EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-01387 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:120555290-120556630 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NKX2-3MA0672.1chr1:120556583-120556593ACCACTTGAA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00001chr1:120545720-120570355Adipose_Nuclei
SE_00811chr1:120555787-120556311Adipose_Tissue
SE_03065chr1:120555710-120557739Bladder
SE_03434chr1:120554599-120564678Brain_Angular_Gyrus
SE_03980chr1:120549079-120570221Brain_Anterior_Caudate
SE_07385chr1:120548934-120569847Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08816chr1:120554636-120556916Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09137chr1:120545789-120570232CD14
SE_12867chr1:120554695-120560603CD34_Primary_RO01480
SE_13322chr1:120545914-120570095CD34_Primary_RO01536
SE_14057chr1:120546042-120569730CD34_Primary_RO01549
SE_18945chr1:120550673-120570213CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_26595chr1:120555685-120560732Esophagus
SE_29608chr1:120554644-120561087Fetal_Muscle
SE_36951chr1:120555708-120560186HSMMtube
SE_41312chr1:120555136-120563468Left_Ventricle
SE_43397chr1:120554561-120565886MCF-7
SE_45586chr1:120545832-120570231Osteoblasts
SE_46953chr1:120555779-120556587Ovary
SE_49875chr1:120554642-120565868RPMI-8402
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I120013chr1120555780120556587
Enhancer Sequence
ACTGATTTGC CCAAAGTTGG TTATCTGTGA ATCTAGCAAT TTCCCCAGTT TTACAAATAT 60
ATCCCTATCT TCACCTAGAC CTTGCAATGA AATAGTACTT AACTGAAAGT GTATGACTAA 120
GTCTTGCCCC AAGACTAGCA CCTATTCAAT CAGCTCTAAC ATCCTAAATG GACCAGCATC 180
CTATCCATAC CTCTCCTCTC CCTAAGGACA GTCTGGAAAT TCCTTGCTGA ACCTAAGCAT 240
ATGACTAAAA GAATAATCTT TCCTAAGCAT AATTTTCATG TCATTCTTCT GCTCAGAAAC 300
TAGCAACAGT ATTAATACCA AGCCTTTCAA ATCCAAGTTC TTTACAATCT CTGATCTGCC 360
TGTCTGTCCC ATTCCAATCA TCTAACCATC TTACTCTTTA GTAATCCATA ACTCGAACAC 420
TCCATATTAT TTCCACAATC TTGTTTACTG TCCCCTATAT TAAAATCTTT TTAATTTCCA 480
GTGAGAAACA TCATGCTTCC CTTCTGGTAT ATCTCCAACT TAGGTTCCTT TCTTCCACCC 540
TTTTTTCAAA AATCTGCTGT AAACCTGTCC TATAGTAAGC CTTCTACAAA TCATCCCACC 600
TATCTCTGAT CCTTCCAACA GCAGATGTAG TGCCATGTCA TGCACTACAT TGTCTCCACT 660
GGTATGGTTC TTCTTTATTT AAGCCACTGT TATGTCTTTG CTGTACCTTT CTCAAACTCC 720
CATCTAGATA GTTTTTGTGG GGAAGAGCCT GTCTTGAACC CTTGGTGTAG GTTCCCTGAA 780
TACCTGAGTA CCTAAACCCC ACTAAGCAGC TGGTTCCAAA GCAGGCTAAA TTTCATGTGA 840
TGGATAAAGT CAGTCTCTCA ATCCAAATGT TCCACAAAAT CCATCTCTAC TCTGTGATCT 900
GTCTGGTAGA ATAACAGGCC AAATCAACCT AATAGTCATC CTGAGGTACA GAATTATCCT 960
TCACACCCCA GGAAGCTAAG CAGCATTATG GACATGGGAA GAAAGGGGAG TAATAGGTAA 1020
GACAGTCAGA AATAACAGAC CCTTGTTTCC TAAGGCAGGA GATCTTTCAA CTTGCAAATC 1080
CCTGTTCAAC TGTGGTATAA GGAGAAAATA TACTCTGTTA GTCTTGGTGG AAAGTAAGGT 1140
TCTCTGCTTG AAAACAAGGG CTTAAATAGC TGTCTTCTTG AGATGGCTAA AGTTGAATTT 1200
GGTTAGAGAG TGAAAACATG GCTAAACACC CAACAACCCT TACATATCTA TAATTCCATT 1260
AAGCTACCCA GCACACATTT TGGAAAATAG TCTACCACTT GAACTAAAGG TGTATATTCT 1320
AAAAAATAAC CACAAAAATC 1340