Tag | Content |
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EnhancerAtlas ID | HS129-27147 |
Organism | Homo sapiens |
Tissue/cell | MCF10A |
Coordinate | chr4:3469210-3475130 |
Target genes | |
SNPs | Number: 1 | ID | Chromosome | Position | Genome Version |
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TF binding sites/motifs | TF | JASPAR ID | Coordinate | Motif Sequence | Strand | -Log10(p-value) |
HOXA13 | MA0650.2 | chr4:3472419-3472430 | GTTTTATTGGC | - | 6.14 | INSM1 | MA0155.1 | chr4:3471496-3471508 | TGCCCCCTGGCA | - | 6.62 | KLF4 | MA0039.3 | chr4:3471278-3471289 | GGAGGGTGTGG | - | 6.32 | Klf1 | MA0493.1 | chr4:3471280-3471291 | AGGGTGTGGCT | - | 6.02 | Klf1 | MA0493.1 | chr4:3473173-3473184 | TGGGTGTGGCT | - | 6.14 | Klf1 | MA0493.1 | chr4:3472656-3472667 | AGGGTGTGGCC | - | 6.32 | SRF | MA0083.3 | chr4:3472039-3472055 | TTCCCAAATAAGGACA | + | 6.11 | SRF | MA0083.3 | chr4:3469597-3469613 | TGTCCTTATATGGTGT | - | 6.39 |
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| Number of super-enhancer constituents: 4 | ID | Coordinate | Tissue/cell |
SE_40841 | chr4:3462461-3473794 | Left_Ventricle | SE_40841 | chr4:3473941-3475812 | Left_Ventricle | SE_49257 | chr4:3470399-3472998 | Right_Atrium | SE_49514 | chr4:3471263-3472351 | Right_Ventricle |
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| Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder | Number of disease enhancers: 4 | Chromosome | Start | End |
chr4 | 3471152 | 3471517 | chr4 | 3471904 | 3471954 | chr4 | 3472317 | 3472639 | chr4 | 3474161 | 3474493 |
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| Number: 4 | ID | Chromosome | Start | End |
GH04I003467 | chr4 | 3469081 | 3469745 | GH04I003469 | chr4 | 3471264 | 3472351 | GH04I003470 | chr4 | 3472441 | 3472570 | GH04I003472 | chr4 | 3473942 | 3475812 |
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Enhancer Sequence | CCAAGTCCCA GGGCTCATCC TGGATTCCTC GTTTCCCTGT GGCTGTGGAG GTGAATGCAG 60 GGGGAGCGTG TGTGCACGTG CGTGTGTGTG TGTGAGGATG TACATGTGCA CCTGTACACA 120 CCGTGGGAGC GTGTGCACGT GTGAGCAAGT GTGAGCATTT GGGTGAGTGT GTAAGAGTGA 180 ATGTGTGAGT GTGGGCTTGT GTGGCTGTCT TAGCTCAGGC GGCTCTTAGC GAATGCCACA 240 GCCTGGGCGG CTCAGACGAC AGCCAGTCAC TGCTCACGGT TCTGGGGGCT GGAGGTCCAA 300 GATCAAGGCA GCCTGGGTGT CTGGTGAGGA TCCGCGTCCT GGGTGTCTCG TGAGGACCAT 360 GTCCTGCTGC ATAGGTGGCG CTTTCTCTGT CCTTATATGG TGTAGGGGGA GGAAGCGCCC 420 TGGGGCCCCC TCATCAGGTA CTGGTCCCAT TCTTGAGGCT CCACCCTGAT GACCTCATCG 480 CATCCCAAAG GCCCCACCAC TAACCCATCG CCTTGGGGGT GAAGATTTCA ACACTGGAAT 540 TTCAGATTCA GACCCCAGCA CTGAGTGCAT GAGTGCACGC TTCTGTGTGT GCACAAGCAT 600 GAGTGCAAGT GCATGACTGT GTCCACGTGT GTGTGCATGT GAATACCTGT GTGTGCAGGT 660 GTGTATGCAA GTGTGTGTGT GCATGTGAAT ACCTGTGTGT GGGGGTGTGT GTGCACAAGT 720 GTGTGTGTGT GCATGTGAAT ACCTGTGTGG GGGTGTATGT GTGCAAGTGT GTGTCCGCGT 780 GCATGTGAAT ACCTGTGGGA GTGTGTGTGC ACGTGTGCAC ATGCGTGTGA ATACCTGTGT 840 GTGCGAGTGT GTGTGAGCTC AAATGCTTGT CTGTGTGCGT GTGTCTGTGT GTGCAAGTGT 900 GTGCCGGTGT CTGCATGGGC ATGCAGCAGT GTGTGTGCCT GTGTGAATGT ACATGTACGA 960 GTGTGTGCCT GTGTGTGCAT GTATGTGTGC CTCTGTGTAC ATGTATGAGT GTGCATGTGC 1020 GTGTGTGCGT GTATGAGTGT GTGTGACTGT GAGTGTATGT GTGTGTGCCT GTGTGAGCAT 1080 GTATGAATGT GTGTGCTTGT CTGAGTGTGC GTGTATTGGT GTGTGCGTGC CTTTGTGTGT 1140 GCGTGTGTAT ATGCCTGTGT GTGTGCATGT ATGAGTGTGT GTGCCTGTGT GCATGCCTGT 1200 GTGTGCATGT ATGTCTGTGT ATGTGTGTGT ATGTGTGCGT GCCTGTATGT CTGCCTGTGT 1260 ATGTGTCTGT GTGCGTGTGT GTGTGCATGT ATGTGTGCCT GTGATCATGT ATGTCTGTGT 1320 GTGCCTGTGT GTGTATGCAT GGAGTGTGTG TGTGCGTGTA TGTGTGTGCG CGTATGAGTG 1380 TGCATGCCTG TGTACGAGTG TGCCTGTGTA TGTGTGCATG TCTGTGTGTG TATGTGTGTA 1440 TGAGTGTGCG TGCTTTTGTG CACGTGTGAG TGTGGTGCCT GTATGAGTGT ACGTGTGCCT 1500 GTGTATGCAT GTGTGAGTGT GCGTGTATGA GTGTGTGTGC CTGTGTATGT GTATGAGTGT 1560 GCATGTCTGT GTGTGCATTA GTGTGTGTGC CTGAGTGTAC ATGTGTGTGC CTGTGTGTGC 1620 GTGCATGTAT GTGTGCACAC ATTGTGTGTG TGCGTGTATG TGTCTGTGTA TGAGTGTGCA 1680 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GGCGGTGTTG GCTGGCGTCC CTGACGGCCA CGCTCCTTGC 5920
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