EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-04009 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr1:244610230-244614930 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr1:244610578-244610589TAAGTAAATAT+6.14
Foxd3MA0041.1chr1:244611674-244611686GTATGTTTATTT+6.11
Foxd3MA0041.1chr1:244613885-244613897AAACAAATATTC-6.18
Gata4MA0482.1chr1:244610943-244610954AAGAGATAAGA-6.02
Gata4MA0482.1chr1:244610530-244610541GAGAGATAAGA-6.32
MAFKMA0496.2chr1:244612127-244612146TTTTGCTTACACAGCAGTT-6.53
RREB1MA0073.1chr1:244614496-244614516GGGGGGGCGGTGATGGGGGG-6.27
SOX10MA0442.2chr1:244611970-244611981AAAACAAAGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr1:244613940-244613951TGCTTTGTTTT-6.02
ZNF143MA0088.2chr1:244611160-244611176CACCCAGAATACATTG+6
ZNF263MA0528.1chr1:244613621-244613642GAAGGAGGGAGAGGTGGTAGT+6.08
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
SE_05523chr1:244607983-244611433Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05523chr1:244611645-244616566Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07255chr1:244607616-244616510Brain_Hippocampus_Middle_150
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1244612207244612257
chr1244613568244613600
Enhancer Sequence
AAAACTTAAT ATAGACAAAA ATCTCATTTT TAGAAATCTC ATGGAGCCTC TTTTCAAAAA 60
AGAATTTTGT TATATGAATC AAATATAAAT TTTGGTTCAA TGTAAAGAAC TATCCCATCC 120
CAGAGCCAGA TTAGCCACAG GAACTCCCCT TCATTTATTG TTCTTTTCAT TGCTTTCAGC 180
AGGCAATACT GAATGTTGAT GTTTCTGTTG CTAAAAGTAT TACAATAGTC ACCAATTTTA 240
ATTTATCAAT ATGTAGCTCA TCCACACTAA TCTTTGGTGT CAACATCTGA CACAGTCCCT 300
GAGAGATAAG ATAGCTGGAT TCGTATCCAG TTACAGAAAG AAAGCTATTA AGTAAATATC 360
AATTTATTGG TTCATTCTAG ATTTGCTCTA GGCAACAGTT TTTCTTAGAG ATACTTGTAA 420
ACATCCAACA AACCCATCCA TTCCCACCAA AGTTAAAGAA ACAGAATAAT TTTGATCAGA 480
CACCACTGAG ATGGTCTCAT ACACGTTTAA AAACTCATGC CTCAAAAGTA GAGCTGACAG 540
GATACTATAT TTACTAACTG CAATAGGACA TCCTCATTGA CCGAACATTG AGATTTACTG 600
TCCTCAGCGG GGAATAACTA GTTACTAGAA CCCCACATGG TATTCAGTCG AAATATGTTG 660
AGGAGATACA TGAAAAAGAT ATAAATATCA GTTACCTATT TTCTCCTAAA AACAAGAGAT 720
AAGATTTTAA TATAAACAAA GACTTTGAAT GGTACAATGT AAAAAATTCC AGCTGAAAAA 780
CTAAATAACA AATGTTAATC CAAGGAATGC TAGGAATTCC GCCTTAAATG TATGCCACCA 840
GTCAATTAAA TTGTCCAGAG AGATGTTAAA ACAATTACAA GAAAGGGTTA CTATTATTTA 900
TTTCAAATAA ATTTCCAGGG GTGATCTTGC CACCCAGAAT ACATTGGTTG AGTATTTCCC 960
TTCTGCTTCA TATAGTATTA GGTGCTACAG AATAAGAAAA GGAAGAAGTC TCCCTTTTGA 1020
GAAAATTTAC ATTATAGTAG AGAAAGCACA GTAACCAAAC AGAACAAGAT TTAACCAAGT 1080
ATAGTATAAC AGACATTGGT AAATACTTAT ATACTAGGGA AATGCTATAA ATGATATAAA 1140
AAGAATCAGA AAAATGGAAA TAGCAATTGT TATAAACCTG GAAGAATGGC TTACCTTAAA 1200
TGCTAATTAC CTACTATCCT TAAAATTATG GGAAGTAGTC TGGCAGATCA TTTTAGCTGT 1260
ACAAGGTCAA GGCATTAAAT AATACTAACG TTATTTTCTT TTAAATTATC TTTCACCTTT 1320
TCTATTTCAA GGAGAAAGTT TTAGTTTGCT GCTGATATGT CTTTTATGCT TCTTTAACAC 1380
TAATAGTGGT TTCAGATCTT CAGCAGATAC TTGTATCTAG CTAGAAAATA GTAATATTTT 1440
TTCAGTATGT TTATTTTTAT AGCAAGCTTT TATAAACATA TATCAAGTGA TGGGGTGTGC 1500
TTTCCCTTAT GACTAACTTT AGTATTTTCT CTTTTTATTG ACTTTGAAGC CTTGGAGAGA 1560
ATACACACGG AACACTGCTC TAGCCTTTCC CGATCACAGG CAACTTCATG TGTGTCATTA 1620
TAACCAAGAC CACCGAAGTT ACTTTCCTCA AGAACAATAA ATAAGTAAGC CTTTGCTTAA 1680
AGCCTGGTAT AAACTACTAT AGTTAAGAAG TTTCTGTAGC TTCTACTCAG CAAAATACAG 1740
AAAACAAAGC ACAGTATTTT ACTTTGAGAG AACTGGGGAA AAAACAGTAT TAGGCTTCCT 1800
TTTGTGATGC CAGAAAGGGA CTTTCTTGGT CCCATACTTT AACCTCTTGA GAAACGTATT 1860
AGACTAGTAC CTTTCTCCAT CCCGACCTTC TCAACACTTT TGCTTACACA GCAGTTGTCC 1920
CCCAGATTGT GAGCTCCTTG TGGGCACAAT CCCTGCCTTT TTCAGATTTT TGACTCCCAG 1980
GCTAAGTGAT CCCCTGCAGA TACTCAATGT TTACTAGATG AATGACCTGT ACCCAGGGTT 2040
GGGCCTCTAT TTAATTCTTC TCTCTTCTTC TTAAAATAAA TATTGATTTA AAATTAAGGC 2100
AGCAGTAGTG GTTGTCCTTT GATGCAAGTC CTACATATTT ATGGATCTGG GGAACCTACC 2160
AAGTTATAAA TAACTCCCCA TAAATCCTGA ATCTGAACAA CACAGGCCTT AAGCGCTGTT 2220
AAGAGTGAAA ACGCCACTAG GTTTGCATCT ATTGTTTCCA AAAAGGCATT TTATACATTA 2280
AAATTTATCA TTAAATGCAA TGCCAGTTTT TCTTTTTAAA ACTATATTTT ATGTTGGGAG 2340
AAAGTCCTTA TGAGTCTACT GGTGAAATAC GGATACATTA TGTGTACATC ACTTCTGGAG 2400
AAACAGTACT GAATAAAATT TGAACTCATG ACATAAATAT GGCAGAATAT ATTAAACTCT 2460
AACAAAGGAC ATATTTTCAC TAACACACAA AACTTAAGAC ATCAAACAAG GCAATCCAAG 2520
CTCACAATGT CTTACTGTTG ATTTTTTCCA GCTCTCTATA CACACTCACT AAGAACTTCA 2580
ACATTCCAAT TTTATAACCT AGGGGAACTT CATTAAGTAG ATGCCAGCTT ACTAGGGCTA 2640
ACCAAATAAT ACAAAGTTAC CAAGGTAAAT CACAAAAGAG ATAATGCTTA AATCTATTCA 2700
TTACTCATCT ATTTTTTGCT AACAAGACTA ATAAAGAATC CTAATGATAC ACTTTTAAAA 2760
AGCACTAAAA GAACATAAGG ATTCTATAAG GAAGGTAGTT AAGTCAAAAA TACACAGGTG 2820
AGGGAAGTCT GCCCAACAAG GCCCCTCATT TGTTTCTCCA CTATCTTCAG CTAACATTTT 2880
AAAGCCAAAC TTAGTTCCTT CTCAATCACT TCTCTAGCCT TTCCAAGGGC ATCAGATCAG 2940
GTTGGTCCAT GACTTCAAGA CTACTTTCTC GGTAACATTA GTAACACCTT CTCCAAGCTA 3000
CAAACTACTT CTAATATTTC TCCATAGAAT ATTAAAATTG AGGATCCTTT AGAATAAATA 3060
CCATAATGGT TGTGTTCTCC AAACCTTCTT ACAACCCATA GTGTAGCTCA ACCTGAGCTA 3120
TTTCCATATT AACGAGATGT CAAGATGTCA GTGAAGGAGA CACACAGGCC TCAGCCTCTC 3180
TCCCGCTGTC GACAGCAAGA AAGCTCGGTA TTCGGATACG TCTTCCCCAC AGCATGACCA 3240
GATCTGAATG TAAGACAAAA GGTAGGTAAA GGCTGGATTT CTGGAGTATT TCCTAAGAAA 3300
GTGCGGGGCA GGAATTTAAT GGCAACACCC TGAAGATTGC TAAGGTACAA AGTGTGTTGC 3360
CAGAGGGGTG GAGAAATAAT AGGCTGGAAG GGAAGGAGGG AGAGGTGGTA GTGACAGTTT 3420
CCTAAGAGGC AATTAGTGCA ACAGCTATTT CAGAATGGGC AGGGTGGATT TCTAAATGAA 3480
AACAAAACAA AACGAAACAA GGTAAATCAG AGAATATTTG CAGTATTTGC ATTTAGCTTT 3540
TTAACATACC TGTGATTTCA TTGTTTCTGC ATGCTCAAAA TGGTATTCAA GGGGGCCTAT 3600
AACTTACTAG AACATATACA GCATGGCACC ATCATATCAT GCCATGCATG TTCAAAAACA 3660
AATATTCTTG CAACCTAAAC AGATAGCAGT TAACTTCAAA TATTACATTA TGCTTTGTTT 3720
TGAAAGTGGT TATTGCTCAT CTGCTTAGAA TTTTGAAACT GGAGAGAGTT ATCTGAGAGC 3780
CTTTACAAAG GCCTTACCCT GTATGCTGCG TCAAAGGAAA CGACAAATAG GAAGAAAGGT 3840
TACACTGAAA ACCACGTGTC TCCCGTTAGA AGTACATTAC CACCTCGTTT TCCGAAAGTT 3900
CACTTTCGAT GTCACCTTAA CAATGCAAAT ATTTATTTCC AAATACTCAA TTTGACATCC 3960
ATGTATTTAC TTCCCTCACT TTTTTTGAAC AGAGAAGGGA TTCCTTCCTC TGGGACCAAC 4020
TAGTAAAAGT AATTTCTCCT TAACTTTCAT GTATGGAGCA CACTGTAAAA ACAAAAACAA 4080
AAACAAGAAA CTCAGGGCCC TAAAACAACA GTCCAAAGCC CAGAGGTGGG TGGGTTTGGA 4140
TGTCAACAAA GTGGACCAGA GGAAGCAAAG CACTGCATGC CACGGTCCTG CAGATGGGGG 4200
ATCGGTGAGT CTGATTTCAG GACGTTTCGA AACAATCCAC TCCCACTCCG CCGCCCTGGG 4260
CGGGGCGGGG GGGCGGTGAT GGGGGGTTCT GCCGTCGCGC CGGGTCTCCG CCCGCAGTCG 4320
GAAGAGTTGG GAGCAGGCCT CGGGCGGTAG CTCCTCAAAC TCGGACCGCA TCCCACCTCC 4380
ACCCCGGCCT CAGTCCCGGC GCTGAGCACC ACTCGCCAGA CGCAAAACTG CAACTGCCAG 4440
GCATCGCGCA TCTCTCAAAG GCTCCCCGCC AGCCCACCTC TTCCTCCAGG GCCACCCCAA 4500
GTTTCACCCG ACGCTCCAGG TCAGGGGTCC CCGACCTCCC GCCATTTCTC CACGTAGCCG 4560
CAGCTCAGGA CAGGAGGAGA GAGCCTCAAG GTGACACCTC ATTTTGGCCA GTGGATCCGG 4620
GTTCTGGGTC CGAGTTCCCG GGCACCAGGA GCCAGGCAGC CCGAGCTCCC GGGCCCGGCT 4680
TCCCATGAGA GGCCCCGTCG 4700