EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-33391 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr7:43650850-43653490 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2AMA0052.3chr7:43652680-43652692ACTAAAAATAGC+6.18
MEF2BMA0660.1chr7:43652680-43652692ACTAAAAATAGC+6.62
MEF2CMA0497.1chr7:43652678-43652693TGACTAAAAATAGCA+6.59
RFX2MA0600.2chr7:43651911-43651927GGTTGGTATGGCAACC-6
RFX5MA0510.2chr7:43651911-43651927GGTTGGTATGGCAACC+6.44
RFX5MA0510.2chr7:43651911-43651927GGTTGGTATGGCAACC-6.46
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02027chr7:43650885-43651448Aorta
SE_02027chr7:43651629-43652111Aorta
SE_10894chr7:43650576-43695007CD20
SE_12060chr7:43652320-43653043CD3
SE_17400chr7:43650363-43653339CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18336chr7:43650539-43674584CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20054chr7:43652066-43653243CD56
SE_22324chr7:43650789-43654745CD8_primiary
SE_45666chr7:43650777-43654373Osteoblasts
SE_58298chr7:43621281-43741410Ly1
SE_62288chr7:43651338-43740420Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr74365214243652940
chr74365102143651092
chr74365168843652069
chr74365301143653133
chr74365325443653430
chr74365277943653072
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH07I043611chr74365088643651448
GH07I043612chr74365164743653108
Enhancer Sequence
GTTTCCTACA GAAAAATACA GGGAAAAGAA AACAATGTGG AAGTTTTCTT GTTCTCTTTT 60
GAAAGATGCC AATGTAAATT CATTTTATAC ACATTTATCT TTTCTCAAAG ATATTAATTT 120
TTTAATACCA TGGCTAAAAT GGACACTCAG GACCCAGTAG CCACATGGTA CACAGTGGCG 180
TTTTTTGAAA GCAAGTATGG ACATGTGCAC ACCCACACGC TGAGGTGGCC TGATGTTAAT 240
GCTGAAGGTT ACCTAGTTAA AACCTTTCAT AGCTTGGGTG GGGGCATTGC TTTTCCCCTT 300
CAGTGTGTCA TATGCATAAG AAGTTCAAAG ATCCTTGCTG CAAGAAATTT CCACCTTGCT 360
TCCCTCGGGA ACATTTACAA GGAAGATATG GCCTCCGCAG TACGGACTTT CACTGGGCTA 420
ATACTTTAAG TATTAGCCAT GCAGAGGAAT TCCCAAAATA AATGTTTATG CTGTAGCTTC 480
TTTCATGTTT GGTTTTACAC TCTTAACTTT GCAAAATCGT GTATCTGTTT TATTTTTTAA 540
TGATGTTTTA CTAGTCTTAT GATGGACTTC CAGGAAGAGA ACCCCAATTT AAATAGCATT 600
GCACCTATAG GAAATGAGCT TTCAGCTTAT GACAGTTGAA CCTGTGACTA TTCAAGAACT 660
AATTAAGTAG CAAGTCAAAC AGGTTGTCAG CACCATGTGT CATGGATCTT TGATGTTACT 720
TGAGAGCATC AAAGGTGAAT ATTAAGTTCT TGAATACCAA CTTTAAGTGT GTATTTACAC 780
AAGGAAATTA TATCCCTTTC TCCTCAGTAT ATTCAGTATC AATCATATTC CTTTCTCTCT 840
AATACACTTG GTTTAGAATT CTTTCCAGAT TCAGTAGAGG CCTTGATGAC GATGACAGGC 900
CTTTGATGTT GGAAACTGGA CTCTCCATGT TTCCTCGACC CAGAGGAACT AGAAGACAAA 960
GTGGTCCAAA GGGTTCTCAG CCTTCCTTCT GCCTTCATGC CCCTCCATGT GCAGTCAGAC 1020
ATGTCTCTGA GTCAACTACT GGAGGGAGAG GATAGAGATG GGGTTGGTAT GGCAACCATG 1080
CATGCGGGAG TGATTTCTAC TAAAAGGTCA TTTCCAATTG GCCTCTGTGA GTCTGGATGA 1140
AGTGAGTCTG CTGTCCTCTG TCTTCGACAG TGTGTGCTCA TAATGTTGAC TCTTGGTCTC 1200
TAGAAGCGTT TGAAAGACTA GGCTATTTTT TAAGAAATTA TTTTCCCACA TTGCCTCAAA 1260
GCTAAATATA TTATGTTTTC ATTCTCTAAA AACTGATAAT CCCAATATGT ATGGTAATTT 1320
TGAATTATTA GGCTATTTAG TCTCCATGCT GGTTAAAATG GGAAACTCCT GTCCCTGTGA 1380
CAGAAGTTAG TTGGAAGTTA AAACAACTGT TATAGTTGCT TCTATTAAGG ATATAATTGA 1440
CGCTATGGGA AATACACTGC TTAGCTTTGG TGCAGAGCCT GAATGATCAA TTTGCCAAAA 1500
GACTGATTCA CTGAAGACTG TCAGCCAAAT ATCTTAAATA GAGCTGGGAA AGTTCTTGGG 1560
GTGGGGGAGG GAGTAGCAGA TGCAGATTTA GGAGTCTGTA AAAGTATGAG TCCATACAGC 1620
CACAAAAATA GAAAAGACAA GCCATGATTA AGAGAAAACC CATTCGTTTA ATATATAAAA 1680
TGTTGCAGAA ATTGCAAATC TGAGAAACAA CAACCCTGGC AAAGTCAGAA CAAAACCAAC 1740
TAAAAGTACC CAAACAGTCT CAATAATTTG GTGAATTAGT CATTCAGTAC AGCGGCCTGG 1800
TTTTAGTCCT GTCAGAGGGA GGGAGGACTG ACTAAAAATA GCACAAAGAA ATCTGGTCTT 1860
AAAATCTATT GCTCTTTTTT CTTCAAATGG TGTTGTACTG GTTCAGTCTT TCAGCAGTGT 1920
TAGTACAGTC AGCCCTCTGC ATCCATGGAT TCAACCAACC ACAGGTTGAA AATATTCAGG 1980
GTGCAAAAAT TCCACAAAGT TCCAAAAAGC TAAACTTGAA TTGGCCCCCC ACCAAGTATT 2040
TCATTGAATC CACACAAATG AGGTGATGTG TGGTATTATA ATAGCTATTC TGAGTAACCT 2100
AGAGATGATT TAAAGTTTAC AGGAGGATGT GCTTAGGTTA TATGCAAATA CTGTACCATT 2160
TCCTATCAGG AACTTGAGCA TCACAGATTT TGGTATCTGC AAGGAGTCCC TGAACCAATC 2220
CCCACTGATA CCATGGGACA ACTATACTAG GATTCTATCA CTAACTTTTC CACCCAGTTA 2280
TGCTCATGGT TAAAAGTAGA CTAGAAGAAG GCCAGGTGTG GTGGCTCACA CCTGTAATCC 2340
CAGCACTTTG GGAGGCTGAG GTAGAAGGAC CACATGAGCC CAGGAGTTTG AGACCAGCCC 2400
AGGCAACATA GTGAGACCTC ATCTCCACAA AAAATTAAAA AAATCAGCCA GCCATGGTGG 2460
CACGCGCCTT TAGTCCCAGC TACAGAGGAA GCTGAGGTGG GAGGATTGCC TGAGCTCAGG 2520
AGTTCGAGGC TGCAGTGGGC TATGATTGCA CCCTGCATTC CAGCCTGGGG AACAGAGTGA 2580
GATCCTGTCT CAAAAACTTT TTTATTAAAA CATTAATTTC TAAAAATTAA TTTCAAAAAA 2640