EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-22210 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr3:45179310-45182780 
Target genes
Number: 10             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs77743040chr345181216hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:45180124-45180139GAGGTCAAGAGTTCG+6.24
ZfxMA0146.2chr3:45180100-45180114GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23409chr3:45180341-45182524Colon_Crypt_1
SE_24554chr3:45180704-45181783Colon_Crypt_2
SE_26951chr3:45179138-45182555Esophagus
SE_34427chr3:45179164-45182896HCT-116
SE_34949chr3:45179136-45183155HeLa
SE_35922chr3:45179132-45182894HMEC
SE_39339chr3:45180142-45182303IMR90
SE_39859chr3:45175092-45181940K562
SE_44835chr3:45179987-45182484NHLF
SE_46103chr3:45171823-45183152Osteoblasts
SE_50396chr3:45179190-45180098Sigmoid_Colon
SE_50396chr3:45180138-45182407Sigmoid_Colon
SE_52910chr3:45178714-45182374Small_Intestine
SE_55649chr3:45170435-45184518u87
SE_64277chr3:45179192-45183205NHEK
SE_67446chr3:45170435-45184518u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr34518044045181435
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I045130chr34517191045183056
Enhancer Sequence
GTCTTCTATG TTCCGTGAAG ATAAGGACTT AGCTCTGACA GATGTAGCCC AAGGCTGAAG 60
TACCTGATAA GACTGTCAGA AACTTCCAAG CCAGTTCCAG AGTAATCCTC CATCTCTCAG 120
CAGGGATTAA AGGCCAGGGC CCTGCCAGGT TTCCCTCCAT GGAGATCTAG CTCTAGTTTC 180
ACAGACTGGC AAACTGCAGC CCAGTCTTGG CTAATAACAC CCGGTCATGA AGATAGCTGC 240
AATCCCCAGG AGACCACTGG GGTGTTCTCA TTCCCATCTC AAATGTAACT GAGCATGACA 300
ATTAAGTTGT TATAAAACTG GTCCAGTCAG TTCCTTGGCT ACCAGGAAAT TCATGTGTGT 360
GCAGGCACTT GCTCACAGAA CATTTTTTAA AAACTTGTTC TAGTGTCTTT TAGAATAACT 420
TCATACGGCT TTTCACTGAG CAGCTTCACT TCTAGGAATT TCTTCCACAG ATATCCTTAC 480
ACGTCCCCAA AGTCGACTGC ACTGGGACAG TAACCAAAGC ACAATGTGTA GGTAACAAAA 540
GTCAAAAATA ATCTTACTGT CTCCCACTAG AGACCTGGTT ATACAGACTA TGATAGCCTA 600
TAATTTTGGC CCAGGTTGTC TGCCTATTGA ATATCTAAAT GTTCTTCTTG GACCTGACTC 660
AAATAATCAA AGTGTCTTAG TTCGTTTTGT GTTGCTATAA AGGAATACCT AAAGCTGGCT 720
AATTGATAAA GAAAAGAGGT TTGGCTGGTT GCGGTGGCTC ATTCCTTTAA TCCCGGCACT 780
TTGGGAGGCT GAGGCCGAGG CGGGTGGATC ACCTGAGGTC AAGAGTTCGA GACCAGCCTG 840
GCCGACATGG TGAAACCTCG TCTCTACTAA AAATACAAAA ATTAGCCGGA GGTGGTGGCA 900
GGCGCCTGTA ATCCCAACTA CTCAGGAGGC TGAGGCAAGA GAACTGCTTC CCAGGAGGTG 960
GAGGTTGCAG TGAGCTGAGA TTGTGCCATT GTACTCTAGC CTGGGCAACA GAGCGAAAAC 1020
TCCATCTCAA AGAAAAAAAA GAAGAAAGAA AAGAAAAAGA AAGACCGAAA AGAAAAGAGG 1080
TTTATTTAGC TCATGATTCT GCTGGCTAAA AGGTTCAAGA TTGAGCATCT GGTGAGGGCC 1140
TCAGGCTGCT TCCACTCACG GCAGAGGGCA AAGGGGATCT GGTGTGTAGA GATCACATAG 1200
CAAGAGAAGA AGCAAGGGCA GGGGGTTCTT GCTGGGCTCT TTTTAACAAC CAGCTCTCTA 1260
GGGAACTAAC AGAGTTAAGA ACTCACTCAC TCCTGAGGGA TCCACCCCAT GACCCAACAC 1320
TTCCCATTAG GCCCCACCTC CAGCACTGGG GATCAAATTT CAACATGAGA TTTGGAGGAA 1380
ACAATCATCC AAACTACAGC ACAAAGTCAT GAAATTCTCA CTAACTGAGG AATTTGTTCT 1440
AGGCCAGACT AGTGCACACA TCATTTCATT CAGACCTCCA GCCAGCCTCA GGGTGCTGCT 1500
GTCCCTACAG GTTAAGCAAC TTGCCCAGCT CACCTCGTTA ATAAGTGGTG GAGTCAGGAT 1560
TTGAACCAAG CTTTGACCAA CTCCAGAGCT TGTCTGAATG AGGCTGTCTC CAAAAAGCTG 1620
GAAAGGCAAC TCTGAGTCCA GTGAGGTCTT TGGCTCCAGT CCTTCCATTT CTCTGCCCTC 1680
CTCCCTCCAC CAACTTCCAG CTGGGAAGCT AAGCCCTTTG GGATGTGCAG TCTGAAGACA 1740
CGGGCAATGT AGCAGTGAGC AAGAACTCAG AGGCAATAGT GACCGGGAGA GCCTGGTGTT 1800
TGTATCCTTG AGGGTGGCCC AGGATGCAAC TCCAGCGAGA CTTGTCAGCA GGGCAGTTGA 1860
TGTGAAAACA GCCCATCAAC ACAGGCTGAA CCCTCCTGAC ACAGTGTCCC TGGGCAGACT 1920
CCAGCAGAGC ACAGAGTTCC AGTATGAGCA GCAGTGTGTA ATAACTCATC TCATTATGTT 1980
GTTTGGTTCT TGGTGTGTAC CTCTCCACTG TGGCTGGTGG CCACTCTGTA GGAGTTGACT 2040
GTCTACCTGT GTCCAAGAGA TGCCGTGAGT CCTTCAAACT CAGGGGCTTC ATCTTACCAC 2100
CTCTGCATTC TCTGTGATGT CCCAGAAACT GCTTGTCTGC TCTAAGCTGT TCTCGGGGTT 2160
AAACATTGTT TTAGCCAAAC TTCCTTGTTT GAAATGGCCA GATGTTCCCG CCTCCAGATC 2220
AGTAACAGAA GGCATCTCTT TGGATGCATA TGGCATATGC CTGGATGTAC ACCATTCTAG 2280
CTCAGCTCCC AGCTGGACCA CACATTGCCA AGAATTGAAG AAGCCCTCTC ATGGCTCCAA 2340
GGGTTTTGTG ACATGGCAGA TGCCAAGGAA GTAGGCAGAC CCAAAATAAA GACAACAGCC 2400
CGACTTCAAC TCTATATAAT CTTTGGACTC AGGGAGTTGA TAAAACTCAT TTCTGGAGAC 2460
TGTATTTACC CAGACAAAGG CAGCAGATTG TCACCTTGTA CATTTTTGCA TTTGGCACAT 2520
TTCTCCCGGA ACCCTTTGAT CTCCTGTCAT TGAGGGTAGG ATCATTTGCA CTTCATTTAA 2580
AACTTAAAGA AAGCTACGCC ATCTGTGCTC AGGGAACAGT TTTAATTTTC TTTTCAAGAC 2640
GTTCTCAGAT TTATTATTTA AGCATATTCC CACCCTGAGG GGAGGCATTT ACTGGCCTTG 2700
CAGTCCTATG ACCGAGCTGG GTTCTGGAGT CATACTCCTG GGGCTGCCAG CTCAGCATCA 2760
TTACATACCA GCTAGGGAGC CCTGGCAAGT CACGTCACCT CTCTGTGCCT ACTAACAGGA 2820
AGTTAGTAAG AGCAATTGTT TGAGGACGGA GAATTAAATG ACACGCAGAC CTACTCAAGA 2880
CCACCTCTCC CATTTACATT TTCTCAGGAG AAAATAGCTT CATTTTTATC ATTGAACACT 2940
GTAGAACTTA TGTTTCATCT ATGAAAGTTA TTTTTGGCCA AGGTCTATTT CAGAAATGTG 3000
TATATTTACA TCTCCAACCT CAACACATTT TAAACAAAAT TATGTGCAGA AAGTCTTTAC 3060
TTATATTCCA AATACACTAG GATCAAGAAT GTCAGGATCT GGCTGGGCGT GGTGGCTCAC 3120
GCCTATAATT CCAGCACTTT GGCAGAGCGA GGTGGGTGGA TTGCTTGAGG CCAGGAGTTT 3180
GAGGCCAGCC TGGCCAACAT GGTGAAACCC CACCTCTACT AAAAATACAA AAATTAGCTG 3240
GGCATGGTTG TGCACGCCTG TAATTCCAGC TACTTGGGAG GCTGAGGCAT GAGAATCACT 3300
TGAACCCAGG AGGTGGGGGT TGCAGTGAGC CAAGATCATG CCACTGCATT CCAGCCTGGG 3360
CAACAGAGTA AGACTCCGTC TCAAAAAAAA AAAGAATGTC AGGATCAAGT GAGGACACCC 3420
CAAGTGTCAA AAATGTCAAC AAAGGGAGGT GCCCTACATT ACTGCACACA 3470