGGCACGGT GACTCACACC TGTAATCCCA GCAGTTTGGG AGGCTGAGGC GGAGGGGTGA 2640
CATGAGGTCA GGCATTTGAA ACCAGCCTGG CCAACATGGT GAAACCCCGT CTCTACTAAA 2700
AATACAAAAA AATTAGCTGG ATGTGGTAGC ACAAGCCTGT AATCCCAGCT ACTCGGGAGG 2760
CTGAGGCAGG AGAATTGCTT GAACCTAGGA GGCAGAGGTT CTAGTGAGCC GAGATCGTGC 2820
CACTGCTCTC TAGCCTGGGC AACAGACACT CTGTCTCCAA AAAAAAAAAA GTAAACCCTG 2880
AAGATAGCAT TTATACATTT TCTTCTATTA TAGTATAGAA CAGTAGTTTT TAAGTTGTGG 2940
AATCAGGACT CGCAGCATCA GCATCACCTG AGAACTTGCT ACAAATGCAA GTTCTTAGGC 3000
CTCATGCCTG ACCTACTGAA TTAGAAACTC TGGGTCTGGG GCCCAGCAAT CTGTGTTTTA 3060
ATAAGCTCTC TAGGTGATTC TAATGCACAC TGAAGTTTGA GAATCACTGA TATAAAATAA 3120
ATGGTGGGTA CACATGTCTC ATTTGAAGTT CAACCTAAAG AGGCAACAGG CAGGCTGTGA 3180
AAAGACCAAT AACTTCAGAA GTTATTGCAC TACTGAAGTG CAATATTGCC TGGTATATAC 3240
TATCGTCACC TCCCATTCTT TTGTTTTGAA ACACAACTTA TTTGTTTGCA ATTCTTAATA 3300
ATACCACGTT AACTACCAGC TGACACTTTC AGTTAGTATT TCATTGTCTG AGAGTTCCTT 3360
CTGGCTATCA CTTGCCCTTT CTGCAAGAGC CAAAGCATAC GTGGGCCAAA CATTTGCTGA 3420
AGTAAGAGAA CCTGGGGATT GTAAGGTGGG AAAAGCCTTG TTAAGATGCC ATGGCATTAC 3480
CTCTTTTGTA ATTGGACAAA CGAGGAAGTG ACAAGCAGGG GTGAAGGATG GTAAAGATAA 3540
TGAGGAGAAT CAGAAGTCAA CTTTAGGAAA TAATATATTG AAAAGATTGG GGAAAACAAG 3600
GCAGCATGGT GAGGAGCAGT 3620