EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-02117 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:159885090-159887890 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12122337chr1159886422hg19
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF1MA0154.3chr1:159886224-159886238AATCCCCTGGGAAT-6.12
EBF1MA0154.3chr1:159886224-159886238AATCCCCTGGGAAT+6.46
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:159886551-159886569GGAAAGGGGCAAGGAAGG+6.32
Klf1MA0493.1chr1:159887296-159887307GGCCACACCCT+6.32
MEF2BMA0660.1chr1:159886082-159886094GCTATAAATAGT+6.18
ZNF263MA0528.1chr1:159887799-159887820CTCTCATCTCTGCCCTCCTTC-6.31
Number of super-enhancer constituents: 34             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02009chr1:159885104-159886879Aorta
SE_02009chr1:159887204-159896462Aorta
SE_02391chr1:159885366-159886916Astrocytes
SE_09609chr1:159887196-159888381CD14
SE_10984chr1:159884833-159896640CD20
SE_13325chr1:159885066-159886957CD34_Primary_RO01536
SE_13325chr1:159887045-159896510CD34_Primary_RO01536
SE_14052chr1:159885331-159886978CD34_Primary_RO01549
SE_14052chr1:159887218-159889883CD34_Primary_RO01549
SE_14513chr1:159887124-159888159CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17500chr1:159885071-159886264CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17500chr1:159887129-159888080CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_19597chr1:159887228-159888080CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_30108chr1:159886059-159886832Fetal_Muscle
SE_30108chr1:159887279-159889941Fetal_Muscle
SE_34858chr1:159885031-159888333HeLa
SE_36438chr1:159885508-159886945HMEC
SE_38165chr1:159885029-159888329HUVEC
SE_41182chr1:159885360-159886918Left_Ventricle
SE_42315chr1:159885077-159886984Lung
SE_42315chr1:159887173-159896572Lung
SE_44957chr1:159885611-159886831NHLF
SE_44957chr1:159887350-159890242NHLF
SE_47692chr1:159885387-159886849Pancreas
SE_48986chr1:159885191-159886903Right_Atrium
SE_48986chr1:159887203-159888576Right_Atrium
SE_52604chr1:159885209-159886864Small_Intestine
SE_52604chr1:159887183-159889012Small_Intestine
SE_53483chr1:159885044-159886920Spleen
SE_59359chr1:159879583-159907614Ly3
SE_63031chr1:159879414-159896447Tonsil
SE_63399chr1:159883649-159916570NCI-H69
SE_64771chr1:159885478-159886944NHEK
SE_65431chr1:159886137-159888901Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1159885236159887800
chr1159885499159885591
Enhancer Sequence
AGAAAGAGAG AGAGACACCA CTGTAGACAG CCACACAGAA TAAGGTGTTG GGAGATGGCA 60
AGAAAAGGCA GAACCATACA CAGGCTGGTG CCTAGTCTGG GCCCCAGGGC CTGAAGTGGG 120
GTCAGAGATG AGAGAAGCCA AGTTAAGGAT GAAATTGTAA CCTCAGGTGA GACAAAATGC 180
TAGAAAGCAG ACAAACAGAA AGCTGGAAAA TGTTGAGATG CCACTGGAGG CCGGCTCCAG 240
AAGGAAGCAG CTGAGTCTGC AGTTAGATGA ATTAAGGGAA CATTGAGATT CCTCACAAGG 300
CTTGGGTGGT GGTGGGTGCA GCCAGAAGAA GGTGAGCCCA ATGGCTGAGC CCCTCTCAAA 360
TACAGCTGGT GTCTCCCTTG AAAATAAGCT GTTCCAGGTA AAGGGGATAG GGCCACTGAA 420
AGCATCTTGG CCCGTGTTCA ACAGGACAGT GGTGAAGGGC ATGAAACTGC TGGGCATCAG 480
CTCCCTCTCA GCCCAGGGTC CATACACAAA TGTTCCACCT TTTATTCCCC ACACTTCCAT 540
TTCCTGAGCA CTATGTGCTA GCATTCCCCA TGCAAAGTGC TTTCCAGGGT TCATCTAATC 600
CTCACGGCAA CTTCACGAGG AAGGAATTAT CATCTTCAGC TTACAGATGA GGAGCATTGC 660
CCTGCCACCC ACCACCACCT CTGTCCCCTA GTCCCTTGAC AGCTTCACTT CTTGCTGAGC 720
CTAGAGCTGC ACAGGCTCAG CCAGGTTCAG AGCCAGCTTG ATTGGATGCA AATCCCTGCT 780
TCTCCCTTAA TTGCTTTGTG GCCCTGGGCA CATTCCTTGG CCCTTCTGAG ACCAGTATCC 840
TCATCTAAAG ACAAAATGGG GAACACATTA CAGTAATATC CACCTCCTGG GCGTTTGTGA 900
GAATCTTCTG GGAGAAGGCA GTGGTTCTCA GCGCTGGCAC TGTAACAAAT GGCATTTCTC 960
AGAGTTGTGA GGCGTGTGGC CAATAATTTA TAGCTATAAA TAGTTAAACC AGGGAAGGTG 1020
GCAAACGGCT TGTTGTTTTA GTATACATAG CGAATTCAAT GTTTTCTCTG CAATGACATC 1080
ACTCTCCCTG ACTAGCATTC CACAAAGCCT TCCTGAATGA GAGATAAAGG ATCTAATCCC 1140
CTGGGAATTT GCCCATAGGC TGCAGCCTAT CTTATCTGTG CCACAGCCTG TGGGAGTGCA 1200
GCAAGCAAGC AAATACAGTC TCTCCCGAGG TGTGGTGTGG CAAGGCTAAG CGTGGTGTGG 1260
GGATGAGGCT GACAGCCATG GCTATGAAGA ATTGGCATTG GGCCTCGCCC CTAGTGGGTG 1320
CTTTTTGGAA GAGGGAGCCT CAGAGAAGCA GGGGAACAAA AGGGGAGAGA ACAAAAGCTC 1380
TGGATACAAA CCTGTTTCCC TCAGGCACAG TGTTGTGGCT TTCTCCTCCT AGGAGACAGA 1440
GATACCCTCA GGTAGAAAAG GGGAAAGGGG CAAGGAAGGC CAGGCCTCTG GGTGAGGCTG 1500
ATGGGGCTGG AACTTAATGT CAGACTGGCC CAGCGTCCCT CAAATTCCCC CTGGGGAGAC 1560
ACAGAGTCTG ACTGGGAAGC CTTGGGGTAA AGGTAACACC TAGTGGTTAG AAACTATGGG 1620
TGGGGCTCCC AGCACTTTGG GAGGCTGAGG CTGGGGAGTT GGGAGATGGC AAGAAAAGGC 1680
AGAGCCATGA GGTCAGGCAG ATCGCTTGAG CTCAGGGGTT CGAGACCAGG CTGGCCAACA 1740
TGGTGAAACC CCATCTCTAT AAAAAATACA AAAAATAGCC AGGCACGGTG GCTCACATCT 1800
GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCGAGGCT GGCAGATCAC CTGAGGTCGG GAGTTCAAGA 1860
CCAGCCTGAC CAACGTGGAA AAACCCCGTC TCTACTAAAA ATACAAAAAA ATTAGCCAGG 1920
CGTGGTGGCA CATGCCTGTA ATCCCAGCTA CTCAGGAGGC TGAGGCAGGA GAATCGCTTG 1980
AACCTGGGAG GCGGAGGTCG CAGTGAGCCG AGATCATGCC ACTGCACTCC AGCCTGGAGA 2040
ACAAGAGCGA TCATGCTACT GCACTACAGC CTGGGTGACA AAGCAAGACT CTGTCTCAAA 2100
AAAAAAAAGA AAAGAAAAAA AAAGAAACTG TGGGTGGAAC ACTCATGCCT CGGTCAAGGA 2160
TAGGTGCTAG AGACAACCTG ACCCAAAATT GATGATCATG GCCCAAGGCC ACACCCTAGA 2220
AAGGAAGTTT TAGTCTCTCC CAGGCACTTA GTTCACAGGT GCTTAGGATC AATCAACACG 2280
GCTTCTTCCC TCCAGCGACC ACCACCAACT CACTCCTGCT CATTCCCCAG CTCTCCACGT 2340
TTCCTCACCA CTGCAACCCC CACCCTCACC ACTCCAACAC AGACCACCTC ACCCCAAGCC 2400
CGCCTGAGGG ACCTCTCACC TGGAGACAGC TTCACTTGCC AGGACTGATG GCTGTGCCAG 2460
CAGCCAGCCC CACCCTCTCA GTGACTGAGA AGCTGTTCCA ACTGTAGAGG CAGACCCAGC 2520
CAAAGGCAGC AGGCAGGATT AGCCAATTCC ATTGACTAGA AAGGGCCTTA CTTCCCTGTG 2580
GACACTGCCT ACATAGTCTG CATTCAGCTG TGAGGTCCTG TCCCCTCTCA ATTCCAACCT 2640
ACACCACCCC CCAAAGCAAG TGAGAATGAG GATGGGGAGG AAACTCAAGA CAGGGGTTAG 2700
CACTGCAACC TCTCATCTCT GCCCTCCTTC CTGTATCACT CACTGCACTT TGCCCAGTAT 2760
TCCTCCCTTC CCCACAGTGG CACAGTGGCC CCAGACACAG 2800