EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS133-00082 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
melanoma 
Coordinate
chr1:2227730-2234410 
Target genes
Number: 37             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11576356chr12233961hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC-6.06
ArMA0007.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC+6.17
Foxd3MA0041.1chr1:2227836-2227848AAACAAACAAAC-6.32
NR3C1MA0113.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC-6.03
NR3C1MA0113.3chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC+6.23
NR3C2MA0727.1chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC-6.08
NR3C2MA0727.1chr1:2233877-2233894AGGGACACGGTGTCCCC+6.2
RREB1MA0073.1chr1:2230472-2230492TCTATGTGGTTGTTTTGTGT-6.35
STAT3MA0144.2chr1:2228168-2228179TTTCTGGGAAG+6.02
TFAP2AMA0003.3chr1:2233512-2233523TGCCTGAGGCT-6.32
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01499chr1:2230890-2232649Adrenal_Gland
SE_10605chr1:2230613-2234200CD19_Primary
SE_11303chr1:2229194-2235579CD20
SE_12227chr1:2230249-2234208CD3
SE_16839chr1:2230637-2234084CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17322chr1:2224537-2236334CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18225chr1:2229290-2235668CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18345chr1:2227498-2228664CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18345chr1:2229268-2234646CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19191chr1:2229524-2234390CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20385chr1:2230482-2234122CD56
SE_23033chr1:2230059-2233784CD8_primiary
SE_31962chr1:2230626-2233595Gastric
SE_33669chr1:2230327-2233314H2171
SE_41586chr1:2230182-2231307LNCaP
SE_46124chr1:2227109-2228639Osteoblasts
SE_46124chr1:2230507-2233519Osteoblasts
SE_54996chr1:2230147-2233027Stomach_Smooth_Muscle
SE_55573chr1:2231182-2233462Thymus
SE_68719chr1:2229029-2232774H9
SE_68719chr1:2232808-2234035H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr122279902228378
chr122332002233593
chr122308362233000
chr122316912232185
chr122324282232896
chr122306782230895
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I002298chr122301062234390
GH01I002296chr122271102228664
Enhancer Sequence
GGCTGAGGTA GGAGGATTGC TTGAGCCCTG GGTGGTTGAG GCTGCAGTGA GCTGAGATCG 60
TGCCACTACA CTCCAGCCTG GGTGACAGAG CAAGACTCCG TCTCAAAAAC AAACAAACCC 120
AGTTCTAGCC ATCGTTGTGG GCGTGAGTTG ACGTCTCCCT GCGGTGTGAT TGCGTTTCCA 180
CAGTGAATGA TGTCAGGCAG CTTTGCATGC GGTTACTGGA TGTTAGTATC CTGTTTGGAG 240
AAATGGCTAC TCGAATTCTC TCCCATTTGG AAATTGGGTT GTGTTTTGTG TTTTCCTTGC 300
TGACTTGCAG AGTTCTTCAT GTGTTCTGAA TCTGGTCCCT TACCAGCTAC CGGGTTTGCA 360
CGTTTTCCCT TGCATCCTGT GGGCTGTCTT TTCCCTTTCT CGATGGTGTC CTTTGAAGCA 420
CAAAGACGTC GTGATTGTTT TCTGGGAAGC CTTGTTGTTG TGTTTTCTCT CTGTTCCTTG 480
TGCTTTGGTG TCATGGAAGC ACTTCTGCGG GGGCGGGAGT CTGGACTGAG GCCGCCACGT 540
TCCTGCTGTG AAAACCTTCA CGTGCGCTCG CAGCCTCGGC TCTACAGACG GTTCAGTCCG 600
GGAAATGGTT TAAGGAGGCC GTGCACAGAA ACAGTCTTTG CAGCCAGGGA CATGAGAGCA 660
TACCGTGCTG TTCCCACAAG GCCCGTGGCC TCTGCAGGTG AGAATTGGTG GCCTCCCTTG 720
AAAATACTGA ATGGAGGTGC CAGGCACCCG CACAGGCTCT TGGTGTGGGC ATAGGCCGTC 780
TTCCACTTGA AGAATGTGGC AAGATGGTCT GAAAACCACA AAGTTTGTGT TTGGAGACAC 840
GGTCTCAGTG TGTTGCTCAG GCTGGAGTGT AGTGGTGGGA TCATACCTCA CTGCAGCCTC 900
GACCTTTTGA GGTCCAGTGA TCCTCCCACC TCAGCCTCCC AAGGAGCTGG CATTACAGGC 960
ATAAGCCACC ACGCCGGGCC CACGGCTGAA GTTTGGGTTG TATCCTTTTA AGGAATAGCA 1020
GACGGGTTTT CAGCCACACC GAAGAGAACC TCAGCGTAGC AGAGTGTTGC TGGGCCATGT 1080
GCTTCAGGAG CAGGGCCACA GGCAGGACCT CGAGTGCCCA GCCCGCTCAC CACGCTGTGG 1140
GCGGCCTCTT GGGAATGTCA GAACACCAGC ACAGGCGATC TCCTCGGAAC CCAGATTGTG 1200
GGCGATCCTG CCGCTCCACC TGCTGTGGCC CCAGGGTTGC ACCACCATGT GGACTGTGGC 1260
TGGCAGCTTC TGGAGGCTTC TTGGTGCCTA CAACATCTGC GCCACTCCAC AGCGTTGCCT 1320
ATTGGTGGCA GCCATCCCCT CCATAAGCCC GTGGCCCCTG TACAGAGACG AATTGGCGCT 1380
CACGGACTCA CCCTGCGAGG CAGCATCTGC GTCTGCAGGA CTTCCCGGCC CTTGGCCGCA 1440
CATTTCCCTC CAGTTCCCAT CATGGCAGCT GTGCCTGGTT GCGGATGCTG CATGCTGAGG 1500
AGAGGAGGCG TGGGCCCGCC CGGTGTGCAT GGGCAGGTCT GAGACTGGCC ACTCCCATGG 1560
CGCATGCATT CCCCTGGAGG GTCCCCTTGC CCCGTGGCTG CAGCCTGGCA GGAGAAGACG 1620
CTGAGGGGAC GCACGGGAGG GGTTGCAGGG TGGGCTGTGC TGTGTGGCAG GCCTTGGGGT 1680
GTAGCCGCAA GCTGTGGGTC CATCCCCCCG CACCAGAGTG CAGTTTTGAC ACCGGGTGGT 1740
CATGGGCCGA GCATCCATGC AGGTGTGGAG ACGGAAGCCT GACCCACAGA GCTTGGTGGT 1800
GGCCCCTGGA CTGACCTGTG GGCTGCTCAA CCGCTCTGCC ACTGTGCGTT GTTCACATGT 1860
GAAGCCGGCG TCACAAAGGC CTCAATGTCT GTTTCAGCTG GATACATGCG CGCCCTCGTG 1920
GGGGCTTGAG GGCACACTGG CCGCTGGACA CTGGGGTCCC GGGGTGACTG AGGCTGGTGC 1980
CCTCCTGACA GGTTGCTGGG CTGCAAGTTG AACAGAAAAC TGGTTTTCTT CACTCTGCGA 2040
AGTTCCCTGT GGTTGTCCCT GGGGTTGGAG GGAGTTGTGT TGACATCATC ATGGCTGCTG 2100
CTGTGCGCCT CTCCCTTGGA GCAGGTGTGG TCCCCGGCTC CTGGATTGGC TGCCCATGCT 2160
CAGGATGGTC TGGGGTGTGG CCGTGGCCTG TCCCCGGGCC GGATGGCTTT CTCAGCAGCT 2220
CCCTGAGGCA GCATGAGCAG AGGCGGGACC CTGCCCGGGT CCTGTTTCCC CCTTGTATCC 2280
TTTGGCCCTA ATACGGGGTC CCGTTTACCA ATGAGGGCAA AGAGACCAGT CTAAGGGGAG 2340
GCTGAAAACT CACAGGCAGG CCTGTCTGGC CTTGGGGTCT GGGTGCTGCT TCCAGGCAGA 2400
CCACATCCCA GGTGAGGTGC AGACATTCAG AGACAGACGT GGCCGATCCT GGCTGCTGTA 2460
TCAACGCGCC CACCAAATGG GGCCTTCTTT GATCATCAGT CAAAAGCAAG AATGTGCCTG 2520
TGGTGGGCGG GCGCGTGTGC CAGCTTCCAG GCCGTGGGCT CCTTGGTGCC CAGAGCTCAC 2580
CCTGTGGTGC TTGCCCACTA CTCACTCCCG CCTCCCCGGA GTCTTGCCCT GGGGGGTCCT 2640
GGTGTGGGAG CTGCCTTCTC TAGTTGGGTG GAGCCTTGCC TGCTGGTGCC TGTGAGCCCT 2700
GGGTGGGTGG ATGCCGGGTG GTCGTGGAGG TTCACAGCAG GCTCTATGTG GTTGTTTTGT 2760
GTGGATTTGG GGTGTGAATT CTCTCAGCAA AGGCTGACTC AGACCCCAGT GTTCAGAAGG 2820
TTCAAGGAAG CGACCGTCAG CGCCGAGTGG CCAGCAGGGC GGGGATGCGG CGTTGAGCCC 2880
CGTCATTCAG CTTCAGTGTG GAGAAGGCCC GGAGCTGTGG GCATCAGCTC GGGGACCCGA 2940
GTGACTGTCC CTGCCTCGGG GAGGGGGGGG GCCACACGGG CAGGCGGGGC AGCAGCTTGT 3000
GCCCATGTCC TCCTCACGGA CTCTGGAAGT GAGAGGCGCT GAGGCCACAG TGGGGGAAGT 3060
GGCCCAGCTG ACGACCCGGG CTCTCGGTGC CCTGGGAGGA GCTGTTGTTA GGACATGTGC 3120
AGACTGGGTT CAGCCTGTCT GGAGTGGCTC AGGTGCCTGG GGACAGAGGC CAGCTGTAAC 3180
CGCTGCTGCA CTCGGTTCTG GATTCAGTGC CCTCCGCCTC TGCGGCGTCT CCCTCGGCAG 3240
CTGTCCAGGA CTCCAGCCTC CCTGCCAGGG TAGGGGACAT GGAGCGTCTC CTTGCTCTGG 3300
GGGGTTGAGG TCTTCTGTGT TTGGACCCTG TGGGATCTGG CAGGAGAAGC AGCCCCCACT 3360
CATGTTGTGC CAGGGGCCTG GGGAAGGGAG ATGGCAGTTC TGTGACCTCC AGACTCCCTT 3420
TCCTTATTGC AGGGGATGGG CCAGCGTTTC GCCCTGAGCA TCTGCACGTG TCAGGCAGGA 3480
AAGGGTCCCC AAGGCCTTCT CAATGGCTCT TCTCTGTTCC TGGCACCTTA CAGGCCTGAA 3540
ACGCAGGGCC CCCAAGGGTG GGGTGTGCAT TTTTGGAGAG CGTCTTTTCT GAGACTCCCC 3600
CATGGGGAGC TGGTGGCTTG CTTGTGGCAG TGTACTGTGG CTGCCCAGTC CTCGGCAGGC 3660
ATCCACTGCT GGCTCACCTG TTTGGGCCAC CGCCTCTGCA TAGGTCCTGT GGGCTTTGCT 3720
CAGGAACTGT TCCGTCAGAG GGCCTAGGGT GTCCACAGTC TTGGGCCCGC TATTCCTCAG 3780
CCCAGCCCTG CCCTGCCCTG GCAGGGGGGC ACCTGTCCTT GGGTGCAAGC TCACACGCGT 3840
TGCCCGGGTG CCTGCTGGCC AGGTAGCTTG CCTGGTCATC CTCGGGGTGT GGGGAAGGAC 3900
CCCAGGAGGG GAAGTGGCCG CGGGGCAGCG CGGTGTGTCG TCTGGCCTCC GCTGTGTAAG 3960
CTGACAGTGG CCTGAAGGGC TTTGGGATGG GGCAGCCCCT TGCAGGCCTA TCCAGGCCCA 4020
GCCCCATTGC TTTGGTGTGT CAGGTCCAGA GCCGTGCTCC TGCCTCGTGG CCTGTGGGCT 4080
CCAAGGGCGG GTTTTGAAGC CCCAGGAAGG GTCACACCAG AGGCAAGCGG TCGTAGCTGC 4140
TCTTCCCAGA GTAAGACTCA GCCGTCTGTC ACTGGGTGTG GTTTTGTCCC TGACCGACAG 4200
CTGACACTGG GGCCCCCAGG GGCCTTGGTA GGGCGGGTGG CATCCCAGGC CTGAAGACGG 4260
CTGTCTGCTT CCTGGGGCTT TGAGAAACCA ATACTGCTCA GGTGACAGTC CCTCTGAGAG 4320
TGTCACTTCC TCCGCCCACA GGGGCGCAGA CACCTTCTAT TTTACACGTT TCTCTCCGTT 4380
TCTCTGATGC TGCAGAGAGC CCGCCCTGAG AGCCGGGAGT CGCCTGATGA GGGGTCGGCA 4440
GGGGTCTTAA CGGAGTCATG TCTCCGAAGG CTCGTCCTGG CTCCCTGAAG ACCAGGAGCG 4500
TCCCTGGCCC CAAGGATGGC CCTGAGCCCA TCTGCCTCAA CCCTCCAGAT CTGCAGGGTC 4560
CTCGGCCACC CCCCACTGAG CGGATTGGGC TCGGGGCCCC GGGCCTACGG TCCTCCCGCC 4620
ACCTCCACGG GGCGGCTGTT GGGGCCCCAC CAGGCAGAGC CGTGTTCTCA GGCGTTGGCT 4680
CTCATGGAGG TGGCCTGAGG CATCTGACTC TTTCCCCTCA AGGAGTCTCT GAGTCTCCCG 4740
GAGTCAGCGC CGGCTGTTGT GGCTTTTCCC CGGGTGATAA CTGAGCCGAA TTTCCGCGCC 4800
CGCTTCAGTG GCTGCTTAGA CAGGAAGCTC CACCCAGCCG GGCGTCCTCG GCCTTCTGTG 4860
CCTCTCGGGA GGGTCCGCAT GATTCCGGAA GGGGCTCTGC TGCAGCTAGG ATGGCACCCG 4920
CCCCTGCCAG GCATAGGCAC AGCACCCTGC GGTCAGGGCC TCCGCCAGAC GTCATCAACA 4980
CTCACTTCCC CTCGAAAGCC GCCACATAGA GGGGGTATTT TCAGTGTCTT TTTTCCTGAA 5040
CAGCTATTTT AGTGTCTCTG AAAAAAACCA TCCACAGCCG TGAGCCTTCA GGGGCTGCCT 5100
GCCCTGCGTC CCCGGCCCTG TGCGCCCGAG CACTTATCTT TCTCCCTTGG GCCCAGGTCA 5160
GAGCCAGGCA CCTGCCCCTC CCCTGGCCCC ACCCTGCTTG TTCCCTGAGG GCTGCAGGGT 5220
GGGTGCACGT GCTGCAGGGG AGGCCACGGG CTTTGGCCAG ATCTTCCCCC AGGGCCCTCC 5280
ATCCCCATAA TTGGAGCACC TTGATGGACA GCCTGCCCTG CGCCCCATCT TCCCCCTAGG 5340
GAAGCAGGGT CCCTGCTGCC TCCAGGAGGC TGGTTCCTGA TGCAGCGTCT TCTCCTAGAG 5400
TCCTGGAGGT GGGAAGAGCC CCCGGCCCTG AGTGTGCTCT GTCCACCAAG GCTTCCTGGC 5460
TGAGGGCAAG GGCGGAGCCC CCACCGCCCG ACTTTGCTGC CTCCTCTTGA GGTTGGCCTC 5520
GGCAGAGTGA GTGGGACCTC ACCCCTGTGA AGGGCCCCTT GCCCTGTGTG GCCTGTTCTG 5580
CATTGGCCTG TGGTGTAGAC CTGGTGCCAG CTGCCCTGGA GACTCTGTGC TGTCCTGTGG 5640
GGTCTTTGGC AGTAGAGGAA TGGCCCATTT TACGGAGACT GCCCTGTGAT TTTGCTTGGG 5700
AAGAGACCTT GGGTCTCAGT TGTGCCTTGC GGGCAGCACC GTCTCAGGGG TTTCCAGCCG 5760
CAGGGCTGTG GGAGTTCACG TTTGCCTGAG GCTGGATGTA CCGGCTCAGG CCCCCAGCAC 5820
ACAACCCACA TCACTCACTG GCTCTTGGGG GATGTGCCTC AGCACCTGAC ACACAACACC 5880
TGGTTCTGAG TGGGCTGGGT CCAGGCACCT TCGCTAAGCT TCCTCCACCA GCGGGACCTG 5940
GTTCTGGGTG GGCTGGGTCT GGGCACCTTC GCTAAGCTTC CTCCAGCACC GGGGCTGGCA 6000
AGGAGCGAGG CAAAGGTGTG TGTGGTGCCA TCCTGTAGGA GCCAGGCTCC TTGGGGATGG 6060
TGTCCTTCAT TTTGAAAATG TTTCCTTCCC ATGGGGAGGG GGCAGCCAGA ATGCCCACTC 6120
TTTAATGCAC CTGTGCCAGT GGCCCACAGG GACACGGTGT CCCCTCCCCG CGACCACCCC 6180
TGTGCCGCAG CTGCCCTTCC CAGACGCATC CGTCGTGAGT GGCTCTCGCC GTGCTGTGGC 6240
TGGTTGAGCT GAGTGCCCAG CGCTGGGCAC CCTCTGAGGA CACACTCGGG TTCTAGGAAA 6300
GGGGTTTGGC AGGAGAAGGA CGAGGGACTC CTGGCCAGGC TGAGCCGCTG TGGAAGGGGA 6360
GAGTGGGTCT TGGTGCTCCA TCCCAAACCT GCTGCAGCCG TGGGTGAGGT CACCCGGAAT 6420
GGCAGGACAA GGTCCACTCT GTTCTCTCGG AGATGACTTG TCCCTCAGCA CAGCCTCCAC 6480
GTGCCTGTTG CGCGTGGCCT AAGGGCCTTT ATGCAAAGTG AACTTGGTCT CCTGGGGGGT 6540
GCCCTGGAAT CTGCCTTCTG CGCCACTCAG GGTCGTTTGT GGCCGGAGTG CATGGGGCTC 6600
TGACTGCCAT GTGCCAGCCA CGGGGCTGGT GGAGGGACCC TGCCCTGGGA ACCACAGGTG 6660
CCAACAAAAC CTTTCATTGA 6680