EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-00355 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr1:12512090-12515740 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr1:12515004-12515015CTCTGTGGTTT+6.14
Sox3MA0514.1chr1:12513684-12513694AAAACAAAGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00009chr1:12506389-12526105Adipose_Nuclei
SE_01743chr1:12511532-12515011Aorta
SE_03005chr1:12513269-12513663Bladder
SE_03005chr1:12513943-12515024Bladder
SE_15065chr1:12506299-12515319CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20910chr1:12506384-12515111CD8_Memory_7pool
SE_26086chr1:12513098-12515726Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26716chr1:12506659-12513255Esophagus
SE_26716chr1:12513330-12515524Esophagus
SE_28215chr1:12513081-12514952Fetal_Intestine
SE_29231chr1:12512885-12515007Fetal_Intestine_Large
SE_29871chr1:12514499-12515348Fetal_Muscle
SE_33776chr1:12506505-12516452HCC1954
SE_37319chr1:12513768-12518184HSMMtube
SE_39882chr1:12506572-12512625K562
SE_39882chr1:12512832-12515652K562
SE_41209chr1:12512181-12515171Left_Ventricle
SE_42647chr1:12511538-12515195Lung
SE_45864chr1:12513386-12516437Osteoblasts
SE_49026chr1:12513381-12515085Right_Atrium
SE_50544chr1:12513372-12515427Sigmoid_Colon
SE_51539chr1:12512592-12515650Skeletal_Muscle
SE_52815chr1:12513220-12515041Small_Intestine
SE_54847chr1:12512158-12515661Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr11251340412513748
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I012452chr11251265812518656
Enhancer Sequence
AAAATTCAAA CTCAGGTGTG ATTATCTTTC TATTATGCCA CATCCATACT TCCCTACTGA 60
GGTCTTGAAG GCAAGAGACA GAAACCACTT CTGATTTCTG ATTCTCTGTC TCTAGCCTGC 120
CGTACAAGTA GGGCTTCTGC ACATGTTGGA TTGCTTGGTT GACTGGGTGT GTAGTGGATT 180
TGTACTTGCT CATATCGGGA CTCATTTTTC CTTCGTCTGA ATAATCTGGA CCTCTATCTC 240
CAGGCTTTAC TTGTCACAAG ACAGTGGGAG GATGGGATCA TGAAGGATGG CCTGGGCCAG 300
TCACTCCCTA CATGATGGTG TAGCTCTTTT GGGTATCTCT GCCCTGTTTT GATGACCATC 360
TTCAAAGTCA AGGACCTGGG TAAAATAGTG CTTCCAAGCT TCAGAGAAGA GCAAGGCCAG 420
AGGGCACCCA TGATGAGCAC CACTGGAATT CCCTCCCTCC ACAGCCCACT TGTTTTCTGC 480
TGTCTTTGAG GGAGAAATAA TGGCTGGGCA GGACTTACCT TCCCACTGAG GTGGGGAATG 540
GGGTAGAATT AAGGATGCCT AACTAAATGC CTCCATAGTA AAAGGAGGCC ACATGCTTTA 600
TGGTAGCCTG GATTCAATCC TCAGAGTGCA GTGAACTGGC CCAGGGCCCT GCCTTTACCA 660
CTGTATCCAT CATTTGGCTG GCTTTGGTTT AGTTTCTGTA AAACGTCTTT CCCAGTAAAA 720
TCTGATTAAC TACTCATCAA TACAGGTTTG GTTGGATCAT AGATTTCAAC ATCTACTCAA 780
GTTTTCTGGG TTCTCAAAGC TGTATTTCTA GGGGTGAAGA CTTTTGTAAT GGTTGACTGT 840
TAACAAGTGG CAAAGGACAA GTCCAGTTGG CTTGCATAAG CAATTTTTTA TGGACAGAGA 900
AACAGGAATT CAGACAGAAG TCCTACAGTA AGTTGAGATA GGTGTAGGTA CCTTTCCATG 960
GCAAAGGTCT TCATCTTACG GAAGAATCCA GCATTAGAGG GAAGAGTGAT CTCTTAGGTC 1020
ATCTCATCCC ATCCTCCTTG GGTCAATACA TTGTCTTTGT ATAGAGAACA CCCAGGACCC 1080
AGTTGGTGCT GGGGAGCTGA GGCTGCCACA GCAGACTTAG TTGGAAATTA AGCTTTTGGC 1140
ATAGGCTCAC TCATCAACTT TGGATATTAA TTGATGGGAG TAGAAGAAGA GGGAGTGATA 1200
TTGGGTATTC TGCCTAGATT ATTCTCCCAT ATTCTCTTGG TGGGGGAGTA TTATAGGATT 1260
TTTAACTTCC TCCTAGTTAG CTGCCAGAGA TAGGTAAAGA GCACTTTACC CTATCTGTCT 1320
TCCAAGAAAG AGAATGTAAG CTCTTAGAAA GAATATAAGA GCTTGAGAGA AACAGGAAAG 1380
ACCTGAATAA GACCCTGAAT TGGCTGCGGT GCTCCTGGGT CTCTTCAGGT GGAGATGTGT 1440
CCCCTGGAGA CACACAGGAC ATGGGCACGC GTCACTTAAC TGTGGTTCTC ACAGCGTCTG 1500
GGGCACCAGA GAGACACGTT TTTGTCTGGA ACCTGAAGAA CGCTGGCAGC CTACATAATT 1560
CTAAACATAG CAGGCACTCT TATTGATTCT TTCCAAAACA AAGGTCACAT TTCCTTTCTG 1620
TGTAGTTTGT GTCCTGGGTT CCTGCTGACT GTTTTGTGTA TACGATTGTT ACCTTCTCAA 1680
AGAGACTGTC AGTTCTTGAG GGCAGGGTTC AAGGCTGCTG TTTGTTTGTG TTCTTCAGCA 1740
GTACCTAAAT CTGTCCTGGG CTCAGAGGAA GTATTTAGTA AAGACATTCT ACCTTGGGTT 1800
GTAGGTCACA CAGTGCCAGA GCTGGAAAGG ATTTTGGAAA TCGTAGAGTC CAACACTCTA 1860
ATTTTGTAAG TGGTACCACT CCAAAAACTT ACTTGGGAGG CTGGTGTTTA TCTGCTGGAA 1920
AGAGAGGATT TTATTATGTT AAACTATAGT GCAAATGACC ATAATTCTAA ACCTTTGACA 1980
GGCTTCCCTC AAACGCTGCA GGCATGTTCC TCCTTGGACT AGTAGCAGAG TAATAAGAAC 2040
AGTAAGAATG CTAACTAGAT ACCAGGCCCC CGAGCCATTG TCATGAATGC TTCCAGCCAC 2100
ATGACAAAGT AGGTACTCTG GCTATTCTCC AGATGCAGAG GAGGCTCAGA GGTAGGTGAC 2160
CTCGCTCAGG GTCATGTAGT TACCAGAATG GTCGAGGGAG GACTGAAGTT TGGTCAGATG 2220
CCCCAGCTTG TGGCCCTTCT CCTATACTGT GGTAACTCTC AGATGGGGTC TCTGACTGAA 2280
GCCACTCCTT AGTGATTCAC GGTGCTAGCT TTGCAGCGTC GTGTGGTGTT TCCAGTTGTC 2340
CTAAAGGAAG TTATTAATTT TCATTAACTT TAATTCTCTC ATTAGACAGG CAGTGATATG 2400
GAAGGCAAGG CAGAAAGCAA ACAAATAATG ATAGGGGTTA CATCTCCAGA AAGGTCAGGA 2460
ATCACTGCCC TAGGTTGTAA AATATTTGGA CTGAGTAAAA GGCATGAGTC TTCCCATAGC 2520
TTCTTCCAGG AACTGTTGCT TTACATGGAA TTGCTGCTGT GTTCACTAGT CCCTCTTCTG 2580
TGCCCAGAAC TCACTGTCAC ATGTGTCAAG AATCCTCATG ACTGAGGTTT CCAGGGCAGA 2640
TCTGATCTGT GTAACACGCA CCCTAACCCC CTTGCCAAAG GAGAATGAAA TAGGCCCCTA 2700
GATGGCCACC CAGTTCCTGG GCCTTCCAGG CAGGCAGCTT GCCTTGAGGC TTTCCCCTGA 2760
GCCTTGTATC TAAGGAACAT TCCTGTGAGT TTTCTAAGAG GTTAGTCCTG GGTCATTGGC 2820
ACTTAAACCA CTTGTTTTGG TAGATCCTTC CTGAGAAGGT TAATTATATA TTTGATATCC 2880
TTCTCTTTTT ATGCCTGAAT GATGAGGATA AGTACTCTGT GGTTTATTAA CTGTCACTTT 2940
AAACCTTTTC AGATTGTCTT GTGACAAAAC AGAGTTTTAT GTCCTTTTTA TCCCAGCTTT 3000
GATGGATGAG ACAGCTTTTC TGGTTAAAGT ATGCCAGGAT AAATAAAATC TCTGAATTGT 3060
GGAAAGGGTG GGTTTGCATT TGAAATCATG AGTTCAAGTC TGCCACCTCC TATGAACGGT 3120
GACCTAACCT GTTAATCTTT CCATCGATTT CGTTTTTGGC TTTTGACAAA TGGAGCTTGG 3180
CACCTCATAG GTACTCAGTA ATTATTGAAT AAATGAAAGA CAGCATTACT GGAGGGAGTT 3240
TGATGTCTCC AAATATTTGA TACCAAACCC TAAAGCAACA ATCTGACACA TTTCCTGTTT 3300
TGAATTCCAC TAATTCTTAG AGCAAAGAGC CTATGTTCTT ACCATGATAC AGTCCTGAAG 3360
CTCACTTCTC CCTCAAGACT ATTTTGTTAT ACCTCTGATT TTTTCAGTAA ATTTGGAGTA 3420
GTATTCTGGA AAGTGAATGT CATTAAAGAT TTTTAGTAGT TGCTTTGCAA AGCCTAGTGT 3480
CCTCCATTGT ATGCATCCCC CAATTGGTAT GTGTCCAGTC CTTTTGAGAA CCACTCAACC 3540
TGGGGCAGAC AGTATAGGTA ACTGCATTTA AAATATTTAA ATTTATTTAT ATTTAAATTA 3600
TTGGCCAGGC ACAGTGGCTC ACGCCTGTAA TCCCAGCACT TTGGGAGGCC 3650