EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-02077 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:155945200-155947850 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:155945882-155945900GGAATGAGGCAAGGAATG+6.3
PLAG1MA0163.1chr1:155947698-155947712GGGGACAAAGGGGG+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155947633-155947653GGGGTGGTGGTGGTGGTGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr1:155947542-155947562ACCCCAGCCACCCGCCCACC+6.3
ZNF263MA0528.1chr1:155947307-155947328GGAGGAGGAGGAAGGGCAGGG+6.28
ZNF263MA0528.1chr1:155945257-155945278TCCTCACTTCTCCCCTCCCCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr1:155947310-155947331GGAGGAGGAAGGGCAGGGAAC+7.1
ZNF263MA0528.1chr1:155947304-155947325GGGGGAGGAGGAGGAAGGGCA+7.39
Number of super-enhancer constituents: 57             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155941812-155954742Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155943468-155954747Aorta
SE_02626chr1:155944686-155950278Astrocytes
SE_03231chr1:155943838-155950206Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155943981-155947946Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155944922-155954549CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155943238-155950634CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155943527-155950426CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155943689-155952043CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21118chr1:155944387-155954735CD8_Memory_7pool
SE_26270chr1:155943880-155954619Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155943540-155954349Esophagus
SE_29653chr1:155943497-155954685Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155943835-155950402Gastric
SE_34744chr1:155944639-155954826HeLa
SE_36575chr1:155944054-155950067HMEC
SE_37367chr1:155943411-155954717HSMMtube
SE_39002chr1:155943945-155954683IMR90
SE_40164chr1:155944018-155954524K562
SE_40938chr1:155943868-155954680Left_Ventricle
SE_42293chr1:155943432-155954731Lung
SE_43728chr1:155943835-155954686MM1S
SE_45406chr1:155945111-155946504NHLF
SE_45406chr1:155946520-155950447NHLF
SE_47089chr1:155944170-155950162Ovary
SE_48803chr1:155943444-155951076Right_Atrium
SE_50236chr1:155943456-155954539Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155941703-155954664Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155944861-155946413Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155946616-155947212Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155943486-155954414Small_Intestine
SE_53512chr1:155943435-155954278Spleen
SE_55468chr1:155945161-155949969Thymus
SE_56150chr1:155944721-155954706u87
SE_57594chr1:155947238-155949021VACO_503
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59086chr1:155939045-155960951Ly3
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_60754chr1:155943974-155952549DHL6
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155944167-155946550HSMM
SE_64071chr1:155946602-155947446HSMM
SE_66797chr1:155945231-155946165Jurkat
SE_66797chr1:155946303-155950580Jurkat
SE_67350chr1:155943835-155954686MM1S
SE_69165chr1:155944816-155949957H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr1155946363155946660
chr1155945743155946196
chr1155945200155946600
Enhancer Sequence
TCTAACCTCC TGCAAGTCAC TCAGTGACTT CCCTAAGCTT TAGACTCCCT TCCCCTATCC 60
TCACTTCTCC CCTCCCCCTC AACTCTCTCC CTAACCTCCA CGACCCCTAG AATTTTTGTC 120
TATGTCCCCA GAAGCCTCAG CCACCAGGAG GACCCCCCAT TCTTCCACTC TCCTCCAACA 180
CCGTCAGCCC TCTCAGCTCC CTCCTGGGCT CCCCCAGCTC TCCTCTCCAC TGCACTCCTA 240
GTCCTGCACA CAAAGCCAGC CACCTCTCCA TTCCTCAGAA CAAAGAAATA GTCGCTCTGC 300
ACACTCCCCA CTCCACCTGC CCACCACAGA GATTCCAAGG GGACCCCCAG CCTCCACAGC 360
CATCCCTGGA CCTCTGGTCC CTGCTTGGCA GAAAAGGACC CTTTGTTCTA AGGGATATGA 420
TGGTTGGGGT TTGGGAAAGG AGAAAGGGAA GAACAGGGGA CTAAAGAGAG AAAGGGGACC 480
TGTGAGGTTT GGGGCTTGTG GAGGTAGGAA GTAGAGCAGA GAGAACAGAG GAGGTGGAGG 540
ACTGAAGACA GCCTGGGAGA ACAGAAATGG AGTGAAAAGA AAAAGGAAGC ATGGAGGGGG 600
CTACACAGAG AGATCCTGTG AGGATGGGAC AGAGAAAGGG GCAGGTTAAA CTTACATTCC 660
TCCTCCTAGG AGGAGCTCCC AGGGAATGAG GCAAGGAATG GGGAGGGGCT GAGGTGTCAG 720
GGCTTAGCTG TGACCCATCC CCCCAAGGAG GTAGCAGGGG ACACCATCTT CTTCAAATAA 780
TGTCTTTTCC AGCGGGTGCC CCTCTACTTC CCACCACAGT ATAAAAAGAA AGGAGACAGC 840
TGGTGTGCTG GGGGGAGGGG GAGAGGGGAT CCAGGGTTTG TTGGCTAAGA ACCAACTCCC 900
CCTTCTGTAA CCACAGTTTT CCGGAGGTGG CCCTCCCCTT CCGACCGGCC CAAACTGACA 960
ACCACCCTTC TCCGGTGGCC TCTTTGCCCT CTCAGATCCA CCCACTCAGC CCCCGACTCC 1020
CTGCTGCCAG CCAGATTCCC AAATTACCTG CCCCACACAG CCAGCCCCCA TAGTAGAAAG 1080
AAGAGCCAGT CCCCCCACCA CCAAAAACAA AAACAAAAAC AGAGCATGAA CACCCAGATG 1140
TCTGACGTCC CAGCTCCCCA CAATAATGGA AAAGGGATCC CAGTAGCTAC CTGCCCCCAC 1200
AGAACCGCTC TCTATACCCC CTAGCCAGGT CTTCCCCCAA CCAGCTCCCC CATGGCTTTC 1260
CTTTTTAGGG TGGAACCAAA TTTCTGCGGT TTCAAAAAAC CTCCCCCGCC CCCCTTGGCT 1320
CTACTCCAGG GTCTCAGCTC AAACGGTTGA AAAAATAAAC AGACTTTTGG AGCTGGGGCC 1380
TGGGCTGGCG CAGGCTGTGA AGAGCCTGTC TGCCACCCCA CTGTTCCACC ACACTTCAGC 1440
CACCTCACCC CGGCCCTCTG TTTGTCTTAG GCCCTACTCG AATCCCCAGT TGCTTTCCAG 1500
ATAGCAAAAT CTAATCCCAA CCCCCTAAGG AAAGTCCTTT TAAAGCTGCT TTCCCTGGCC 1560
CTCCACCCCC AACCCAGGAT GGAACCTCTG TCTCTCCCAG TTTAGCATCA AGACAGGTAG 1620
CCTGGCTAGG AACTACCAGG GAGGTGGAGG GGAGGGCTTT CCATCACCCT TAAGGACTCC 1680
TAAGGGGTAC TGCTCCCTTG GCTGAAGTTG GTGATCAGCA TAGGCTGGCA CCAGGGTAGT 1740
AGGGCACTCA GGTTGGAGAG AAGCCAGAGA TTAAACCAAC TCTGGGCTGG GACCTGTCCT 1800
TTCTGATAAT GGGTACAGTG CGGGGGCCCC AAAGGAGCTG GGAGGTGCTG TCTGCAGGCA 1860
CCACCTTCCT TTCAGCTCTG ACTTATTCAC CTGCAAGTCA GCTTCATCAT TTCCTGGGGT 1920
CTGGGTGTGG AAAGGTCAGG GCACTTGGGA ATGGGGCTGG GTACAAAGGC AGGGATAAAG 1980
GGTACTTGGA GAGGAGTGGC CAAGAGGTCA TGATGGGGGA GGCGTGTGGA TAATTATACA 2040
CCCAGACTCA TGAAATGCTA GGTGAAGGGA CCCCAAGACG AGCAGATAAG AGAATGAGAG 2100
CGCTGGGGGA GGAGGAGGAA GGGCAGGGAA CACAATGCAT AGTGCCAGGT GTGTCAGCCT 2160
AAGGGTTTCA GGTTGGGAGA AGGAAGAGCT AGGAGGCTGG CGGGGCAGAT AGGGATGGAG 2220
GCCCTATGTT CCAGGCAGAA GGGCTCAGGA TGGAGGAAAG GAGCCCAGCT ACACAAAGAC 2280
CTCTGCTCCC TTCACCTAGA GGTGATGGTT TGGGGGAAGT AAGCCGTCCC TCGGCCGTCC 2340
CGACCCCAGC CACCCGCCCA CCCAGAGGGG AGAACTGAAT CACAGCTGGA AAGTCCATTT 2400
GCGAGGAGAG GAGGAGCTGA CTTTTGTCTT GGAGGGGTGG TGGTGGTGGT GGGAGGAAGC 2460
CGGGAAACCA CCCCCTCCCG TCCCCTCCGC CGGATGGCGG GGACAAAGGG GGAACGACCA 2520
AGCCAGCGAT TGGGGAGTGA TGGGGGGTCG CCACGCCAAG CCCAAGCCGG TGGGGCCCGG 2580
GGTGAGAGGA GGTGCCGGAG CTTCCACCGC CCCCACCCGC GAGACACACA CCTCCCTCTT 2640
CCCGCTCCGT 2650