Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS133-18286 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | melanoma |
Coordinate | chr2:235591060-235591910 |
Target genes | |
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
RREB1 | MA0073.1 | chr2:235591680-235591700 | GTGGTGGTGGTGGTGGGTGG | - | 6.5 |
|
| Number of super-enhancer constituents: 1 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_56503 | chr2:235582378-235593937 | u87 |
|
| Number: 2 | ID | Chromosome | Start | End |
GH02I234682 | chr2 | 235590737 | 235591661 | GH02I234683 | chr2 | 235591848 | 235592432 |
|
Enhancer Sequence | GGAACAATGG AAAACGAGGA TAGGAAAAGT AAGATGAGGT CAGTGCACCT GTATTATTCA 60 ACTAGTACTG CAAAAGTGCT GCATAATGGA CAATGACAAA ATCTCCGTGG CTGACAACTG 120 CAGCATTCCC TTTGCACTCA TAAGCCTGTG AGTCAGCTGG GGGCCTCTCT CACTGCAGAC 180 CCTGCTGGCT CTGCTCCACG AGTCTCTTGC CCTCCTGGGA CCAGAGAGGC CAGTTGGGGC 240 ATGTTCTTTT CATAGTGAAG GCAGACCACA GGCTGGCAAA TGGAAATGCA TGATGCTTCC 300 TAAGGCCTAG GCTCAGACCT GGCAACTGTC AATTCCACTT TCCTCATCTT ATGTAAGTAG 360 AAACTCTAAA GCAAATCTGC ACAAGGAATG GGATTCTGGG AAATGTAGTT CCCAGCCTTA 420 GATGCCTATA GTGATGGTGG TAAAGGTGAG GGTGATGGTG TGATGGTGAT GGGTAGTAGC 480 GGTGATGATG GTGGTAACAG TGGTGGTAAT GATGGTGATG ATGGTGACAG TGGTAGTGAC 540 AGTGGTGGTT ATGGTGGTGA TGGTGGTGAT GCTGTTGGTG GTGATGGTGG TGGTGGTGGT 600 GGGTGATAAT GGTGGTTATG GTGGTGGTGG TGGTGGGTGG TGATGGTGGT AGTGACAGTG 660 GTGGTTTTGG TGGTGATGGT GGTAGTGGTG ATTATGCTGG TGGTGAAGGT GAATGGTGGT 720 GGTAATGGTA GTGATGTGAT GGTGATGGTG ATGGTGGTGG TTATGGTGGT GATGGTGGTG 780 GTTATGGTGA TGATGGTACC GGTAGCAGTG ATGTGATGGT GGTGGTTATG GTGATGATGG 840 TACCGGTAGC 850
|