EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-02915 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:230238450-230243310 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs3811489chr1230239259hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:230242907-230242918AGAGATAAGGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:230239421-230239442AAACAGAAAATGAAAGAACCC-6.65
PLAG1MA0163.1chr1:230241093-230241107GGGGCCCACTGGGG+6.86
RREB1MA0073.1chr1:230239920-230239940GGTTCTGGGGTGGTGGGGGG-6.25
TFAP2AMA0003.3chr1:230242926-230242937AGCCTCAGGCA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01245chr1:230239641-230243336Adrenal_Gland
SE_01785chr1:230239049-230240587Aorta
SE_01785chr1:230240637-230243187Aorta
SE_02496chr1:230239508-230241945Astrocytes
SE_25348chr1:230236453-230250730DND41
SE_31112chr1:230238334-230250198Fetal_Thymus
SE_34791chr1:230238329-230243364HeLa
SE_36634chr1:230239950-230242005HMEC
SE_37247chr1:230239177-230242475HSMMtube
SE_39241chr1:230238979-230242188IMR90
SE_39366chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_39366chr1:230239361-230243263Jurkat
SE_43672chr1:230238380-230242897MM1S
SE_45047chr1:230239152-230242696NHLF
SE_45719chr1:230236856-230242994Osteoblasts
SE_49908chr1:230237167-230243238RPMI-8402
SE_50426chr1:230239072-230243127Sigmoid_Colon
SE_51846chr1:230239549-230242044Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_58501chr1:230239434-230311477Ly1
SE_61418chr1:230219055-230306985Toledo
SE_63637chr1:230239456-230242241HSMM
SE_65792chr1:230239400-230241648Pancreatic_islets
SE_65792chr1:230242407-230243231Pancreatic_islets
SE_66256chr1:230238433-230239296Jurkat
SE_66256chr1:230239361-230243263Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1230239370230239686
chr1230240136230242131
chr1230242543230242593
chr1230242784230243065
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I230101chr1230237569230243904
Enhancer Sequence
TGATGGCCTT AAAAAAAAAG CGAACAGATT AAATCACTCT CTGTTTTTTC ATAGCCATTG 60
ATGGAAACAG ATTCTGTGGG GTAAATAACA GAGTCTTGGG TGGTGGAAAG GTTGAAGATG 120
TCCAGTAGTT GTGGCAGGGC AAGGATGGAG GACTTTTTCT TTGCAGGGGC AGTGGAGAGG 180
CGGGGCCATG GGTGAAGACT GGAGAATACT CAGAAGGTAG CATGGACGAG AGTGTTGTTT 240
GATGACTCTG CATGTGACCA GTAGTGACAT TTTACTCACT GAGGCTCATA TTGAGGTTAA 300
GCCCGAGGTC CATTGGCCTT GCTGAGATCG TGTTTAGAAC ACAGCACTGT GCAGTAAGAG 360
ACTCCTATAA CTCTATCAAA TTTGCATTTG GAGGAATTGT AAAGAGCCTC TGTTACCTCC 420
TAGGTGAGGC AGTCCAGGAA AACAGTTGCT AGAAGGAGCT ATCTGCAGAA ATAGACAGTT 480
GTGGTCCTTT CATGTTTTAA TAATTGTTCC CTGGATTTCA AGGAGTCAGT CCAAAATCCC 540
CGTAATAGAT TTTAGTAACG TTCATGGAAT CTCAGTTTGC ACATCATGAG ACCTTTAGTG 600
TGGTGTTTAC TGTCTTCACC TTAATATACT TTGTATCCAT GAGCAACCTT GCTACAGTCA 660
TGCAAAGATG ATTATTTTTT ATTCAGCAAT AATTAGCCAC AGTGTTGAGC ACCCAGATGC 720
CTTCCTGCAG CAGCCCCCCT TTTCTCCCCA GCCAACATCT GCAACTGTGA ACAGATTTCC 780
ATCTTCAGCC TTGGTGGTTG GAAAGAAATG TAAGTCACCT TTTTTTCTGG TTGGTTCTGG 840
GGCAGATGCC ACCAGGCTGC AGAGGCAGTC TGTGTCTGTG GGGCTCACCA GGGCATGAGT 900
TCTGCTCCCA GGAAAGAGAT TCTTGCAGGA TTTTGTCTGT GGTTCTAAGG AGACAAGTAG 960
GTGGCACACA AAAACAGAAA ATGAAAGAAC CCATCCCTCC AAAACCACAC ACACAAAGCC 1020
AAAAGGAAAA AAAAAAAGCA CATAATTATC ATGTAGGCAC TGTTGCAGCT AACCCTGATT 1080
TTGGCCTCAA TTCTGAAACA AGTTAGCTGG TTTAGACAAA CCCCTTATTA GGTAATGGAT 1140
TGTTATTCAT TCCTCCCCTT CTCCTAGTCA TTTACTCCGT GAGAGCTGCT CCTACCTGAC 1200
CTTCCACTGA TTTTGGTAGC AGCATCTCCC AGAGCGACTG TTTCCTTCTT CAGCAGTGTT 1260
CCTTACTCAG GGTGTAAGAT CTTAACCCCA CAGAGCCCCG TATCAGGTTT AATTAACTAA 1320
TTGATTCAGC TTGTGCTTAC TGAGTGCGAG GCAGTCATGT GCTTCTGTTT GGTAAATGGC 1380
TTCATTTTCC CTCTAACTCC TGAGCGTCCT GAAGCTTCTC TTATGGTTCT CTCCAAAGGA 1440
GTCAGCAGGC TGGCTCTGCA AGGGTCAGTA GGTTCTGGGG TGGTGGGGGG CCGAGGGAGG 1500
CAGGGAGGTT GGCTCTGTCT TTATTTGGCA TAGAGCTCCC CGAACAGGGT CTCTCCTCCT 1560
TTCTCCAAAG GTTAATGGAA CCACTATCTT AAAAAGCTGA AATCTTATCT TCTGGGGTAT 1620
TTGGGTAGAG AAGGCTAGGG AATCCCTTTT CCATGGTGGT GCAGTAGGTT CTCAGAACCA 1680
GCTGGTGGGC CTCAAAGAGA GGCGGCTGTA TTTTAGCCTG ATAATCTTGA TTCCTGGTTT 1740
CCTGGCTCTG TAGCATCAGA AATGGGAAGC TTTAAAAGCC GTGCCTTGTT GGATGCACCG 1800
AGTCATAAAA TAAATGTGAT GTGCTGGGTG GGGGAAATGC GGGAGGAGGG AAACAGGTGG 1860
TTGGAGCTGC TTCGTGATGG CCGCCCACCC TGGCTCTCCT TTCTTAATAG GCTTCAGAAA 1920
TCCTGGAATG CGTAATTCAC CAGCTCACAG AGTTCCACCC ATGTCCCCAG TGGCTTCAAA 1980
ATGTAAATGA CATTTGCAGT GCTGGGAGGT AGGAGGGCGA TCCCGTTCCT TCCCTGGATC 2040
TCAGTCGCAG AGGTGCTGGC TCATGTGCCT GAGTGCAGCG GCTGGCCCGT CATTACTGGT 2100
CTTTGCAGGA AGCCACTCTG AAGGCACCTG GGCCCTTGCC AGGCTGAGTC ACAGCTGACT 2160
TAGGGAAATG CCACACAGGA CGCTTGCAGT CCCCCCGTTC TAAGCGTAGG TTTTGCAACT 2220
GCATACTCGG AAAATGAATC AGAGTGGGGG AAAGTGTCAG AGAAACAGCA GAAATGGAAT 2280
GTAGGCAGGA GGGCCACAGT GGCGCTGTGG ATTCAGACCA CACCTTCGGC TCTGTTTGGG 2340
GCCCTTCCTG TAAGGAGCGT ACTGATGCCA GAGGCTGGGG GTGTGGAAGG GAAGCTGCTG 2400
TGCTGTTAGA TCCATTCTGC TATTTAGCCA GCCTTCCTTT TCCCAGCTGG CACAGACAGG 2460
ATGTGTTAGA GAGGTGCTCA GACCTCCTTT CAGAGCAACT GAATCATTCT CCAGGAGGGA 2520
CAGGGAGTCT GAAATGCAAA CAGGTTCCCA GGGTTATTGA AGAGCAGCCA AACTGAACAC 2580
CCACTGCTCT GTGGACTCAA GCTGGTTTTA GACATTGTTT GGTCAGGACC AGAGCCGAGC 2640
TCTGGGGCCC ACTGGGGGCT CTTGTCGCAC CATATCATTG ATTCTACAAT GCACATTTCC 2700
CCCGCCTCTC ATGTTTTAAC ATGTCTGAAA TCAGGATGCA TCTTCCATGG ATGGTGTTTC 2760
AGGGTTTCAT TGATCGTGTT TTTCTTCCTG AGTGGCACAC AAAATTAATG GTGCTCCCTA 2820
GAGTTGATGG TCCCTGCGGT TCAGTGAACC GTGTTGCTCT TGTGTAAGCT CCTGTGGGAA 2880
CATAGAGTCT CTGTGTCCCA CCTTCTTCCT CGCAGTGGTC AGCACGGATG AGGTGGGAGT 2940
TGCATAAATG TCAGCATTCG AAAGTGAGGG CGTCTGTCGG TGCTGTCTCA CTGTGGGGCT 3000
TCAGAGAACG TGAGCACCTG TGTTTGCATT CTCCATCAAG GTTCATGTCC TGTTGGCTCA 3060
TAAGCATGAT TATATCCATT ATACAAACTG GGGCACAGGC ACCCAGAGAG AAGTCAAAAG 3120
ACTTGTTCAA GATGGACAAC TAGGAAGTGG TGGGGACAGA CCAGTCCTGT CTGATGCCAG 3180
ATCCAGCGCT GTATCTGCCA GTCAGCATGC ACACTTTCAT CTCTCCAGCC TCTTCCCACT 3240
CACCTTTACT CAACATTTCT GGGCCTCCAT AGTGATTGTA GTAATTCGGT AAAGATGATT 3300
CATTTCTTTA GTCCGGTCTT CGGACTTGAC TTCTTAGAAG CAGGTCTTGT GCAATAGTTG 3360
CATATTAACC ACTTGGTGAC ACAGTGCATG AGGGTATGCC AACTCTTTTT GCTCATGGCC 3420
GTGCAGTGCA GAATTTCCAG GCATTGTCCG CTCTGTTTCC TGGACTTCGG AGTGATAGCA 3480
AAGTTTTGTA TTCCCTGATC AGCTGTGTAT CTCTGAGCAG CAAGTTGATC TCTCTGTATA 3540
AGGGTGACTG TGCCCATGGA GGATGGCATG CAATTGCCTA AAGATTTCAG TCTGAGAATC 3600
TGAGAAACGA TACTGAATGG AGATGACAGG CTTAGTGCCT GCTTCCAGGA GCCATGCCTC 3660
CTCCTGGCCT GGAATGAATA CCTAAACACC TGAGGCTCTG AGTTCCGGCA GTGTGCTGAA 3720
ACTGCTGTTG GTCTGGCCCA CTGACCCGGA AACCCAGCCA CCTGAGGTTG TGACTTTAGG 3780
GCTTCTAGTT TTGTATTTAG CTTTAATTCC ATCTGTGAGG CAGTGGAGAC TGTTCATTTT 3840
ATTTTACATC AAAGGCTTTT GGAGGTTGAG ATGGGAACAG GATGATAGAA CAGTAATGCA 3900
TAATTATGGA GCATTTGCTG TATGGCAGGC ATTCGTAAGA GTGCATTTGT TGATATTATT 3960
GTTTGGCCTC TCCTGTCATT AGCCCTAAGC AGCTACACTT GCTAAGCTCT GTGCTAAGGC 4020
TGCAGTAAGC AGGCAGGCAG TGCGTGCTGG TGAGCTTGGG CAGTGCTGGA GTGTGTCTTG 4080
CCCAGTGTGG GGATGAACAT ACACCCTTTC ATGCTCACAG GTGCCTTAGC CTGGATGATA 4140
ATGTTTAAGT TCATTCTGTT TATATGCACC GTGTCATTAA ACAATGCTGT GAAAAGGGCA 4200
CTATTATTTC CCCCATATTT TCAGTGATAA GGCAGAGGCC CATGGGCTCC TTGTAGCAAT 4260
GGAGGCATTC CTTGAGGATC CAGGCAATCT GACTCCCGAG TCCCGGGGCT GGACAGAAGG 4320
AAGCTGGCTC CGAGAGCTAG ACTGCAGTGC AGAGGAATTC CACGCTCCGC AGGTGCTGTC 4380
TTCAGAAGTT GCATCTCGTC AGCAGGATGA GTGCTTTTGG AATAGACAAT CTTAAATGTC 4440
ATAGTGAGGT GACTTGCAGA GATAAGGAAG GACGCCAGCC TCAGGCACTG ACTGATGAAT 4500
CCAGATGGTG ACTTCCTCCT TGCAGGAGAA TCAGCCACTT ACACAGACTG GGAGGGATTC 4560
TACTGAGGGA AAAAATGAAT TCGCAGCCAG GGACAGTGGC TCATGCCTGT AATTCCAGCA 4620
CTTTAGGAGG CTGAGGAGGC AGGAGGATCA CTTGAGCCCA GGAGTTCGAG ACCAGCCTGG 4680
GCAACAGAGC AAGATCCTGT CTCTACAAAA ACAGAACAAA CCAACAATTA GCCAAGTGTG 4740
GTGGCACACA CCTGTAGTCC CACCTACTCG GGAGGCTGAG ACGGGAGCAT TGCTTAAGCC 4800
TAGGAGTTTG AGGCTGCAGT GAGCTATGAT TGTGCCACTG TACTCCAACC TGGGTGACAG 4860