EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-38169 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr9:137261240-137266140 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR2MA0258.2chr9:137262121-137262136TGGGCAGTGTGACCT-6.22
LMX1BMA0703.2chr9:137265679-137265690ATTTTAATTAA+6.62
SPI1MA0080.4chr9:137263955-137263969TACTTCCCCATTTA-6.03
SPICMA0687.1chr9:137263955-137263969TACTTCCCCATTTA-6.55
Sox3MA0514.1chr9:137265662-137265672CCTTTGTTTT+6.02
YY1MA0095.2chr9:137263697-137263709CAAGATGGCTGC+6.74
Number of super-enhancer constituents: 27             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00174chr9:137261148-137271210Adipose_Nuclei
SE_00860chr9:137261032-137275300Adrenal_Gland
SE_02933chr9:137262940-137265682Bladder
SE_05812chr9:137261360-137282798Brain_Hippocampus_Middle
SE_09174chr9:137254160-137271835CD14
SE_23121chr9:137264346-137265593Colon_Crypt_1
SE_23757chr9:137264349-137265626Colon_Crypt_2
SE_24707chr9:137263084-137265478Colon_Crypt_3
SE_26524chr9:137261081-137273486Esophagus
SE_31436chr9:137263056-137265664Gastric
SE_33498chr9:137255830-137262370H2171
SE_33498chr9:137264862-137274948H2171
SE_34906chr9:137261183-137274052HeLa
SE_40986chr9:137262434-137273204Left_Ventricle
SE_41556chr9:137243649-137273607LNCaP
SE_42130chr9:137261389-137273101Lung
SE_43440chr9:137261193-137264159MCF-7
SE_43440chr9:137265603-137267722MCF-7
SE_48050chr9:137252285-137278501Psoas_Muscle
SE_49423chr9:137262969-137272077Right_Atrium
SE_50152chr9:137263044-137271792Sigmoid_Colon
SE_51460chr9:137262103-137271156Skeletal_Muscle
SE_53315chr9:137260801-137271867Spleen
SE_54834chr9:137263825-137271890Stomach_Smooth_Muscle
SE_65247chr9:137261076-137277919Pancreatic_islets
SE_68695chr9:137261373-137263011H9
SE_68695chr9:137265176-137266584H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr9137261446137261800
chr9137262888137265728
chr9137261392137262303
chr9137263305137264168
chr9137264339137265222
chr9137264490137265116
chr9137265242137265562
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH09I134369chr9137261189137279971
Enhancer Sequence
GGTTGTGTGT GTGTGGGTTA TATGTGTGTG AGTGCAGGGG TTATGTGTGT ATGTGGGGGG 60
GTTGTGAGTG CGGGGGTTTT GTGTGTGGGT TGTATGTGTG AGAGTGCGGG GGTTGTCTGC 120
GTGTGTGTGG GGGGGTTATG TGTGTTGGAG ATCGCAGCTG TTGTGCCTCC GGGGGCTTCT 180
TGGATACTGT CACCCATTCC CTGTGAGCTC TCCACACCCC CACCTTTGTG TCCCCTCCAG 240
CCCCACCCAG GGCCTCCTCC CTGTGGGCAT GGGAGTCATG GGCCTGGGTT TGAGGTCTGA 300
CCTGCTCGGT GGCCTTGGCG TGTTGAGGCC TCTCGGGTAT CCTGTCTCAG AGCTGCCTTG 360
GTGCACCCTC CCACAGCCTC ACATTTGGAG GCAGAGGTGT GGGAGGAGAG GCTGAGTCCA 420
GAGGTCCCCT CCTCCTAGTT CAAGGCTCAC TGTAACCTGA AACTTTACAG ACTCCATTTA 480
CACAGTCCCG TGTGTGCGGG TGCATGAGCC CAGCATGTGT ACTGTGTTTG CACACGTGGG 540
AGCTCGCCAC GGAGTCTGCC TCCTGCCCAG TGGGATGAGC AGGGTGTACT CAGAGCCTCG 600
GTGCACCGAG GAAAGCACAG CCCGTTTCCC TTTGCTGGAC TGGAAGTCAC AGTGGGGTAC 660
TGGGGGCTCC CAGACAGGTG GGAATGGGGG CCCACTGCCT GACTCCCTGG GACCCAGCTG 720
GGATCTGGTC CTTGGTCTTC TGATGTCCCG GGTCGGAAGG ATGACTGTCT GTCCCATGGC 780
TATGGCTTTG AGGAGCCCCG GAGGCCCTGT GGGGTGGTGT CCATCTGCAT GGGACGTGGG 840
GGAGCACACG CTCTGAGCTT GAGCACTGGC TCCGCCGCTG CTGGGCAGTG TGACCTCGGG 900
CAGGGCTGCG CTGAGCTTGG CAGGGCTCTC TGCCCTCGCC GTGTCCACTG CTGGGAGCAC 960
GTCAGGCCTC CCTGCCCGGC TGGTTCCAAG GCCTTTCTGG TCCCTGTGTG CAGACGAGGC 1020
TCCTCACCTC GGGACCCCAC ATTACTTTCT TATTTGTGCG CTGGTTTACT TTGTCTCTCG 1080
CCGTGGGGCA TCACCTCTAC AGGACAAGGC CAAGCCTTTG CCCCGTAGAC GAAGGGCTCA 1140
TGGTGAGCCC CTCATTTGGG ATTCTGTAGC TCTGTTGGGG CAGCCTGGTC ATGCCAGGGC 1200
CTTTCAGGGT TTCAGAGTGC TGCCTGCTAT GTGACCTCCC TGGTCGTCCT TCCTCGCCAC 1260
CTGCAAGCCA TCCCCGTGTG CTGGCTGGGC CCTGGGCTGC AGACTGGGGC CAGGGAGATC 1320
TGGACAGCAG CGTCCACCCC ATGCAGTTCG CTGTGTGGCG GCGCCGGGTG GGCCTTGTGC 1380
ACAGCCCAGC TCAGACCACG GAGGGTCTGG GGTTGGAGGT GGTGTGGACA TGATGAGTGC 1440
TCTCACTCCA GGAGAGAACG CTGCCAAGAG AAGGGTGGCT GGCCCGGCGG GTGGCTGCTG 1500
AGGGGCCATC GCGGAAGGTG GGTGGTCAGC AGAGAGTACA GTGTCCCTTC TTCCACTGGG 1560
TTCCACCTGA GGGAGTGGCA GGAGCCGGAG GGCTTGGGGA AGAGGCCGCA TCAGCCTCAC 1620
TTGAGGGCTG AGTGCTGAAG ACAGTGTGGG GGGCCCTGGG CTGGCAGGTG GGTCACCCTC 1680
GCTCTGGGAC ACGCTCAAGA GAGTGCCCTG GAGAGGGGTT TGCATCCGAA GCTGATCCTG 1740
CTTCCCCATC ACATTCCCAC CCAGTTACAA AAGTCATCCC TCCCACCGGC CCAGTGGGGG 1800
CTGCTGGGGC TTGGGGCTGA GTGGGGTCCT TGCTGCCTGC CTTGTCTGAT GTGTGGCTTT 1860
GGAAAAGTCC CTTGACCCCC CCAGGCCTCT GTGTCCTTTG CCGTGAGGTC TCAGGGGACC 1920
AGTCGTCTAG AGCCAGGGTG CTCTTGGGCA GCCGCCACTG TCTCTGGCCC CCCTGGTGTT 1980
CATTCAGGCA GGGCCAGGGT AGCCGTGGCT ATGAGCCCAG GTGGGTATGG GGCTTGGCGG 2040
GGCTGCCGTG TGTCCAGCGA GAGCCAGCTG GGCTGAGCTT CTCCTCAAAT GCTGATGGGG 2100
GCCAGACTTC TGGGGGCACC GTCTCTTTCC ATAACATGAT CTCCCCTAGG CCTCGCCCCT 2160
AACAAGCTGG CAGAGAACTC TCGCCCCATT TCATGGCCAT GGCACTGGTG GCTTGGGGCA 2220
GGGCCTGGCG GCCAGCTCTT GGGCCGGTGC CTCTGGTTCA CTGGGCCTGT GGCCTGGCCC 2280
TTGGGGTATG GAGGACGGGC CTGGGGGTGG CGTGCGCCCC CTTGAAGTGG TCCGCCCTTG 2340
TCTCTGCCTG TCCTGAGGAT GAGGGTCATC AACTGAGTCG GGGCCACAGG GCAGCCATGG 2400
GTGCGCGAGT GCAGGGCCGG GCCTGTCTCC TCCGGGCGGC GTGGCAGGTG GCTGGGCCAA 2460
GATGGCTGCA GCGCTTCCTG GGCGCTGCTG CGTGTTGAAA CCCGTCTGTG ACGTGGCCAG 2520
CGGTGTTGAA ATAAGTGCCT GTGCATTTCC CAACATCCTG CCAGCCTGGT GCAGGACTGG 2580
GTGCCAGGCC CAGCCTGGGC CTCCCTTGTG GGGTGCTCAG GCCCCACTTC CCTCCCTGGG 2640
GAGGGGAGGA GAGGCCACCT CGAGGGAGTG ACGTCAAGGC AGGGTGACAT TAGTCTGGGC 2700
CCACGGGATC CTTGCTACTT CCCCATTTAT GGAGGGGAAA CTGAGGTGTG GAGAGGGGTG 2760
AGGATGGGTT TGAAGCCCGG CCATCCAGTC TCAGTGCCGC TTGTAGAGGC AGAAGGGCGT 2820
AGGGAGGGAG AGGGAGAGCC AGGTAGGCCG AAGGCGCCTG GCAGTGTGGC AGGACACGCG 2880
CCCACTGGGG AGGTGGAGGG CCGCAGCCAG GGCCTCAGCT GAGGGCCTCC TGGATGCTGG 2940
CTTTGCTGTT GGGGCTGGAG CATGGACCCG TCCTGGGCCG ATTATGGGAG ATGGTGTGGA 3000
GTGGGGGCCG CAGGCGAGGG TCCCTCTTCC TTTGGCTGGA GGAGGCCTGG CCCTGGGACT 3060
GTCCCGTGAG GGGAGACAGT GGTTGGACCC ATTGCAGAAT TGATTTGTTA TCACTGGGTT 3120
CCAGGCACAC GGCTTAGAGG GCATCACGGA GGCCTCCCCG TCACCTCAGA GGGCATCACG 3180
GAGGCCTCCC CATCATCTTA TGGGGTGGGT GTTATTAGGC TTAGTTTAGA GGAGACAGAG 3240
GATCAGAGAG GCCCACTGAC CCGCCTTGGG GCCCCCAGCA GGCAGAGGAA CTGTGTCCAG 3300
GTGCTGGACT GTGAGACCCT GCTCTTCCCG GGACTCTACC ACCTCAGAGG GTGGCAGCAC 3360
AGGGCCCAGC AGGGCGTGTG CTCCTGTGGG GCAGGCGAGT CCTGGCTCTG CCCTTGTAGG 3420
CTGTGTGACC CCAGGCGGTA GCTCAGGCTC TCTGGTCTGG ACTGGGCGCG GAGCTGCTTG 3480
AGATCTGGAA TCTGGCTTTC TGGTGAAGGG GCAGCAGGAG AGGGGCTGAG ACCCAGCCTT 3540
CCTGGTTGCA GAGCTGCGGT AGGCCAGACC CTCCTGCCTG CTGGGTGGGG CCTGGCATTC 3600
CAGGAACCTG TGGTCAAGCC TGGCCTGGGC TGTGGCGTCT GCCCCGGGTT CGTCAGCAGG 3660
GGAGGGGCCC TGGAGACCAG TCCGTTATGG ATGAGGAAGC GGGTGCCCAG AGAGGGTGAG 3720
GAGCTGGGCT GGGCCACACA GCCAAGTGGC CACAGAGCTG GGGGTGGTCA GGAGCCATGC 3780
TTTCTGGTAA GGCGGAAGTG TCTGGGGCCC GGGTGGGATG AAGGACTCGG GTCCCAGAGA 3840
CCAGCCTTTG GTGCTGTTCT TGGGCTAGGA ATGGCAGTAA CAGGAAGGGC ATGGCCACCG 3900
AGACGCACTG AGTTATGGGC ACCTGCCGTC TGCCAGGAAC TGTGGTCCAC GCCCGACTGT 3960
CTTTAACAGC TCTGTGCCTG CTGCTGTGTG CCGGGCCCTG CGCTCAGCCC TTCTCGTGTG 4020
TGGTCTCCAA CCCTGTGTTT TCCCAGGCCG TTGGCCCATT TTCCAGATGA GAATACTGCG 4080
GCCCAGAGAA GCAGCATTGT GTGCTGCGGT CCTTGGCCAC GAGGTGGTGT GGGTTTTTTT 4140
GACCCAGATC TTCCTGTCTA TCACCCTCCC TGGGCCTACC TTCCTTATGG TAGACACATG 4200
TGCAGGTCTG TCCCATCCCC CAGCTATCCA CAGAGAGGCC AGGGTTTGGC ATGGGGAGGT 4260
GTCGGAGCCT ACTGGGTTGT AGCTGGAGGG AGGTGAGTGG CACCTCCCAC AGGAAGCCCC 4320
CCTTGATGTC TCCTCCACCT TGCCACATTA CCAGCCGATA GCCAGGTTCC TGGAAAAGGC 4380
TGTCTTTCTG ACTCTGGACT GGGTGCCCCT GGGCAGGGCC CACCTTTGTT TTCTAATTTA 4440
TTTTAATTAA AAATTTAAAA ATTAGAGACA GAGTCTTGCT TTGTTGCCCA GGCTAGACGT 4500
GAACTCCTGG GCTCAAGTGA TCCTCCCGCC CCGGCCTCTC GGGTAGTGGG GACTTCAGGA 4560
GTGCGCCACC TCACCTGGCC TCCCAGCCTG GTTTTTCTCT GCCTGTTTGT AGCCCTGGGT 4620
TCGACGGGGG AAGCAGTCGC CTGATGGGCA AGTGCTCTCT GAGTGGTGCA TGAAGGTGGC 4680
TGTCCACGTG GCTGTCTGTG GTGTCGGTTA ATCGTCACGG CTTCCGGGAG TTAAAGGTGA 4740
GGGTGCCATC CCCTTTCTGG GGACAAGGAC GTTTAGAACC AGCGAGGTTG AGTCAGATGC 4800
CCAAGGCCCT ACCCAGCCGA GAGCGATGCA GCCAGGACTC AAACCCAGAT CCGCAGGCGG 4860
CGGCCGCTGT GCCCCAGTGG AGCTTGAGCC TGGGTGGTGG 4900