EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-17951 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr3:111640400-111644690 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:111640936-111640947ATATTAATTAA+6.62
CUX1MA0754.1chr3:111641885-111641895TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr3:111641885-111641895TTATCGATTA-6.02
LMX1BMA0703.2chr3:111640939-111640950TTAATTAAATT-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:111642451-111642466TGAACTCTTGATCTT-6.07
PHOX2AMA0713.1chr3:111640940-111640951TAATTAAATTA-6.62
PPARGMA0066.1chr3:111643182-111643202ACTAGGGCACTGTGATCCAC-6.93
PPARGMA0066.1chr3:111643183-111643203CTAGGGCACTGTGATCCACT+6.95
PROP1MA0715.1chr3:111640940-111640951TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr3:111640940-111640951TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr3:111640940-111640951TAATTAAATTA-6.62
RESTMA0138.2chr3:111642133-111642154TTCAGTACAGGGGACAGCTCT+6.54
SCRT1MA0743.1chr3:111643479-111643494ATACACCTGTTGCTG-6.31
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00093chr3:111641548-111644049Adipose_Nuclei
SE_34247chr3:111620068-111657645HCT-116
SE_36420chr3:111641018-111644000HMEC
SE_38241chr3:111641509-111644273HUVEC
SE_41017chr3:111641695-111644040Left_Ventricle
SE_57425chr3:111642976-111643614VACO_503
SE_64408chr3:111640954-111643763NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr3111642000111643953
chr3111642125111642530
chr3111643131111643619
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I111922chr3111641042111646194
Enhancer Sequence
TGCACAGGCT TTTCATATTA AATTTTATGT ACGTTCATTC TGCCCCCAGA CTTTTTTTTT 60
TTTTTTTTGA AACGGAGTCT CACTCTGTCG CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG CGCAATCTCA 120
GCTCACTGCA AGCTCCGCCT CGCAGGTTCA GCCATTCTCC TGCCTCAGCC TCCCAAGTAG 180
CTGGGACTAC AGGCACCCGC CACCACACCC GGCTAATTTT TTGTATTTTC AGTAGAGACG 240
GGGTTTCACC ATGTTAGCCA GGATGGTCTC GATCTCCTGA CCTCGTGATC CGCCCACCTC 300
AGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCGT GAGCCGCCGC GCCCGGCCCA AACTTTTAAG 360
TAGTATTTGG GTAGTGGGTG TATTTTTCCT AAAAGGCCAA AATGAAGTCA AAGAGTTGAC 420
TGTCTAAGTC TGCAGTACTG AAGGATTCAG TTAATGGCTA TGCTTTTCAA AGATTCTGCA 480
AGAAGCCTTC ATTGGAGGCA TCAGATGTCT TGTGTTAATA TTTTATTATC AAGTAAATAT 540
TAATTAAATT AAGTAATAGT AGAGTAGTTT TATTGCTATG TATATCATAT TGGAAAACTC 600
GTGCAACATA GGAATTAGGT ATCATGTTCC CTGTGAACCC TCCTGCCATC CTAATCCATG 660
TAGTTATTTA TTTTGTGTAT CTCACATATG GCATGGCCTG CAAATTCTAT TTGTGTATTT 720
CTCATTAATA TCAGATTCTA CACAAAAGTG AAGCAAGTTG AGCCAATGTT AAATCTCACT 780
TCCCAGGGAA AGTTATCTTA TGTTTTCAAG GTGGAATTCT CAGGTGGAAT TCTAGGAACA 840
CGGGCAGAAA CAAGCAAGGA AGCTACCTCC ATCCTTCCTA ATATTGTTTT GATGGCTTGA 900
CAGAGGCTAT GCACTGGAGA GGGGACTACA GGGGCTTGAC GCATAGGACC AGCTCATACA 960
GCTATGAGGG AATTAGTTGG TCTTAGAAGG TAGGATTATT CTCTGTCATT ACATCATGTG 1020
AAAAATGGCA GAAACTGGCT TGGGGTGAGG AACTCCAGAA GAGGATGTGG GAAGTGGAAA 1080
CAAAGACTGG TCTAGATGAT GTTACTACGT ATTCTTGACA ACTAAACTCA AATAGAGACT 1140
CAACACAGCT TGGCAAAAAC ATTATTATGT TTCTCAAATA AATTTATTCC ACCATTTAAT 1200
GACACAGCTA TTTCATACAC TCTGTTCATA CTCCTGGCCA ACTTTCATCC CTCTGGCTCA 1260
GAGATCATCT TACCATAGAG AAATTAGAAG CATCCCATCT TCTCACAATG AAGGCGGGGT 1320
TCCCTCCTTC CATCAAAGAC CACTCCCTTT GGATGTGCTC TGGGTGTCAT CCTATCCCAC 1380
CTTCTTGAGG TCTTCAGTCT TTCTGCACCC TCACCCCCTG GGGTCAGTTT CTCTCTCTTT 1440
ACTGTCAGCA TGCCAATATT ATTATTTTTA AAATAAATTA CTACTTTATC GATTAACGAT 1500
AAGCTACTAC CTTATCTCTC TTCTCTTCAT CATAGCTAAA CTTATTAAAC AATTTTCTGG 1560
GTATACTGTG TCTCCTTTTC TTCATTTTCC AATTAAACAT TCTTCCCACT CCAGTTGGCT 1620
TAGACCTCTA CTCCTCCATC AGATTCTCTC CTGTTAAGAC TACTAAAGAC CTCAGTGGTG 1680
CCCAGCCTGC TGGGTGCTTT TCAGTCCCCT CATGATCAGA CTCCCGAGCA GCATTCAGTA 1740
CAGGGGACAG CTCTTTTCTT GGTGCTTCTT CACTGTCTCC CTTTTGTTTG CCTCTGTGTA 1800
CCACAATCTT CTGGTTTTCC ATCTATTTCT CTTACCTCTT TCTCACTCTT TATCTCTCAT 1860
CTGAACTCAG TTCTCTTGTA CCCTCATGTC CTTCTATAGC TATGGCTTCA AATAACTTGT 1920
ATATGCTGGT GACTATCATA GGGATTTCTC TAGTTCATAA CCCTTTTTGG AATTCTGACT 1980
CATATCCTGT GCCTACCTGA CATCCCCACT TGGATATTTC ATGGGTATTT CCAATTGAAC 2040
ACACCCATAA CTGAACTCTT GATCTTATCT TTTCCCTTGC CTTCCACCCT CCACCCTCCA 2100
TCCTCTAGTT TTTCCAACCA GGAGATTGCA TCTCTATTCA CCTATATGTT CAACAGAAAC 2160
CTGGAAATTG ATCTTGACAC GTCTTTCCTT ATCATCCCTA CATTCAGTTG ATTACCAGCT 2220
TGTTTCTTGA TTGCTTCAAC ATCTCTGCAT CTCCACTAAC AGCATTCTCT TCTCTATTAT 2280
GAAAATCTCT TATTTAGTCT ACTTCCACTT GCTTTCCTTC AATCCATTCT CTTCACAGCA 2340
GCCAATGTGA TTAAAAAGAA GAAATTAGAC CATATTACTG TGGTTTGCAT CACACTGTAC 2400
TTGACTATGC ATCCAAATTC CGTAGTGTGA TCTGTCACCA GCCTTTCTGT CACCACCCTC 2460
CCATTCTTCA CAGCACTCTC AGAGTCACCT TCCTTTCTAT CTTTCTGTTT GTTAAAAGAT 2520
TCATCCTCCC CCAACCCCAG TCCTTTGCAG ATACTGTTTT CCCCTACCTG GAATTCCCTT 2580
CCTCATATTC CATGCCTCAT TGGTTCTGTC TTTCAGGGCT CAAGATCAGT GTTAGTTTTT 2640
CAGAAAAGCC CTCCTAGACC TTTCCAGTTC GGGTTAGATT TTCCCTGTTG TTCTTTTTAC 2700
AGATAAACAT TTTATAATTT ATGTTTGTTT TGAGCCTACT AGACATTTAT ATCCCACTCT 2760
AGCCTGTGAA ATAGAGGAGG GCACTAGGGC ACTGTGATCC ACTGTTTATC CAGCCCGTAG 2820
CATGTGCCAG GCAGGATACT GCCCAGTGTG CTTACGAATA TTGTTGTTGG ATTTTCCTGC 2880
TAATGGCTGG TCCAGGCTGG GCCTTAGCAA AACACTGAGC CAAACACCTG CCAAAGAGTG 2940
CAGCCAAGTT TCAGGACAGC TGGGCTGGGC TGCCCGTGTG CATATGCCAG GAGGCCTGTA 3000
GTCACACGGC CCATCATGCC AAAGCGTAAG ACAGAAGGAG GAAGTGGCCT TTCCCCTTAG 3060
GGATCGTGTT TCCTTTTCCA TACACCTGTT GCTGTGGTCA GATATAAACC ATGGAATGAG 3120
AAAAGCAAAA CCTGAAAAGA TATCTCTGTT GGGCAAGCTC CGATTCAGAT GTTAATAGTA 3180
CATCCTGTAA GCCTGGCTCT AGAATTTTGG AGACAAGGCC GGAGCCATAG GAAAAAGGTT 3240
TAATAATACC TCAGAATGCC TCCCCATTCA AATCTTTTGT TTTTTATTTT TTTGGGACAG 3300
AGTCTCTCTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AGTGGCTTAA CATTGGCTCA GTGCAACCTC 3360
CTCTTCCCAG GTTCAAGTGA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCC GAGTAGTTGG GATTACAGAC 3420
TCCCACCATG ACACTCAGCT AATTTTTACA TTTTTAATAG AGACGGAGTT TCGTCATGTT 3480
GTCCAGGCTG GTCTCGAATG CCTGACCTCA GGTGATCTGC CTGCCTTGGC CTCCCAAAGT 3540
GCTGGGATTA CAGGTGTGAG CCACCAAGCC CAGACATCAG CATTCAAATC TTGATATGAA 3600
ATTACTGATG TTATTTTTTT GGCTCTGAAG ATTGGTCTTT AGTGTTACTT CTTTTAGCTG 3660
ATTTAGGAAT GCATTTTATT TTGCACATTC GTTACCCTAT AAAATATAAA CCATAGGCAT 3720
ACTTCTATAG AAAACATAAA ATATAGTCAG TTTGTTCTAC TGTGTATTTA TTGAACATTT 3780
TTGCAGCAGT TTCCTGCACT GGCCTTTTAT TACCCTTAGG GGTACCACTG TTACGAACAT 3840
CAATAACCCT GTTTCCATCT GACCTTGAGA TACATGCCAC CTGCCGGTTG TGTTCTCGGA 3900
TAGTAGCCAC ATCACAGATG GAGCCACTAT GAACATTGAT AAAGCTTAAA CAAGGATCTA 3960
ACTCAGACAT AAATCTGGAG GGTATATTTA CTTGGTGAAG CAGTAAGCAA AGAGACCATC 4020
ACATTTTCTT ATAGCAAGTG AAAGAAGATT GGGACCTCTG GTCTAGCAAA CTGTTTTCAT 4080
TTAATGGGCC TGGTGACAGA GTAGGGAAAC CGCTAGCACC ATGAAGCCCA GCTTGGGCAA 4140
AGGCCTGACT GTGGAACTGG CTTCCTTCCC TTCTACTCCC CATCCCCATT CCAAGGCAGA 4200
GCCTGATCTC AGGCAATGGC TAAGAAGATA CGGATGTGTG CATCTGTTTG CGTAGGTTTT 4260
CTGTCTCTAT TTCTAGCTGT GTTAAAAATT 4290