EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-01628 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:143991570-143994000 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:143992125-143992137AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:143992129-143992141AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr1:143992849-143992870ATGAGGAAAGTGAAACTCAGA-6.44
IRF2MA0051.1chr1:143992853-143992871GGAAAGTGAAACTCAGAG+6.24
MafbMA0117.2chr1:143992994-143993006TGTCAGCATTTT-6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:143992257-143992268CTTGAGTGCTT-6.02
TBX2MA0688.1chr1:143992636-143992647GAGGTGTGAAA+6.14
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03284chr1:143992144-143993814Brain_Angular_Gyrus
SE_03937chr1:143988807-143994041Brain_Anterior_Caudate
SE_05248chr1:143988738-143994157Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06288chr1:143988677-143994186Brain_Hippocampus_Middle
SE_07109chr1:143988755-143994121Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08886chr1:143992546-143993564Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09271chr1:143979006-144016984CD14
SE_36217chr1:143989934-143994076HMEC
SE_36936chr1:143990303-143994482HSMMtube
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH01I145015chr1143988901143993897
GH01I206279chr1143989719143993929
GH01I121261chr1143990398143993806
Enhancer Sequence
GAAATGTGCC ATTTAATAAT AAAGAACTGG GATACGGGTT TTTTTTTTCT AAAATTTGGG 60
GAAGACTACT TTGTTGAAAA GGAAAATGAA ATTTCCAAGG GAATCAGGTT CATCCAGTCA 120
AGCTATTGTG TTATTTTGTG TCTTTTCCTC TAAAAGTATT CTAATGTCAA AAAATTTTTT 180
AAATCAAGTT GACATAATAC ACACCTGCCC AGGGAACCTG GAGACCTGTA AAATAATTTA 240
AAACCATTTT TTTTATCATA TCTTTAAAAA ATACTGGCAA ACATAGTAAT AAGAATTTGA 300
GACTGGGTGC GGTGGCTCAT GCCTGTAATC TCAGCACTTT GGGAGGCTGA GTTGGGCAGA 360
TCGCTTGAGG TCAGGAGTTT GAGACCAGCC TGGCCAACAT AGCGAAATCC TGTCTCTACT 420
AAAATACTTA TAATCCTAGC TACTCCAGAG GCTGAGGCAT GGGAATCGCT TGAGCCCAGG 480
AGGTGGAGGT TGCAGCCAGC TGAGATCACA CCACTGCACT CTAGCCTGGG TGACAAAGCA 540
AGACTCTGTC TCAAAAAACA AACAAACAAA CAAAAAAAAC TTGAACCCGG GAGGCGGTGC 600
TTGCGGTGAG CAGAGATCGC ACCACTGCAC TCCAGCCTGG GCGACAGAGT GAGACTCCGT 660
CTCAAAAAAA AAACAAAAAA AAAAAAACTT GAGTGCTTTT CTTTGTTGGA ACCTGTAACA 720
CTTTGCTTTT ACATTCTCAT TGATTTTTAA AATTACTAAT AACTTTTTGA GACATGTAAA 780
ATCATGACAA ATTCTACAGA AGTTCTATCA AAGCAAGTCA TGTAGTGTGT TCAGGGTCCA 840
GAACCTGAGT TCACCAGCTC CAGGCTGATT CACTTTTGTC AGCTGCATCC AACCTAAGCC 900
TGGAACCAGA TTGAATCAAA TGCTAAGTTT TAATGTCTTT CATTTGGTTC TTTTATTTAG 960
TTCAGTGTTT CTTACTGCTA GCTGACTTGG CTCTGAATTT TGTTCCTGCC TCAAGCAAAT 1020
TCTGAATATG CCCATCTATG GATTTGAACA GTAGGATGTT TTTTCAGAGG TGTGAAATGA 1080
TCAGGCAGCT TGATAACTTT AGACATACTG TACGTTATGA AGCATTTTCT TGCTTCTTGT 1140
TGTCTTTTTC TGGTGGATTG AGTCAATGCA GTTGGTAGAA TCTTTTCCAC TTATGTTATT 1200
GAGGCATGTG GTTGAAAAGT GGCCTTTAAA TGGTGTGAGG TGGGTAGGCA GGGGATAAAT 1260
TCTTACCACA GTTTCTAGGA TGAGGAAAGT GAAACTCAGA GGCCCAAATC TTCTGACTCA 1320
CACAGTGATT CTGGGGCTGT CTGTAATATC TAAACGATGA GACTGATCTA CTTGCAAGGT 1380
CAGGGCATGT GGTCATTTTC TTGCTAGCCT TTGGATCACC AGGCTGTCAG CATTTTGAGG 1440
GGGAGTATTT GCATCTTGCT TTATTTGGAA GATTCAGCTT GAGGGAGTCA TTATTAGAAG 1500
ATTCTTAGAA CACTTGAGCC CTCTGAAAAT GAAAAGTCTC ACATTTCCCT TCTACTTTGG 1560
CTCTCTGTTG GAGGGGAACA CTTATGTCAT TAAAAACATT GTACTTTGCT TATCTAATTC 1620
CCACTCTGTG TTCACATTAA TAGCTTCCCA TTGCTCTTAG GAACAATTCC ATACTTCTTC 1680
AGACTATTTG CAATACTCAC CAGAGCTTGA CCCCTGCTTC TTTCAACAGT CTCATCTTTT 1740
TTTCCTCTTC TCATTTAAAT TCTATGCTTC AGTTACCCTG AATTTCTTCG ATTATTTCGG 1800
TTCCTTGCAT GCAGCTTCTT TTCTGTTGCC TCTGGGCCTT TGAACATGCT GTTGGCTGGA 1860
GTACTTTTCC TGCCTTCTTC CCATAGGTAA TTCCAATCCT TTACGTCTAG CTCCTCTGCG 1920
AGCCTCTTGC TGAGCCCTAG ACCAATTTCT GTATACTCCT ACAGCATCGT CTTTTTCCCC 1980
GATAATGGGC TTTTTACATT GCAATTACTT CTTATGGTAG TCTGTCTTCT CTGGTAGACT 2040
AGATTCCTTT GGAAGGCAGG CCCAAGAAGC TGGTTTAAAT TACTGGAGTC TGACTAAAAA 2100
GACTTTTATA TTAGACTGGT ATTTCCCAAC ATTTAAAAAT TTATGAACTT GGGCAGGGCA 2160
TGGTGGCTCA CGCCCATAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCTG AGGCGGGTAG ATCACTTGAG 2220
ACCAGGAGTT CAAGACCAAC CTGGCCAACA TGGTGTAACC CCATCTCTAC TAAAAATACA 2280
AAAATTAGCC GGGCATGGTG GCACACCATT GTAATTCCAG CTACTCGGGA GGCTGAGGCT 2340
CACTAGAATT GCTTGAACCC AGGAGGCAGA GGCCGCAGTG AGCCGAGATC ATGCCACTGT 2400
ACTCCAGCCT GGGCAACCAA GTGAGACTCT 2430