EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-19463 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr20:52227220-52230180 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs145910606chr2052230031hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr20:52227590-52227611AAAAAAAAAGAAAAAGAAAAA-6.09
IRF1MA0050.2chr20:52227600-52227621AAAAAGAAAAAGAAACTAGAA-7.46
Stat6MA0520.1chr20:52229304-52229319AATTCTCAGGAAACA-6.17
ZfxMA0146.2chr20:52229437-52229451GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 41             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00202chr20:52229627-52230578Adipose_Nuclei
SE_01520chr20:52227904-52228381Adrenal_Gland
SE_09307chr20:52227456-52229525CD14
SE_13374chr20:52227775-52228702CD34_Primary_RO01536
SE_14425chr20:52227523-52228738CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14425chr20:52228890-52230913CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17991chr20:52224312-52227521CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_20778chr20:52224189-52227518CD8_Memory_7pool
SE_20778chr20:52227614-52228534CD8_Memory_7pool
SE_20778chr20:52229662-52230966CD8_Memory_7pool
SE_25474chr20:52227878-52228502DND41
SE_29954chr20:52229575-52230578Fetal_Muscle
SE_32501chr20:52224533-52229350GM12878
SE_33810chr20:52227828-52228751HCC1954
SE_34736chr20:52224589-52230352HeLa
SE_37291chr20:52224939-52230704HSMMtube
SE_38829chr20:52227586-52229062HUVEC
SE_39111chr20:52227794-52228918IMR90
SE_39554chr20:52227785-52228386Jurkat
SE_40005chr20:52227903-52228449K562
SE_40005chr20:52229701-52230460K562
SE_43170chr20:52227929-52228479Lung
SE_43529chr20:52225107-52229423MM1S
SE_43529chr20:52229543-52230886MM1S
SE_44298chr20:52227460-52229585NHDF-Ad
SE_44298chr20:52229590-52231235NHDF-Ad
SE_45084chr20:52227613-52228880NHLF
SE_45865chr20:52225147-52230822Osteoblasts
SE_47117chr20:52224347-52233145Panc1
SE_49906chr20:52229610-52230931RPMI-8402
SE_52644chr20:52227869-52228444Small_Intestine
SE_53525chr20:52227803-52228836Spleen
SE_55973chr20:52227452-52229514u87
SE_55973chr20:52229604-52231041u87
SE_58388chr20:52194578-52305868Ly1
SE_60096chr20:52194891-52241355Ly4
SE_61672chr20:52194577-52244989Toledo
SE_62467chr20:52194714-52241390Tonsil
SE_64787chr20:52227590-52228771NHEK
SE_66461chr20:52227785-52228386Jurkat
SE_68377chr20:52196064-52241229TC32
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I053607chr205222426852230738
Enhancer Sequence
ACATAGGAGA ATTTATAATA CTTTAGTAAA TAAAAAAACA AGAGAATTGA ACCAAAGGTG 60
GTTAACATCT TGAAACTAGA ACTTGCCCAG GCACCGTGGT TCACGCCTGT AATCCCAGCA 120
CTTTGGGAGG CCGAGGCAGG TAGATCATGA GGCCAGGAGA TCAAGACCAT CCTGGCTAAC 180
ACGGTGAAAC CCCGTCTCTA CTAAAAATAC AAAAAATTAG CCGGGCGTGG TGGTGGGTGC 240
CTGTAGTCCC AGCTATTTAG GAGGCTGAGG CAGGAGAATG GTGTGAACCC GGGAGGCAGA 300
GATTGCAGTG AGCTGAGATC GTGCCACTGC ACTCCAGCCT GGGCGACAGA GCGAGACTCC 360
ATCTCAAAAA AAAAAAAAAG AAAAAGAAAA AGAAACTAGA ACTGGGCATC AGATATGGGG 420
GTTACTCATT ACACTATTTT TATTATTCTC TCTACTTTCG CATACATTTC AAAATTTTTA 480
TTAAAATTGT TTCTTTTTTT CTTTTTTTAC CCTTAATCCT ATGATGGGTT ATATTTAAAA 540
ATTTTTTTAA TGTTTGTTTT TCAATAATGG CATATGTATG ACCCTTTTTC TACTTTCTAT 600
TTTTCTCTAA TTATTTTTCA TAATCTACTT ATATTACCTT TGAAATAAAT TAACATTTAT 660
TTTACCAAAA AGTAATTTAA AATAAGAATA GTAAACAGTT CCACAGAAAA GTTTTTCTTG 720
CCATGTAATT CTAGTGAATC CTCAGAATGC TATGATAAGC CTGTGTACCT TAAAATGTGA 780
GCTTCTAAAT GGTCCAAATC TTTTGGGACG GCACCGTGCC ATCTGAGACT GCTGTAAATA 840
TGATCAGCTG ATAAAAGGCC AGCTGCAACT AACCATTTTA AAGATTAGGA ACCATTTAAA 900
AACACACACA CACACACACA CACCACCTCT GGCCTCTTAA GTGTTAAGTG GCAAGATACT 960
CTGGTTTATT TCTAAAGTTT CATGCAATAA TCACGTAAGC ACCGAGCAGG ACAGAATTCT 1020
ACATACCGCC AAGCTGACTC AGAAAGAAGG GTTCCACATT CCTTAATTAG CAGCATGAGA 1080
AAAGCACCAC TTCCTGCGGT GGAGTTCCCA TTTCATCCAG CCACTCCACT GGCTCGGTAC 1140
ATCCTCAAGT CCACGAAAAA GATTTTCATA AAGTCTGGAG ACACAGTGTT GTTTAATTTA 1200
TTTCATTTTA CTTTGTTTTG TTTTATCCTA CTTTATTCTA TTATACTCTA TCCTATTATA 1260
TGTATTCTAA TTTTTACAAA TTGAAGATGT TTGTAATGAC GTAGATTCTT TGTTTCTAGA 1320
CTTTATGGAT GCCTGTATAT ACTGAAATCA CAGTTGGAGG CAGAGTAGGT GAACACTTGA 1380
CCAACTTGAA AATACAGCTT CTACTTTGGG AGGCCAAGGT GGGAGGATCA CTTGAGCCCA 1440
GGAGTTTGAG ACCAGCCTGA ACAACATAGT GAGACCCCCC CATCTCTATT TTTAATCTTT 1500
CTTTTTTTTT TTTTTTTTAA GACAGAATCT CACTCTGTCA CCCAGGCTAC AGTGCAGTGG 1560
CATGATCTCG GCTCACTGCA GTCTCCCTGT CCCGGGTTCA AGCAATTCTC ATGTCTCAGC 1620
CTCCCGAGTA GCTGGGACTA CAGGCATGCA CCACCATGCT CGGCTAATTT TTGTATTTTT 1680
AGTAGAGATG AGGTTTCACC ATGTTAGCCA GGCTGTTCTC AAACTCCTGA CCTCAAGTGA 1740
TCTGCCCACG TAAAACTCCC AAATTGCTGG GATTACAGGC GTGAGCCACA CACACACCCG 1800
CAGCCCCCAC CACCACCAGT CGTCTCTATT TTTTAAACGA AAGAAAATAC AGCTTTCTTG 1860
ATTATTAACA GTCAAAAGAT TCAAAGTCCT AGACCAGAAG TTTCTTTTTT AGTACCTATG 1920
ACTTAAGTTT ATGATTTGGA TTAAAGTTCT CTGGCAGAAC ACCCACAGGA TGCCAAAGCC 1980
TGAGGAAGAT TTCCGAACAA GATTACACGG TTTTCCAATG GGATACATTT GATCACGTGT 2040
GAAAACATGG TGGCAGCACT ACTGCAACCT TAAATGAAAG GGCAAATTCT CAGGAAACAC 2100
ATTCTGCTTG TAAATATTGG ATGTAACCAT TCTAACAGTT ATTTACTTTT AACTTGAGAA 2160
ATTTTAAAGA AATGTAGCCG GGCGCGGTGG CTCATGCCTG TAATCTCAGC ACTTTGGGAG 2220
GCCGAGGCGG GTGGATCGCC TGAGGTAAGG AGTTCGAGAC CAGCCTGGCC AACATGGTGA 2280
AACCCCATCT CTACTAAAAA TGAAAAATTA GCCGGTCATG GTGGCAGGCG CCTGTATGTA 2340
ATTCCAGCTA CTCGGCAGGC TGAGGCAGGA GACTCGCTTG AACCCAGGAG GTGGAGGTTG 2400
CAGTGAGCCG AGATGGCGCC ATTGCACTTC AGCCTGGGTG ACAGAGCAAG ACTCAAAAAA 2460
AAAAAAAAAA AATTTCTAGA CTTTTTTCCT TTTTCCCTTT CTAAGCTTTT AAAGATTTTA 2520
TGTCTGTCTT AGTTTTCAAG TTATACAGCA AAACACTGTA GATCCATTAC AGAAACACTA 2580
AAATTTTAGG GTATAAGAAT TCAAAGCTTC TATTATCTGG AACACAAGGG CACCCCTCAT 2640
TGCCAGTGTA TTCTGTTGTG TTCTGTTTGC ATAGAATCCA GCCTAAATGC TGCCCACCTG 2700
GAGTGAGTTG CTAGATGGAC TGAAATAATC CTAGCAAACT TGTAATGGTT TGGGCACAAC 2760
CACTGCTCCT TTGCCATCTA GCTGGTACTG CTGCTGTTAC CAGGTCTGTT AGATAGCGAC 2820
CGATGAGGCC TCCTGGCCTT GTTGATATTT CTTTGCCTAT CAGTGGATCG TTAGTTGGAG 2880
TATTTCCTTA GTCACAGACC GGCCTTTTAT TGGGATGTTC TCAGTAGGAA CTACATTTGC 2940
AGATAACAGA TGGTTATTTA 2960