EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-15561 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr19:39145850-39152000 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HES2MA0616.2chr19:39151177-39151187GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr19:39151177-39151187GGCACGTGCC-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39149919-39149934TGAACCCTTGACCTC-6.07
Nr5a2MA0505.1chr19:39151246-39151261GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RESTMA0138.2chr19:39147759-39147780TGCACCACCATGGCCAGCTAA+6.23
TCF3MA0522.2chr19:39151362-39151372AGCAGGTGTT-6.02
ZNF263MA0528.1chr19:39148845-39148866GAGGGAGAAGAAAAAGGAGAG+6.03
Number of super-enhancer constituents: 121             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39138153-39152329Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39146593-39147862Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39148092-39149078Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39149526-39151135Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39151209-39152062Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39138141-39146483Aorta
SE_01543chr19:39146606-39147905Aorta
SE_01543chr19:39148036-39152396Aorta
SE_02393chr19:39145095-39151185Astrocytes
SE_02946chr19:39148347-39148983Bladder
SE_03166chr19:39145204-39147806Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39148042-39149717Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39151248-39151982Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39142528-39150950Brain_Anterior_Caudate
SE_03903chr19:39151098-39152311Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39138188-39150664Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04868chr19:39151145-39152446Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39137791-39163220Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39142593-39150737Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06803chr19:39151039-39152377Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39138293-39150177Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07777chr19:39150990-39152302Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39145164-39150661CD14
SE_09404chr19:39150878-39152059CD14
SE_13194chr19:39148036-39149296CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39147007-39147805CD34_Primary_RO01536
SE_13490chr19:39147965-39149621CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39147864-39149886CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39145153-39150715CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39145217-39146792CD56
SE_20249chr19:39148933-39150874CD56
SE_20865chr19:39147003-39149092CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39145750-39147768CD8_primiary
SE_22709chr19:39148116-39149221CD8_primiary
SE_22709chr19:39149249-39150729CD8_primiary
SE_22709chr19:39151153-39152066CD8_primiary
SE_23062chr19:39146719-39147435Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39148152-39149702Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39149763-39150897Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39151201-39152363Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39148201-39148967Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39148159-39150480Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39151239-39152366Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39138146-39159498Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39146509-39147842Esophagus
SE_26525chr19:39147926-39151143Esophagus
SE_26525chr19:39151219-39159772Esophagus
SE_27614chr19:39137681-39163004Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39138161-39147807Fetal_Intestine_Large
SE_28533chr19:39147858-39163235Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39138278-39146703Fetal_Muscle
SE_29583chr19:39148014-39150736Fetal_Muscle
SE_29583chr19:39151289-39152312Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39146607-39147857Gastric
SE_31384chr19:39148129-39151115Gastric
SE_31384chr19:39151193-39152368Gastric
SE_34299chr19:39145476-39147821HCT-116
SE_34299chr19:39147843-39150429HCT-116
SE_34681chr19:39145644-39150909HeLa
SE_35812chr19:39145150-39151216HMEC
SE_35812chr19:39151229-39162882HMEC
SE_36926chr19:39137778-39163235HSMMtube
SE_38012chr19:39137938-39147548HUVEC
SE_38012chr19:39147692-39151398HUVEC
SE_38896chr19:39145503-39147795IMR90
SE_38896chr19:39147940-39151140IMR90
SE_40594chr19:39137778-39152373Left_Ventricle
SE_41601chr19:39148332-39148962LNCaP
SE_41601chr19:39149759-39150533LNCaP
SE_41601chr19:39151326-39152007LNCaP
SE_42097chr19:39138003-39147895Lung
SE_42097chr19:39147994-39152419Lung
SE_44161chr19:39138251-39151170NHDF-Ad
SE_44161chr19:39151200-39152423NHDF-Ad
SE_44797chr19:39145079-39151181NHLF
SE_45660chr19:39138201-39152333Osteoblasts
SE_46686chr19:39148242-39148950Ovary
SE_46686chr19:39149799-39150424Ovary
SE_47108chr19:39136358-39164169Panc1
SE_47461chr19:39149789-39150618Pancreas
SE_48075chr19:39137690-39146503Psoas_Muscle
SE_48075chr19:39146532-39151189Psoas_Muscle
SE_48075chr19:39151218-39152334Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39146714-39147871Right_Atrium
SE_48555chr19:39148061-39148983Right_Atrium
SE_48555chr19:39149099-39151161Right_Atrium
SE_48555chr19:39151170-39152407Right_Atrium
SE_49449chr19:39148223-39148947Right_Ventricle
SE_49449chr19:39151227-39152097Right_Ventricle
SE_50056chr19:39137733-39146496Sigmoid_Colon
SE_50056chr19:39146575-39147809Sigmoid_Colon
SE_50056chr19:39148052-39151172Sigmoid_Colon
SE_50056chr19:39151209-39152408Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39137722-39163232Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39138189-39151169Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39138135-39147829Small_Intestine
SE_52339chr19:39147924-39151151Small_Intestine
SE_52339chr19:39151229-39152378Small_Intestine
SE_53291chr19:39145255-39146498Spleen
SE_53291chr19:39146742-39147807Spleen
SE_53291chr19:39147912-39151142Spleen
SE_53291chr19:39151158-39152388Spleen
SE_54534chr19:39138178-39150778Stomach_Smooth_Muscle
SE_56336chr19:39145089-39150693u87
SE_56725chr19:39145158-39147805VACO_400
SE_56725chr19:39147957-39149761VACO_400
SE_56725chr19:39149768-39151132VACO_400
SE_56725chr19:39151236-39152349VACO_400
SE_57359chr19:39148169-39150430VACO_503
SE_57359chr19:39151257-39152297VACO_503
SE_58002chr19:39145257-39147305VACO_9m
SE_58002chr19:39148223-39148973VACO_9m
SE_58002chr19:39149062-39149753VACO_9m
SE_58002chr19:39149779-39151104VACO_9m
SE_58002chr19:39151269-39152290VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39145110-39152245HSMM
SE_64225chr19:39145110-39151003NHEK
SE_64225chr19:39151203-39153683NHEK
SE_65266chr19:39149035-39150482Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39150728-39152038Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 8             
ChromosomeStartEnd
chr193914975839150541
chr193914799639148107
chr193914925339149575
chr193914853339148920
chr193914692139151075
chr193915093739151053
chr193914815639149750
chr193914678039147782
Enhancer Sequence
CATAAATATA ATAGAAGGAA ACTGCAAAAA TAAACACATT GAAAACAAAA CAGTGTTGTT 60
TCCAGGTGGT TACCACTCGG GCTGAAGGCC CCCCAGGCTT GAGGCCTGCT CCCTTTGTTA 120
GAAAGGGATT GGCAAGTGTT GGTGAGGTGT TAAAGACCCA CCAGCACCAA GCAGAGACTT 180
TCTCTTTGAA GTCATCAGGT TTACAAGAGA ATCAAAGGAA ATAACTTTCT CAATGTGATT 240
CAGGGTGTAA TGTAAGGTGT AGATAACCCT TAAAATTTTC CATGTGTGTA TGTCACACTT 300
GGGAAAAAAA CTTGATCTCA TCTGGTCGAG GTGGGCAGGG CAGCACCTTG TCCAGGAGCA 360
CACAGCCCCT CTTGGCTCTG TGTGTCATCC GGCCATACTA GACTCGAACA TATGGCTCAT 420
GACTGGATGA TGCTTGATTC ATCTTCAGTT TCAAGTGTTA GTGCTTTTGA GGTTTTGTAA 480
GAAACCAGGA CACATTGAAA ATACAGTCAT TTCTCAGTAT CTGTGGGGGA TTGGTTCCAG 540
GAACCCCCTT ATATACCAAA ATCCACAGAT GCTCAAGTTC CTTATGTAAG ATAAAACGAT 600
GTGTAATTTG CATTTTAACT ATGCACATCC TCCTGAATAC TTTAAATCAT CTCTAGATTA 660
CTTATAACCT AATGCTAAAT GCTACGTAAA TGGTTGTTAC ACTGTGCTGT TTAGGAAATA 720
ATGACAAAAA TATGTACATG TTCAGTGCAG ATGCAACCAT TCATTTTTTT TCTTCCAGTA 780
TTTTCGATCC ATTGTTGGTT GAATTCACAG ATAGAGAACC CATGGATACA GAGGGCTAGC 840
TGTAAGAAAT GTGGGTTTAT CATTTGTTCC TCACACAACT TTTTTCTTTC TTCGTTTTTC 900
TTGCCTTTGT TCCTTTTTTT TGAGACAGGG TGTCACTCTT TTTACCAAGG CTGGAGTGCA 960
GTGGAACAAT CTTGGCTCAC TGAAGCTTTG ACCTCGGGCT CAAGCCATCC CCCCACCTCA 1020
GCTTCCCAAG TAGCTGGGAC TAGAGGTGCA CACCACCACG CCTGACTGAT TTTTGTGTTT 1080
TTGTAGAGAT GGGGTTTTGC TGTGTTGCCC AGTCTGGTCT CAGCCTCCCA AAGTCTTGGG 1140
ATTACAGGTG TGAGTCACCA CGCCCAGCCA ACTTTTTCTC TTAAGGCTCC AGTTTTCTTC 1200
TTAGAGTTGG GCCCCTCCCA CGAAGAAAGC ACACTGCCAC CCCTTCATCG GATTTGAACC 1260
CTACATTTTG AAAGGAAAGC AGTGCCCTCC TGCTGAGTTA ACAAGGCTTA TTTAAATGTT 1320
TTTCTTCCAA ATATCAGAGC AGAACAGATT CTTTGTCTTC CAGTGGAACT ATCCACATGG 1380
GGCAGAAGTA GTTGGAAGCG GCAGTTACTA CCCTGCAGAA CACAATGAAG TCATCTTGGG 1440
AAATATCGTG GATGGTGTTG CAATGATTGA ATGGGATGCT AGAACACCAG CAATACAATA 1500
GCATTTGTGT CTTCAGCTTC AGGCAGGAAT AAAGAAGACT TTGTGGTTTG TTTTATGTTT 1560
TTTAAAGTTT CCCCCCCAAA GGTGTGGGGC TGAGTGATGT CTGTCACTAG CTTTCTAGTG 1620
GGTTTTTCTT TTCATCTTTT CCCCTCCCTG ATGTCTTTTG AGAGTGGGTG GAAGCCACAG 1680
TCTAGGTGGA TCAGAGGAAG CACAGAAGGC AGGCAGTATA CCCCACTTTG TGTTTTCCAT 1740
GTCTGAAGGG AACACATTTG GTTTTTGTTC TGTTTTGATT TTTTAGAGAC AGGGTTTCAC 1800
TGTCACCCAG GCTGGAGTGC AGTGGCCTAA TCATAACTCA CTGCAGCCTT GAACTCTTGG 1860
GCTCAAGGGA TCTTTCAGCC TCAGCCTCCC TAGTAGCTGG GATTATGTGT GCACCACCAT 1920
GGCCAGCTAA TTTTAATTTT TTTTTTTTTT GAGATGGAGT CTCACTCTGT CACCCAGGCT 1980
GGAGTGCAGT AGCACGATCT CAGCTCACTG CAACCTCTGC CTCCCCGGTT CAAGTGATTC 2040
TCCTGCCTCA GCTTCCCAAG TAGCTGGGAT TACAGGCGCG CGCCACGACG CCCAGCTAAT 2100
TTTTGTATTT TTAGTAGAGA CAGGGTTTCA CCATGTTGGC CAGGCTGGTC TTGAGCTCCT 2160
GACCTTAAGC GATCCACCCA CCTTGGCCCA ACAAAGTGCT GGGGTTACAG GCATGAGCCA 2220
CTGTGCCCGA ACTAATTTTT AAATTTTTTG TAAAGACTGG GTCTCACTAT GTTGCCCAGG 2280
CTTTTAATCT GCAAAAAGCC CAAGATAAAG AGTTTTAATA TCTTACCTCC TGAGTAGTAA 2340
TGACTGATTC CAGTTCTAAT AATGTCTTAA TTACAGCTAT ACAGATTGAG GGGACTGCAG 2400
GAAGTGAAAT AGATGCATTT CTTTTTTCTT TCTTTCTTTT CCTTTTTTAA ATACACACTT 2460
CGTTTCGGTG GTGAAGGCCA GTTTGAGGTT AGGAGAGGCA TCTTGGAAGG AAGCTCGCAG 2520
GTGGTTCGGC ATCTGGACAT GCTGGGAAGT TGCCTGAGGG GGACGTCACA ATAAGAGGAC 2580
TGTGGGTCTA CAGCCTGCCT TAGCAAAATG ACAGGCCTTC TTTTACCAAG GCCAAGGGCA 2640
GTGGTGGAAG CTGACTTCAG TTGGTGTCAT CAAGGCCTCA GTATGTGTAA CGGTTAACAA 2700
ATTACTATTC TATGATCAAT CTCCATCTGG GTGTGAGTAA AAGGTATTTA GTTGCTATCA 2760
CCATGGAAAC CAAGTTGCTT ACTTACTGTT TTGGGGAGTG CCCTCATACC AGAGGCAGTG 2820
CTAATGGTGG AGTGTTAGGC CCCGGGCAGA AAAAAAGATC CTGCCACTTG GTATCACAGG 2880
AAAATACCTA CAGGCACAGC AGCCTTGCCA GGTAGGGGAT GAAGGCCCTC TGTCCTCGGG 2940
GCAGGAGTTG GGCCAGTTGA TTGTGTTGAT GAGGAGTGTG CATTTGTGCA TGAGAGAGGG 3000
AGAAGAAAAA GGAGAGCACT CCATGAAATC CGCTGCTGGC TTTGTAGCCT AGAAGAGTGC 3060
TTTTTTTCTC TAGGAGTTTG GAACTGGAAT CTCAGCTATG TGACTTCTTA ATAATAGGAC 3120
AAAATATGCC TGTATCTTTT GCCTACTTCC ACAAACACTG ATAAATTAAA AAGAACTCTA 3180
AATTTCCCAC AAATCCCAAG CACAAGTAAC TTTTTTTTTA AATCCACATC CTCCCTAATC 3240
CAAATCTAAC AGCAAATCCT TTTCTCTCTG TCACTCCCTG CTTTTCTTTA AGAAAATGAG 3300
TACCTTGCCT TAAACTATAT ATTGGATGAA AATATTAAAC ACTTTCACAA AGTGCTTCTT 3360
TGGCTGTTAC TGGTATGCCT TGCATTTGGA AGGGTCAGAG ATTTGAAGAC TTCTGTGATC 3420
TTCCAGTTCT GGCCTATGAA ATACAGTCAG TTTCAAAATT CAAAATGTCT GGAAGAGCCA 3480
ACTTGCCAGG CCGGTTCAAG GGCAGTCAGA TGAATCGACC CTTCTTACAG GCTGTCTACG 3540
AACCAGTCAT GATTCAGATA TTCAAGTCCT GGAAGGTATC CAGACGGTAA ACATCACCAG 3600
GATTGTGAGG CAGTTACTTT TTTTTTTGGA TCGTTTGAGC TACACTGCCA AGACTGTGGT 3660
AGGACTTGTC TGTGTAAAAC AGAAAGGGCT GTCTCTAAAT GTCTTTTTCA AGAATGTCGG 3720
CTATAATCAC CCGACACTGT GTCTCATGGT GGGGTGAGAT GAAATACCTA GACCGGTTAG 3780
GGGAGGGCCT TCTTGGCCAT TTTTTGAACT AATTTTCCCT TTCCCTTTGT AACTTTTTTT 3840
TCTTCTTTTC TTTTCTTTTT TTTTTTTTGA GACGGAGTCT TACTCTGTCA CCCAGGCTGG 3900
AGTGTAGTGG TGCAATCTCG GCTCATTGCA ACCTCCGCAT CCTGGGTTCA AGTGATTCTC 3960
CTGCCTTAGG CTCCCGAGTA GCTGGGACTA CAGGCATGCA TTCCACGCCC AGCTAGTTTT 4020
GGTATTTTTT AGGAGAGACG GAGTTTCACC ATGTTGGCCA GGCTGGTCTT GAACCCTTGA 4080
CCTCGTAATG CCCACCTAGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGTATGA GCCACCGCGC 4140
CCAGCCCCTT TGTAACTTTC ATTAACACTG ATGAGGCACA AGCCATAGGA TAGAATTGAA 4200
TCCATTGAGA GCTGTGAGCC AATTGAGGGA TGATTGGTTA ATAGATTGTG GCTTGAAGCT 4260
GTGGAAGGTA AGGGGTGACA CTTGACTCCT ATTAGCCTTG TAGAAACACC TCAGAGATTC 4320
ACAGGAAGCA AACTTTGACC ATAAAAATAT AAGACTCACA GCGCACCGAG TTCTCTTAGC 4380
AGCTACCTTA GAGTTGAGAA AGTTTTGGGC CTCTTTAATA AACAAGCACA AAGCAGTTCT 4440
TGCCAAATAC GGCCTGCTCT GGGGCCACAG GGTTAGCTTA GGAGACAACT TTCTTGCCTA 4500
AAAATAAATG CATGTTCCTA TCAGACATTC CAAGCATAGT TTAAACATGA GACTTCTGAG 4560
CAGCAGCTCA AGCTCTGTGG GTTCAATTAT GTCAGAGTAT GGGCAGTGAG GGTCTTTGGG 4620
GAGTGTGCCC CCTTATTTGG GATTGGTTGT GGCTACCAAG GAAATCAGAT GATCAAATGC 4680
AAAACTTCCT CCATCTTATT TCTATATGAT CTTTTTTTTT TTTTTTTGAG TTGGAGTCTT 4740
GCTCTGTTGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC AGGATCTCAG CTCACTGCAG CCTCTGTCTC 4800
CCAGATTCAA GCTATTATTC TCCTGCCTCA GCCTTCCAAA TAGCTGGGAC TACAGGCGTG 4860
GCCATCATGT CCGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTAGAGAC AGGGTTTTGC CATGTTGGCC 4920
AGGCTGGTCT CCAACTCCTG ACCTCAGGTC ATCCACCCGC TTTGGCCTCC CAGAGTGCTG 4980
GGATTACAGG CATGGGCCAC CGCCCCCAGC CTTATTTCTA CACGTTCTTG ATCTATCACA 5040
GGCTGGTGGG GGAGACAGCA TGCATATAGA TAATGAACAA GGTAACTTCA GATAGGATTA 5100
TGTGCAATAA ATTAAATAAC AGCTAGCATT TTACCTTGTG CTAGACACTA TTCTAAGTGC 5160
TTCCCATGGA CTGACTGGTT TTTGTTTTTT TTTCTTTCCT TTGAGACTGA GTTTCGCTCT 5220
TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AATGGCGTGT TCTTGGCTCA CTGCAACCTC CGTCTCCTGG 5280
GTTCAAGCAA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCC GAGTAGCTGG GATTACAGGC ACGTGCCACC 5340
ATGCCTGGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGACGGGGTT TCTCCTTGTT GGTCAGGCTG 5400
GCCTTGAACT CCCAACCTCA GGTGACCCAC CCGCCTCAGC CACCCCAAGT GCTGGGATTA 5460
CAGGCGCGAG CCACCATGCC CGACCCATGG ACTCACTTGT ATAATCTTGT GAAGCAGGTG 5520
TTGTTACCCT TACATGCAGA AATGGATCCA TGGGCCTTTA AGCCACTTGC CCCTGTGACA 5580
GTGCCAGGAT TTGAATGTAG AAGTTGAGGC TTTCAAGTTT ATGCTGTTAT TTCTACACTA 5640
CACTGAAGTC TAGTGATTGG GAATGGCTTT GCGAGCGGGT GGTGAGGGGA GGAGTGTGCA 5700
GTGCAGGTAC TTCAGATGGA GAGGAAGGTC TCAAAGAGGT GGCATTTCAG CTGTTCCTTA 5760
ACGGATGAGA AAGAGAGAAC CAAGAGAGCA CCAGAGGAAC GCGCTTCCAA CAGAGAAAAC 5820
CAAGCAAGGG GGCCCCCGAG GAGCAGAAAG GCCCGAGTGG TCAGAGCGGA GCCCGTGGAA 5880
GAGATGGGCA CAGCCAGATT GCTTAGAGCT GTGTTGTTAG AAGTGCTGAT GAGTCTACAT 5940
TCAACTTGCG CCTGCAAACT CAGTCCCTCT TAGATGCCAG TAGGTCAGGA ACCTCATGCT 6000
TCCAGGACTC TGGCGCTCCT ACCCTTTCCT CCCAGGCCTC CTGGACAGGC CAAACCAGAA 6060
CTGACTTCTA AAGTGGGAAC CCCAAGACGG CAGAACATGA ATCAGCCAAA CAAAAGCTGC 6120
AGTTATCTCT GTGATGATTT CGGCAGTCGG 6150