EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-02516 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr1:155943590-155947850 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:155945882-155945900GGAATGAGGCAAGGAATG+6.3
KLF4MA0039.3chr1:155944110-155944121CCACACCCTCT+6.02
Myod1MA0499.1chr1:155944747-155944760GGGGGCAGCTGCT-6.03
PLAG1MA0163.1chr1:155947698-155947712GGGGACAAAGGGGG+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155947633-155947653GGGGTGGTGGTGGTGGTGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr1:155947542-155947562ACCCCAGCCACCCGCCCACC+6.3
ZNF263MA0528.1chr1:155947307-155947328GGAGGAGGAGGAAGGGCAGGG+6.28
ZNF263MA0528.1chr1:155945257-155945278TCCTCACTTCTCCCCTCCCCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr1:155947310-155947331GGAGGAGGAAGGGCAGGGAAC+7.1
ZNF263MA0528.1chr1:155947304-155947325GGGGGAGGAGGAGGAAGGGCA+7.39
Number of super-enhancer constituents: 59             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155941812-155954742Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155943468-155954747Aorta
SE_02626chr1:155944686-155950278Astrocytes
SE_03231chr1:155943838-155950206Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155943981-155947946Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155944922-155954549CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155943238-155950634CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155943527-155950426CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155943689-155952043CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21118chr1:155944387-155954735CD8_Memory_7pool
SE_26270chr1:155943880-155954619Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155943540-155954349Esophagus
SE_29653chr1:155943497-155954685Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155943835-155950402Gastric
SE_34744chr1:155944639-155954826HeLa
SE_36575chr1:155944054-155950067HMEC
SE_37367chr1:155943411-155954717HSMMtube
SE_39002chr1:155943945-155954683IMR90
SE_40164chr1:155944018-155954524K562
SE_40938chr1:155943868-155954680Left_Ventricle
SE_42293chr1:155943432-155954731Lung
SE_43728chr1:155943835-155954686MM1S
SE_45406chr1:155945111-155946504NHLF
SE_45406chr1:155946520-155950447NHLF
SE_47089chr1:155944170-155950162Ovary
SE_48803chr1:155943444-155951076Right_Atrium
SE_50236chr1:155943456-155954539Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155941703-155954664Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155944861-155946413Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155946616-155947212Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155943486-155954414Small_Intestine
SE_53512chr1:155943435-155954278Spleen
SE_55468chr1:155943829-155945106Thymus
SE_55468chr1:155945161-155949969Thymus
SE_56150chr1:155944721-155954706u87
SE_57594chr1:155947238-155949021VACO_503
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59086chr1:155939045-155960951Ly3
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_60754chr1:155943974-155952549DHL6
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155944167-155946550HSMM
SE_64071chr1:155946602-155947446HSMM
SE_66797chr1:155943888-155945154Jurkat
SE_66797chr1:155945231-155946165Jurkat
SE_66797chr1:155946303-155950580Jurkat
SE_67350chr1:155943835-155954686MM1S
SE_69165chr1:155944816-155949957H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1155946363155946660
chr1155945743155946196
chr1155945200155946600
chr1155944562155945214
Enhancer Sequence
CATTGTGGAT CTCTACTGAA AAGCTCAAAG GCAAACACAG TCTCCCCTCT TCTCTCCACT 60
TTGTCTCCCA GAATAAGGGA TGAGGAAACA GTGACGTACA TGGAGGGGAA GGCAATGCCA 120
AGGCTAGGAC TTTGGCTTCC TGGGCTCCCA GCAGGCAGCA AGGCCAGGCA GATCCACCCA 180
GGCGAGGTAG AGCTTCTCCA AGCAAGCCCT AAGCTCTCAT CTGACTTTTT TTTTTTTAAT 240
AATAGATTTT AAAAACTTAA TGTTTTTGTA GAGATGAGGT CTCACTATGT TGCCCAGGCT 300
TGTCTCAAAT TCCTGAGCTC ATGCGATCCA GCTGCCTTGG TCTTCCAAAA TGCTAGGATT 360
ACAGGTGCGA GCCACTGTGC CCAGCTCTCT CAGCTGCCTT TGCTTCTCTC TCAGGTATGT 420
CCAAATCAAG ACTTCTGGGA GAGTCACAGA GTACTCAGAA TCACCTCTCC TCCAGCTGTA 480
CCTGGCAGCA GCCCCTTCCC CAAGATGGTG ACACCTCTGT CCACACCCTC TGTAATAGTG 540
ACCGGAGAGC CTGTGGAGCA TTCCACCAGG ATTCGAGTCA CCTGTGGCTC AGCCCCTGTA 600
CAGCAGAGGC GCCGTTGGCT ATGAAGGGCA CTGAGTCCTG GAGGAGGAGC TATAGGGCTG 660
GGAAATGAAG AGGTGAGGGA TTGCTGGGGG TGGGACTGAG AAGAGGGCTT GGGGTGGTCT 720
CAGCCGGGCC CTGCTCCTTT ATGAGCTTCC AGGGACAAGA TGAAGACAGG AGGCAGAGGG 780
GAAGGCAGCC AAGTGGAAAC ACTAATGCCA AAGCCAGAAA CAACACAGAA AGACATCACT 840
GCACACACAA AGGCACTTAA TAAATGCTTG CTTAGTGAAT GAAGATGAGA CACTGGCAAT 900
GGGAGTGGGT ACGGGTGAAA CGGAAGAGGA TTGCTAAGGG CCACAAGGAA TAAATCAGGT 960
TAGGGACCCT GAGACCCAAG CATCCTGGAA CCCAGCCTGC CCCCTACGCG GCCACACCTG 1020
TCAGGCCAGG AGAGAGAGAC AAGCAGAAAG AGAGGGGGGG TAAGCGATGC AAACAGACAG 1080
GCATTTGTGC AAGTGAACAA TAGCTGTGCC AGGACTCCCT GCCCTCCTGG CACAAGGCAG 1140
GCCGGCTGGG TTGGGAGGGG GGCAGCTGCT GCCTGCAACC CCACCCCCAC CCTCTCCCAA 1200
AGAGACATAA ACAAACCCGG AAGGGTCCAG CCAGCTCCTC TCAGCCTTTT CTCTTACCAG 1260
CTTCAGAAAT CCTAACCAAT CCGCTCACTC AGCTCCTAGA TGATATTTCC AACCAGAAAC 1320
TGAAGCTAAG GATGAAGCTA CTTCCTCGTG GCCAGAGAGC ACGAACCCCC TACTTTGCTG 1380
ACCACTGTTC AAAACAGTAG CCCAGAGCAT CTGGGTACAG AATAGGAGGG CAGGCAGGCA 1440
GACAGACACA CTGACACACC AGCACACCAG TAACATGCAC ACAGGGGATG CACACATTCA 1500
CATCTGTCCC CTCCTTGATT CCAAGGTCAA ATTCCACAGC CAGAGTGGCT AAGATCAGAC 1560
CCCACTGTAA CTCCTCTGGT CGGCCTCAGT AGGTCCTTCT CTAGGCCCCA TCTAACCTCC 1620
TGCAAGTCAC TCAGTGACTT CCCTAAGCTT TAGACTCCCT TCCCCTATCC TCACTTCTCC 1680
CCTCCCCCTC AACTCTCTCC CTAACCTCCA CGACCCCTAG AATTTTTGTC TATGTCCCCA 1740
GAAGCCTCAG CCACCAGGAG GACCCCCCAT TCTTCCACTC TCCTCCAACA CCGTCAGCCC 1800
TCTCAGCTCC CTCCTGGGCT CCCCCAGCTC TCCTCTCCAC TGCACTCCTA GTCCTGCACA 1860
CAAAGCCAGC CACCTCTCCA TTCCTCAGAA CAAAGAAATA GTCGCTCTGC ACACTCCCCA 1920
CTCCACCTGC CCACCACAGA GATTCCAAGG GGACCCCCAG CCTCCACAGC CATCCCTGGA 1980
CCTCTGGTCC CTGCTTGGCA GAAAAGGACC CTTTGTTCTA AGGGATATGA TGGTTGGGGT 2040
TTGGGAAAGG AGAAAGGGAA GAACAGGGGA CTAAAGAGAG AAAGGGGACC TGTGAGGTTT 2100
GGGGCTTGTG GAGGTAGGAA GTAGAGCAGA GAGAACAGAG GAGGTGGAGG ACTGAAGACA 2160
GCCTGGGAGA ACAGAAATGG AGTGAAAAGA AAAAGGAAGC ATGGAGGGGG CTACACAGAG 2220
AGATCCTGTG AGGATGGGAC AGAGAAAGGG GCAGGTTAAA CTTACATTCC TCCTCCTAGG 2280
AGGAGCTCCC AGGGAATGAG GCAAGGAATG GGGAGGGGCT GAGGTGTCAG GGCTTAGCTG 2340
TGACCCATCC CCCCAAGGAG GTAGCAGGGG ACACCATCTT CTTCAAATAA TGTCTTTTCC 2400
AGCGGGTGCC CCTCTACTTC CCACCACAGT ATAAAAAGAA AGGAGACAGC TGGTGTGCTG 2460
GGGGGAGGGG GAGAGGGGAT CCAGGGTTTG TTGGCTAAGA ACCAACTCCC CCTTCTGTAA 2520
CCACAGTTTT CCGGAGGTGG CCCTCCCCTT CCGACCGGCC CAAACTGACA ACCACCCTTC 2580
TCCGGTGGCC TCTTTGCCCT CTCAGATCCA CCCACTCAGC CCCCGACTCC CTGCTGCCAG 2640
CCAGATTCCC AAATTACCTG CCCCACACAG CCAGCCCCCA TAGTAGAAAG AAGAGCCAGT 2700
CCCCCCACCA CCAAAAACAA AAACAAAAAC AGAGCATGAA CACCCAGATG TCTGACGTCC 2760
CAGCTCCCCA CAATAATGGA AAAGGGATCC CAGTAGCTAC CTGCCCCCAC AGAACCGCTC 2820
TCTATACCCC CTAGCCAGGT CTTCCCCCAA CCAGCTCCCC CATGGCTTTC CTTTTTAGGG 2880
TGGAACCAAA TTTCTGCGGT TTCAAAAAAC CTCCCCCGCC CCCCTTGGCT CTACTCCAGG 2940
GTCTCAGCTC AAACGGTTGA AAAAATAAAC AGACTTTTGG AGCTGGGGCC TGGGCTGGCG 3000
CAGGCTGTGA AGAGCCTGTC TGCCACCCCA CTGTTCCACC ACACTTCAGC CACCTCACCC 3060
CGGCCCTCTG TTTGTCTTAG GCCCTACTCG AATCCCCAGT TGCTTTCCAG ATAGCAAAAT 3120
CTAATCCCAA CCCCCTAAGG AAAGTCCTTT TAAAGCTGCT TTCCCTGGCC CTCCACCCCC 3180
AACCCAGGAT GGAACCTCTG TCTCTCCCAG TTTAGCATCA AGACAGGTAG CCTGGCTAGG 3240
AACTACCAGG GAGGTGGAGG GGAGGGCTTT CCATCACCCT TAAGGACTCC TAAGGGGTAC 3300
TGCTCCCTTG GCTGAAGTTG GTGATCAGCA TAGGCTGGCA CCAGGGTAGT AGGGCACTCA 3360
GGTTGGAGAG AAGCCAGAGA TTAAACCAAC TCTGGGCTGG GACCTGTCCT TTCTGATAAT 3420
GGGTACAGTG CGGGGGCCCC AAAGGAGCTG GGAGGTGCTG TCTGCAGGCA CCACCTTCCT 3480
TTCAGCTCTG ACTTATTCAC CTGCAAGTCA GCTTCATCAT TTCCTGGGGT CTGGGTGTGG 3540
AAAGGTCAGG GCACTTGGGA ATGGGGCTGG GTACAAAGGC AGGGATAAAG GGTACTTGGA 3600
GAGGAGTGGC CAAGAGGTCA TGATGGGGGA GGCGTGTGGA TAATTATACA CCCAGACTCA 3660
TGAAATGCTA GGTGAAGGGA CCCCAAGACG AGCAGATAAG AGAATGAGAG CGCTGGGGGA 3720
GGAGGAGGAA GGGCAGGGAA CACAATGCAT AGTGCCAGGT GTGTCAGCCT AAGGGTTTCA 3780
GGTTGGGAGA AGGAAGAGCT AGGAGGCTGG CGGGGCAGAT AGGGATGGAG GCCCTATGTT 3840
CCAGGCAGAA GGGCTCAGGA TGGAGGAAAG GAGCCCAGCT ACACAAAGAC CTCTGCTCCC 3900
TTCACCTAGA GGTGATGGTT TGGGGGAAGT AAGCCGTCCC TCGGCCGTCC CGACCCCAGC 3960
CACCCGCCCA CCCAGAGGGG AGAACTGAAT CACAGCTGGA AAGTCCATTT GCGAGGAGAG 4020
GAGGAGCTGA CTTTTGTCTT GGAGGGGTGG TGGTGGTGGT GGGAGGAAGC CGGGAAACCA 4080
CCCCCTCCCG TCCCCTCCGC CGGATGGCGG GGACAAAGGG GGAACGACCA AGCCAGCGAT 4140
TGGGGAGTGA TGGGGGGTCG CCACGCCAAG CCCAAGCCGG TGGGGCCCGG GGTGAGAGGA 4200
GGTGCCGGAG CTTCCACCGC CCCCACCCGC GAGACACACA CCTCCCTCTT CCCGCTCCGT 4260