Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS133-20714 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | melanoma |
Coordinate | chr21:45377980-45379510 |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
KLF14 | MA0740.1 | chr21:45379467-45379481 | GTGTGGGCGTGGCC | - | 6.21 | Klf12 | MA0742.1 | chr21:45379466-45379481 | GGTGTGGGCGTGGCC | - | 6.28 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378552-45378572 | TGGTTTGTGGTGTGTGGTGT | - | 6.03 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378515-45378535 | TGGTTTGTGGTGTGGTGTGG | - | 6.08 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378411-45378431 | GGTGTAGGTGTGGTTTGTGG | - | 6.14 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378447-45378467 | GGCGTGTGTGTGGTTTGTGG | - | 6.36 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378766-45378786 | GGTGTGTGTGTGGGTGGTGG | - | 6.63 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378739-45378759 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.68 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45379112-45379132 | GGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.68 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378945-45378965 | GTGGTGTGTGTGGTTTGTGG | - | 6.77 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378778-45378798 | GGTGGTGGGGTGGTGTGTGT | - | 6.83 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45378770-45378790 | TGTGTGTGGGTGGTGGGGTG | - | 6.92 | RREB1 | MA0073.1 | chr21:45379283-45379303 | GGTGTGTGTGTGGTTTGTGG | - | 7.54 | SP1 | MA0079.4 | chr21:45379468-45379483 | TGTGGGCGTGGCCAC | - | 6.83 | SP3 | MA0746.2 | chr21:45379468-45379481 | TGTGGGCGTGGCC | - | 6.64 | SP4 | MA0685.1 | chr21:45379466-45379483 | GGTGTGGGCGTGGCCAC | - | 6.92 | SP8 | MA0747.1 | chr21:45379468-45379480 | TGTGGGCGTGGC | - | 6.22 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 1 | Chromosome | Start | End |
|
| Number: 2 | ID | Chromosome | Start | End |
GH21I043958 | chr21 | 45377961 | 45379229 | GH21I043959 | chr21 | 45379261 | 45379410 |
|
Enhancer Sequence | GCAGTTTGGA TCTTTTAAAT GAGATACTAA ATCAAATAAA AATTATGATG CCTTCACCAC 60 AAGTTAATCA CTATCAATAT TTGGGTGTAT TTCTTCTAGT CTTTTCGTTT TTTCTTTCTG 120 GTTTGCATGG GAGAGTGTGT GTGTGTGAGT GTGGCATGTT TATGTGTATA GTGCTTGTTG 180 TGTGTGTGAG ACTGTGGTGC ATATGAGTGT GCATGGGGTG GGGGGATGTG TTGCAGTGTG 240 TGGTGTGTGG TACAATTGTG TGTGTGTGGT GTAGAGTATG GGGCTGTGTG CAGCAGTGCG 300 TGTGGGATGT GGTGTATGTG TTTTGCACTG TGGTGTGTGT GGTTTGTGCT ACAGTGTGTG 360 TGGTTTGTGG TATGGTGCTT GCAGTGTGGT ATGCACCATA TGTGTGAGCG TGTGTGTCGT 420 TTTTGGTGTG TGGTGTAGGT GTGGTTTGTG GTGTGTGTGG TGCGTGTGGC GTGTGTGTGG 480 TTTGTGGTGT GTGTGGCATA TGTGTGGTTT GTAGTGTGTG TATGTGGCGT GTATGTGGTT 540 TGTGGTGTGG TGTGGTATAT GTAGCATGTG TATGGTTTGT GGTGTGTGGT GTGTATGTGG 600 CATATGTGTG GTTTGTGATG TGTGGTGTGT GTGGCATGTG TGTGGTTTGC AGTGTGTAGT 660 GTGTGTGGTT TGTGATGTGT GTGTGGCATA TGTGTGGTTT GCAGTGTGTG TAGTGTGTGT 720 GGTTTGTGAT GTGTGGTGTG TGTGGCATGT GTGGTTTGCG GTGTGTGTGT GGTGTGTGGT 780 GTGTATGGTG TGTGTGTGGG TGGTGGGGTG GTGTGTGTGT GGCATGTGTG TGGCTTGTGT 840 GTGTGTGGCG TGTATGTGGT TTTGCGGTGT GTGTGGCATG TGTGTGGTTT GCGGTGTGTG 900 TGTAGCATGT GTGTGGTTTG CAGTGTGGTG TGTGTGGCAT GTGTGTGGTT TGTGGTATGG 960 TATGCGTGGT GTGTGTGGTT TGTGGTGTGT GTGTGTCATG TGTGTGGTTT GCAGTGTGTG 1020 TGTGTGGCAT GTGTTTGGTT TGCGGTATGT GTGTGGCGTG TGTGGTGTGT GTGGTTTGCA 1080 GTGTGTGTGG CGTGTGTGGT GTGTGATGTG TGGCATGTGG GGTTTGTGAT GTGGTGTGTG 1140 TGTGGTGTGT GGTTTGCGGT GTGTGTGGCA TGTGTGTGGC ATGTGTGGGG TTTGTGATGA 1200 GCTGTGGTGT GTGGCGTGTG TGTGGTTGTG TGTGTGTGGC GTGTGTGTGG TATGTGTGTG 1260 GCATGTGTGG TTTGTGGTGT GTGTGTGACG TGTGGTTTGC AGTGGTGTGT GTGTGGTTTG 1320 TGGTGTGTGG CGTGTGTGTG GTTTGCAGTG TGGTGTGTGT GGCATGTGTG TGGTTTGTAT 1380 GTGTGTGGCA CGTGTGTGGG GTTTGCAGTG TGCTGTGCAG CATGTGTGTA TAAGCGTGAG 1440 GCATGTGCGG GGTGTGCAGT GAGCAGTGCC CCGGTGTTCC TGTGAGGGTG TGGGCGTGGC 1500 CACCCTGACG CTGTCCCTGT CCCTGTCTTT 1530
|