EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-25408 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr3:58033420-58039980 
SNPs
Number: 5             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11707429chr358033834hg19
rs12494328chr358035497hg19
rs858215chr358036811hg19
rs732527chr358036935hg19
rs732526chr358036962hg19
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr3:58033864-58033874ACCAATTAAC+6.02
KLF4MA0039.3chr3:58037766-58037777CCACACCCTGC+6.62
NFE2L1MA0089.2chr3:58038185-58038200ATGGCTGAGTCATGT-6.2
NKX2-3MA0672.1chr3:58034318-58034328TTCAAGTGGT-6.02
NR2C2MA0504.1chr3:58033638-58033653TGACCCTTCACCCCC-6.01
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58037833-58037848TGAACTCCTGACCTC-6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58035975-58035990TGAGCTCTTGACCTC-7.23
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58033509-58033524TGAACTATTGACCTC-7.41
PLAG1MA0163.1chr3:58039738-58039752GGGGCTTAAGGGGG+6.59
RARAMA0729.1chr3:58033506-58033524TCGTGAACTATTGACCTC-6.16
ZfxMA0146.2chr3:58035998-58036012CCCGCCTCGGCCTC+6.01
ZfxMA0146.2chr3:58039432-58039446CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00762chr3:58032174-58039716Adipose_Nuclei
SE_01957chr3:58034706-58035838Aorta
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SE_01957chr3:58037976-58039178Aorta
SE_23194chr3:58034815-58035733Colon_Crypt_1
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SE_30574chr3:58034058-58035832Fetal_Muscle
SE_30574chr3:58036943-58038968Fetal_Muscle
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SE_37989chr3:58025669-58040227HUVEC
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SE_41579chr3:58036203-58037368LNCaP
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SE_45969chr3:58032377-58039419Osteoblasts
SE_47269chr3:58019885-58040171Panc1
SE_56289chr3:58032310-58039346u87
SE_64106chr3:58033450-58035902HSMM
SE_64106chr3:58036259-58039158HSMM
SE_65730chr3:58034390-58037100Pancreatic_islets
SE_65730chr3:58037283-58039024Pancreatic_islets
SE_67942chr3:58032310-58039346u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 7             
ChromosomeStartEnd
chr35803351558034395
chr35803500658035314
chr35803683758037638
chr35803799458038685
chr35803814758038335
chr35803760058039400
chr35803950458039783
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058046chr35803243758041425
Enhancer Sequence
CTCCTGAGTA GCTGGGATTA CAGGCACGGG CCACCATGCC CAGCTAATTT TTGTATTTTT 60
AGTAGAGATG GGGTTGGCCA AGCTGGTCGT GAACTATTGA CCTCAAGTGA TCCTCCTGCC 120
TCAGCCTCCC AAAGTGCTAG GATTACAGGA GTGAGCCACC ATGCCTGGCC ACATGCGTGT 180
TTTTTATTGA ATCATTTGAA AGTACTCAGC TCGTATCATG ACCCTTCACC CCCACATACT 240
CCAACAAGCA TCTCTAAGAA AAAGGACATT CTCCTAACCA CAGTGTCTCT GCATTCCCAG 300
GACATTCTTC TAACCACAGC GTCACTGCAT ACCCAAGAGG TTAGCACCGA TACAGTAATA 360
ACATCTTGTG TAAAACTTCC CAAAATGCTC CCAAGTGTCC TTTATGACAG TTTAAAAAAA 420
AATGGCATTT TTTGGGATCC AGGAACCAAT TAACGATTAC TCAATTGAAT TTGGTTTCAA 480
AGTCACATAC CTCAACTTTT CCTTTAATCA AGAACAGCCC CCCTGCCTTT TACACATTTT 540
TTTGTCTTTC GTGACCGTGT CATTTTTGAA GAAATCAGGC CCGTTGTCTT GTAGAACTGG 600
TGTTTCTCAA GTGTGCTTGG GAGGGTCTTG GTAAAATGCA CATTCTGATT CTGGAGAACA 660
GGGTGGAGCC TGGGAATCTG CATTTCCAGC CAGCATCCCG GTGATGCCAG TGCAGCTGGT 720
CTTCGGCTGT AGAATGTTCC ACATTCTAGG TCTGTCTGTT TCCTTGTGAT TAAATTCAAG 780
TTGAATATTT TTGGCTAGGG CACTTCCTGA GGTCATAGGT ACTTCCCACT GCCTCACAGC 840
ACAGGCTCAC AATCTCAGTT TGTCCTGTTA CTTCGTGGTG CTAAGTGTGG TCACCTGCTT 900
CAAGTGGTGT CCGCCTGCTC TCTGTTGAAA CAATACCTTT CTCCTAGTAT AATGATTAGG 960
TAACCTGTGA TTGTAATTGG TAAGTAATCT TTGAGACTAC ATGAATATCC TGTTCCCCAG 1020
CAGTTTTCAC TCATTGGTGA ACTGTTTTGG GAAAAATAAT AGCATCTTAC AGTTATAATA 1080
CCCTGCTGGT AACACATGGC TCTTACATAA TCAGCAGTTA ATTGTTTGTA TGTGTGTTAA 1140
TTTTTATTTT TAAAATGTAA CTAGTGACTG GTAACTCTCA TTTGTATTTT AAACATTGGC 1200
TTTTACAGCT TCTCAGTACA TTTCACTCTG TGTATGTTTT TGGTAGAGCA TTTGTTGTCC 1260
TGTATAATGG TTTAGGAAAT CCTATAGGCC AAATGAAGGG CTGGAGACTC ACCTGTGTTC 1320
CCACCACTGT GTTTCACTGT GTATTGCCAG AGAAAATACA GTTAAATTTG AATTTCAGAT 1380
AGACAATGAA TAACTTTTTA GTATAAGTAT GTTCCAAGTG TGGCAGACAG CTCTCACAAG 1440
TTACAAGTCG TTGCGTAGGA CATACCTATG CTAAACGATT TGATGTTTAT CTAAATTAAT 1500
ATGTAACTGA TATCTTGTAT TTTTATTTGT ACGATCTTCC AAGCCCACGT CCCACCGCCT 1560
TCTCGGGGAT GGCCACCATT TGTGTTTGCT GCCTGGTGGT GTTTGCAGCT GCGAGAAGGG 1620
CCTTGGAGGA GGAGCAAAGT GTAGTGGTAT CTCCGTGCTG TGGCCTTGGG CACTGGGGTG 1680
GGGGTTAGAT GAGTAATTAG CTGAATATGA CCTCACCCAT GAAGAATGTG CCCTTGCTAG 1740
GTATTAGCAG AGGTTTAGGC TCCAGGGAGC CATTGTCAGA AGCTTGTCAG TGATGTCATC 1800
AGCTGGAAGG GCCAGCTTTC AGGCCTCAGG AAAAAGCTTG AAAGTCAGGG CTCCAGTTTT 1860
GGTAATAAAT GGGAATGGAG TTTCACAGGT AGGGTGTGGA GGAATTTATT GTGACAGGAA 1920
GCCTGATGGA GCCTCTTGCC TGTGTGCAGC CCCCAGCCAG GTTTCTGAGT TCTGATGAAC 1980
TACCAGAAAC TTCCACCACG GCCTGTGATT ACACTGTTGG CCCAATGCCC TGGAAAAATT 2040
GGCTTGCTCT CGGGGAACAC TCCAGGAGCT GCAAAGGGGG TGTCAGGACT GTTGTGCAGC 2100
TCCCCTTAAA TTGGGGAGGA GGGGTGGCTG ATGTGGAAAC TGTTCATTAG ACTGCTCAGG 2160
GTAGTGTGAG AAAACGTGTA ATCTGTGGGC ATCTACCCCT AGCTGCCCCT CTGATCTCAC 2220
CCACTACTGT GGGAGGACCC CGTGGATGGG GGCAGAGGAG GGTCTTCTGG ATTTAGACAC 2280
TCACAAAACT TCCTTTTACC TTGTTCATTG GAAGAAATAG AAAATGCCTT TTTTTTTTTT 2340
TTTTTCTTTT TTTTTGAGAC AGAGTCTCGC TCTGTTGACA GGCTGGAGTG CAGTGGCATG 2400
ATCTTGGCTC ACCGCAACCT CTGCCTCCCG GGTTCTAACA ATTCTCCTGC CTCAGCCTCT 2460
GGAGTAGCTG GGACTACAGC CACGTGCCAC CACACCCAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA 2520
CAGACGGGGT TTCACCATGT TGGCCAGGAC GGTCTTGAGC TCTTGACCTC GTTATCCACC 2580
CGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC AGGCGTGAGC CACCATGCCT GGTCTCTTTT 2640
TCATTTTTAA AGGGTAATTT GCTGTGCAGG AGTGGGCTCT CAGACCAGAA GTGGGGACCT 2700
GAATGAAATC AAGGACTGAG TATGGTAACT ACAGCCATTT AATTTTATTT GAAGTCTCCC 2760
GTAAAATGTT CTGGAAAAAA CAGGGGTTCC AGGGCTGGGT GGGCAGTTTC AATCATGGAC 2820
TGGATTTTGT GGTTCAGATT TCTCTGGGCC TGTTGGAGGT TCCCCTTAAG CAATTACCCA 2880
AGGCAGTTCT GCCCAGCTGA AGTACTGATT ACCTGCACAC TATACCAGTG AGGACTCATG 2940
GGTGAGCAGA TGGGAGGCAC TGAGCTTGAT TCTGAAACCC TGGCCTCCAT CCCACCTGAC 3000
ATTCAATGTC AGATTAGAAT TTGGAAGACC CTAAGTCTCC AGATTGGTGC ACTGGGTAGC 3060
TCCTGAAATG GGGTGGCTGA GACAGGTCCT CTGTGCCCCC TTCCACAGCT TCCTCTGGGG 3120
CCCTTCTGCT CACTGGCATG TGCTTCTGGG CAAATAGGCC TCTCCCAGCA TTTGTTTTGG 3180
CTCTGTGAAA TGGGGTAATA TTTGTTCCTA TTGCGGGTGA AGCGCTGCTG TTGGGATGCT 3240
CAGGTAACTC ACTCCGTGGG TAGCTGATAT TGCCTGGGCA AGTGGCATTT TAGAGGAAAT 3300
CTGTGCCATC AAAAGAGTTG GACCTGATCA CACTTTTGCT TTTGAATATG CTTTGTCCCA 3360
GCCTGGCCAT TCGTCACTTG GGACCCCCTG AGTCTCTCTG ACCCCACTGT AAAATGGATA 3420
TGCCATGGAG TTGTCCCAGG AATCAAGGGC AGGTCCTCTC CAGTGAGTGA TGGGCTTGCC 3480
TCTCACTTCT CTAACACCCT TCTGCTTCCT TGTGTAAGAT TTCACTATTA GTGGCTATTC 3540
TCTTTTACAG AAGAAAAAGG GAGACGCATG CCTCTTCCAG TTCACTGTTC ACCATTGCAG 3600
CATATTTATT CCAAGGGACT GGCCGAATCA TCCCTTTCTT TGTTAGAATG TGGTTTTGTT 3660
GCCTTGAGAC AAGTGGCCCG CATGTCTGCA CTGAAGGAGG CTTTGCGCAA TAGCCTTGGG 3720
CACCTCCGGT TCTGCAAGCA TGTACAGTAC TTGCTCTCCT TTCCCTTTCT TTGTATACTT 3780
TTTCTGGTCT GCTACGTGTC CATCTGCATG TGGATAAAGG GTCGTCGTCT TGAGTAGTGA 3840
TTTTGCTGTG ATGTGATTCC TGTGAGGTCT AGTTGCACAC AGTGATTCCG AAGGTAGACC 3900
CAGCTGGAAA GCTTTTAAAT TGCTGATACT CCAGCCCCAC TCCCCAAGAG ATGCTGATTT 3960
TGTTTTGTTT TGGGGAGGGC AGTTTTTTTG GGTTTTTTTT TTAAGCTTTT TGATGTGTAG 4020
CCAGGGTTGA GACTGAAGTG ATTTTTGTGA GTAACGGAGA AGTGTTAAGG CTTGAGAAGT 4080
TGGAAGAGCC ATGCTTGAGA TAGGACCAAG GTCATATCCC CGGCATTAGC ACAGAGCAAC 4140
CCTGACCTGT TGGAGAGTTG GGCTGGATGG ATGCGGTCAG GGGAGAGACT CGCTTTATTT 4200
TATTTATTTA GAGATACAGT TTCACTCTTG TCACCCAGGC TGGAGTGTAA TGGCACGATC 4260
TCGGCTCACT GCAACCTCTG CCTCCTGGGT TCAAGTGATT CTCGTGCCTC AGCCTCCTGA 4320
GTGGCTGGGA CTCCAGGCAC GCGCCGCCAC ACCCTGCTAG TTTTTGTGTT TTTACTAGAG 4380
ACAGGGTTTC ACCATTGTTG GCCAGGCTGG TCTTGAACTC CTGACCTCAG GTGATCCGCC 4440
CACCTCGGCC TACCAAAGTG CTGGGATTAT GGGTGTGAGC CACTGTGCCC AGCCTCGACT 4500
CGCTTTATTA TATCCACACT TGGAATACAA TTCGGATTGA TTGTAGTGGG GCATTTTATA 4560
ATTAGGAAAA ATTAATCAGG AAAAATCACT CCATGTAGAT TAGTACCACC ATATGAGGGG 4620
ACAAGAATTT CTTCAGATTA GGAACTTCTT CCAACAGGAC TGACAGGGTC CAAAACTACT 4680
CTTGGATCCA GCTTTAAGAT GGACCCAGCC CACTGTTGAG TCCCCTCTGA GGTCTTCTCT 4740
CTGTGGATGG ATTTGATTGT TAACAATGGC TGAGTCATGT GGCACCCAGC CCGGTGAGTA 4800
AGACAGCTGA GTAAGAGGGG AAACAGGGCC TTTGGTCAGA AAAACCAGAC TGACTTCAGT 4860
CTTATCTGTT TAGAGAAGCC CCAGAAGCTG CAAAAATTGC AGCTTCCAGA CTTTAGTGTG 4920
CCGTGGTCAT GACATCGGTG TGGATGGCAG GTTGTCATCT GAGCAGTCAG GGTGGCAGCA 4980
CACAGCTTGC GGGCTGGCTG ATGGCCGAGG TGTGTGAACT GACCTGCCCC AAGTGACTTC 5040
AGTGCTGGGC ACAGCATAGG AGCAGTACTA ATGATATGGA CAGTATGCTC AGAGGACGTT 5100
AGGGAGCACA GCTTTGTGTA AAGGGCATGC CCTGCCCTGT CCGGATTTAA AGCAGCTATA 5160
GCACTGAAAC CCCATGGTCA CCCTCGCATT TCTACACTTC TGCCTGTGCC AAGTCTAGTT 5220
TGTGTGCCTC CTCCATTTTG TGTGTACATG GGGGTATTTT TTTCTGCTAG GCAACTGCTA 5280
TTTATGCCTC TCAGTACTGT ACTTAGTGTG TACCATTCCT GCAAGGTATA GACATTGTCA 5340
GCCCATTTTA CAGATGAGGA AAATGGAGTT TTTGAGAGGG TGAGATCATT CAGTGGCAGA 5400
ATGGAATGTT AACCCAGGTA GTCTAACCTC TCTGCTGTAG ATCTGATGTC CATTTGAACT 5460
TTAGACTTCC CATCTGTGTC TACAGTCTAG CCCTTAAAAA ATGTGATAAA CAGGTTTTTA 5520
GGTAAGTCTG TTAATTTCAG AAAGACATTA TTATTATTTT TTAGAAAGTT AGAGCTTATG 5580
TTAGGGCTCA GTCTATCCTC CTGCCTCAGC TGCCTGAATA GCTGGGACTG CAGGCACATG 5640
CCACCATGCC TGGTTAATTT CTGTGGTATA CATCATTGAT TACTGAGAAG TCACAGTCCG 5700
TTGTTAAATA ACTGAGCTAT TCATAGCCAA ATCATTTTTA AAAACACAAA TATAAGCAAA 5760
AACAAAACAT TTATTTATTT ATTTATTGAG ACGGAGTCTC GCTGTCACCC GGGCTGGAGT 5820
GCAGTGGCGC TATCTCAGCT CACTGCAACC TCTGCCTCCT GGGTTCAAGT GATTCTTCTG 5880
CTTCAGCCTC CCCAGTAGCT GGGACTACAG ACACCCACTA CCATGCCCGG CTAATTTTTT 5940
TTTTATTTTT AGTAGAGACA GGGTTTCACT GTGTTAGTCA GGATGGTCTT TATCTCCTGA 6000
CCTTGTGATC TGCCCGCCTC GGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGACGT GAGCCACTGT 6060
ACCTGGCCCA AACATGTGGT TTTTTTAAAT GAAAGTGTGT TCATTTTACA AACAGTGCAT 6120
TCTTACTAAT TTTACAGGCC CTGTGCTAGG GACATGGCCT CGTCTTCCGC TATCTTAGAG 6180
TGAAGAAGTA AAGACAGAGA AAGTGTTCAC AAGTTGCTGC ACAAGTCTCA TTGCAGTGCC 6240
TCCCAGAGGC GCGAAGAGCA ACACCTTTCA CCTGGGCTGT CCTAGAAGGC CCGTGGCAGG 6300
GTGGGGTTGG TGAACACTGG GGCTTAAGGG GGTGAATTCA GAAGACAAAG GACCTTCTGG 6360
GCAAAGAAGG GCCCAGTAGT GGGAAGTGCA GGAGTGTGAG AGTGCCTGGA ATTGCCCACT 6420
CACTGGCTCT GGAGCTTGGT GCTGAGTGCT TGGGAAGTGT TGGGAGGATC AGTTATATTG 6480
CTGGCTGGGT TCTAAAGAAC CTCCAAAGTT TACATAAAAG TTACCTTTGA TTTGACTGTT 6540
CTACCCTCCA GTCACGTGGC 6560