EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-36764 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr9:682950-687290 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs73639400chr9683423hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr9:683820-683830TTTAATTAGA-6.02
MEF2CMA0497.1chr9:685295-685310TGCTATTTTGAGATT-6.12
NKX2-3MA0672.1chr9:686446-686456TTCAAGTGGT-6.02
PHOX2AMA0713.1chr9:683822-683833TAATTAGATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr9:683822-683833TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr9:683822-683833TAATTAGATTA-6.32
TCF7L2MA0523.1chr9:686044-686058AAACATCAAAGAGA+6.86
Number of super-enhancer constituents: 34             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00057chr9:682186-707716Adipose_Nuclei
SE_01576chr9:682590-683646Aorta
SE_01576chr9:683917-684891Aorta
SE_01576chr9:685682-687734Aorta
SE_02616chr9:682661-687041Astrocytes
SE_03555chr9:683889-684804Brain_Angular_Gyrus
SE_03952chr9:682675-683739Brain_Anterior_Caudate
SE_03952chr9:683788-684972Brain_Anterior_Caudate
SE_03952chr9:685214-687778Brain_Anterior_Caudate
SE_05000chr9:683852-687064Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06040chr9:682510-685187Brain_Hippocampus_Middle
SE_06040chr9:685239-687791Brain_Hippocampus_Middle
SE_06844chr9:683512-687779Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07840chr9:683604-687776Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_25950chr9:682493-687836Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26975chr9:682541-683661Esophagus
SE_26975chr9:683753-691322Esophagus
SE_35913chr9:682601-689122HMEC
SE_37287chr9:683418-687313HSMMtube
SE_38059chr9:682135-688129HUVEC
SE_40812chr9:682596-683520Left_Ventricle
SE_40812chr9:683814-685093Left_Ventricle
SE_40812chr9:685522-690146Left_Ventricle
SE_42454chr9:682653-683491Lung
SE_42454chr9:683941-685060Lung
SE_42454chr9:686007-687411Lung
SE_44344chr9:682472-687757NHDF-Ad
SE_45346chr9:683780-686737NHLF
SE_46027chr9:682282-687838Osteoblasts
SE_48428chr9:683764-685036Psoas_Muscle
SE_48731chr9:682743-683399Right_Atrium
SE_48731chr9:683919-684849Right_Atrium
SE_64323chr9:682653-687982NHEK
SE_68390chr9:682539-707651TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr9683957685625
chr9685726686885
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH09I000682chr9682381688400
Enhancer Sequence
CAAACAGAAC TCTGAGCCCA CTGCGGTGAA CCTGATAGCA GGAATTACGT GCTATTTGTC 60
AAGTATAAGA CTAGTTTGCA GTGACTGGTC TGGCTAGAAC CCACCTGGTG TTTTCTGAGA 120
TCATCTGTAA GGAAACACAC AGCACAGCAG AGGCAGTGTG CGCCCGTGGT GGTGAGTCTT 180
AGACCTGTCA TCTGTGTTAG CATTACCCCG AAGGCAGAGA GTTTGCTGAT TAGAAACTAT 240
GGCTGCTTTA ATTCATGGGT ACCCTCCGTG ACTTTTCAGG GTCTCCTGGT TGAATGAATT 300
TGCAGAAGGA TTAAAATGTG TGTTCTTATT TGTGCTTTGT ATTCTCCCAT AAGTAGTGTG 360
TTGGAGGCTA TTAGAATAGC TGAGAGGGTA AAACATAAAC ACATAGGTAG GAGCCTGACA 420
TAAACACATA GGTAGGAGCC TGCCATAAGC ACGTAGGTAA GAACTAAAAG GGTGTGTTTC 480
CATTTCAGTT GTCCAGCCTT CCTTCCATAC TCTCAGATGA CAAAACACAA GTTGCTGAGC 540
TCACACAGCT AATGACTAAG CCAGAAGTTG GACATGGAGA ACATTTTTCC TTTGTTCAAG 600
GTTATTTATT ATGTTGACAT TTAAAATCAG AAGTGTGATA TCTGTGAAGT TCTGATTAAA 660
CAGATCAAGT GAAAAGGATG TAGTTCAGAA AACTGCATAA AACCCTAAAG TACAGTGTTT 720
AAAAATAAAA CGTCCTCCCT GATAGGGATT ATGTTGGTAA GTTACTTTTT TTCTTAGTAT 780
GGATTATTTC AAATTAATAA ACATATTGTT ATTCCTTTAT TTATTGCATC ATACAGCTTC 840
ATCCTAGTAT TAGTGTGTTT AATAATTGCA TTTAATTAGA TTATGCATTT CAACTTTCAA 900
TGAAACTGTA GCTGTTAGTC TTTTGAAGGC TAATTTCACG CTGAAATTTA TAGATGAAAT 960
AATTTTCTTA TAGTGGTGGT GTTTGAGAAG ATAATGTAAC TACTTCTTAG ATTTCAATTT 1020
CATAACCCTT AAAATGTTGG GACCACCTAC AAATGGGGGA CACCCTGGGT TTTGAAGTCT 1080
TGCCTGTGTG GTTAATCAGA ACCTCAGAAT TCACCCAGCC CCCGGAGAGG TTTTGAAAAG 1140
CCCCTGGCTC ATCAGAGCTT GCTTGTTTCA TAAACTCTTA AGGCTTTGTT TTAACCTGTA 1200
GCCAGCTTCG CCTTATAAGC TTTCTTGCCC CAAGCCTTGA GCCAGTCATA ATGGCTTAAG 1260
CATCAGATTT CAGACAGGCG ATTAGCTCTC CAGCTAAGCC AAGAAAGGAT GATTTATCTT 1320
CCAGTGAGTA CCAGCCTATT TGAGTGTAGG AAGGAGAAAA ATCTGTGCTC CTGCTCCTGG 1380
GTACTGGGCA AAGAAACCCT TTGGTTGGGG ATTTTTGCCT GGTACCAACT TTATAGGTGC 1440
CAACAAGAAA GAAAGAAAAA AACACATACA AAATAAACAC CCAACAGGGA GATTCGCTGT 1500
GTTAAGAACT CGAGCTGTTG CTATTATTCT AAGAGACTGG GTAGCCAGTC AAAGGGTTAA 1560
AACAGCCCTT CCTACAAGGA TTTGAAAACT CTGTGCTCTG CTCTTCCTCA GCAGACTTCT 1620
CGTTGTGAGT ATTGGCATTT ATTTCTGATT ATGCACTTCC CCTCTTTCTT GAATGAGTTG 1680
GGTGGGCTAG CTGAGCCCAT CAAAGGTATA GCTCATTTGC TTCCTTTTCC AGGGTTTGCC 1740
TTCTTCCTGT GTCTGGGATA ATTTCAGTTC ATCTCCTTTG TGCAGTTTCT GAGAAAGGTT 1800
TGTATGGGCT TAGAGGAAAA TGATCGTGAC TAAAGCTCAC AGTCACCGCT TTGGCTCCTT 1860
TTCTATAAAA GGTGGTTTGA TTTGATCTGG CATGAAAAAT ATTATCATAA TTCTCAAATT 1920
CACAGAAACG ATAAGTTCTT GCTCTTTCCT GACCAAAAAA AAAAATTAAT TGCATTGGGT 1980
AGACTTCTCT AATAAAACCT TTAAGGAGAC CCATCCAGGA AATCAGATTT TATAAGATTC 2040
ATTCAAACAG TTGTAGAAAT TCTAAGTTCA AAAACCAAAA GCAGACTCTT TTCTTTTTCC 2100
TTCCTTGGCT TCTCTGTTGG ATATTTTTGG AGTGAGCCTT AACTGAGTTA CTCATTTCCA 2160
CATGCTTTAG GAAAAGTATG CTCATGTTTT ACAGGCTAAG CCTGGTTCTG CTTTTGAGCT 2220
GCAGTTCATT ATGAATCCGG AAAACACAGG TTTTTGAAAT GCGGCCCATT TGTACATATA 2280
GCATTAGTCA TCTCAGCTGG TAGTTCTATA CGATGAGTTA TCTCACCACT TAAAAATAAG 2340
TACGCTGCTA TTTTGAGATT TAAAAATATA TATAGTGACC AGATTTCTTA CCCTAGTTAA 2400
AGCAAGCCAT GGCTGAAACT CAGATTAAAC AATATTCTAT AAAAATGAGA GAAGGCCACT 2460
CTAATCAACA GATAGAAAAA CAGAACTATA GACATAAGGG AGAGCTGTGC TAAGGGACAA 2520
ATTGTTGGAT TTGTAGGATT TGTTCGTATC CTGAAAGTTA AATCTTTGTA CTCTTACCTT 2580
GTTTATGGCC AGATTTGCCT GATCCCTGAT TTCCCTCCCA ACTGGATCAG AGGTTGTGGA 2640
ATTGGAATTT CACCATACAA ACCTTTACTT AAAGGAGGTA GTACTAGAGT AACCATTTAT 2700
GGGAACAGTT TGCTACTAAT AGTTACTAGT ACTGAGTTTA TTTTAGTTCC TTTTTCATGA 2760
TTTTATTCCA TTGGAAAAGT TTTCTCTCAG GGATCTTTTC TACTTTGGAC ATGATCTCTG 2820
TTAGGCAGAA TCAAAAGATA GCTGTGTGGC TTTCTGAATT TAGTCTCACA ATATTTGGTT 2880
TAGTTGATAA ATCCCATCCA TCAGCTTTGC AAATAATTTT GTGAAAACAT TGATTCAGCT 2940
TGTCCTGCCC AATTTTCCCA TCCCTGCCCA GTTTACTGAG TGCCTTTTCC ATTTGCATCC 3000
ACTGTCCATT AGGCCAAGGC GTTTGAAGTG TTTCTGTACA GCAGGTACAT TTAAGACTCT 3060
CCAGGAAGAA AGGGGGAAGA ATATTCCAAA CTGAAAACAT CAAAGAGAGA GATGGGGTAT 3120
TTCCAGTAAC TTATATGCCC AGTGCTTAAT ATCTTAAAAA CCCTACTCAT GTGCATCAGC 3180
TCTTACTTTT TTCTAACTAA AACCAGAAAA AAGTTCTCTC TTCCTCTGTT CTCAGTATCC 3240
CCCTCATGTA AGTCTGTCTA CCCAACACGG TGCAGCCGAT TTATTTATTT TTCCCTCAGC 3300
ATTTTTAGGT GGATTGACTG GGATGCTTTA TTCAACTCAG GGACGCACCA CGAATATGTT 3360
TTTTGGGGCA ACCCGTTTGG CATGTTCCCC CTCAGCTGTG AGGACAAAGA CTGGTTTGTC 3420
TTCTTGTGAC CTGGCAGAGG AGGCAGAAGT ACCTGCTGAG CTTATGCAGC ATGTACCCCA 3480
ACCGGTGCCC CACCTCTTCA AGTGGTGAAT CAGCCTGATG ATACACTGAT TTTTAGAACA 3540
CGCTAGGGTG GAGACCTGGA AGTCTGTACA CTGGTCGGGG AGGGAGGGAT GGTTTGCATG 3600
TCAAACCATT TCAACAATGC AGCTTACAGG AAAAAAAAAT TAATTGCAAA ACACTGTGAT 3660
GCCCTTTGCC ACCAGATTTT TCCATTAGCA CCACACTTTA TACAGCTTCC AAGTCTGCCC 3720
CAGGGACAAC TGTTTGGCAG TGTGAGGGGA AATGGCAGCA TCACGTCATA AGTGCAATGA 3780
TTGTTACCTA TGAGCCTATC CGGTAAGGGA TCTGAGTGGG CCCAAGCATC ACACACGTGC 3840
TGGAGCTGAG TGTTCTCTGA GGAACATGCT AGGATGTTAC TTGGGTGCTA GAAAACAGCA 3900
GCTGGAATTC ACAACACCTC AGGACACTGA TTGTAAATGA AGAATCCTGA GACTAAACAT 3960
CTTCTAGAAA GGTAAAGGGG GCTTAGGGCT GGGGGCTTTT CCTCTGGGCT CTTATCCTTT 4020
GGTATGTTGT CCCTGGATGC TTTGAGATGA GACTTTGCAG ATACTGCTGA ATTTCTTTTC 4080
TTTTCTTTTT TTTTAATACT GCTGCATTTC AATTGGGGTG TTGTTTGGGG ACTACTGGAA 4140
GGAATGTTAT GAAACTCCAT AGAAATACTT CAATTCAGTG AGTTCATTCA TTCAGTGGCT 4200
CACTTTTAAA TGACCATACA GATGTATTTG GCAGAATACA TCTTTGCCAT TTTCCTTCTT 4260
TGTGTAATGG ACCAGCCCCG AGGCTGCGAG CATTGGTCCT TCTTTGCCTT TTTCTCCCTG 4320
CTTTGTGGTT TTGTGTATGT 4340