EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS129-20897 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
MCF10A 
Coordinate
chr2:178099000-178103460 
Target genes
Number: 11             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr2:178103340-178103355CGAGACCAAAGTCCA+6.5
Lhx3MA0135.1chr2:178100736-178100749AAATAATTAATTT-6.78
MEF2AMA0052.3chr2:178102417-178102429TCTATTTTTAGT-6.27
MEF2BMA0660.1chr2:178102417-178102429TCTATTTTTAGT-6.32
MEF2CMA0497.1chr2:178102416-178102431TTCTATTTTTAGTAG-6.57
POU2F2MA0507.1chr2:178103286-178103299ATATGCAAATGTT-6.21
RAXMA0718.1chr2:178103441-178103451GCCAATTAAC+6.02
ZNF263MA0528.1chr2:178103132-178103153CCTTTCCCCCCCTTTTCCTTC-6.34
Number of super-enhancer constituents: 23             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04365chr2:178097979-178099881Brain_Anterior_Caudate
SE_04365chr2:178100338-178101595Brain_Anterior_Caudate
SE_04365chr2:178102487-178108824Brain_Anterior_Caudate
SE_05456chr2:178095174-178100035Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05456chr2:178100161-178101677Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05456chr2:178102580-178108702Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06605chr2:178097943-178099889Brain_Hippocampus_Middle
SE_06605chr2:178100335-178102270Brain_Hippocampus_Middle
SE_07153chr2:178097104-178102275Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07153chr2:178102671-178108691Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08697chr2:178095063-178100034Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08697chr2:178100153-178101608Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08697chr2:178102435-178108704Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11391chr2:178097852-178101836CD20
SE_11391chr2:178102484-178108874CD20
SE_17501chr2:178102398-178108666CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_27757chr2:178102324-178108497Fetal_Intestine
SE_28727chr2:178102213-178108544Fetal_Intestine_Large
SE_37359chr2:178099730-178101690HSMMtube
SE_42450chr2:178100141-178101268Lung
SE_49035chr2:178100225-178101169Right_Atrium
SE_50467chr2:178102571-178104331Sigmoid_Colon
SE_51368chr2:178099775-178101993Skeletal_Muscle
Number: 3             
IDChromosomeStartEnd
GH02I177233chr2178098070178099332
GH02I177235chr2178099863178101993
GH02I177237chr2178102546178111927
Enhancer Sequence
TATGTTTAAG ACAAAAAAAG GAAGGAGAGA GCTCATGTTT TTTAAATGAC AGATACCACA 60
TAAATTAATT CACATTATGC CACTGTTGAT GGTGGGAAGT GGGGAGATTA CAAATACAAT 120
CTAAATGAGA ACACAGATCC AATGTTCTAG AAGAGCACAG TTAATTCCAT TCAATGAATC 180
TATTCATTAA AGACAACAAA CAACCTACAA ACACATAGCC ATCCATTCTA ATCACTTGGA 240
TCATTAATGA TAGGGTGATG GTAGAGGTCA CTAAAGGGCA AAGTCACAAA TGGTTTGAAT 300
GAGAAGAAAT CCCACCCTTG TTTAATGGAA TATAGAAATT AGAGCAAGCA CTCTAAGCCA 360
CTGGCTTATA TAAGAGAAGT GGGGTCTGGA AAACATTACT GAATACATGG AGTTTTCTTT 420
AAACTTTGCT CAGCAAATAT CCAGTTTATA GAGGGATAAC TCTCAAGTTA AAGTGTCAAT 480
CTAGCAGTTG TGAAATATCA CCATTCTTTC CATCTTTCCT ACACTAGATT ATCTTCTCCC 540
CATCACTGCT TGCTACTCTT ATCTCTGTGG CTTACCTATA TGCCTGTAAT CCCAGCACTT 600
TGGGAGGCCA AGGTGGGTGG ATCACCTGAG GTCTGGAGTT CGAGATCAGC CTGGCCAACA 660
TGGTGAAACC ACGTCTCTAC TAAAAATACA AAAATCAGCC GGGTGTGGTG GTACGTGCCT 720
GTAATCCCAG CTACTCAGGA GGCTGAGGCA GGAGAATCGG CTTGAACCTG GGAGGCAGAG 780
GTTGCAGTCA GCTGAGATCG CACCACTGCA CTCCAGCCTG GGCAACAGAG CAAGACTCCA 840
TCTCAAAAAA AAATAAAATA AAAGCAGACA GGGACAGGTG CGGTGGCTCA CGCCTACAAG 900
CCCAGCACTT TGGGAGGCTG AGGCAGGTGG ATTGCTTGAG CCCAGGAGTT CGCGACCAGC 960
CTGGGCAACA TGGAGAGACC CTGTTTCTAC CAAAACAAAA ACAAACAACA ACAACAACAA 1020
CTGGTGTGGT GGCGCACACC TGTGGTCCCA GCTACTCAGG AGGCTGAGGT AGGAGGATCA 1080
CTTCAGTCCA GGAGGTCATG GCAGCAGTGA GCTATGATCG TGTCACTGCA CTCCAGCCCG 1140
GGCAACAAAG TGAGACCCTG TCTCATAAAT AAATAAATAA ATAAATAAAA CTATGGCTCC 1200
AGGGAAGGAT TAAAGGTATT AAGTTTTAAG ACATAGGAAG AATCTTACAA AGAGGGAATG 1260
GTTTTGATGA GGAGAGGCTG AGCTTGGTGA CTCAGGCCTG TAATCCCAGG AGTTTGGGAG 1320
GCCAAGGCAG GAGGATTGCT GGAGCACAGG AGTTACTAGC CTGGGCACCA TAGTGACACC 1380
TGTTTCTACC CAAAATCAAA ACAAATTAGT TGCACGTGGT GATACGAGCC TGTAGTCCCA 1440
ACTATTAGGG AGACTGAAGT GAGAGGATTG CTTGAGCCCA GGAAGTCAAG GCCATGGTGA 1500
GCTGTGATTG TACCACTGCA CTCCAGCTTG GGTGACAAGA CCCTGTTTCA CACACACAAA 1560
AAGATACATG GGGAGAGAAT TTATATGACT AGGCTAGGCA TAGGAACCAC ATCCAGATTT 1620
TCCTAACCAA AAATGTGTCA ATAGCAGTTT TTCTGATTTG TAATTTTAGT CTTTGGAAAA 1680
ATCTAAATAG GTAGGAAATC TAAATCTGTT TCCATTCCAC AAATCACCTA TAGGGGAAAT 1740
AATTAATTTG AGAATGGAAA AAAATCAAGA TGGGGGAACG GGAGTTGGGA CTTGAAGGCC 1800
AGTGGGTACA GTGTAGACAC GTCACACTTT GCATTTCATT CTGCTGACAG CTGGCAACGC 1860
CAGACTTAGA GTTCTATTAC TTTCAGCTTC CCAAGGACGC AAATAACATG GTGGTTGTTT 1920
CAGTGAGGAG TCAGGCTATT TTTATCCAAC AGAGGAGCAG GCCACCCAGC CTGGAGGCAG 1980
CGCAGCTAGC TAGATGGCAC AGGCCACCTG TGTCCATGAT TGAAGGTTGG CGTTGGAATC 2040
TTAAATGCTA TGAAACCCTG CTCATGGGGC TCATTATTCT AGCCTTGAAC AATATATATT 2100
GTAAAGCACA CAAAGTAGGC ATAGTTAAAG TAGCACTTGT AGTTAGGTAT ACCTCACTAG 2160
GACATACCTA ATTATCTTTA AGCCAGTATC TATTAAGGGC TTCCTATATG CTATGCACTG 2220
TTCTAAGTAC TTTACATATA GAAACTATTC CTCAAAACAG CCTTATACAG AGAAAACATT 2280
CCTGTTATAC AGTATAAGAA TACTGAGGTT AAGAAAAAAG ATACTACCAG AAAGTGGCTG 2340
AACAAAGACA CATACCCAGG CAGCTTCAGT CGGGTTCATG CTTTATTAGC CATGAGCCTA 2400
CACTATTATA AAATGGCATG GCATTTGCTG CAAATAACCT ATGCATATCC CTTTATATAC 2460
TTTAACTCAT CCCTGGATTA CTTACAATAC CTAGTAAAGT GTAAATGCTG TGTAAATAGT 2520
TGTTATACTG TATTTTATGT GTGTATTGTT ATTTTTTCGG GTTTTTTTTC CACTTTTTTC 2580
CTTTTGAAAT TTTATTATTT ATTTACTCAT TTTGAGATAG GGTCTCACTC TGTCACCCAG 2640
GCTGGAGTGT GGTGATGCAA TCATGGCTCA CTGCAGCCTT CACCTGGGCT CAAGTGATCC 2700
TCCCACCTCA GCCTCCCAAG TAGCTGGGAC TACAGGCACA TGCCACCAAG CCCAGCTAAT 2760
TACTTTTTGT AGAGATGGCG TCTTGCCATT TTGCCCAGGC TGGTCTTGAA TTCCCGGGCT 2820
CCATTGATTT TCCTGCCTCA GCTTCCCAAA GTGCTAGGAT TACAGGCATG AACCACTCCA 2880
CTGTGCTTGG CCTTTTTCCA AATATTTTTG AACCAATCTG CCATTGGTTG CATCATGGAA 2940
CCAGAGGCTG CATGGGCCGA CTGTATATAC ACTTGGCTTT GGAATCTTGG TAGTATGAAG 3000
CGGCCAGTCT GCAGGTCAGA TTAAGTCTGT AGGTCACCTA GATCAGTTTC CTGGCCAAGA 3060
GCAACAAAAT AGCAACCACA GAGCATTCAG TCGACTATAC ATGGCTATCT TCTCAGGGGG 3120
ATTCCCACTA AAATAGGTAT GAGAATAATT TCTATTTTAA AAAATGATTT GTTTCCATTC 3180
TGATGGACAT GTTTACCCAA AGGTTATCAT GGGAGACAGA AAATTCAAAG GTATAGAGAA 3240
ACCTACTTTA TTTTATTTTT TTTTGAGACG GAGTCTCGCT CTGTCGCCCA GGCTGGAGTG 3300
CAGTGGCACA ATCTCAGCTC ACTGCAACTT CCGCCTCCAG GGTTCAAGCA GTTCTCTCAC 3360
CTCAGCCTCC TGAATAGCTG GGATTACAGG TGCGTGCCAC CATGCCCGGC TAATTTTTCT 3420
ATTTTTAGTA GAGACAGGAT TTCGCCATGT TGGCCAGGCT GGTCTCGAAC CCCTGACCTC 3480
AAGTGATCTG CCTGCCTCGG CCTCCCAAAG TGCTGGGATT ACAGGTGTGA GCCACCACGC 3540
CCAGCTGAGA AACCTACTTT AAAATTCTGA TTAGCTTGGG CCGCTTCTTC TCAGTAAATC 3600
TAGATACATA GCAGGGTATC CTGTCTAGAC TTTCTGCAAA CTGGAGCTAT CTGCCCAAGC 3660
AAGGTATTAA GTGTTCAATA TGTTCCCATC TTCTAGGTAC TAGCACCAAA AATGAAAGGA 3720
ATGCATGATC CTGCGATCTT AATTGAACTC TGTAAAATAG GCAGTCCATG TTCCCACCCA 3780
TCTCAAGAAG TGATGTGCAA AGTGTGCAAA GCTCTTTGCA AAGTCAATCA AAGAAACTCA 3840
AATACTTGTC CCTGTACGTG GGGAAAAGTG TACTTTGACA CATCCCTGCC TCACCCTAGA 3900
CTTCCTGGGC CTGAGGTTTT TTCTTGTTAA GGAGATCCCA GGATAAAAAT CAGTAAAAGG 3960
TTGTGACTTT TTCATGCAAC TGAAGCAATT TAGGTTGCAA ACATCTTCTG CTCATAAATC 4020
TGACTTGCAA AGTATCCTTA CAACCAACCC TCATGAGCTG GAAGAAAATA TTGAATGGAA 4080
TTTATAATTG TCAGTGTCAA TCATGCCAAG AATTGAAATA ACTATTTAAT TTCCTTTCCC 4140
CCCCTTTTCC TTCCCATCAG ATGATAATAT TTGAGGGGTT TGGATGGCTT TAGCTATACA 4200
TTGTTTAATT ATTCCATCCT ACCCAAGCAT ACAGATGTTA GTGGATCAAA TGAGGCACGT 4260
GAAAAGTATC TCTCTATAAA TGTAAAATAT GCAAATGTTT ACATGTTGAC AGTGATAGGC 4320
TCTACTACTT GCTGTATAAG CGAGACCAAA GTCCAGGCCA ATGGATAATA ATGAGGTTGT 4380
GGACCTAACT AGGGGGAGCC TAAAATAATG TTGGGACTAC CTAGATGGTC AGAAAGAATG 4440
AGCCAATTAA CTTCTAAAAT 4460