EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-02916 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr1:179109760-179112060 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:179111617-179111627TTTAATTAGA-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:179110820-179110838ATTTCCTTCCTTTCTTCT-6.36
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:179110824-179110842CCTTCCTTTCTTCTTTCT-6.56
Nkx3-2MA0122.3chr1:179110906-179110919ATATCCACTTAAA+6.41
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_36579chr1:179109514-179114792HMEC
SE_38819chr1:179108447-179114258HUVEC
SE_46058chr1:179108548-179114790Osteoblasts
SE_63943chr1:179109677-179113945HSMM
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1179110934179111289
chr1179110615179111403
chr1179110907179111290
Enhancer Sequence
AATGAACTAT GTATACATCC TTACTCACAG AGGATGCTAT GAGAGGAAAG AATATAAAAC 60
AAAACTCTAG AGTCTGGCAA GGTTTCAGAC TTAAAATTAG ATAAACATTT AAACTGGATG 120
AACGCAGGCC AGGCACAGTA GCTCATGCCT ATAATCTCAG CACTTTGAGA AGCCAAGGCG 180
GGAGGATCAC TTGAGGCCAG GAGTTCAAGA CCAGCCTGGG CAACATCATG AGACTTCATC 240
AGGTGTGGTG GCTAGCGTCT GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCGAGGTG GATCACCTGA 300
GGTCAGGAGT TCGAGACCAG TCTGGCCAAC ATGGCAAAAC CCTGACTGGG TGTGGTGGCG 360
GGTGCCTGTA ATCCCAACTA CTCGGGAGGC TGAGGCAGGA GAATTGCTTG AACCCGGGAG 420
GCAGAGGTTG CAGTGAACTG AGATCAGACT GCTGCACTCC AACTTGGGTG ACAAAGCAAG 480
ACTCTGTCTC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AATTAAGTAT TGGCTGGGCA TAGTGGCACA 540
CAACTGTAGT CCCAGCTACC CAGGAAGCTG AGGTAGGATT GTCTGAGCCT GGGAGGTTGA 600
GCCTGCAGTG AGCCAAGATC ACACCATTGT ACTCCAATCT AGACAATAGA ACAAAACCCT 660
GTCTTTAAGA AAAAAAAAAA TTAGATTAAT AGGAATTCTG CACTGATGAC AGTAGAGTGA 720
CAGACTGTCA ATACGCAAGG ACATGTTTAT AATAAGGGGA AACTCTGAAC CCAAAAGAGG 780
ACTCTTAAAG ACAAGTCAAC TTCCTGAAAG TTGTGTTATC TGACAAAAGG AGAAAACAGA 840
ATGAGATCTA CAGCACGATT TTATGTAAAT TTAGAAGATA TATGCAGGCC AAACAATATT 900
ATATTTCTGA AATATGTAAA GTAATAACTA TAGGATAAAA GTAATTTTTG AGGCCAAAGT 960
ACTAAAAGAA CCACAACTTA GAAAACAATC CTTCTTATTC CCCATTCCCC TTCTTCCCGT 1020
CTCTGGTTTT ACGGTCTTTT TGGTTGAGTC AAAAGATCTT ATTTCCTTCC TTTCTTCTTT 1080
CTTCCCACTC CTCTTTTGTT CTCAAAGAAC TTAGGGTCAA TTTCCTGCAC AATCTGTCTG 1140
CACAGGATAT CCACTTAAAC ACCATTCTAC CCATTAGCAC CAAACAAAAG GAAAACTTTT 1200
TCAAAGAGAA AAACACCCTA ACATTTTTCT GAAGCTAAGA ACGAACATAT TTTGAATCAT 1260
AAAGAGTAAG GGAACTAAAT GAGGGGGAAC AAGATAAGGG ATAAAGGCAA AAACAAAAGA 1320
AAACAAAAGC CTGTGGGAAG AGCAAGTAAA TGTCAGTGTT ACCCAGTAGC TATAGTCTAT 1380
GTCACTTTCC TCATTGGTTA AGACAGACAT GTCTGGATGA TTCAGATGTA CTGTATACGC 1440
CCAAATGCAA GTGTGTGGGC TGGGAATGGT TTATTTTTGA ACAAAATGAA ATGACTACTA 1500
TAAATTAGGT AACTTAGATA TCAAGTTAAC TTATCTTCCA TTATTCACTG CTATAGAGGT 1560
AGATCAGAGA TTTAAGATGG GATAAGAGAA GACTGATTTT CACTCACATG TAAAGAACCT 1620
AGATAACAGA AATATATTAT CACAATTTAA AAAAGGCATT TTTTTTCTAT TGCTACAGTT 1680
GCAGGCTACA ACAAAAATAA AGCAAAACAG AATAGCCACT TGTACAAAGT AAATTATCAT 1740
GATTGAAAAA GTTAAAACCC AAAATAATAA AACTGAAATT GAGAAAATTC CTAAGCTTCA 1800
TGTTTAATTT TATTAAAAAT ACTTTTCACC AGTTAGTCAT TCAGTAACTT TTATCAGTTT 1860
AATTAGAAAT TTGTCAGGTA GTAATAGGAG AAATTAATAT TACAAATTTT TAGTTTAGGC 1920
ATTTTCAAGT ATTTTATAAA CATTATCTTG CCAGAATTCT ACTTTATCTG ACTGTATATT 1980
CTCTAAGAAG CTAATAAGTT TTAATAACTT CTTTTAAAAA TTATGTAAGG TAAATTATTC 2040
AACAGTTTTC AATATAGCTT AAGTTCTTCA CATCAAGCCA TCTATATCTT ATTATTACAA 2100
AATACTACAT ATTATCCATA CATTCTTCCA TTCAGTATTT ATTGAGATCC TACTATGAGA 2160
TATTCCCCCA AGAAAGCACA CAAACTTTCA CTGACCAAGA ATGAAGACAA AAACAGTAGC 2220
AGATAAGATG AATTTTTTGA AATCTTCATT CACACTTGAT TAATGTGGTT ATCAAGCCTC 2280
CCTGAAACTA TCAACTCTGA 2300