EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-24170 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr22:36745900-36750400 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSMA0476.1chr22:36747419-36747430AATGAGTCAGA-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr22:36749617-36749632TGAACTCTTGACCTC-7.64
RARAMA0729.1chr22:36749614-36749632TCTTGAACTCTTGACCTC-6.45
STAT1MA0137.3chr22:36747217-36747228TTTCCAGGAAA+6.62
Stat4MA0518.1chr22:36747217-36747231TTTCCAGGAAAAAA+6.02
Znf423MA0116.1chr22:36747665-36747680GCACCCCTAGGGTCC-7.34
Number of super-enhancer constituents: 71             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00116chr22:36744550-36773501Adipose_Nuclei
SE_00874chr22:36746686-36749897Adrenal_Gland
SE_01541chr22:36746469-36750065Aorta
SE_02243chr22:36745759-36746423Astrocytes
SE_02243chr22:36746448-36750080Astrocytes
SE_02896chr22:36746764-36749337Bladder
SE_03974chr22:36746265-36749101Brain_Anterior_Caudate
SE_05110chr22:36746539-36749052Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05865chr22:36745664-36749751Brain_Hippocampus_Middle
SE_05865chr22:36749883-36755979Brain_Hippocampus_Middle
SE_06839chr22:36746221-36749461Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07886chr22:36746444-36749406Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09195chr22:36744556-36774047CD14
SE_11020chr22:36744527-36785336CD20
SE_11868chr22:36746699-36749424CD3
SE_13866chr22:36746670-36747253CD34_Primary_RO01536
SE_13866chr22:36747411-36748155CD34_Primary_RO01536
SE_14476chr22:36746586-36749510CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15488chr22:36748215-36749371CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15971chr22:36748273-36748974CD4_Naive_Primary_7pool
SE_17339chr22:36744253-36756628CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17788chr22:36746596-36785463CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18286chr22:36744506-36778586CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19119chr22:36746443-36756379CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20220chr22:36746651-36747865CD56
SE_20220chr22:36747943-36749387CD56
SE_20975chr22:36746713-36747518CD8_Memory_7pool
SE_21957chr22:36747587-36749474CD8_Naive_8pool
SE_22328chr22:36744237-36746463CD8_primiary
SE_22328chr22:36746496-36750262CD8_primiary
SE_23071chr22:36746695-36749282Colon_Crypt_1
SE_23740chr22:36746710-36747692Colon_Crypt_2
SE_23740chr22:36748059-36749254Colon_Crypt_2
SE_24731chr22:36747992-36749185Colon_Crypt_3
SE_25782chr22:36745771-36749770Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26521chr22:36746510-36750054Esophagus
SE_27650chr22:36746600-36749232Fetal_Intestine
SE_28644chr22:36746606-36749313Fetal_Intestine_Large
SE_29722chr22:36746454-36749523Fetal_Muscle
SE_30956chr22:36746552-36747615Fetal_Thymus
SE_31378chr22:36746613-36749945Gastric
SE_35832chr22:36745691-36746433HMEC
SE_35832chr22:36746508-36749778HMEC
SE_36959chr22:36745856-36756423HSMMtube
SE_37948chr22:36745836-36771974HUVEC
SE_38863chr22:36746512-36750107IMR90
SE_40597chr22:36746441-36750092Left_Ventricle
SE_41574chr22:36746698-36749421LNCaP
SE_42094chr22:36746473-36749553Lung
SE_44196chr22:36746589-36749105NHDF-Ad
SE_44762chr22:36746525-36749737NHLF
SE_45604chr22:36744839-36756631Osteoblasts
SE_46902chr22:36746701-36749272Ovary
SE_47169chr22:36744668-36771991Panc1
SE_47463chr22:36746759-36749751Pancreas
SE_48566chr22:36746493-36749504Right_Atrium
SE_50050chr22:36746480-36749977Sigmoid_Colon
SE_51217chr22:36746200-36749792Skeletal_Muscle
SE_51217chr22:36749860-36754364Skeletal_Muscle
SE_51723chr22:36746666-36749232Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52340chr22:36746510-36749958Small_Intestine
SE_53283chr22:36746498-36750084Spleen
SE_54489chr22:36744394-36771971Stomach_Smooth_Muscle
SE_55761chr22:36746577-36749540u87
SE_58448chr22:36724049-36832686Ly1
SE_62244chr22:36719186-36785326Tonsil
SE_63497chr22:36746626-36749524HSMM
SE_64824chr22:36746894-36748868NHEK
SE_65307chr22:36746376-36749610Pancreatic_islets
SE_67526chr22:36746577-36749540u87
SE_68689chr22:36746643-36749506H9
Enhancer Sequence
ACAGATACAA AGGTAGCAAA GTAGCCACAC AGTTTGGGAG GATTTCCAAC AAAAACAGGT 60
TTCTAATCAG CCAAAAAACA CAACTGACTA CAACCCCACA TAGTGGAAGT TTCCAGTTTA 120
AAAAACTTGT TATTAGTTCA TGAAGTCAAC TAAGACAAGA GAAGAAAATA AAACATCAGT 180
ACATGTTGCC ACCAGATTTT AATTCCATCT TGATAATACA GCCCAAAAAA AGCACAGAGA 240
AAAGATGCCA GGTTCCAAGA AACATGGAGA ATGCTAAGAG TGCTTCCCTT TGGGGACACT 300
AAGGTCAAAA GTGACCCTCA CAATTCATGA GCCAAGAGAA CTTAAGTTCA TGTGTGTTTG 360
CTTTTTTCAA AACTCATTTG CAAAATGAAG ATATAAAATA GGCTGGGGAC ACTGGCTCAG 420
GCCTGTAATC CTAGCACTTT GGGAGGCCGA GGCAGGCAGA TCACCTGAGG TTGGGAGTTT 480
GAGACCAGCC TGACCAACAT GGAGAAACCC CGTCTCTACT AAAAATACAA AATTAGCAGG 540
GCGTGGTGGC GCATGCCTGT AATCCTAGCT GCTCAGGAGG CTGAGGCAGG AGAATCACTT 600
GAACCCAGGA GGCGGGGGTT GTGGTGAGCC GAGATTGTGC CATGGCACTC CAGCCTGGGC 660
AACAAGAGCA AAACTCCGTC TCAAAAAAAA GACATAAAAT AACAATGCCT TATATATCTG 720
TATGGTTTTA TAGTTTATGA AATGCTTTCA CACATATTTC GCTATCTCGA AAGGTCTTTG 780
TAGTAACAAC TCTGTAAACC AGGTAAGGTA TATATTATTA CCACCAATTT ACAGATGAGG 840
AAACAAGCTC CCTGGATGTA AGGGGCTTCT CCATAGTCAT CCAGTCCTGT GGCCTTTCCA 900
CGACTAACAC CATCGTTATT CCTGCTCAGA GGCGCAGGCT GGGATCACCT GAGGTGACTA 960
CCCTAGTGTA AAACTGACTC AGCTTGTGGC CACCAGAGGA GGCAGCCCAG AAGCTCACTG 1020
CCCAGCTCCC GCTGGGAAAT CAAGGAAGAT CAGGAAGGTT TTTTTTCCCT CTATGAGATC 1080
AAGCCCCCTC CCCTCAGGCC CCTGCAATCC AGGAAGTCCC CAGATCCAAA CACGGAACAC 1140
CATGGGCTTT TGTGCTTCCA GATTCCAAGA GGGACTTGGA TCCCAAGGAG GCTGGGGGCA 1200
TGGGAGGGAA AGAACAAAGG GAAAAATCTA GGCTGACCAG AACTTTTCAT CTGGGCTCAT 1260
TAGTGGTTTT CAGTCAAGGC CAAGGGGCTC CCCTGGACTC ACTCCAGAAG GGGCGGTTTT 1320
CCAGGAAAAA ACCTTTTTGC TGGCTCCCTT TCGCCAGGAG GGACACAAGT CCCAGGAACA 1380
GAGCTTGGCA GCATCACCAG CTTCCCCGGC CGGTGGCTCT GTTGACATTT CCCAACACAG 1440
GCAAACCCCA CAGACCCTTG TGGGGGCCAG GGGGCACATC CACTCTGCAA GGACCACCCT 1500
GAGAGCAGGC CGGGCTCAGA ATGAGTCAGA GCAAACAAGA CAGGAACGGT GGCTGTGAAC 1560
TGCCTGGCCG CCCCTCGTCT TTGCTGCGGG TCTGAGGTCT AGGGTCTATA CCAGGAGCAG 1620
CCTCCAGGGC ACCACCAGCT TATTTTCAGC TGTCTGCACT TCACCCTGGC CAGTCCATTC 1680
AAGCAAATCC AAGGTTTCTC CCTGCCAGGT AAATCCTAGT TGTTCTTTCT CCCTACCATG 1740
TGTCTAACCA CTAACTAGTC AACAGGCACC CCTAGGGTCC CAGCACCCAG GCTCCCCAAA 1800
GTCTCCCCAT CGCGCCCCTG CCCTGCTCAA GACCTTGCAG CAATCACAGA ACACAGGTCT 1860
CAGGCTGCGG GTTCTCAGCC TTTTCATAGA CCTCAAACCC ACAAAGGATA ACTCCATGAA 1920
TAGCAGAGAG ACTCACTTGA ACCCCATGCC CCCAAACCCT AAGTGTGTTG CTGACCCCGC 1980
CAATGAACGC ATCTGAGGAC ATCGGTGCCC CTCACGAGAC TCCTACCGAG AGCAGAAGGG 2040
GCAGGGGATG GTTACTAAGT ACCTCCCAGC ACCACGCTCA GTTTATTCAC CACCTCACCT 2100
AACTGGCAAC CATCCTGGGA AAGAGCTGTC TCATCATCCC CAATTCATAA ACTAGGAAAC 2160
AGACTCAGAA AGGGCAAGTC ACTTGCCCAG AGTTGCCCAA CCCAGGCATG GAGTGGGACG 2220
CTAACCCAGG GACGCCTGGC TCCTGTGCCT GGCCTCCTCC CAGAACAATT GTGCCTGGGG 2280
TCCCTCGGAA GCCAGGCCGG CACTGGAGCT GGGCCCTAAC TGTCCCCACG AGCTGAGTGT 2340
GATGTGGGGA GTGGAGAGGA ATGCATTCCA GAGCGTTCAA CAAATATTTG CCGGATGTTA 2400
TCAGGTAGGC AGGAAGGCTG AGTGAGCCTT CCCAGTGTGG ACCACATGGC CCGTCAAAAA 2460
GCAGGCACGT TAGAACTCAA GATTTACTCC CTCGGCCCGC TACTGTCGGC GCAAGCTTGC 2520
AGCCCATCAG CAGTGGCAGA ATGAGCTCTG ACCGTCCTCA AACGCTGCTT CGCCCCAGCA 2580
ATGCCAACCC TAACAGCAAA GAACCCATCT GGTAGCCTGG CTTCTCGGCA GCCCATGGGC 2640
ACCCTCAGGC TGCAGGGCCC AGGCACTCAG ACTGCCCTGG AAATCCGCTC TGGAGGGTCA 2700
CAAACATCAC ACCAGCTGGC GGGGAGGAAT TCCACCCAAC CAACTGCCCT CAGAACCTCA 2760
CCCTGTCCGA CTTTCAGGCT TTGGTGGGAG GGCAGGGGAC AGTCACAGGC CAGTGGTGTC 2820
CACTTGAAGA CTAGCAGAGG CCTGGCCACC AAGCCACAGT TCTTGCAAGA GGAAGAGAGA 2880
ATGCATCCCA CCAGGGACAC CCCCCGCCTC CAAGGACCAA GGCTCCAGCT GAAGGTCAGA 2940
GCCCCAGCTT GCTGGGCACC TCCCTCCCAG AACTTTTCAT TAAGCAAGGC TGGGCTCTGC 3000
TCAGCCTGGC CAAGGACAGG GCTATTTGGT TTCAGCAACT CTGCTAGAAT GACGTGGGTG 3060
AGCAGCGGCG CCAAGATCAA TACACGGGTT AGACCGGCAG GGAGAGCCGC AAAGGTCAGG 3120
ATAAACAGTG GAGTTTCTAT GAAAGCCCCC TCGGCCACCT GGGCAGGATC AGCCACATTC 3180
AATGATGGGG AGCCACAGGG CTGCAGCAGA GCTGCTGTTT CCACTCGTAT CCTGTGCCTC 3240
TGGGGGCGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTATA AGTGTGTTCA GTCAGGTTAA 3300
TACTCAGACC TCTCCAGGAT GCATGTGGGT TAAACCACCT TATCTATAAT CCATATGCCT 3360
CATTTATGAA TGGGGGATAG TAAAGAGCTG CTAAAAATTC AATAAGGGGC ACGACAGCGG 3420
GATACCCGGG AGGTAGTCTA TCAAACACAG CAGCCAGCGT GCAGCCACTC CTTCCTACTC 3480
TGTCCTGGGG CTGTTAAACA GCCTCTTTGA AACTTTTTTT TTTGAGACAG AGACTCACTC 3540
TGTTGCCCAG GCTGGAGTGC AATGGCAAGA TCTCAGCTCG CTGCAACCTC CACCTCCCAG 3600
ATTCAAGCAA TTCTCCTGTC TCAGGCTTCC GAGTAGCTGG GACTACAGGC GCCCACCACC 3660
ACAGCCGGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGATGGGGTT TTAGGTCAGG CTGGTCTTGA 3720
ACTCTTGACC TCAGGTGATC TGCCCGCCTT GGACTCCCAG AGTGCTGGGA TTACAGGCAT 3780
GAGCCACTGT GCCCAGGTGA AACTTTTTAA AACTGCCCAT AATAAAAAAG TTTTTGAAAA 3840
TAAAAGAAAA ATAATCCCCT AAATTCCTGA ACTCCCCCCA CCGCCTCTCC CCGCCTTGCA 3900
AAATCAGTTT TCTCTTTCTT TTCGTGGTCC TTTCTGGACC TGGCTCATGG AAACACTTGA 3960
TTTTTAACTA TCAGGCAGAG GACAGAGTTT CAGATTTTGT ATTTTCCTTA CTTACTGTGA 4020
CTATTTTCCT GTAGGGCTAG GATTTGCTTG GTTTTTGTTT TTTGAGATGA AGTCTTGCTC 4080
TGTCACCCAG GCTAGAGTGC AATGGCACGA TCTCGGCTCA CTGCAACCTC CATCTCCTGG 4140
GTTCAAGCGA TTCTCCCACC TCAGCCTCCC GAGTAGCTGG CACTACAGGC GTGTGCCACC 4200
ACGCCTGGCT AATTTTTTGT ATTTTTAGTA GAGACGGGGT TTCACCATGT TGGCCTGGCT 4260
GGTCTCAAAC TCCTGACCTC ATGTGATCTG CCTGCCTTGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT 4320
ACAGGTGTGA GCCACCACAC CCAGCCTCAG ATTTGCTTGT TAATCAATTT TATCCAACCC 4380
ATTTTACAGA TGATGCAGTG GTGGCCCTGA GAGAAAGTAA CTCTACTCGG TCACACAAGC 4440
TGGGGAATGA GGACCTGAAC CCAGAACTCC TGACACCAAG GCCTCACTGT CCAACATTTA 4500