EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-22872 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr20:49043180-49049030 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr20:49048196-49048214CCTTACTCCCTTACTTCC-6.91
Foxd3MA0041.1chr20:49043321-49043333AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:49043325-49043337AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr20:49048753-49048765AAACAAACAAAC-6.32
HNF1AMA0046.2chr20:49045567-49045582TTTTAATTATTAATT-6.51
HSF1MA0486.2chr20:49047650-49047663TTCCAGAACCTTC+6.3
IRF1MA0050.2chr20:49046645-49046666TTTTGCTTTTTCTTTTTTTTT+6.44
KLF14MA0740.1chr20:49047841-49047855AGCCACGCCCCTCT+6.25
Lhx3MA0135.1chr20:49045255-49045268AGTTAATTAATTT-6.74
Myod1MA0499.1chr20:49044252-49044265AGGAACAGCTGCC-6.36
TEAD1MA0090.2chr20:49045031-49045041ATGGAATGTG-6.02
ZfxMA0146.2chr20:49047750-49047764GGCGCCTGGGCCTG+6.41
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00918chr20:49043435-49044707Adrenal_Gland
SE_03055chr20:49046892-49048359Bladder
SE_31629chr20:49043562-49044836Gastric
SE_31629chr20:49046851-49048332Gastric
SE_34001chr20:49045579-49048580HCC1954
SE_35076chr20:49043169-49045260HeLa
SE_36034chr20:49043492-49045264HMEC
SE_36034chr20:49045293-49048813HMEC
SE_42215chr20:49043397-49045059Lung
SE_48118chr20:49043385-49045403Psoas_Muscle
SE_51230chr20:49043703-49044984Skeletal_Muscle
SE_52679chr20:49043347-49044956Small_Intestine
SE_64485chr20:49043528-49045253NHEK
SE_64485chr20:49045394-49048631NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr204904428649044567
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH20I050426chr204904337549045168
GH20I050428chr204904551549048510
Enhancer Sequence
GCATGGTGGC ACACACCTGT AGTCCCAGCT ACTCGGGAGG CTGAGGCAGG AGAATCGCTT 60
GAACCCGGGA GGCGGAGGTT GCAGTGAGCC GAGATTGTGC CATTGCACTT CAGCCTGGCG 120
ACTGAGCAAG AGTCCATCTA AAAACAAACA AACAAACAAA AAAACACAAA ACTCTCCCCT 180
TGAGCTTTTT TTTTAGAGAG ATTTTTGTTG TTGTTTTGGT TTGGTTTTTT TAGATAAAGA 240
CAAGTTCTCA CTATGCTGCC CAGGCTGGTC TCAAACTCCT GAGCTCAAAT GATCTTCCCA 300
CCTCGGCCTC CCAAAGTTTT AGGATTACAG GCATGAGCCA CCATGCTTGG CCTCTCCTTG 360
AGCTCTTTTA ATCTGGAAAG AAAATCTTTC CCATGATCTC CCTGAAAGGA CTTCCCTTCA 420
CATTTCATTG GCCAGAACTG GTCATATCTC TGCTCCACGC TGCAAAGGAG GCTGGAAAAG 480
GGAAGTGGGA TAGTGTGACT GGCACAGCCC AATCTTAATC CCTCTCCCCT GGCTGGACCT 540
ATCACCTCCC ACCCCCAAAC AAAATCAGGG CTCTGCTGTT GAGGACTGAG GGTCCAGCTA 600
TTAGGCAGCC AGTAAAGGGT GTCACCATAG TGTAAACCTC TGCTTCTTCC AGAAATCTCA 660
CTGACAGGGT AAAAGGGCAC AAACACACAG GGCAGAGAAC AGGCAGAGGA AGAGATGATG 720
CCACTGGGTT ATAAAAGCTG GACAGCAGAT GATGGGTGAG GGAACCCACT GAGTTGGCCA 780
GAGAAAACTG GCAGCAAGTG CCTGCAGGAA GGTTGGGCGA GGCAGAGGCA GGTACATGGC 840
ACCCCAGAGC CCTGAAAGGA CCGAGACCTC TGCAGGGAGC ACTGAAACCT GAGGGGTGAG 900
ATGAAAGTCC CCAAGGACCC TCATCCCCCT TCACGCTCAT GGAAGAGTCC AAGGTGAAGC 960
AGTTGAACCA GGGATGCCCT GACCACAGGA ATGGGGGTTC TACACAGAAA ACAAATGTAA 1020
ATCTGTCTAC TGAACAATGA GATCTGCAGA CTCCTTCTCC CACCTCGCCC TCAGGAACAG 1080
CTGCCTAGGA CAGGAGATAA AGACTTTCCT ATCTTGGGAA GCACCCCTGA CTGAAGACAA 1140
AAGAGAAAGC TCCCGGAAGA TAATGATTTG GAGTTCCCCA ACAAAGGACC ACGGCCCTAC 1200
CCAGGCACCC CACCATGTGA CAGGCCCTGC CCAGACACAC GGAGCATGCA AAGGTGATTA 1260
ATTGCCTCAC ACTCAAATAT CACAGAACAT GAGACATTTG AGAACTGCTA ACACGAGACA 1320
CAAACAGGAA AAGGTCCTGG GGAGATGCCA GTGCTCCTTG GCTGGGGACC TAGTCTTGGA 1380
TCTGTCAGAA GCTGGCTGTG TGGCCTCGGC AAAGTCCTGT CCCCTCTCTG GGCCTCAGTT 1440
TCCGTGTAGT TGAGGAGAAT CTTTCTGGCC GGGAACTTGC CTCAACATAT CTCCTACTGG 1500
GGCATGTGAG TCCTTTGCTC TGCTTGAGAA ATTATCCTGA AAACCATTGG GTTATTTTGT 1560
GGATCTCACC TGGATGACCT AAAGGGTGTG GATTTCAAGG GCAGAAGAAA ACTTATCAGT 1620
CCTCACGGTG CATGAAATTC CAGCATGCTC CTCTAAAGGG GACCCTTGAA ACAAATAAAT 1680
TTCAATGGAT GATACTCAAA GGATGTGTGG GAAGAGCGTG GCTAGAGAAG GCTGGCTTTG 1740
AGCACTTAAA TGTTGCCTGG CACTTTACAC ACATTGTCTT ATTTCCTTAC TCTCTTTGTG 1800
ACCTTGAGGA ACCACTTAAC TATGCTGTGC CTTAGTTTCC CTATCTGTGA AATGGAATGT 1860
GGTTGAGACT GTTAGTTGTC CCTAAGTATC TTCCCCTAGT TCCATAGTAA TGAACTTGTA 1920
GCTGAGCATA GGACTGTCTC AATAAAAAGT ACATTTCCCA GCCTCCCTTG CAGTCAGATG 1980
TACCCATGTG ACCAAGTTCT GGCCAACGGG ATGTGACTGT AAGCTATGTG GCTGATTTCC 2040
AGGTTGTACT TTATTTTATT TTATTTTATT TTATTAGTTA ATTAATTTAT TTATTTTTGA 2100
GAGGGAGTCT TGCTCTGTCA CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC ACAATCTCGG CTCAGTGCGA 2160
CCTCCACCTC CTGGGTTCAA GTGATTCTCC TGCCTCAGCC TCCCAAGTAG CTGGGATTAT 2220
AGGCACACAC CACCATACCC AGCTAATTTT TATATTTTTA GTAGAGACGG GGGGGTTCAC 2280
CTGACTAGGA TGGTCTCGAT CTCCTGACCT CATGATCCCC CCACCTGAGC CTGCCAAAGT 2340
GCTGAGATTA CAGGCATGAG CCACTGCACC CAGCCTGTAC TTTATTTTTT TAATTATTAA 2400
TTTTAATTTT TTTAGAGATG AGGTCTTGCT ATGTTACTCA GGCTGGTCTC GAACTCCTGG 2460
CCTTAAGTGA CCCTCCCACC TTGGCCTAGA GTTACAGAGG TGAACCACCA TGCCCAGCCA 2520
GGCTGTATTT TTTTTTTTTT TTTTTTAGAG ACAGGGTCTC ACTTTGTTGC CCAGGCTGGA 2580
GTGTTCTGGC TATTTACGGG AGTGATTCCA CTACTGGATC AGCACGGGAG TTTTGACCTT 2640
TCCGATCTGG GCCATTTCAG CCCTCCTTAG GCAACCTGGT GGTTCCCCTC TCCCAGGGAG 2700
ATCACCATGT TGATACTGAG CTTAGTGTAG GCACCCGATT GACACAGCGC ACTACAACCC 2760
AGAACTCTTG GACTCAAGTG ATTCTCCCGC CTCAGCCTCC CGAGTAGCTG GGACTTCTGG 2820
CTCACACCAC TGTGCCCAGC CTAGGTTGTA CCTTAAAGGG AAAGGGTATG CCATTCCCCC 2880
TTTCCTTTTC CCACTGGCTG GAATGTGGAA TGTGACACCC TAAGGAGGGG AAAATAGCAA 2940
GTTAGCAGCC CGGGCATGGG CAGTGGGTGT CTGCACTGTC AGCCCCAGCC TAACACACTG 3000
GGTGTGAAGC CTCAATGTGT TGAGACATGT AAATCACTTA CCACGGGGCT TGGAACAAAG 3060
TTGGCATTCT GAAATTGTGA GCTGTTTTAT TATTACCATC AACGTTATGA TTATAATCAT 3120
CACTCCAAAT GGGCCTGTGC AAGAAGGCCT CTTAAGGCCC ATTTTTCAGA TGAGAAAATG 3180
GAGCTCAGAG AGGTTAAGCC CCTGCCCAAA TGATCCCAGG GGGAGGGTAG CAGAACCAGA 3240
TCTGCCAATC TGGGGAAGGA GTAAAGAGAA GCAGTAGAGG GTGGAAGGGG GAGCAGTCCC 3300
AAGTCCCCAT GCCAGCCCCA TGCAAGTCCC CATGCCAGCC CATACCAGCC CTGTCTGGTT 3360
GGTTTAAGGG GTTTTCTTCA GCGGGTCTAG TGCAGTGGGT CTTAACCAGG GACACTTTTG 3420
TACCCTGGGC GACATTTGAC AATGCCCGGA GGCATTTTTT TTTCTTTTTG CTTTTTCTTT 3480
TTTTTTTTTT GAGACAGGGT CCCGTTGTCT CCCAGGCTGG AGTGTAGTGG GCGATCTCGG 3540
CTTACTGCAA CCTCCACCTC CTGGGTTCAA GCGATTCTCG TGCCTTAGCC TCCTGAGTAG 3600
CTGGGATTAC AGGCGCCCGC CACCACGCCC AGCTAATTTT TGTATTTTTA GTAGAGACAG 3660
GGTTTCACCA TGTTGGCTAG GCTAGTCTCA AACTCCTGAC CTCAAGCGAT CCGCCCACCT 3720
CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCACCG TGCCCAGCCC TGCATTTTCA 3780
ATCACCGCGA CTGGGAGAGG AAGCCAACCG CCGGCCCTAG TGGGTGGCAG CCAGGAATGC 3840
TGCTCGGTAC CCTACAGCGC ACAACACGGC CCTTGCCAGA AAGAATCAAC AGGGCTGTGG 3900
GCGAGGAGCC CTGGTCTCAC GAGAGGTTGC CCACCCCTCA CCTGGTGCCC CAGGAGGTGG 3960
GAGGCTTCGC GGGCTCCAGG TCTTGGGCAG GATTCTCTGA TTTCTTCCCC TGGAAGGCGT 4020
CTCTCTGCCC TCACCGCATC TTCCTATCAC TCGCCCTCTC TGTCCACACA GGCCCATTTG 4080
TGGGGCAAGG GATTTTCATC AAGAGGAATC TCTAACCTCA GCCCATCCCT GCAACTCACC 4140
CCTGCCGCCT GCCCCGCTCC CGAGGCCGGG AACAAGCCCC AACAGTTCAG CCTTCCTCCC 4200
CACCCACCCG TTGCCAGCAA GGCCAGTTTC CGGGTGGTGG GTGGAGGGCA TGGTGCCATC 4260
TGAATACGGT CCAGTTCTCC CCGGTGGGGG AGGGAGAGAA GGGTTTTGCT CCTGGAATGC 4320
AGGGCCCACA CCATCAGAGC TGCCCATCTG TCTGTCTATC CGTCCATGTG AGACAAGAGC 4380
GGGGACTGTT GAGGGAACTA CTTCCAAATT TCTCCTCCCT CAATTCCCAG GAGGTGGTGA 4440
GCCCCAGCCT TCTAGGATGG CAGGCCAGGC TTCCAGAACC TTCCATCTCA GCCACACAAA 4500
ACCAAGAGAC TGAAGCGAAA GGTAACCCCC TGAGGAACTC CCGGGATTTG TGAAAAATTC 4560
AAGAGGGAGT GGCGCCTGGG CCTGATCCGC ATCCAGAGGC TGTTCTGTTG GTGAGCAGTG 4620
GCTCATTTAC TGAAGTACAG ACTGCACCCT GTGGCCGCGG CAGCCACGCC CCTCTGCACC 4680
CACCAGTCCT GTTCACTGGC CTAGGCTTCA GGCCGCCAGC ACCTCCATCT TTTTGCCAAG 4740
GGCTTTCTCT GGCCACCACA CCCCACTGAG CCCATGCAGG ACAAGCGGAG TACCTGAGAG 4800
ATCATGCCCC TGGCAGCTGC CCTTAACCAA CCACTGACAG GAGGTGATGG AGGAAGACGC 4860
CGGTTTCCTT GCCCCTTGGT GGAAATAGCC TGGAGGCATG TTTACACTGG CTCCCAGAGT 4920
TCCCCAGTGG AATCGAGCCC CAGTTGCCCA GACCAGTAAC TTGCTCAAAA ATGTCCCCTG 4980
TGTGTGTCTT CTCATCTGTG TCTCATGTCC CCACTCCCTT ACTCCCTTAC TTCCTAAGAC 5040
TACCACCCAA ACAAATCACT TGAATCCTTG CCTCGGTGTC TGCTTCTGGG GGCACCCAGC 5100
CTAAGACCAA CACAGTCTAA GAGGCAGACA CAGATATTTG CAGATCAGGA TGAATGTGGC 5160
TGCCCCCTCT AGCAACTCAC AATCAGATGG AAAGCCCAAC ACCACTCAGT CACACAGACG 5220
CAGAATTGCA AATGGGGAGA AGGCTGAGAC TGTGAAGCAA CAGAGAACCT TGTTGTTAAA 5280
ACCCTCCAAT GGGCTGAGCA TGACGGCTCA CGCCTGTAAT CCCAGCACTT TGGGAGGCCA 5340
GGGTGGGCGG ATCACCTGAG GTCAGGAGTT TGAGACCAGC CTGGCCAACA TGGTGAAACC 5400
CCATCTCTAC TTAAAATACA AAAATTAGCC GGGTGTGGTG GTGCACACCT GTAGTCCCAG 5460
CTACTCAGGA GGCTGAGGTA GGAGAATCGC TTGAACCTGG GAGGCAGAGG TTGCAGTGAG 5520
CTGAGATCGT GCCACTATAC TCCAGCCTGG GTGACAGAGC AAGACTCCAT CTCAAACAAA 5580
CAAACAAATA AATAAAACCC TTCAGGCAGG GCATGGTGAC TTATGCCTGT AATCCCAGCA 5640
CTTTGGGAGA CCTGAGGTCA GGAGTTCGGG ACCTGCCTGG CCAACATGGT GAAACCCTGT 5700
CTCTACTAAA AATACAAAAA TTAGCCAGGC GTGGTGACAT GTGCCTGTAA TCCCAGCTAC 5760
TCAGGAGGCT GAGGCAGGAG AATCACTTGA ACCTGGGAGG CAGAGGTTTC AGTGAGTCGA 5820
GATCGTGCCA CTGCACTCCA GCCTGGGCAA 5850