EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-22197 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr20:25233310-25237840 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr20:25234071-25234086GAGGTCAAAAGTTCG+6.4
RARAMA0729.1chr20:25234071-25234089GAGGTCAAAAGTTCGAGA+6.38
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23378chr20:25231565-25234081Colon_Crypt_1
SE_23378chr20:25235259-25236501Colon_Crypt_1
SE_23378chr20:25237152-25238106Colon_Crypt_1
SE_27519chr20:25232530-25234102Esophagus
SE_27519chr20:25235273-25236408Esophagus
SE_27519chr20:25236967-25237853Esophagus
SE_40630chr20:25226831-25240996Left_Ventricle
SE_41813chr20:25235735-25236371LNCaP
SE_41813chr20:25237156-25237651LNCaP
SE_42625chr20:25227111-25234240Lung
SE_42625chr20:25234952-25238389Lung
SE_47363chr20:25228650-25234415Panc1
SE_47363chr20:25234685-25236410Panc1
SE_47363chr20:25236440-25237972Panc1
SE_48678chr20:25229875-25234116Right_Atrium
SE_48678chr20:25235290-25236488Right_Atrium
SE_48678chr20:25237016-25238203Right_Atrium
SE_50579chr20:25231586-25234275Sigmoid_Colon
SE_50579chr20:25235408-25236386Sigmoid_Colon
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr202523358025234008
chr202523563025235824
chr202523726925237461
chr202523679325236861
chr202523760325237703
Number: 4             
IDChromosomeStartEnd
GH20I025252chr202523300725234093
GH20I025253chr202523414725234588
GH20I025254chr202523554925236330
GH20I025255chr202523644125238203
Enhancer Sequence
GAGGGAGGGT GCAGGGGCTT CCATTCCCTC TGCAGGTGCC ACTGTCCCAG CACCTCCAGG 60
ATTCACTGAA CTGGAAGGAA GCTCTTCCAT CCCCTTCAGT TGGGGATTTT ATGGAGGCCG 120
CAGTTACCTA GTGTGATTAT TGGCCATTGG TGATGAGCTC AGCCTTTAGC CCCTCTCCCT 180
TCACTGGAGG TTGGGGCTGG CGGGAGGGGT GGGCCTGAAA CTTCCAACCC TCTAATTAGA 240
GCTGGTTCCC CTGGCAGCCA GCCTCTGCCC TGAGGGGCTT GCCAAAAGTC ACCTTTTGGT 300
GACCACATCA GGCGTGGTTG AAAGGGACTT GTTATGAATA ACAAAAGACA CTTCTTTCAT 360
TTTTATTGCT CTTATCACTT AGGAAATTAC AAGGGTGTTA GGAGCACAGG CCAGGAAGAA 420
CAAATAAGTA TATCTCATTA CATCACAGTT TCACAGCCTC CCATGGGGGA AGGCCTTGCA 480
GAACAAACCC TGCCACCAGC TACCTTGCAC CAGAGCTGCA GCTTGCCTGG GTCTCCAGCC 540
TGCTGGCCCA CCCCACTCTG TAGGTTGTGG CCTTGCACTT CAGAATCACT TGAGCCAATT 600
TCTTAAATCT GTCTCTCTCT ACACATACCT TACTGTTCTG TGTCTCTGGA GAACCCTGAC 660
TAATCCACAG GGGCCGTGGT GGCTTTATAA AATATGGCCG GGCGTGGTGA CTCACACCTG 720
TAATCCCAGC ACTTTGGGAG GCTGAGGCAG GTGGATCACC TGAGGTCAAA AGTTCGAGAC 780
CAGCCTGACC AATATGGTGA AACCTGGTCT CTATTAAAAA TACAAAAATT AGCCGGGCGT 840
GGTGGTGGAC ATCTGCAGTC CCAGCTATTC GGGAGGCTGA GACAGGAGAA TTGCTTGAAC 900
CAGGGAGCCA AGACTGCGCC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA ACTCTGCCTA AATAAAATAA 960
AATAAAATAA AATAAAATAA AATAAGGTAA CCGACCTCAC CTCCACATCT CAGCCATATT 1020
TCCTTTTAAA CTTTATGTGA TTTCAGACCC TTAAAAAGTT GCAAGAATAA TACAGAGATT 1080
TCTTGTAATT CCTGTTGACG CTTCATCCGG ATTCCCCAGA TGTTAAACAT TGCAACACAC 1140
TTGTTAGGTC ATTTTGTCGC TGTAAGTTCA TTTTTCTCCG AATCATTTGA AAGTAAGAAC 1200
CAGCCTGACC AACAAGGTGA AACCCCTTCT TTACTAAAAA TACAAAAATT AGCCAGGCAT 1260
GGTGGTGGGC GCCTGTAGTC CCAGGTACTT GGGGGACTGA GGCAGGAGGA TTGCTTGAAC 1320
CTGGGAGGAG CAGGTTGCAG TGAGCTGAGA TCACGCCACT GCATTCCAGC CTGGGCAACG 1380
GAGCGAGACT CTGTCTCAAA AAAAAAAAAA AAAACTGAGT CATAGCCTTG TTGCCCCTTC 1440
ACCCCCAAAA ACGGCAGTGA GTACTCCGGA AAAACAGGGA AGCTCTCCTA CACACCCACA 1500
GTAGAGCAGT TAAACTCTGG ACATTTTAAT CAACACAGTG CTGTTGTCTG CAAATCTTTT 1560
CAGTGTCACC AGCTGTCCTG CTTAATAAAT ACAAATAAAA TGCAATAATA CAATTGTAAA 1620
AAATACAAAT AAATAATTGG GAGAACTTTA GAAGTCTTTT CAGATTATAT CTTTTATTAT 1680
TATTATTATT AAACGGATCA AAGCTTTAAG CCATTTGGAA ATTCAAAGCA TCCTAAGACA 1740
TGCAGCAAAT AACCGCAGGA GATAGGAGCT GGCTTTTTCT CACCCATGCA GAATGGCATT 1800
CTTAGGATAC GGTGAAGGGA AGAGAAGTGA ACACAGATTT AGAAAGGTAA TTGGACAGTA 1860
AGAGAAGTTC GGTTAACAGT GTCTTCAACA GTACCTTGAG TAGGAATGAC ATGTAATTTT 1920
AGGTATAGGT AAGTGGCATT TCTCGGCCTA CAAACAGTTA AAATGAAAGA TTAAAGTAGT 1980
GTTTAAAAAC GATGACTGGT AGCTCACTAG GTATAAATAT AGTTTGACAC GGTCCAGATC 2040
ACTTAGTGTA AGTTGATTAG GCTCTGTCAG TGATAAGGAG AAGGCTCCCA TCGCTTTCTG 2100
GCTCTGGATT AGTACTGAAT AGACTTTTTG TGGAGCTTAA TTGCATAGAA GGCGGGAGAC 2160
AGTGACTTGT GGCAATGTGT GTCATGGAGT GTAGAAGGAA TTTGTTTACT ACAGAACCAA 2220
GTGATCTCTT AAGATCCCCA TAAGTTCTAA AGTTCTATAA TTCTTTTACA TTTGACATTT 2280
TCAAAATTGA GCAAACAGAC CTGTGTTTGA GTCGTAGGTA CTGGAGTGAG AAGGAAATCC 2340
ACGATCCACG TTGAGAAGCC TGCCCACTGT TCATGGGAAG CCAAGTTTCC CTGGCAGTTA 2400
ATTCATTAAG AAAGTACCGT GTGACATCAC AGGCTGGGAG CTTGAGAGAT GTGCTAGCTA 2460
ATCCTCACAT CCTTACAGCA GATACAGTAG TGGATTATCA GATTGCTCTG TGAGCAACTC 2520
CCCAGAAGCC CCCTCAGACA CAGTGGAGTG GACACTGTGA CACTGTCAAG GAAACCAAAG 2580
ACCAACCTCA GCGTCTGGCA GGTGGGAGGC CCCTCAACAT CTCTCCTCCC ACAGGACCTC 2640
GGTTCCCCTG GATGGTATCT GAGACTGCTC AGCTCACCAG CAGGAGCCAG CAGGTCCAGC 2700
CCAGGGAGGT GGCCCCTTTG TGTCTGGAGG GGCTGGGAGC CCCCGCTCCA AGGCCTGGCT 2760
GGTGGAACGT GGTGCCCACT GGCCTCTGGC TGGCTCAGTG GCCTGTGTTC CTGTGTCTTA 2820
TCAGGGCCAG CTCTGTCCAT AGTGCCTGGG TGGCAGGGAG GGACACTCTG CCCTGTGAGT 2880
CACTCTGTGC CCATGTAGGA ACCAGTAGAG GGCGGCTGGT CTGAGGCATG CTGGCACCGA 2940
CAGAATCGAA TACACAAAAG GAGAGTTGCT GTGCTTTCCT GGGGACAGGA GGGGACCGGT 3000
TTCAGACCAG ATCTGCCTGT AGAATGAGGC TCTTCATCTT GGTGAAAGCA GCCGCCCAAC 3060
TCTTTTTTTT TTTTTTGAGG TGGAGTTTTG CTCTTGTTGC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC 3120
GCGATCTCTA CTCACTGCAA CCTCCGCCTC CCGGGTTCAG GCGATTCTCC TGCCTCAGCC 3180
TTCCGAATAG GTGGGATTAC AGGTGTGCAC CACCACGCCC AGCTAGTTTT GTATTTTTAG 3240
TAGAGACGGG GTTTCATCAT GTTGGCCAGG CTGGTCTTGA GCTCCTGACC TCAAGTGATA 3300
TACCTGCCTC AGCCTCCCAA AGTGCTGGGA TTATAGGCAT GAGCCATCAC ACCTGGCTCC 3360
AGCTCTTTCT TTTGTTTCCC TGAATGTTGG GAAAGTTCTT TCTTTTTCCA CCAGAGTATT 3420
AAGACACTAA CGTTAAATGA AGACTCTAGT TAAAAATCCC TTCAGAAAAG GGAGAAAAAA 3480
TTGGTGGTCT CCACAGGCCC AATTCTGTGA ATCTCTGTCT GTAAAGAACA AAATGAGGCT 3540
CTGCCAGTTG GTGTTACACT CTCTTTTCAG AGTCTGTTAA CTCCTAAGGT GTCTTTAGGT 3600
GATTGGTATT TGGTGTACTG TTCGTGTTGA TCATATTTTC ATCTATTTTT GAGCTTTATG 3660
TTTTTCTATT ATTTGCCTGG TTGTGTAGGC TTTGCATGTG ATAAACTCTG TTAAAAAAAA 3720
AAAAGTGGAG GGCCTGGCTT GAACCCAGGA GGTGGAGGTT GCAGTGAGCC AAGATTGCAC 3780
CATTGCATTC CAGCCTGGGC AACAGAGCGA AACTCTGTCT CAAAAAAAAA AAAACAAAAA 3840
CAAAAACAAA AAACAGGCTG GCTTTAGGCT ACTTAACACT TGTTATGTCA TATTGCAAGA 3900
AGGGACCATG GTAGAAAGAT CAATGGCCCA GTTCAATCCC AGGCGGCAGG GCCTCCTTAG 3960
AGCAGAGCTG CTGAGCAGGG AGGTTAAGGG ATCGTGTTGG CATTTTCAGG CTGAAGCAGG 4020
TGAGTCCAGT TCTCCAACCA GCGCTCCCTG AGCAGGGAAG CCCTGTTCAT GGTTGCACAA 4080
GAGGAGCCAG AGGGGAGTGA GTGGAAAGAG GCTGTCCTGC AGCAGCAGGA TTTGGGGTCA 4140
TGGAAGAGCT AGGTCCCTAG GCTGTTGCTT GGACAAAGCC TATGCCTTTA CATGGTTTTT 4200
TTCAGAACTG CCACTTGGCA ACTTTCTAGG CTTTGCATTT CTCCTTGAAA AGTCTGGTAT 4260
GGTGAGGGGA ACCAGCCTTG CCTGAGTCCT AGCCTAGCCC TGTGCGAGCC CACAGGTGAA 4320
TGTGGTCCTC TCAGAGGCTG AGTGACTTGC CCAGGTCACC CAGCTAGCCA GGGCAGGGAG 4380
CTGGGATGAG ACCCCAGCCT GTACCATTCA AGTCTGCATT TTCTTGGCCA GCTCCTCCAG 4440
CAAGCCTCTT TTCAGTTTCA TGGTTTTCAC TCTGAACCAT ATTAAGGTAA AAGCAAAATA 4500
GACACATCTC AGCAAATGAT GAAAGTTCTT 4530