EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-29393 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr5:71728820-71731800 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs12054750chr571729221hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArMA0007.3chr5:71730749-71730766AAGAACAGTGTGTTCCT-6.52
ArMA0007.3chr5:71730749-71730766AAGAACAGTGTGTTCCT+6.63
CrxMA0467.1chr5:71729136-71729147AAGGGGATTAG+6.32
NFE2L1MA0089.2chr5:71729520-71729535AAATGACACAGCAAT+6.33
NR3C1MA0113.3chr5:71730749-71730766AAGAACAGTGTGTTCCT+6.12
NR3C1MA0113.3chr5:71730749-71730766AAGAACAGTGTGTTCCT-6.1
NR3C2MA0727.1chr5:71730749-71730766AAGAACAGTGTGTTCCT-6.05
RAXMA0718.1chr5:71730842-71730852GCCAATTAAC+6.02
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01983chr5:71729340-71730910Aorta
SE_36958chr5:71728919-71731445HSMMtube
SE_51545chr5:71729094-71731376Skeletal_Muscle
SE_63586chr5:71729087-71730058HSMM
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH05I072433chr57172948171729630
GH05I072434chr57173044171730677
GH05I072435chr57173072171730870
GH05I072436chr57173151271732042
Enhancer Sequence
TCCTGATAAA TTCATGTATC AATCTTGGTC TGATGGAATT CTAAGGAGAA GAAGAGATAG 60
TGGCTGTATC CAATTGCAAG TATATTTAAA ACCTTGCTGA AGATGGTGTA GTAGTAGCCA 120
GGCCCTTCGC TCAGAGAGCT AACAGTCTGA GTAAGGCAAA GCATTTGAGT AGATAAACCT 180
GAGATCAAAA GTAAAGTATC CCTGCAGGAA GGTAAGGAGA TTAATAGCAT GGAGGCATAT 240
GGAGCTTTTG GAAATAGAGC CATTTGAAAT CCACAAAATC ACCTGTGTCT TCAGAGAGGG 300
GCTTAGAGTG ACTTCTAAGG GGATTAGACC CTGTTAACAG TGTGCTTCAG AGAGATGCAT 360
CAGTATACCT GACGAATGTT TATTGAATGT CCCTGGGGAG GCTGACATTG TAATTATCTG 420
TTTCTGAGGC TCTGCATAAC TTTGCTTTGA TTTTTGCTTT TTTTTTTTTT CTGTAAGGAC 480
TTTGCCGTTA CTGGGGATTT CATATTTCTT TTATTTTCAA TTGGTTTTTA AGGAGGGAGA 540
AGAGGCAATT GACTCTATGC CATTTGTATA CAGTCTTGTA AAACCACTGC TGAAGATTTG 600
AAATATTATT CTGACTTGAA TAACTTGCCA CTCCAAGTGA AGCTGTTTTC TTCGCTAGAC 660
TTGCCACAGT TTGGAAGGGA AGCTGTCCTT CAGCAATGAT AAATGACACA GCAATTGTTT 720
CTGCAAGTCC AGAATGATGA ATAGATCTTG CTTCATCCAA AGCTTTATTT CCAAAAGCTT 780
TGACACAAAG AGAGACCAAT TTCATTATTG CTACATTCTA GAAGAAGAAA CAAAACCATT 840
TGCCAGCATG CTTAATATGA TGAATTTCTA AGCTGAAAGC ACTATCCTTG TAATCTTTTT 900
GATGTCTCTT AATATATCTA TCCATTTTCC TTACAAAGAC CGTTTGTTTA TTAAGATCCA 960
TTCTGTGAAA AGAGTCACAT GGTGTATTTC AAACGTCCGT TTAAAATGAT TCTTCAGGTA 1020
TGATGCCAGA AGTTTTAATA GCCCTCCGCC TCCCCTTCAC ATTGCCTGTG TGATCTCTGG 1080
TGTGTCCTGC CAAGTACCCT CACTCTCTCA CTTTCGTTGC CCAAGTGCAT TCTGAGTAGC 1140
AAGGACTTCT GCTTGGACTC ATTGTTTGGG TCAGGCTCAG AGAGAGCTCT TATGTTTTTT 1200
CTCATCAGCT AATAAAGATA AGGGGTGGCA TCAGGGGAAG CATGCCTTAG AGATGAAGGG 1260
CAAATGGAGA TCTTTGATTC AAAGAATGCG GCTCCATCAC TTTCTCTCTT ACATAAAAAT 1320
TCTATTCATC CCACACTTCC TACTGCAAAT CACATTGGTA CACCATGACA ATGCAGTAGA 1380
TACACAAGGA CTTTCCCACA TCACACTACA AACACAGCCA CCCTCTCTGG GGAACGTAAG 1440
AGAAACTTTT GGGCTTCCAC TTCCCCTCCA TTTGTTTGAA GGATCAAGAG AACACTGTTC 1500
CATTTTCAAC AAAAATTAAA AAGGAAAATC ATGAAAAGAG CCAACCTCCT CTTTTTTGTT 1560
TTCTCCCTTA ATATATTGTT GCATCCAGGG AAGAGGAAAC AGTGAGCGCC ACTGATACTG 1620
GGTCCCCAGG GACCCCATAA GGGTCACTCC CCAGCTATCA AATGAGCATG TCTTCCTCCA 1680
CTTGCAGAGT GAGTTTTTAA CGGGAATGGA AGTTACTCTT GGCTCAGCTC TGATGTTGAA 1740
AAAAATAAAA TAAAAAGAAA AGAAAAAAAG AAAAGAAAAA GAAATGCCAC AGTGCTTCAG 1800
GGAACCAGGC TGTGTTCACA CCTGGGTTTT CACAGGACAG AGATTTTTAG CTTTAAGGCT 1860
TTGGAGATTT GGAGAAAGGA GATTTCAGAA ATCATTAGCC ATGTTCCTGC CAGCCTCAGC 1920
AGGCCAGCTA AGAACAGTGT GTTCCTTAAG GGCAGGAACA AATTCCTTCC ACATGTTTTG 1980
GTGTTTTTGT TTCTTCTTAA CGTGCTATCA GTGATGCCAT GGGCCAATTA ACTTTGGGAC 2040
TTAAAATGTG ACGATATCTC ATTTATTCTA CACCGTTGCT AAATAAGATG ATCATGGGAT 2100
AAAATTTTCC AGGTAACTGG ACTGTCATCC TTTGAGAACT GTATTTTAAA AATGGAAATG 2160
TATCTGGACT CCATTCAGTG AATAAAAACA ATAAAGACTG TTAACTCTTT GATTGTGCAA 2220
GTTCATGTTC ATGGGTGTAT TACTTCATTG GCTGTATCAA AGATGTCCTC AAGGTCTATG 2280
GAGATGAAAA GGACTCTGCA GCCTCACATG ATGGTCTTGA AATTCTAGCC TTTCCATTAG 2340
TTTTCTGATC TTCTAACTCA GTGTTCATTT GGCATTGTTA TTCTGTCATT TCTTCCCAGA 2400
ATCTGTGTCT GAGAAGCCTC ATTGCCTTCC TCAGTCTTGA CTATTTACTT CTTCACCAGT 2460
TGTAACATAG GCAAAACTGA GAGAAACCAG ATGGACTTAG TTTTACATAC ATTACTTAGT 2520
AAATCTTCCC TCCTGCCAAC TAAGTGAAGA GCACGGTTTT CATGACAGCA TAAAAATCTA 2580
ATTGATCCCT TCAGTCATTA TGTGAGGAGA TGGACTTTAT ATCAAGTGGC ATTTTATTTT 2640
GAACTTAGAA AAATATGCAT CTTATTACAA TTTACCTTCA GTATAACAAG TCCATTGGAC 2700
CTCCACGTCA GATTTTGAAC CATTCATTTC TAAATTATTT GCTACCTCCT TAATCCAGGC 2760
CAGTATTATC TCTCAGAGAT TATGGAAACT GCCTTTTGAT GGTCTTCTAG CATCATCCTG 2820
GCTTTCTTCC AACCCTATCC ACTATAGTCA GAATGAGCTT TCAAAAACTG AATCTCATTA 2880
TTTCACCTCC TTGCTCAATG GCTTTCCATG TTAGCCTCAC CTTGCCGCAC ACACCCTCTC 2940
CTGCTGTGCT CTACCACACC GTCTTAAGGG GTGAAGAGAG 2980