Tag | Content |
---|
EnhancerAtlas ID | HS133-14644 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | melanoma |
Coordinate | chr19:3244040-3245450 |
Target genes | Number: 20 | Name | Ensembl ID |
|
TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
REST | MA0138.2 | chr19:3244190-3244211 | TTCAGCACCAGGGACAGCGTC | + | 9.61 | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3245297-3245317 | TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT | - | 6.16 | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3244923-3244943 | CGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.35 | RREB1 | MA0073.1 | chr19:3245398-3245418 | CGTGTGTGTGTGGTGTGTGG | - | 6.35 |
|
| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 1 | Chromosome | Start | End |
|
| Number: 1 | ID | Chromosome | Start | End |
GH19I003244 | chr19 | 3244121 | 3244270 |
|
Enhancer Sequence | AGCACATTCA GCCCATAACA GGAACTGTGA ATCAAAGCTC TATTTATCCA GGGGTGGGTA 60 AACATTACGC ATTTTCACCA GCTAGAAACG ACAAGCAAAG AGGCCAAGAA GAGGTTGGGC 120 CAAGAGATCA CGGAAGCCAT AAGGAAGATT TTCAGCACCA GGGACAGCGT CAGGGCGGGC 180 TTTTGTGAGC ATGCGTCTGT GTGTGGCGTG TGCATGGGCC TGTGCGTGCG AGTGTGTGTG 240 TGTATGGTAT GCATGCAGTA TGTGTGTGTG CGTAGTGTAT ATGGTGTGCA TGCATTATTG 300 CATTGTGTGT GTAGTGTGTG GTGTGTGCAT CTGTATGTGT GTAGTGTGTG TGGTGTGCAT 360 GCATTGTGTG TATGTGTGTG TAGTGTGTGG TGTGTGCATG CATCTCTGTG TGTAGTGTGT 420 GGTGTGTGCA TGCATCTGTG TGTGCGGTGT GCATGCATCT GTGTGGTGTG CATGCGTCTT 480 GTCTGCGTGT GTGTGTAGTG TGTTTTGCAT GCATTGCGTG TGATGTGTGT GGTATGTGCA 540 TGCATCTATG TGTGGTGCAC ATGTGTCTTG TCTGCGTGTG TGTGCGTGTG TGGTGTGTGT 600 ATGTATCTGT GTGCATAGTG TGTGTTGTGC ATGCATCGTG TGTGTAGTGT GTGGTGTGTA 660 TGCATCTGTG CATGTGTGTG TGGTGTGTTG TGCGTGCCTT GTGTGTAGTG TGTGGTGTGT 720 GCATGCATCT ATGCGTGTGT GTATGGTATT TGCATGCGTC TTGTCTGGTA TATGTGTGCG 780 TATGTGGTGT GTGTATGCAT CTGTGCATGT GTGTGTGTAG TGTGTGGTGT GTGTATGTGT 840 CTTGTCTGCA TATATGTGTG TGTGGTGTGT GCATACATCT GTACGTGTGT GTGTGGTGTG 900 TGGTGTGTGC ATGCATCTTG TCTGCGTGTG TGTGTGCATG TGTGGTGTGT ATATGCATCT 960 GTGCGTGTGT GTGTAGTGTG TGGTGTGTGC ATGCATCTTG TCCACGTGTG CGTATGTGTT 1020 GTGTGTGTAT GCATCTGTGT GTGTGTAGCG TTTGGTGTGT GCATGCACCT GTGCATGTGT 1080 GTGTGTAGTG TGTGGTGTGT GCGTGCATCT CTGTGTGTGT TGTGCATGTG TCTTTGCGTG 1140 TGTGTGTGGT GTGTGTTTGC ATCTGTGCAT GTGTGGGTGT GTGATGTGTA TATGCATCTG 1200 TGCGTGTGTA TGTGGTGTGT GTATGCATCT CTGTGTGTGT GCGTGTGTGT TTGCATCTGT 1260 GTGTGTGTGG TGTGTGTATG CATCTGTGTG TGTGCGTGTG TTTGTGTGCA TGCATCTGTG 1320 TGTGTGTGCG TGTGTGTGTA TGCATCTGTG TGTGTGTGCG TGTGTGTGTG GTGTGTGGTG 1380 TGTGTGTGTG TGGTGTTTCT TTCCCTTTCA 1410
|