EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-24225 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr22:38284790-38292150 
Target genes
Number: 42             
NameEnsembl ID
RAC2ENSG00000128340
MFNGENSG00000100060
CARD10ENSG00000100065
CDC42EP1ENSG00000128283
LGALS2ENSG00000100079
GGA1ENSG00000100083
SH3BP1ENSG00000100092
Z83844.1ENSG00000233360
PDXPENSG00000241360
Z83844.2ENSG00000241333
LGALS1ENSG00000100097
NOL12ENSG00000256872
TRIOBPENSG00000100106
H1F0ENSG00000189060
GCATENSG00000100116
ANKRD54ENSG00000100124
EIF3LENSG00000100129
MICALL1ENSG00000100139
POLR2FENSG00000100142
C22orf23ENSG00000128346
SOX10ENSG00000100146
PICK1ENSG00000100151
RP5ENSG00000233739
BAIAP2L2ENSG00000128298
PLA2G6ENSG00000184381
MAFFENSG00000185022
AL021977.1ENSG00000256873
RP1ENSG00000251267
TMEM184BENSG00000198792
CSNK1EENSG00000213923
RP3ENSG00000244627
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DNAL4ENSG00000100246
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CBX6ENSG00000183741
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ELF5MA0136.2chr22:38289745-38289756TACTTCCTGGT-6.02
ESR2MA0258.2chr22:38289091-38289106GGGTCACACAGACCC+6.05
LMX1BMA0703.2chr22:38292058-38292069TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr22:38292055-38292068AAATTAATTAAAT+6.07
PHOX2AMA0713.1chr22:38292059-38292070TAATTAAATTA-6.62
PPARGMA0066.1chr22:38289088-38289108TCTGGGTCACACAGACCCAG-6.27
PPARGMA0066.1chr22:38289089-38289109CTGGGTCACACAGACCCAGT+6.37
PROP1MA0715.1chr22:38292059-38292070TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr22:38292059-38292070TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr22:38292059-38292070TAATTAAATTA-6.62
RARA(var.2)MA0730.1chr22:38285457-38285474TGAACTTTAAATGACCT-7.22
RORAMA0071.1chr22:38285656-38285666ATCAAGGTCA+6.02
SOX10MA0442.2chr22:38286930-38286941TTCTTTGTTTT-6.62
ZfxMA0146.2chr22:38285865-38285879GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04600chr22:38287058-38291812Brain_Anterior_Caudate
SE_05142chr22:38287060-38291873Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06080chr22:38287022-38295602Brain_Hippocampus_Middle
SE_07277chr22:38287062-38295791Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08604chr22:38287134-38291844Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_26751chr22:38285393-38286304Esophagus
SE_26751chr22:38287434-38290443Esophagus
SE_26751chr22:38290469-38291873Esophagus
SE_31539chr22:38287927-38290438Gastric
SE_31539chr22:38290474-38291862Gastric
SE_37571chr22:38287059-38296036HSMMtube
SE_43374chr22:38288549-38290325Lung
SE_43374chr22:38290731-38291802Lung
SE_54741chr22:38285141-38286198Stomach_Smooth_Muscle
SE_54741chr22:38287040-38291815Stomach_Smooth_Muscle
SE_64673chr22:38290485-38291861NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr223829060038291750
chr223828800338288511
chr223829076438291741
chr223828944838290170
chr223828613538286185
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH22I037886chr223828263938284896
GH22I037889chr223828514238286304
GH22I037891chr223828735338296249
Enhancer Sequence
CCAGGCTGGA GTGCAGTAGC GTGATCTCAG TTCGTTGCAT CCTCCGCTGC CCAGGTTCAA 60
GCAGTTCTGC CTCAGCCTTC CAAGTAGCTG GGATTACAGG CGTGTGCCAC CACACTCAGC 120
TAATTTTTGT ATTCTCAGTA GAGATGGGTT TTACCATGTT GGCCAGGCTG GTCTCGAACT 180
CCTGGCCTCA AGTGATTCGC CTGCCTTGGC CTCCCAAAAT GTGCTAGGAT TACAGGCATG 240
AGCCACCACG CCCCGCCTAA ATTCAAAATC TTTTTGTTTT TTTTTAGACG GAGTCTCACT 300
CTGTCGCCCA GGTTGGAGTG TACTGGCGCG ATCTCGGCTC ACTGCAAGCT CCACCTCCCA 360
GGTTCCTGCC ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC CAAGTAGCTG GGACTACAGG CACCCGCCAC 420
CATGCCCGGC CAATTTTTTG TATTTTTTAG TAGAGATGGG GTTTCACCGT GTTAGCCAGG 480
ATGGTCTCAG ATTTCCTGAC CTCGTGATCT GCCCATCTCT GCCTCCTAAA GTACTGGGAT 540
TACAGGCGTG AGCCACCGTG CCCAGCCCTA AATTGAATTC TTAAATCCCT CTTGTTCATA 600
AAGCAGTATA TTTGGTTTAC AGGACATTTT CACGTTCAGT ATTTTGTTTG TGCGTCACAA 660
GATCCTATGA ACTTTAAATG ACCTATAATT TTCATGACAT ATTTGTGGCA GTGCTGGGTC 720
CTGGAAGGAA ACTATTGAAC ACCTCCTACT GCCAGGAACT GTGCAAAGAG GGATCCATAT 780
ACATTACTTA CACCTTACAA CTCAGGTTTA GTAGTAGTTC CTCATCTTAT TGATGAGGAA 840
ATGAACCCAC AGTAGTTAGT GACTTGATCA AGGTCACATT AGGCAGCTGC TGGAGCTGAG 900
CTAAATGGTT TCCTGCCTAC CCACAGTATT AATGCTATGC CTGTCACCCT ATAGTGGGTA 960
CTTGGACTGG AAGCCCCTGC TTGCAAGTTG TCTCACATCT CTGCCTGGTT CCTTGTATAT 1020
AAAATAAGGT TAGCAGGCCA GGCGCGGTGG CTCACGCCTG TAATCCCAGC ACTGGGAGGC 1080
CGAGGCGGGC GGATCACAAG GTCAAGGAGA TCGAGACCAT CCTGGCTAAC ATGGCGAAAC 1140
CCTGTCTCTA TTAAAAATAC AAAAAAATTA GCCGGGCGTG GTGGCGGGCG CCTGTAGTCC 1200
CAGCTACTCG GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT GGCGTGAACC CGGGAGGCGG AGCTTGCAGT 1260
GAGCCAAGAG ATCGTGCCGC TGGACCCCAG CCTGGGTTAC AGAGCGAGAC TCCGTCTAAA 1320
AAAAATAAAA AATAAGTGTA GCAGAACCTG GCTCACTGGG CAGTGGTGAC GAATAAATGA 1380
GAATGCTATT TTGAGTGCCC AGTGCAGTGC CTGGCCTATA ATGGATGTTC AGTTACTGTT 1440
TCCCCACACT TGGAATTCGT AAGCTTTTCA GTATGCTCTT TTTCCCCATT GGTTTGATAA 1500
TTATTATTGG GAACTGAATG GTGGTTCCCA AGAAGACATG TCCATATCCT AAGCCCTGGA 1560
TGCCATCAGC ATGACCTTAT TTGTTTGGCT GGCATGCAGT GGCACGATCT CTGTTCACTG 1620
CAACGTCTGC CTCCCAGGTT CAAGCTATTC TACCTCAGCC TCCCAAGTAG TTGCATGCCA 1680
CCATGCCTGG CTAATTTTTT GTATTTTTAT TTTTGTTTAT TTTTTTGAGA CAGAGTTTTG 1740
ATCTTATTGC CCAGGCTGGA GTGCAATGGC GCGATCTCGG CTCACTGCAA CCTCCGCCTC 1800
CGGGGTTCAA GCGGTTCTCC TGCCTCAGCC TCCCAAGTAG CTGGGACTAC AGGTGCACGC 1860
CACCACGCCT GGCTAATGTT TGTAGTTTTA ATAGAGACGA GGTTTCGCGA TGTTGGCCAG 1920
GCTAGTCTCG AACTCCTGAC CTCAGGTGAT CTGCCTGCCT CAGCCTCCCA AAGTGCTGGG 1980
ATTATAGGCG TGAGCCACTG CGCCTGGCTT TTTGTATTTT CAGTAGAGAC TGGGTTTCAC 2040
CATGTTGGTC AGGTGGGTCT CAAACTCCTG ACCTCAGATG ATCACCCATC TCGGCCTCCC 2100
AAAGTGCTGG GATTACAGGC ATGAGCCACA GTGCCCGGCC TTCTTTGTTT TGTTTTTGTT 2160
TTTGTTTTTG AGATGGAATC TCGCTCTGTC GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG GTGCAATCTC 2220
AGCTCACTGC AACCTCCACC TTCTGGGTTC AAGAGATTCT CCTGCCTCAG CCTCCTGAGT 2280
AGCTGGGACT ACAGGCACCA TTTCTCCTGC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGACTACAGG 2340
CACCCACGAC CACACCTTGC TAATTTTTAT ATTTTTTTAG TAGAGATGGT ATTTTGCCAT 2400
GTTGGCCAGG CTAGTCTCAA ACTCCTGACC TCAGGTGATC TGCCTGCCTC AGCCTCCCAT 2460
AGTGATGGTA TTACAGGCGT GAGCCACTGT GCCCAGCCAG CATGACCTTA TTTGGAAGAA 2520
GGTCTTAATG GTTGTAAGTT AAAGATCTCA AAATTAGATC ATTGTGCTTG CTTTAGCAGC 2580
ACATGTACCA AAATTGGAAT GATGCAGTTT AGCATGGCCC CTGTGCAAGG ATGACATGCA 2640
AATTTGTGAA GTGTTCCCAT GTATTAAAAA TACATTTTTA AAAATGAGAT CATTCTGGAT 2700
TATCCAGGTA GGCACTAAAT CCAATGACAA GTGTCATGAG AGACACTGAG GAAAGAGACA 2760
GGAGGAGAAG GCCACGTGAA GACAGGCTGA TGGAGTTAGC AGGCACAAGC TAAAGAATGT 2820
GCGGGGCCAC TGGGAGCTGG AAGAGGCAGG GATGGCTTCT CCCCTGGAGC CTCTGGTTTT 2880
GGACTCGTGG CTTCTGGAAC CGTAAGAGGA GAAATCTCTG TTGTTTAAGT CCCAAGTCTG 2940
TGATAGAGCA GCCCCAGGCA GGAATTGAAT GCATTGCCTC CTGTGTATCA AGCCATTGGA 3000
GGATTCAGGG ACAGAAAGCT GGGTCCTTTT CTACGAGCAA ACCAGCCAGG CACTGATAGG 3060
CAAGGGGGAA GTCGGGACGT GGGAAAAGAC CGAATTCCTG TCTTCAGACT CAAATTCTAA 3120
TGGTTGAAGA CAGGTGATAA GCCATATTTA GTGTGTTGGA TGGTGGTATG TGTTGTAGAG 3180
AAAAATCGAA GGCAGGAGTT TCTATTGTGA ATAGGATAGT CAGGGACCAC ACTGATTGGC 3240
GTCATTTGAG CAGAGACCTG AAGACATTAG GAGGGGGATG GTGCAAGTAT GTGAGGCAAG 3300
AGCTCTCCAG GAAAAAAACT GCAAGTACAA AGGTCCTGAG GCCACAGCAT GTTTTATATG 3360
TGGAGCAAAT GGAGCAAGAA GGCCAGCTGG AGCAGAAGGT AGCAAGGAGG AAGAGGCCAG 3420
ATCCTGGAAT GAGGCTCCAG GTTGTATGTA AGGCCTTGTA GAAGACAGGA AGGACCGACT 3480
TTGAATCTCA GTGAGGTGGG AAGCCATCCT TCACCAGAGA GGTTGCAGAA CTTGTCCAAG 3540
TTCCCAGAGC TAAAGGATGG AGCCAGGATT TTATTTATTT TTTGGGACAA GAGTTTCGCT 3600
CTATTACCCA GACTGGAGTG CAGTGGCACA AGCTTGGCGC ACTGCAGTGC AACCTCTGCC 3660
TCCTGGGCTC AAGTGATCCT CCTGTCTCAG CCTCCAAATT AACTGGGACC ACAGGCATAC 3720
ACCACCATGC CCAGCTAATT TTTTATAGTT TTGTTTGTAT AGATGGTGTT TTGCCATGTT 3780
GCCCAGACTG CTCTTGAACT GAGCTTAAGC AGTCCACCTG CCTTGGCCTC CCAAAATGCT 3840
GGGATTATAG GCATGAGCCA CTGTGCCCGG GCCCAAAGGA ATTTTTAAAA AGCAGCCTCT 3900
AGTTATAAGT CCAAACATTT GTAGAGCTCT TGGTAGCTTT CCAAGCCGTC CTTCATCTGT 3960
TGCCTTGTTG GAACCGAATG AGTGGCCCAG TGCCAGCCAG GGCTCCTTAC CCCCCACTCC 4020
CTGGCTACCA CATGGTTCCT TGGTGCAGGG AGGTTGCTGT GCATTGATTC CTCCTAAAGA 4080
ATGTCTCATG CTTTGTCCAC TATGCCCTGA CATTTGGTGA TGGTGGCTTG CAGGAACTCC 4140
GACTCAACTG GGCAGCCCCC TGGGTTAATG TGTTTTGAAT TCAATGCCAG TTTCATAGTT 4200
CATGTCATAG TTCTCTATCA TTACAATTAT GCCAGGTCCA AGTGTGTTGT CTGACACGGC 4260
TCTTGGCACT CTTTTTGCTG TGAGGCCATT GCAGGCACTC TGGGTCACAC AGACCCAGTG 4320
TGTATGAGTG CCTGGCTTGG GGCCATCTCC CAGCAGCTTG GTCCAGGCTC AGCAGCCAGG 4380
CCAGGCAGCT AGCAACCCCT GTGAGGGGGC AGGCACAGCT GGACTCTGCC TGGCACCACT 4440
CGCGGAATGC ACAGCATTCA TCAGCTGTGG CCAGCTCAGG ATTTTTATTC CATCAGAGCA 4500
GAATAACCAG GTTCATGATC CCCCCCATGC TAAGGAGAGC AAGGGCTTTG TTATCGGGGA 4560
ATGGGGAGCT CTGGGTGGTA CCAGTTTCCA GAAGTTTCTC CACCAGCAAG AGAAGGGGGC 4620
AGAGCAAAGT GTGTAGGCTT GGACTTCCTT GGACCCTGGT CTGAGTCCTG ACTGCCACAT 4680
ACCAGCTGAG CCAAGTTGCG TAGTTTTCAG TGCCTCACCT TTCTCTAAAA TGGGGTTAGC 4740
GCCTGCCTCA GAATTGTTCT GTGCACCAAA TTATGTAAAG TTCTTAGCAA ATCACCTGGC 4800
AGTAGTGTGT GATAAGGGGA GGAGGGCCTT ACTAAAACAC TTGGGTAGAG TGTGTGATAA 4860
GGGGAGGGAG GCCATTGTTA CCTGGCCATG ACCTTGGCCT CCAGAGCCGT AGAGCTATAG 4920
ATGACTGAGG CAGGTCATGT GTGGAACAGC CCGGCTACTT CCTGGTGGAG CTGGGACTGG 4980
AAACCTCCAG ACTCCCCCCT GGGGCTCTCT TAACTGCTCC AAGGACCAAA GAGAAGGCCT 5040
GTTTAGACAG TGTGGAGGCC CATTCACAGA GGCCAGGGCA CTTGTCTAGA GCAGCCAGCC 5100
ACGGAGGAGC TGGGCCCCAC GCACAGTGTC GGCAGCAGGC ATGAGGGGAG AATTGGAGAG 5160
ATTGGGAGGT TGCAGAGGAC AGGACTTGGA TGTGGCAGCT GAGTGGATGT GGAGGCTGTA 5220
GGGAAGTGAG ATGCCCAGTT CTCAGGCTGT CTGAGATGGG GGTTGGTGGC TGGAGCAGGT 5280
TTGGGACTGG AGGAGGTAAG TGCAAGTGGG TAAGGAACAG GAGTTTGAGG AGCCTGTGGG 5340
ACGTCCAGGT GGAGGTGCCC AGGGCCTAAC AATTTGGGCA GAGGCAATGA ACAGCTGGGG 5400
CTGGAACCCT GGTCTCCAGG CCCCTAGGCT AGAGCTGGTT CCTCCTCAGA CAAGTCCCTG 5460
GTGGGCTTGG CACACTTATT CTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTGAGATGG AGTTTTGTCC 5520
CTGTTGCGCA GGCTGGAGTG CAATATCATG ATCTCAGCTC ACTGCAACGT CCACCTCCCA 5580
GGTTCAAGCG ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGATTACAGG TGCCTGCCAC 5640
CATGCCTGGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA GAGACGGGGT TTTGCCATGT TGGCCAGGCT 5700
GGTCTTGAAC TCCTGATCTC AGGTGATCTG CCTGCCTTGG CCTCCTGAAG TGCTGGGATT 5760
ACAGGTGTGA GCCACTGCGC CCAGCCTGGG CTTGGCACAC TTCTTTCCAC ACAGTCCCCC 5820
TCTCTGCATC CTTCTCCTAC ACTGGATTGT GAGTCCAAGT TGGGGGCGTG GGGTGCTTTT 5880
CCTCCTATGA TCGCCTTGAC CATAGGTGGC TCCGGATGGC TTCATCTTCT AAATGAGGCA 5940
GTGGGACTAG CCGCTGTCTG GGGGCTGCAG CCCTGCATTC TAGAATTCTG GGTGACATCC 6000
TAAGGATCTA AATGGATCTA ATAGGAGGAA AGAGGCAGCA CTTGGGAGCA ATGACCCTTT 6060
CGGTAAAGCG ATTCTGTTGA ATGAATGGTG AATGCAAGAG GAAGTAAGTG AATAAGGATT 6120
GAATGCAACA ATATCAGTAT AGGAATAAGG CTGGAGTGTG CCTTAAATCC TGTCTGGAAT 6180
GTAGCGGCAC AGATGAATTG ATGAATGGAT GTACTCTCCA GCCCAGCCTT TAGCCAGGGA 6240
AAGCCGTGGT GCCCACGCTG GCTCTTGCTA ACAGTGGCCT CCCGTCCCCA CCCCCAGCCT 6300
GCCCTGCAGA CTGGATATAG GCTGGAGTGG CTGTGGCCCG GGTCAGGAAC TGGCCTCCAA 6360
TGTGGGGGAA GGGCATCAAG AAGAAGCTGA GAGGGAGGCA AGGGAAAGGT CCAAAGCCTG 6420
ATCAGCAAGT TCCTGAGATT TTCCCGAAGG AGAGGGCTAG GGGAAGCAGC AACTTGTCTT 6480
GGTTCCTGTG GCTCCACATT CCTGTCAAGC CTGCAGCTGA AAGACCTGGC TTTTCTTTCT 6540
TTCTGGCCCC ACCCTGCCCC TATCCAGCCA CTTGATTAAG ATCAAGTTAT CTCCTTCACG 6600
CCCTGACTCC CACCCCTACT TTCTTACCTG GGGCCAGTGG ATCCTGAGAG GGTGGACTTC 6660
ACTCTCTAGT CATGGTTGGG AAGTGGAAGG GAGTCTAGGT TCAAACCCTG ACGCTGCCCC 6720
TTGAAACTGG AAAATTCCAG GCACTTGGCT TAACTTCTCT GAGCCTCTGC TTTGTCATAG 6780
TCAAATGAGG AGAGTAATTC TCCCCTATCT AGGTCTTTCT AAGTGTCAAC ATAGGCCTGG 6840
CACAGTGGCT CATGCCTGTA ATCCCAACAC CTTGGGAGGC TGAGGTGGGA GGATTGCTTA 6900
GGCCTAGGAG TTTGAGACCA GCCTGGACAA GATAACGAGA CCCTGTCTCT ACAAAAATAA 6960
AAATAAAAAA ATGAGGGCTG GGCGCAATGG CTCACACCTG TAATCCCAGC ACTTTGGGAG 7020
GCCGAGGTGG GCAGATCACG AGGTCAGGAG ATCAAGACCA TCCTGGCTAA CACAGTGAAA 7080
CCCCGTCTCT ACTAAAAATA CAAAAAAATT AGCCAGGCAT GGTGGCAGGC GCCTGTAGTC 7140
CCAGCTACTA GGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TGGCGTGAAC CTGGGAGGCA GAGCTTACAG 7200
TGAGCCGAGA TGGCGCCACT GCACTCCAGC CTGGGCAACA GAGCGAGACT CTGTCCTAAA 7260
AAAATAAATT AATTAAATTA AATTAAAAAA TTAGCCAGGC GTGGTGGTGC ATGCCTATAG 7320
TCCTTGCCAC TTGGGAATCT AAGTCGGGAG GATTGCTTGA 7360