EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS130-00124 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MDA-MB-231 
Coordinate
chr1:8958850-8966690 
TF binding sites/motifs
Number: 31             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HES2MA0616.2chr1:8960846-8960856GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:8964607-8964617GGCACGTGCC+6.02
HES2MA0616.2chr1:8960846-8960856GGCACGTGCC-6.02
HES2MA0616.2chr1:8964607-8964617GGCACGTGCC-6.02
Lhx3MA0135.1chr1:8965058-8965071TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr1:8965073-8965086TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr1:8965061-8965074TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965065-8965078TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965069-8965082TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965062-8965075AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965066-8965079AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:8965070-8965083AATTAATTAATTA-6.78
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:8960292-8960307GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
Nr5a2MA0505.1chr1:8960300-8960315GAGTTCAAGGACAGC+7.06
POU6F1MA0628.1chr1:8965059-8965069ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965063-8965073ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965067-8965077ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965071-8965081ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965059-8965069ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965063-8965073ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965067-8965077ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:8965071-8965081ATTAATTAAT-6.02
RARAMA0729.1chr1:8960292-8960310GAGGTCAGGAGTTCAAGG+6.73
STAT1MA0137.3chr1:8960153-8960164TTTCCAGGAAA+6.62
Stat4MA0518.1chr1:8960153-8960167TTTCCAGGAAAGGG+7.64
TFAP2AMA0003.3chr1:8964140-8964151TGCCTGAGGCA-6.02
ZNF263MA0528.1chr1:8964466-8964487TCCTCTCCTTTCCTCTCCTCA-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:8964456-8964477CCCTCCCCTCTCCTCTCCTTT-6.33
ZNF263MA0528.1chr1:8964444-8964465TCCCCTCTCCTCCCCTCCCCT-6.49
ZNF263MA0528.1chr1:8964451-8964472TCCTCCCCTCCCCTCTCCTCT-7.48
ZfxMA0146.2chr1:8962319-8962333CCCGCCTCGGCCTG+6.62
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_27088chr1:8959478-8960765Esophagus
SE_27088chr1:8962399-8963262Esophagus
SE_27088chr1:8963489-8964684Esophagus
SE_27088chr1:8965237-8966346Esophagus
SE_34103chr1:8959575-8960842HCC1954
SE_34103chr1:8962245-8964866HCC1954
SE_34103chr1:8965610-8966423HCC1954
SE_34433chr1:8958839-8961107HCT-116
SE_34433chr1:8962184-8964511HCT-116
SE_34916chr1:8959109-8961267HeLa
SE_34916chr1:8962041-8965067HeLa
SE_34916chr1:8965216-8966534HeLa
SE_36553chr1:8959977-8960884HMEC
SE_36553chr1:8962470-8964537HMEC
SE_36553chr1:8965481-8966338HMEC
SE_42834chr1:8963483-8964807Lung
SE_46612chr1:8959902-8960819Osteoblasts
SE_46612chr1:8962243-8964865Osteoblasts
SE_46612chr1:8965500-8966434Osteoblasts
SE_47312chr1:8959436-8960657Panc1
SE_47312chr1:8961358-8966536Panc1
SE_56056chr1:8958921-8961024u87
SE_56056chr1:8961345-8962206u87
SE_56056chr1:8962341-8965238u87
SE_67633chr1:8958921-8961024u87
SE_67633chr1:8961345-8962206u87
SE_67633chr1:8962341-8965238u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr189623718964927
chr189640538964236
chr189615308961584
chr189617808961903
chr189653378966372
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH01I008899chr189591858960724
GH01I008902chr189624608964905
GH01I008905chr189655548966260
GH01I008901chr189613468962206
Enhancer Sequence
TTGTAACACT CACGGCAAGG GTCTATGGCT TCATTCCTGA GGTCAGCGAG ACCACGAACC 60
CACTGGGAGG AACAAACAAT TCTGGACGCG CCACGTTTAA GAGCTGTAAC ACTCACTGCG 120
AAGGTCTGTG GCTTCACTCC TGAAGTCAGC GAGACCACGA ACCCACCGGA AGGAAGAAAC 180
TCCGGACACA TCTGAACATC TGAAGGAATA AACTCTGGAC AAACCATCTT TAAGAGCTGT 240
AACAATCACC GCAAGGGTCC ACAGCTTCAT TCTTGAAGTC AGCGAGACCA GGAACCCACC 300
GGAAAGAATA AATTCCGGAC ACAACATTTC TTTTTTCTTT GAGACAGGGT CTCAGTGGCA 360
CAATCATAGC TCACTGCAGC CTCAACCTCC TGGGCTCAAG AGATCCTCCT GCCTCAGTCT 420
CCTGAGTAGC TGGCACACCG CCATGCCCTG CCAATTTTTT TTGTAGAGAC AGGGGTCTCA 480
CTGTGCTGCC TACACTGGTC TCGAGCTCCT GGTCTCAAGC AGTCCTCCCT CCTGGTCGTC 540
CCAAAGTGCT GGGATTATAG GTGTGAGCCA CCGTGCCTGG CCTCTTTTCT TCTTTTTTCC 600
CTCCACATGT GTCTTATTTT TTTTATTTTT TTATTTTTTG AGACAAAGTC TTGCTCTTCT 660
CCCCCAGGCT GGAATGCAGT GTTGCCATCT TGGCTCACTG CAACCTCTGT CTCCCGGATT 720
CAAGCAATTC TCCTGCTTCG CCCCCTCAAG TAGCTGGGAT TACAGGTGCC CACCACCACG 780
CGTGGCTAAT TTTTGTATTT TTAGTAGAAG CGGGGTTTCA CCATGTTGGC CAGGCTGGTC 840
TAGAACTCCT GACCTCAGGT GATCTACCCG TTTCGGCCTC CTGAAGTACT GGGATTAGAG 900
GCATGAGCCA CCGTGCCCGG CCGTCTTTTG CTTTATTTTT GAGACAGAGT CTCACTCTGC 960
TGCCCAGGCT GGAGTGCAGT GGTGCTATCT CGGCTCACTG CAACCTCTGC CTCCCCGGTT 1020
CCAGTGATTT TTGTGCCTCA GCCTCCCGAG TAGCTGCTGT GATTACTACA GGTGCCCACC 1080
ACCACGCCTG GCTAATTTTT GTATTTTTAG TAGAGATGGG GTTTCACCAT GTTGCTCAGG 1140
TTTGTCTCAA ACTCCTGGCC CCAGGTGATC TGCCTGCCTT GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA 1200
TTACAGGCAT GAGCCACTGA GCCTGGCCTC TATATAAGCC CTAAGTTCTA ACCGCTCCTC 1260
TGAGTTACTC ATCACTGAAT TTCCGTTGCA GGTGATTCAT GAGTTTCCAG GAAAGGGGTG 1320
GGTGATTTCC AGAATGAGGG TTCCTCCCCT TTTTAGACTA TATAGGTAAA CTTCTGGGCC 1380
AGGCATGGTG GCTCATGCCT GTAATCTCAG CACTTTGGAA GGCCAAGGCT GGCAGATCAC 1440
TTGAGGTCAG GAGTTCAAGG ACAGCCTGGC AAGCATGGAG AAATCCTGTC TCTACTAAAA 1500
ATACAAAAAT TAGCTGGGCG TGATGATGTG CTCCTGTACT CCCAGTTACT CAGGCAGCTG 1560
AGGCAGGAGA AGCCGGAGGC AGAGGTTGTG GTGAGCCAAG ATTGTGCCAC TGCACTCCAG 1620
CCTGGGTGAC AGAGCAAGAC CCTGTCTCAA TAAACTAAAC TAAACTAAAA TAAATAAATA 1680
AAGGAATAGA CTACATAGGC TAACTTCTGG ATGTGGCTGT GGCATTTGTA AACTGTCATG 1740
GCGCTGATGA GAGTGTCTTT TAGCATGCTA ATGTATTATA ATTAATGTAT ACTGAGTAGG 1800
GAGGACTACC AGAGGTCACT TTCATTGCCA TCTTGGTTTT GGCTGGTTTG GGCTGAGTTC 1860
TTTTTTTTTT TTTGAGACAG AGTCTCACTC TGTCACCCAG GCTGGAGTGC AGTGGCACAG 1920
TCTCAGCTCA CTGCAATCTC CACCTCCCAG GTTCAAGTAA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCT 1980
GAGTAGCTGG GATACAGGCA CGTGCCACCA CACCCAGCTA ATTTTTGTAT ATTTAGTAGA 2040
GACGGGGTTT CACCATGTTG ATCAGGCTGG TCTCGACCTC CTGACCTTGT GGTCTGCCTG 2100
CCTTGGCCTC CCAAAGTCCT GGGATTACAG GCATGAGCCA CCGCACCTGT CCTGGGCTGA 2160
CTTCTTGACC ACATCCTATT TTATCAGCAG GGTCTTTATG ACCTGTATCT CATGATATCA 2220
ATCCTGCAGA CCTCATCTAT CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTGAGACAA AGTCTCACTT 2280
TGTCACCCAG GCTGGAGTGC AATGACACCA TCTCAGCTCA CTGCAACTTC TGCCTCCCAG 2340
GTTCAAGCAA TTCTCCTGCC TTAGCCTCCC AAGTAGCTGG GATTACAGGT GTGCACCACC 2400
ATGCCTGGCT AATTTTTATT TTATTTTATT TTATTTTATT TTATTTTATT TTATTTTATT 2460
TTATTTTATT TTATTTTTAA GACAGAGTTT TGCTCTTGTC GCCCGGGCTG AAGTGCAATG 2520
GCAGGATCTC AGCTGACTGC AACCTCTGCC TCCCGGGTTC AAGCAATTCT CCTCCCTCAG 2580
CCTCCCAAGT AGCTGGGACT ACAGGCACTT GTCACCACAC TGGCTAATTT TTGTATTTTT 2640
AGTAGAGATG GGGTTTTACC ATGTTGGCCA GGCTGGTCTC GAACTCCTGA CCTCAAATGA 2700
TTCATCCACC TGGGCCTCCC AAAGCACTGG GATTACAAAC ATGAGCTACC GCATCTAGCC 2760
TCCGAGTAAT TTTTATATTT TTAGTAGAGA CAGAGTTTCA CCATATTGGC CAGGCTGGTG 2820
TTGAACTTCT GGCCTCAAAG TGATCCACCC TCATCAGCCT CCCACAGTGT TGGGATTACA 2880
GGCGTGAGCC ACTCTGACCA GCCAAAGACT TCTACTTTCA TGAACTTACT GTAAATCTTA 2940
CCCTTAAGTG AAAGCCTCAA CATTACTGAA ACACATACTT ACCATAAATC CTGCCCTTAT 3000
GCAAATTCCC TATGGTATAT AAGCCCTGGG TCTTGGGGTA TAACATTGTA GGGATCCACC 3060
ATGTCATCTG GAGGCTGCCT GAGACATGGT TTCTGTTCGT AAGTCCCTAT TAAATGTTTC 3120
CTTCTGATCA CTGTGTTTGT CAGCCTCTTT CTTTGGCCTC TCAGCTCCCT GGGCCTTTGG 3180
AGGTAGGTTT GCATAGACCT GCTCACCGCA GAAGAGTGCT TAATATATAT ATTTTTTTTT 3240
TTTGAGACGG GGTCTCACTC TGTTGCCCAG GCTGAAGTGC AGTGGTGCCA TCTCAGCTCA 3300
CGGCAGCCTC CGCCTCCTGA GGTCAAGCAA TTCTCCCTCC TCAGCCTCCT AAGTAGCTGG 3360
GATTACAGGG GTGCGCCACC ACGCCCAGCT AATTTTTGCA TTTTTAGTAT AGATGGGGTT 3420
TCACCATGTT GACCAGGCTG GTATCGAACT CCTGACCTCA GGTAATCCAC CCGCCTCGGC 3480
CTGCCAAAGT GCTGGGATTA CAGGCATGAG CCACTGCACC CGGCCTTAAT ACATTTTTGT 3540
TGAATGGATG AAGTGCTTCT CCATAAGGGA TGTTTGGGTT CAATTTTCTG GCTCCCACAA 3600
ACCCACCTTC TGAGTCTCAG ACCCTCTCCT TGTCCATACC TGTCCATGCG GAGATAGGCG 3660
GTGTGGTGTT ACGATAGATA CATACTGGTT TGCATCTGCA GATCCCCGTT CCTAACTCCC 3720
ACAGTCCTGT GATAATGTTG GGGCACTTGA GGCCTCAGGA AACAGAACCT CTCCTCTGAA 3780
CTTCTCCTGT TCCTCTTTCA CCTGTCCAAC CAGGATTCTA ATCTGATGTG GGTCCAAAGA 3840
CCTTCATTCC AGAGAGGGTC CTGCCCCATA CCCTAGAGCA AGACTGTTCA GCCCACCGTC 3900
CAGGATGGCT TTGAATGCAG CCCAACACAA ATTCATAAAC TTTCTTAAAA CATTATGAGA 3960
TTGTTTCACA ATTTTTTTTT AAAGATCATC AGCTATCATT AGTGCTAGAG TATTTTATAT 4020
GTAGCCCAAG ACAATTCTTC TTGTTCCAAT GTGGCCCAGG AAGTCAAAAG ATTGGTCAGC 4080
CCTGCCCTAG AGGAAGGAAT GCTGAGAGAG AGGCCAAGAA AAGTCTGAAC AGACAGGCCT 4140
TGCCGGGGGT TTAGATCATG AGATTTTTGT CCAATCACAT TTCTACACGG TTATCAGTCG 4200
TGCCCATGTA ATGAAGCCTC CATAAAAAAG CCACGAGGAC TGGGTTTGGA GAGGTTCTGG 4260
ATGGCTGAAT ACGTGGAGGT TCCTGGAGGG TGGTGAGACC CAGGAGAGCA TGGAAGCTCT 4320
GCTTCCCCTA AACTCCACCC TATGCATGGC TTCATCTGTA TCCCTTGTGA ATCCTTTATA 4380
ATAAACCACT AAACATAAGT AAGTGTTTTC TTGAGTTCTG TGAGCCATTC CAACATATTA 4440
ATCAAACCCA GGCTGGGCAT CGTGCCTCAT ACCTGTAATT CTAGCACTTT GGCAGGCCAA 4500
GGCGGGTGGA TTACTTGAGG TCAGGTGTTC GAGACCAGCC TGGCCAACAT GGTGAAACCC 4560
CGTCTCTACT AAAAATACAA AAATTAGCCG GACATGGTGA CTCACACCTG TAATCCCAGC 4620
TACTCAGGAG GCTGAGGCAG GAGAATCGCT TGAACCCGGG AGGCGGAGGT TGCAGTGAGC 4680
CGAGATCCCG CAACTGCACT CCAGCCTGGG AGACAGAGTG AGACTCCGTC AAAAACAAAA 4740
AAACAAAAAG CAAACAAACA AAAAAACAAA CCCAAAGAGG GGGTCATGGG AACCCCAAAT 4800
TGAAGCCAGT GACTCAGAAG TTCCAGAGGC TCAGACTTGT GACTAGCATT GGGGGAGATA 4860
GTCTTGCAGA CTGAGTTCTC AAGCCCTGGG ATGTGATGCC ATCTCCAGGT AGATAGTGTT 4920
GAAATTGAAT TGCAGGACAC CCAGCTGGTG TCCACCCCCA CACATTTGGT CACAGAAGTC 4980
TTCTTCTGTG TTGACTGTTG TGGTGTGAGA GTAGAGGAAA AATGCAGTTT GGATAGAGTT 5040
TTTTTCTGAC ACAGGTGGTG ATCTTCAGGA ACCCACCTGC ACCTGTGAGA TTCTGAAGAC 5100
GTGGACCCAG CCTTCACAGG CATCCAAGTT ACCTTCCCCA TGAGGACTTG TTTTACAGAT 5160
CACAAAAGAC ATCTGCACTT TGTATGGCTC CAGCAGGATC TCTCTGATCT GTGAGGATTA 5220
ATGAGCCAGC CACATCTCTC CCCAGCTTCC TGGACCAATG GCGCAAACCT AGTTCAGAAA 5280
CCCAGCAAGT TGCCTGAGGC ATTAGCCAGG CATCCGTGGT ATGCAAGTTT TGGCACTGGT 5340
TTGCTGTTTG GATGTTTTTC TCCTTCAGGC GGAAATTTAC AAAGCACTCA TGCTCCAACT 5400
ACCATGGCAG AGAGAGGAGG TGAAGCAAAT TGTAAAAACT TCAACCTCAG TATTGAGTTT 5460
CTCCTTGACT TGTGTTGAAG CCAATGATGG CAAGGGATGT GGATAACCTG GATGTTTTCT 5520
CTTGGGATCC ACCCTCTCAC AGGTGTTCCT CTGAGCACTT TGCAGGATGA GAAGTTGAAT 5580
AGGGAGGGGA GAGGTCCCCT CTCCTCCCCT CCCCTCTCCT CTCCTTTCCT CTCCTCACAG 5640
GGTCTCGCTC TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AGTGGTGTGA TCTTGGCTCA CTGCAACCTC 5700
CACCTCCTGG GCTCAAGCAA TCCTCTCACC TTAGCCTTCT GAGGAGCTGG GACTACAGGC 5760
ACGTGCCACT ATACATGGCT AATTTTTATA TTTTTTTTTG GTAGAGACGG AGTTTTGCCA 5820
TGTTGTCCAG GCTGGTCTTC AACTCCTGGG CTCAAGCAAT CTGTCTACTT CGGCCTTACA 5880
AAGTGGGTGC TGATTTCTCT GCAGCTTATG GACACACCAT AAGCTGGGGG CACCCATGGA 5940
AGTGCTTTAG CTTGTAATCT CCATCAACAT CTCCCACAAG ACACCTCCCC AAACTTGATC 6000
TGGTTTGGGG AGTCACTGCT GTCTGGAGGA AAACATCTCT AATTTAGCCC TCGAGATTAC 6060
ACATATTAAG TTCAACTAAG TACGAACTCA AGGTATATTA AATACAATTT CCAAACACAC 6120
CAGCCATCAT GAGTGAGAAT CAGCAGAAAC TATGAATGAC AGACTTAGGC CATCTCAGGT 6180
TTTTGGAGTG ATCAGATACA GATTATTTTA TTAATTAATT AATTAATTAA TTATTTTTGA 6240
GATGGAGTCT CTGTTGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCATG ATCTTGGCTC ACTGAAACCT 6300
CTGCGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCCAAGT AGCTGGGATT ACAGGCGTGC AACACCATGC 6360
CCGGCTAATT TTTGTATTTT TAGTTGAGAT GGGGTTTTGC CATGTTAGCC AGGCTGGTCT 6420
CGAACCCCTG ACCTCAGATG ATCCACCTGC CTTGGCCTTC CAAAGTGCTG GGGTTGCAGG 6480
CATGAGCCAT CCCGCCTGGC CAGATACAGA TTATTAAGCA TAGAGTTGTA AGGCAAGCGT 6540
TCTGGGTCTT TCTCTTTCTC TGTCTCTCTC TCTTTCTTTT TTTCTCTCTT TTTCTTTCTT 6600
TCTTCTTTTG AGACGGAGTC TTGTTCTGTT GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG CCACGATTCA 6660
GGCTCACTGC AACCTTCACC TCCTGGGTTC AAGTGATTCT CCCACCTCAG CCTCTCGAGT 6720
AGCTGGGATT ACAGGCACCC ACCACCACCC CCAGCTAATT TTTGTATTTT TAGTAGAAAC 6780
AGTGTTTCAC CATGTTGGCC AGGCTGGTCT CAAACTCCTG ACCTCAAGTG ATCCACCCAC 6840
CTCAGCCTCC TAAAGTGCTT GGGATTACAG GCGTGAGCCA CTGCGCCCCG CCCTGGGTGT 6900
CTGTTTCGAT CTTGCTGCTC CTCTGAGCCT CCTATACAAA GATTCTGGCG CTACTGCACG 6960
CCCTGTGTTT GTGTCCTCTA TGTTAAAGTT CTTTTTCCTG GCTAATGTGG TCCAGACATG 7020
TTGGAAGGGA TTCTAAAGTA ACAATCCTGT GACCACGTGA CTGTGAGAAG AATTCTTTTC 7080
TAAAGAAAAG GATCTTCATC ACATACCGAC CCATCTCTTT CACTACCTTT AATACCACCT 7140
CAGATATCTC TCTTTTCATT TCCTGCAGCC CTTATTGCTT CCGTGGTGTT AGGCCCCTTG 7200
GCATTTTGTC ATATTTGTTT TTTTCCATTT TGTAGCTGAC TGTCTCACCA GTCACTCCTG 7260
TCTGGAGGAA AACATTCCCA GTTTAGCCCT TGAGATTACA CTTATTAAGT TCAACAAAGC 7320
ACAGCCTCAT GATACATAAT TTCCAAACAC ACAAGGAAGC CAGCCATGAT GAATGAGAAA 7380
CTATGAACAA CAGACTTAGG CCTCTTTAGG ATTTTGGAGA AATCAGATAC AGATTATTAA 7440
ATAACTACTC ATGGATTTTT TTTTGGGTGG GGCGGTGCTG CTTTTTGATT TCTTTCTTTT 7500
TTTTTTTTTT TGAGATGGAG TCTTGCTCTG TTGCCCAGGC TGGAGTGCAA TGGTGTGATC 7560
TCAGCTCACT GCAACTTCCA CCTCCTGGAT TCAAGCGATT CTCCTGTCTC AGCCTTCTGA 7620
GTAGCTGGGA TTACAGATGC CCACCACCAT GCCTGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGTAGAG 7680
ACAGGGTTTT AACATGTTGG CCAGGCTGGT CTCAAACTCC TGACCTCAAG TGATCCATGA 7740
GCCTCAGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACT GGCATGAGCC ACTGTGCCCG GCCTTGATTT 7800
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGACAGAGT CTTGCTCTGT 7840