EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-29722 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr5:118699250-118704430 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HINFPMA0131.2chr5:118699397-118699409CAGCGGACGTTG-6.44
IRF1MA0050.2chr5:118700524-118700545TTTTCTTTTCAGTTTTTTTTT+6.04
NFYBMA0502.1chr5:118699863-118699878CTGATTGGTTCGTCT-6.73
RREB1MA0073.1chr5:118704156-118704176TGTGTGTGTTTGTGTTGGGG-6.95
STAT1MA0137.3chr5:118704198-118704209TTTCCTGGAAA-6.62
Stat4MA0518.1chr5:118704195-118704209ACATTTCCTGGAAA-6.41
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09224chr5:118688077-118707672CD14
SE_10192chr5:118698805-118700069CD19_Primary
SE_10192chr5:118701627-118707489CD19_Primary
SE_11852chr5:118701431-118704487CD3
SE_14409chr5:118703507-118704954CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15564chr5:118703318-118704738CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16877chr5:118701785-118704600CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17336chr5:118698320-118700106CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17336chr5:118700647-118704935CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17778chr5:118687541-118706327CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18242chr5:118687367-118707670CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19112chr5:118687616-118706749CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20232chr5:118701941-118704880CD56
SE_20766chr5:118703403-118704818CD8_Memory_7pool
SE_22350chr5:118696982-118700260CD8_primiary
SE_22350chr5:118701640-118705075CD8_primiary
SE_32471chr5:118700805-118701859GM12878
SE_32471chr5:118701866-118706448GM12878
SE_50308chr5:118701877-118702940Sigmoid_Colon
SE_58310chr5:118603634-118704575Ly1
SE_59189chr5:118668058-118705467Ly3
SE_60461chr5:118639775-118703145DHL6
SE_61019chr5:118608552-118705688HBL1
SE_61555chr5:118642263-118726869Toledo
SE_62209chr5:118603018-118707327Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr5118701155118701492
chr5118701836118701952
chr5118702223118702779
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH05I119363chr5118698726118700442
GH05I119365chr5118700802118707564
Enhancer Sequence
GCAGTGGTAC ATGAGGGTAA CAAGTGAATA TGGGCAGGAA ATTTAATTCA TCTTAAAAAG 60
AAAAGTAACT GGTTTCCTAT ACATTCACAA CATTGCTGAC ACCGAATGTG AGAGGGTCTT 120
TCTTACACCA ACCAGTTTTC CAAATTTCAG CGGACGTTGA CTAGACGTCC TATAATTTAA 180
CTCATTTCTG ACACTAATTG TCCAGAGTTA GGGCAGACCC CACAGGTTAA GGGCTCAGTC 240
CCACAAGACT GTCCTCCAAC TTGAGACAGC AATTGCAAGG CCAGGCATCC CATACTTTTG 300
ACCAACTGGG TATAAATTGG GGATTTGCAT GACAGCCCCT CAGGTTCAGT AATTTCCTAG 360
AACAGCTCAT GAAACTCAGG GAAACATTTA CTGATTTATT CTAAAGGATG CAACTCAGGA 420
AGTGCCAACT GGAAGAGATG TGTAGGACAA AATACAGTAG AGGGATGCAA GCTTCCATGC 480
CTTGTCCAGG CAGGCCACCC TCCCAGCACC TCCAGGTGGG ATGAAGTCAT TGGCCATTGG 540
TGATTAAACT CAGTCTCCAG CCCGTCTCCC CTGCCCAGAG TGGGGGAACT GAAAGTTTTA 600
AACCTCTAAT CACCTGATTG GTTCGTCTGC TAACCATTCC CCATTCTGGT TTATGAGTCA 660
CCTCATTAAC ATAAACAGGT AAGTTTGAAA GAGGCTTATT ATGAGTAACA AAAGGCACCC 720
CTCTCACAAC TATCACTCAG GAAATTCCAA AATTTTAGAA ACTCTGTGCC AGGAACTAGG 780
GACCAAGACC AAATATTACA ACAAAAGATG CACCTATCAC TCTGTTGTTT TAGAGATAGT 840
CTCACTCCGT CACCCAGGCT GGAGTGCAGT GGCGGGGTCA TAGCTGGGCT CAAGCAATCT 900
TCCTACCTTA CCCTGCCAAG TAGCTGGGAC TACAGGTGCA TACCACCTGC CCAGCTAATT 960
TTTAAATTGT TTTGTAGAGA CAAGGTCTCA CTTTGTTGCC TAGGCTGGTC ATGAACTCAT 1020
GAGCTCAAGC AGTCCTCCCA CCTTGGCCTA CCAAAGTGCT AGAATCACAG GGATGAGCCA 1080
CCGCGCCCAG TTATCACTCT TATCATTTAG GAAATTCCAA GAGTTTTGAG AGCTCTAGCC 1140
AGGAGCTAGG GATGAAGACC AAATGTATAT TTCTTACTAT ATAACAGTAT CACACAGCTC 1200
TTCATACTGG GGGAAAGCTT TGGCCACTCA AAATTAGATA ATTTTTTTAA GGTAATGAAG 1260
GGTTTTTTCC CCTTTTTTCT TTTCAGTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTGAGATG 1320
GAGTCTTGCT CTGTCGCCCA TGCTGGAGTG CAGTGGCGCC ATCTTGGCTC ACTGCAATGT 1380
CTGCCTCCCA GGTTCAACTG ATTCCCCTGC CTCAGCCTCC CGAGTAGCTG GGATTACAGG 1440
CGTTCACCAC CACGCCCAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA AAGATGAAGT TTCACCATGT 1500
TGGCCAGGCT GGTCTCAAAC TCCTGACCTC AGGTGATCCT CCTGCCTTGG CCTCCCAAAG 1560
TGCTGGGATT ACAGGTGTGA GCCACCGCAC CCAGCCAAAA TCAGAGAATT TTTATTTGCT 1620
CCCTTTGGCC TTCACTTCCT CTCTCCTCGT ATTTTTTTCT TCCTGTGACA GGAGTGCATG 1680
TCTTAGAATA CCACTGATGT TTCTGCCAGG GGTACCCTAG ATTTGGCATA TAATTTGGAA 1740
CTCTTAGGAC TTTAGTCTTA TACATATTAA CTAGGATTTG GGCCACACTA GTAAGCTGAG 1800
CCATTTTGAG AAATTTTAGA TTCCCTCTGA GATGGTAAGC AGTTGTTACA CCAGTGGAAA 1860
TATGCTAGAT GGCTTATTCC TTGTGAGAAC CAATGAGATA ATGTTAGTGT AAAGCTCAGT 1920
GCTCAGACAG CTTCACTCAG GAGGTACTGT ATAAATAAGG AGGCTTATAA TCACACCAAA 1980
AGACAGAACC CTGCCCAGGC CTGCCTCTTC ATTCAGTTAA GAAGTCCTCA TTTCATATTC 2040
TCTAAAAAGC AGGTAAGAGT TGGCTTGCTC CAATAAACTT TTTCCTCCTG TAAAGTTGTT 2100
TGATAGCAAA ATATTAGTGC ACTGAGTGTT CTTATTATTA AGCACTTACA AAACCATTTT 2160
CACCTTTCAA GGATTAATAT GAGAATTGCA TCAGTTATGA AATATCTAGA ATGAAAATGC 2220
ATGCCTCCTC AATATCACAA GTCTAAACAT TCGACTCAAC ATCTTCAGAA GAAAAGAGAA 2280
TTAAAGAGGA AATCTCTCAA GAGAGTTTTC CAAGAGGTAG ACAGAATTCA GGGGCAAGTA 2340
GCACCCACTG TAAGGGAAAG GAAATAATTA TTGGGAAATC AAAATAGCAA AGAAAGTTAA 2400
GGGAGTGGCA GTTTGGCAGA TTTCACAGTT CTGCAGGAAC AATGAGGGAG ACATAGCAGT 2460
TGGGAGCGAT GGGGAGTAGG AGGGTGTGAG AGCAACAGGG TGGGTGGGAT CCAGGCCTGA 2520
TGAGAGCCTC CGAGGGAAGA AGTAGGAGTG GAGAGAGAGA GGAAGGGAGG AGTAAGGAAA 2580
TAACTCTAAA ATGAAAAAAA AAAAAAGTAA TATGTGCAAA ACTTAAGAAG TGACCAGCAG 2640
TATAATAGGC AAGAGACCAT TGTAACTGGG TTAAGAAGTT TTGGCAGCTT GCTTATTTTG 2700
TTTGATTTTG CAGTTAACAG GAGAGAAAGT GGGGTGCTGG TGTCCAAAGC ACTGTGCAGA 2760
CTTGGAGCCA ATGAAATGTG GCATTTGGAG GACACAGAAG CTCTCTAGTG CTTCTGAGGC 2820
AGGATTAATG CAGAGGCCCA TAAACAAGGA TGTGACATTG AGGAATGCTG CCCCTCTTCC 2880
AACTGCTAAA TTGGGGCCAG TCGGAAGCCA GGGCAGTGTT ATGTTGGCTT GGATTTCTAG 2940
CAACTTTCTT ACTGGGTTAT AAAAATGATT TCCTCAAAAA AGCTTGAAAA TGGCAAATGA 3000
TGAAGTAGAA AAGCAGTGGT GTCTGCCTGT GGGCATCATT TCAAAGCTGC CTGTGACATC 3060
GTGATGCCCA TTTCTGGAGG GCCAGTGGTG AGTGGTTTGT TGGAGGGTTA AAGCCATCAC 3120
TTCCAACCAG TGAAGCTGTA CCTAACTTCG GGGGGTTTCC CTCATTAACA AGTCTGATGG 3180
TAAGCAGGCC TCCTGAAGGA TTTCAGGCAG AGGATTTTTA GGGGTAGAAC TGGTTTAAAT 3240
TATTTGGCTT ACTTGGCCAT AGCTCTGACT TGGTGATTAG GCTGATGACC CTAGAAGTAT 3300
AGGGGTGATT ACTTGACATT CCTGTCCTTG CCACCTACCT ATTCCAGCAT ACTTTGGGGT 3360
TGCCTCTCTG TGCAAATGGG GAGGGACATG AGGGAGAGGA GATGTTGATT GTAGGTCTCA 3420
GCAGTGAAAC AAGCTGGCTA GTTTCAACAT GTGTAAGGGT TAATCGGGTA AATTATAATT 3480
GCTGCTAGGA GAGGCAGCCT AGCTGAGCCC ACCCAGCCCT CAGGGTTGCT GGGGAAAGGG 3540
TCATTCTTGC AATCCTTAAT TGTTTTCCTC TTTCCCAAAG ATGAGTTCTT AATGTAACAT 3600
CATGGTCCAT TGACCCATTA ATAAAGTTTA CATTCCTGAT TTGTTTTAGT CCTCTGCATT 3660
TCTAGTTCTT TAAATTCTCA GATAACCCTT CCTTTAAAAA TGCAATTCGG CCAAATTAAG 3720
CAAAGAAAGG AATAATTTGA TTTTTTTGTT GCTGTTGTTT AGTTATTTGA GTCATTCTAT 3780
GGTCTTAGGC AATTTTCTAA ATGAAACGTG GAATGTCAAC TGGACTATTT TGTCGTAGAG 3840
GATGGGAGGG AGAGAACTGT TATATTTGGT AGTGGTACTA GAATAGTATA GAACCTACCA 3900
GCAAAAGTGT CTCAGAGTAA TATTGTCTGT TGTTTCCTTT CTATTTTTTT AAATGGCACC 3960
ATCTATCCCT ATCTTGTGAA CTAGTTAAAC ATGTTTTAAT TGTATATCTT TTAAAGCTTC 4020
AGTTAGCCAG ATTTTTAAAA AAATGTTTGA TGTTGTTTTT TATTCCATGA ATGACTCAAT 4080
TGACTACATG TAGGCAGCTA CTAAACTTGG CAGTTTGTTG CCATTAGCAT GCCCTTGGAC 4140
AGGAAGTATT CAGTATAGAT ATGACAAACC AGTTTCCAGG CTTAAAAATA AAGCGGGGAT 4200
TTCTGGACAG AATAGGTCTT TGTCACTCAT TTCAACATGT CTGATGAGTG TTAAAGTTCA 4260
AAGCCTATCC CTTTGCTTTC TCATTTTTTT TCAGGCCATC ACTTTACCTG ACATATTCTA 4320
TTATATAGAT TGAAATTTAT TTCATGATGC TGGTGTTTTG TTCAGTTTTT AAAAATGAAA 4380
TAAGAGGATA TTTGAATAGT CATGAGAATC AGCTAGAGTC AGTATTCTCT CCTTGTTATC 4440
TCTTTCATGT TTAGTTCCTT TTAAGTCATC TCCCCACTGA GGTAGGTAAT GGTGAAATAA 4500
TGTTTCCCTG CCTGTAAAGC AGCTTAAATT AAAAGTAGCA AGTGTGTGCC AGGTACACTA 4560
CATGACTTCT CTTCTTGAAT CTGTGGTCCA CTTGAAATAG CATTTTTTTC CCCAAAAGTT 4620
GCTTCCCATC AGTCTTGTAG TTCTTAATTT CATTTGTCAG GTAGTCACTT AGCAACTTGG 4680
GAAGAATCAT ACTATTTTGA CAGATACTAA CAGGTTTTTT GGCATCTTGT TGCCTACAGT 4740
TATTGCTTTA TGACTTAAAA AGTAAGTTCA TACTTTTTTT GCTATCTCCC GAAATAATAT 4800
AATTTTCCCT CCTGTCTGTT AAAAAAAAAA ACCCACACTT TCTCTTCTTT CTTTCACTTA 4860
CCTATTCTAA GCAGCGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGCGTGTG TGTGTTTGTG 4920
TTGGGGTTTA AGAAGCCTTG ACACCACATT TCCTGGAAAT ACTAAATTAG TCACAGCATT 4980
TATTAGATGA GAGTGTCTAC AACAACAAAA AACTTTCTTT TTCTGAAGAC TTAACTCCAT 5040
GCAAGTGTCA ATCTCTGAGC GTCTATTTGT TTTTCAAATA AGAAACTGTG CCAGGGAAAG 5100
ATGATTTGAA ATACAAAATG CTTGCAAGTG TTTTTAGTTT GGGGTAAGGT AAAGTCAATA 5160
ATGATTCTTT GGGACATTTT 5180