EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-16927 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr2:54796250-54802180 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 3             
IDChromosomePositionGenome Version
rs67079536chr254798844hg19
rs10181201chr254799174hg19
rs10205410chr254799599hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr2:54796552-54796573GAAAGAAAAGTGAAAGAATAG-6.69
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr2:54796996-54797007CTTGAGTGCCT-6.14
TCF3MA0522.2chr2:54796258-54796268AACACCTGCT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 77             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54796769-54797896Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54798017-54798845Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54799791-54802361Adrenal_Gland
SE_02562chr2:54796678-54802057Astrocytes
SE_04102chr2:54796918-54798099Brain_Anterior_Caudate
SE_04102chr2:54799690-54802108Brain_Anterior_Caudate
SE_07789chr2:54796529-54798132Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10400chr2:54794677-54803227CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54795467-54804954CD3
SE_12885chr2:54795717-54796939CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54798660-54800004CD34_Primary_RO01480
SE_12885chr2:54800577-54801934CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54797492-54801918CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54797046-54797912CD34_Primary_RO01549
SE_14098chr2:54798186-54800123CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54795303-54804872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54795663-54803273CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54795710-54797849CD4_Naive_Primary_7pool
SE_15859chr2:54798421-54804026CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54795629-54803366CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54795657-54803270CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54795631-54804015CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54795629-54803439CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54795741-54803316CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54795626-54804551CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54796037-54797962Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54797995-54802474Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54796781-54797605Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54799575-54801320Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54801348-54802387Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54795905-54797954Colon_Crypt_3
SE_25070chr2:54797970-54802593Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54795570-54803197Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54796675-54797759Esophagus
SE_27348chr2:54797982-54798877Esophagus
SE_27348chr2:54798913-54803836Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54796534-54797841Fetal_Muscle
SE_29772chr2:54797867-54801835Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54795567-54803312Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54796712-54798915Gastric
SE_31545chr2:54799542-54802418Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_35301chr2:54797810-54803653HeLa
SE_35875chr2:54796741-54804603HMEC
SE_38000chr2:54795734-54802579HUVEC
SE_39396chr2:54795484-54802646Jurkat
SE_40773chr2:54796706-54802488Left_Ventricle
SE_42137chr2:54796708-54803360Lung
SE_43945chr2:54794597-54799592MM1S
SE_46220chr2:54795768-54803253Osteoblasts
SE_47832chr2:54799847-54801132Pancreas
SE_49907chr2:54795402-54803294RPMI-8402
SE_50115chr2:54795848-54803359Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54795955-54803388Small_Intestine
SE_53342chr2:54795939-54803322Spleen
SE_55277chr2:54796750-54798969Thymus
SE_55277chr2:54799481-54802818Thymus
SE_56813chr2:54796632-54797886VACO_400
SE_56813chr2:54798007-54799425VACO_400
SE_56813chr2:54799680-54801306VACO_400
SE_56813chr2:54801496-54802415VACO_400
SE_57612chr2:54799687-54800303VACO_503
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_64270chr2:54795687-54804439NHEK
SE_66257chr2:54795484-54802646Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr25479692454797237
chr25479924154799892
chr25480004554800558
chr25480140654802103
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
GGAGAAAAAA CACCTGCTGA AACTTGTTGG CCGGAAGTTT TTACCCCTGG GAAGAAGAAA 60
GGAACGGGGT GGGGGAGATA AGGGAATTCA GTTCTTGGCT GGCAACACTC CAGAACCGTC 120
CTGATGGAAG GGTTGTGGCC AGTTGAAAGC AGCAGTACTG GAGAGGGGAC TGGGGGTTGT 180
TCTTTCAAAG GCAGGGTTGA AGGTTATTAA TGGACTAAGT TAAATTTCTA GCTGTTCCTT 240
CCTGTTACTC TAGATACTTT TTATATATTT ATTATGTCAC AGCAGTATTG ACGCCCTGAA 300
AAGAAAGAAA AGTGAAAGAA TAGTTCACGT AAGATCCCAC AAGTCCTACA AATTTTAACT 360
TTCCAATAGT TAATATATAT AAGCACACAC ATATACACAC ACGTGCAGTT TAGAAGTGTT 420
AATATAGACG AGTTTTGTCT TGGCTTTTTA TTTTTTACTT AACATCATCT TAAGCTTTTC 480
ATATGTGGTT ATTTCTGTGC CTCTTACCAA ATATTGGCAA TTCACTTTCC AAATCAGACA 540
ATTACTTACC AGTCTGAGAG CCTGCTTCTC ATCTATGGGA TGAAGGTCAT ACAAATTCTG 600
TGTAATGAGA TTGTTGTAAG AATTAGGTGA GATTCTGTGT GGAAACTGTG TTTGGCACAG 660
TCCCTGGTAC ATAATAAGGG CTCATAGGAT TATTACAGAT CCTAGTTAAA TGGCAAGGCA 720
GGGCCCAGCA GGGTGAGCCT TGTAAACTTG AGTGCCTCAA CTCCCACCCC CACCCCCAAA 780
CCTGTTCTGG GTGTGGTTTC CTTTAGCATG TTGGGAGAGT GTTTAGTTTG CCTGAAAATG 840
CACCCAACTG AAACCATTCC CCCCCCCCTT TAGAAAGATT AGAAGGTTCA GTCACTTGGG 900
CCTGGTGACT TTTGATGTAG TTTGAAGGTC ACAATGCTGG TTCCTCTCTC AAGTTCATAA 960
AAGCCTCTGG AGCAGCTATT GCTGCAGCCA GCGAGCATCC AGCACTTGGT CAGAGAGCCG 1020
CCTTTGTCAG AGAGCGCTCC TGTAGCCAGA CTCATATTAA CTGCCCCCCA TGGGTGTGTT 1080
GAATGCCTCT ACTGTGTTTG CCTTTGAAAG GCCCTTCTTA GCCTTTCTCT CTCCCCCAAC 1140
CCCATTTTCA AGAGGCACAA GACCTTTAAG TAGCAAATAC AGTAATCACA GTAGCATGGA 1200
GACACAGGCT GGCCTATATT TGGTTTCACA AAGGCCTTGT GAAAGATCTG GCCTTAAAGT 1260
CCCTTTTTAA TGCTGAAATT ATGCAAGTGG AAAGTTAATT TGAGGATCAC TGAGGCACGC 1320
TTTATTCATG AAGAATGTGA GCAAAACATA AATACAAAGT CTGGAGGCTC TGTTCTACGC 1380
TGGTGGCAAG GAAATTACAT AGGTGGTATC TTTATTTGGC TGAATCCCCC TCCCTCCACC 1440
AAGAGTGCAA CTGTGATAGA ATTTTGGAGT GAGAGCTATT GTTTTAAGCA CTGACTGGTT 1500
GCAGGTGTGT GTGTGCATGT TGCCTGAAAC TCTCTACAAA CCATAGACAT GATTTTGGTG 1560
GAATTGGCGT GCCAACAGTG GTTACAGCTA AGATTGTAGA AGACCAAACA TTCTGTTGGA 1620
ATGTGACCTT AACATTTTGA ATTATGTTTC TTAAGTAAGA TAAATTTCGA AGGTCTATTT 1680
TATTTTTATC TTTATTCTTT GAAGGCCTGC TTTAAAGTTT ACCGTGTCTT TGAAAGTCTA 1740
GTCTGTTGAA CTCTTAAATC CCAGTGAGTT CCTATAGATT GCTAGCTTGA GTGTATAGTA 1800
TTTGAGATGT GAATAAAGTC TAGTGCAAAG TGTGTTTCTT GTGCTTGAAA ATGGTGCCCT 1860
GATTTCTGTT GAGGGAGACG TTTATTCCTA TAAAGGTTTA AACGACTTGC TGTACAATTC 1920
AGTCTTGCAA TGACAGAGAG ATTACACACT ATCTGCAAAC AACTGCCAAG CAGATGAAAT 1980
CCTGGCTGTG GGAAGTCTGC GGTGAAGAGT GGTGGGGGTG GTCAGGAGAG CAGTGGAAGG 2040
GAAGTGGCTC AGAACATTGT AGTGGTGGTT TGGCGTGCCT GTCAAGGGCT GTGGGACGTT 2100
TTCTCTCTCA TTTCAGAAAC AAGGGTGGTG GGAAACACAT GGGCCGTGGA TTTGCATAAA 2160
CCAACAGTCA AATCCTAGCT CTACCAGTGA CTTCACTGAG CCTCATTTTC TTCAGGGGGA 2220
AAGAATAAAT AGCCCTTGGG GTGATTGTAA AGCCTAATTA GGTATGTTAT AATTGTATTA 2280
AGAGGATGAC GAGTTCACCG TTTGCCAGGG AGTTTTCCGG TTTTAGTGCC AAACATTCCA 2340
CATCCGGGGA ATCTTCCTCA GTCCCAGGCA CACTGGGTGG TGAGTCCCCC AGTTATATAT 2400
GAAGATACCT ATTACTGTTC CCTAATTGTA TGTACACACA CACACACACA CACACACACA 2460
CATACACACA CACACACACA CACACACATA TCTATAAATA AAGGGCTTCT GGAAGCTGGC 2520
TGCCTATTAC TGTGTACCTG ATACTCAGTG GGTATTTGTG AACTCCCAGG AGGATAGTGT 2580
GTTAGTGTGT TTGCGTGTAT CTCTGTATTC CTTCTTAGGG ATGGCATACA AATAAATGTT 2640
TCATGAATAA AGGGATGAAT GAGTAGGTAA AGTAATATAA GCAGTAATGC ATATGTTTTA 2700
AAGTGATTTA GCTGGTTTTC CTTCCAGGGG CCTCTTCCCT GAGAAAAGAG CCACTTAATA 2760
AATGATGTCT TGAATGAAAG AATACATCAT GAAAATAATT TTGTCCATGA TGTGGCTAAA 2820
CTAAAACTCC AGGAAGGGCT TAGGCTGGGC CTATCTACTT TTTTTGATAA AATGAAGTTT 2880
AATATGACCC TAGTGACAAC CTCCCCTCAT CCCCTTAAAG CTCAAATTTA GGGAACTCTT 2940
GTGGTTGGAC TCTCACATAC TCCCTAGGAC TCTGCTGGGT GCTGGGGAAT TTACTAAACT 3000
TTGGTGAGGA GAAGAGGAGA GGAGAGGGAA GCCACGGTAC TAAGGTACTT AGGGAGACAG 3060
AAACAGTTCC CCTAGAAATT AGACATCACA TTGTCTTTTT CCCCCCTTTC TTTTGAATGA 3120
GATGGGGCAA GAATATTTGG ACCAGGATAA AGTTTTAAGA TGCATTTACA CTAATGTAAT 3180
CAGGTTACAT AGCAAAAAAA TGTTAAAAAT GTACCCTGGG AAATTGAAAT CTATCCATTC 3240
TTCTAGGTGT GGCAGCTTAT TCAGATTTTT ATGTTGTGTG ACCATAAAAC GAACACAGCT 3300
TTTCTAACCG CGAGTGTCTT TGTTTACAGA GATAACAGTG TGAGTAATGC TTTGCTAGAA 3360
GCCAGGCAGT TAAATCACAC TCTGAGCAAA TAGAGGCTGG GCTTCAGAAA CTTAGATAGC 3420
ACACGAATGT GCAAACTTGG TCTTTTAAAC TGAAGACATA TCTGAAAGAA AACTGCTTTT 3480
GGCCCATGAA CTACTTTCCC AGCCCTTTGT GCCTCCCAAT CTCTGCCCCC CTTTACAAAA 3540
AATCTTTGTT TTTCCTCTAC AAATATACAT ATATGATTTC AATTTGGAGG TGGGATGTTA 3600
TTTTTTTCAC TTGAAACACA AGGAAGCAAT TTTTAAAAGT CATACTCGTT CAGCAGTGGG 3660
CTTGACTGTA GCCAGTTTGA CTAGGAGTTC TTGGCTACAG AACCATACAC TTGCAGTCTT 3720
TATCAGGGTA GTAAATTCAG ATGGGTTTTT GGAAAGGGAG AGGGCTGGAG TTGAGGGAAG 3780
GGCACTAGAG CAGTGTGACC CACGGCCCAG GAGCAGTGTG AGTGGGAAGG GGCTCTAGAA 3840
GCTGACTGCC TTTGTGTTTG CCACAGCGTG CTGGGAATCA GATGAGAAGG CGGGCCCAGA 3900
CCCCACCAGA TACTCATCTC AGCCATTGTT GTCATTAAAT GACTCTGAAA TGACCTTTCT 3960
TACCTCAGTT TCCTGTGAGC TCATAGTTGT CTGCAGATGT GAATTATGTC ATTGATCTTT 4020
GCTCCCTCTT TGCTTATAAG GAGTAGCTGT TCTGCTCCAT GTTTCTGGAA GAGGAAAGTG 4080
ATGCACAGGT CACTTAGTAA AGCGGTCCCC AGCCTTTTTG GCACCAGGGA CTGGTTTTGT 4140
AGAAGACAAT TTTTCCACAG ATAGGGTGGA GGAAATGGGG AGTTGGTTTC GTGATGAAAC 4200
TCTTCCACCT CAGATCATCA GGCATTAGAT TCTTATTAAG GAGTGGTAAC CTAGATCCTT 4260
TGCATGCACA GTTCATGATA GGGTTTGGCT CCTGTGAGAA TGCTGCTGCT GATCTGACAG 4320
GAGGCAGAGC TCAGGCAGTA ATGCTTCCCA TCCACCACTC ACCTCCTGCT GTGTGGCCGG 4380
TTCCTAATAG GTCACGGGCC AGGACCAATA CCGGTCTGTG ACCTGGGGGT TGGGGACCCC 4440
TGACTCGGTG ATTCAGCAGT TGATTTGGGA TCCTCTGTCT TTGTTCCTCC TCCCTCAGCG 4500
GGAATTCACA GTGTAACTCA TTTGCTAAGG TTTTCTGCGT TAGAAACAGA ACTCCTTTTG 4560
GACTACTAGG AGACATGGTC ATTAGAATAA TTATGATTCT TAGTATGACT CAACCCCTTT 4620
TTAATATTCA GCCTTATGGA GGGCCTCTGC CTGCGGCTCT TTGCTCAGGC ACTAGGGCCA 4680
CAGGGGTGTA ATTTCTATCT CTGCCCTCAG GAAGCTCACA AACAAGTCAA GAGACAGGAA 4740
AACGGATCCT GTTTTTCTAA TGGGATTTGA ATGGATGTAT TTATGGGAGG GGGGTGCTTT 4800
GTACACCTGC AAAACAGAAC ACCAGCCCTC CCTTCTCCTC TGGGGTTGCT GTGAGAATCA 4860
GTTAGAATAA TGTGCATGAA CCCCGTATGG AAAATACAAA CTCATAATTA AATCTAAGAA 4920
ATTTTTGTGG GGGGACACAA ATGTTGGGGT TGTCTTTGTT CTCAGGTCCC CTCAACTGGT 4980
CTAATGAAGG AAACAGACAC CTTTCCAGTA ACAATAGCCA ACATTTATTG GACACTTATG 5040
TACCAGACTG TGCTATTTAT GACATACATT ATCTAATTTC ACAATCAGAA GAATGCTAGA 5100
GATAGGGTCA GGCGTTATCT CTGTTTACAG ATGAGGAAAG CAAGGCTTGG AGAGAATGCC 5160
ATACAGTTAT TAGTGTGGCG GAGCCGGCCT TTGCACCTGG CTGTTGACCA CGCCCTAGCA 5220
TTAAACCATT ACCTCACACT GCTTCTCCGA GATAGTTATC TTCTTGGGAT CATTTAGGTG 5280
TGGCAGGATC TGGAGGGAGC AGTTGGACCC AAGTCTCCTA GCAGCAGCCT ACACGTTTCT 5340
TGAGTCTGTT TTGAAACAAC TTCCTTAGCC CTAGCTGCGC AGAAAGCATC CTCCCCTCAG 5400
AGTGATGATT TTTATCATGT GGTTTCCTTC CTCCTGCCTT TGGAGGTCAG GTCTTCTCAC 5460
CCAGGGTCAG AAAGCCCATC AGTTGCTGAT AAGCTGCAGC ACTTGAGTCA CAGGGTGCAG 5520
GCCTGTGTTT AGAATGGGTC ATGCTCATGT CAGGCACGTG GGGAATCAGT GATCCCATGA 5580
GAGCTCGATC AGTGCAGTCT GGTTTGGAAT TGCAGGTCAC ACCCTTCCAC CACTTTGCTC 5640
ATGTGTCTAC TGATGCCTGT GATGTAGTTA GTTAAACCAC TGACTTCTTT CTCCTGCATC 5700
AAACATGACT TTTTGAAAAA GTGTGTGGGG GCTTTCCAGC ATGAACCAGG CATAAACCAG 5760
GTACCTTCAT GAACATATTA TTTATCCCTT CAGTCACCCT GTGTGCTAGG TGGTATCATA 5820
ACTGCTTTGT GGATTGAGGA ACCTGAGGAC CAGAAAGATG ACTTGAGGTG GCAGCCTCAT 5880
TTAGCCAGCA AGTAAGAAAA TGGGTGATGG TGAACTTCTG CAGCAAGAGG 5930